单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12861 - 12880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12861 | 2024-08-07 |
MGP+ and IDO1+ tumor-associated macrophages facilitate immunoresistance in breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111818
PMID:38460300
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了31名接受PD-1免疫治疗的乳腺癌患者的肿瘤组织中髓系细胞的变化，揭示了MGP+和IDO1+肿瘤相关巨噬细胞在乳腺癌中的免疫抵抗机制 | 本研究发现了MGP TAMs和IDO1 TAMs在乳腺癌患者中影响免疫治疗效果的新机制，并提供了新的生物标志物以预测治疗反应和克服免疫治疗抵抗 | NA | 探讨乳腺癌患者在接受PD-1免疫治疗后肿瘤相关巨噬细胞的变化及其对免疫治疗效果的影响 | 乳腺癌患者的肿瘤组织中的髓系细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 31名乳腺癌患者 |
| 12862 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome profiling of infrapatellar fat pad highlights the role of interstitial inflammatory fibroblasts in osteoarthritis
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111888
PMID:38522139
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了髌下脂肪垫（IFP）的细胞异质性，揭示了间质炎症性成纤维细胞（iiFBs）在骨关节炎（OA）中的作用。 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了髌下脂肪垫中间质炎症性成纤维细胞的特性和其在骨关节炎中的作用。 | NA | 探索髌下脂肪垫在骨关节炎发病机制中的作用，并识别潜在的治疗靶点。 | 髌下脂肪垫的细胞异质性及其在骨关节炎中的作用。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞和单核RNA测序 | NA | 转录组 | 10个髌下脂肪垫样本，包括5个来自骨关节炎患者和5个来自健康对照。 |
| 12863 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies FBXO2 as a candidate biomarker associated with chemoresistance in HGSOC
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28490
PMID:38590858
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研究论文 | 这项研究确定了FBXO2作为与HGSOC化疗抗药性相关的潜在生物标志物 | 首次通过结合单细胞RNA测序和整体RNA测序数据集识别出FBXO2在化疗抗药性中的作用 | 在体外验证中可能受限于细胞系的选择，临床适用性还有待进一步研究 | 研究HGSOC中与化疗抗药性相关的生物标志物 | 高等级浆液性卵巢癌患者的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 8871个恶性上皮细胞 |
| 12864 | 2024-08-07 |
Gene features of tumor-specific T cells relevant to immunotherapy, targeted therapy and chemotherapy in lung cancer
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28374
PMID:38590880
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序定义了肿瘤特异性T细胞（TSTs）及其特征（TSTGs），并应用LASSO回归筛选出与生存最相关的TSTGs，构建了肿瘤特异性T细胞评分（TSTS），以预测肺癌患者对免疫疗法、靶向疗法和化疗的反应。 | 本文创新性地通过单细胞RNA测序技术筛选出肿瘤特异性T细胞的特征基因，并构建了一个新的评分系统（TSTS），用于预测肺癌患者对不同治疗方式的反应。 | NA | 研究旨在寻找能够预测肺癌患者对免疫疗法、靶向疗法和化疗反应的生物标志物，以优化临床治疗选择。 | 肺癌患者的肿瘤特异性T细胞及其特征基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | NA |
| 12865 | 2024-08-07 |
Identification of fatty acids synthesis and metabolism-related gene signature and prediction of prognostic model in hepatocellular carcinoma
2024-Apr-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03306-4
PMID:38584256
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研究论文 | 本研究通过分析基因表达综合数据库（GEO）、癌症基因组图谱（TCGA）和国际癌症基因组联盟（ICGC）的数据，识别了与肝细胞癌（HCC）中脂肪酸合成与代谢（FASM）相关的基因特征，并构建了预测预后模型。 | 本研究首次揭示了FASM相关基因特征在HCC中的分子特性、生理功能和临床预后价值，并通过一系列功能实验验证了FASM效应基因在促进肿瘤进展中的作用。 | NA | 旨在理解肝细胞癌中脂肪酸合成与代谢的异质性，并评估其对患者预后和治疗反应的影响。 | 肝细胞癌患者及其脂肪酸合成与代谢相关的基因特征。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 转录组数据 | 涉及来自GEO、TCGA和ICGC数据库的肝细胞癌患者数据 |
| 12866 | 2024-08-07 |
Locally delivered hydrogels with controlled release of nanoscale exosomes promote cardiac repair after myocardial infarction
2024-Apr, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.02.035
PMID:38417558
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研究论文 | 本文介绍了一种生物工程化的可注射透明质酸水凝胶，用于优化滋养层干细胞衍生外泌体的局部递送效率，以促进心肌梗塞后的心脏修复。 | 该水凝胶通过精心设计的超支化聚合物交联剂，增强了生物降解性和独特的控释能力，同时保留了纳米级外泌体的生物活性。 | NA | 旨在通过局部递送含有控释纳米级外泌体的水凝胶，促进心肌梗塞后的心脏修复。 | 研究对象为心肌梗塞后的心脏修复。 | 生物工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12867 | 2024-08-07 |
Canopy2: tumor phylogeny inference by bulk DNA and single-cell RNA sequencing
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585595
PMID:38562795
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研究论文 | 本文提出了一种名为Canopy2的贝叶斯框架，利用批量DNA和单细胞RNA测序数据来推断肿瘤谱系并进行突变分析 | Canopy2通过马尔可夫链蒙特卡洛方法处理单细胞数据的稀疏性和随机性，能够区分不同类型的零值（非癌细胞、随机突变和测序技术导致的零值） | NA | 研究旨在通过构建肿瘤细胞的谱系树来深入了解肿瘤的复杂性和异质性 | 肿瘤细胞的遗传组成和功能差异 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量DNA测序 | 贝叶斯框架 | DNA, RNA | 涉及乳腺癌和胶质母细胞瘤的数据 |
| 12868 | 2024-08-07 |
miR-644a is a tumor cell-intrinsic mediator of sex bias in glioblastoma
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.11.584443
PMID:38559056
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研究论文 | 本文研究了miR-644a在胶质母细胞瘤（GBM）中性别偏倚的肿瘤细胞内在介导作用 | 首次揭示了miR-644a在GBM中性别偏倚的肿瘤细胞内在介导作用 | NA | 探讨miR-644a在胶质母细胞瘤中性别偏倚的机制 | miR-644a及其在GBM中的性别偏倚作用 | NA | 脑瘤 | miRNA和mRNA测序 | NA | 测序数据 | 39名GBM患者（22名男性，17名女性）和110名GBM患者的单细胞RNA测序数据 |
| 12869 | 2024-08-07 |
A vagal reflex evoked by airway closure
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07144-2
PMID:38448588
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研究论文 | 本文研究了一种由气道闭合引发的迷走神经反射，该反射导致喘息现象 | 发现了由表达PVALB的迷走神经元介导的气道闭合反应，并揭示了神经上皮小体（NEBs）在肺机械感觉中的关键作用 | NA | 探讨气道闭合引发的迷走神经反射及其对呼吸功能的维持作用 | 迷走神经反射、神经上皮小体（NEBs）、表达PVALB的迷走神经元 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 12870 | 2024-08-07 |
Oscillatory differentiation dynamics fundamentally restricts the resolution of pseudotime reconstruction algorithms
2024-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0537
PMID:38503342
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研究论文 | 本文理论性地展示了细胞分化过程中存在的动态振荡现象如何限制了伪时间重建算法的质量和分辨率 | 首次揭示了细胞分化过程中的振荡动态对伪时间重建算法分辨率的内在限制 | 指出了当前伪时间重建方法的固有局限性 | 探讨细胞分化过程中振荡动态对伪时间重建算法的影响 | 细胞分化过程中的动态振荡现象及其对伪时间重建算法的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12871 | 2024-08-04 |
Integration of scRNA and bulk RNA-sequence to construct the 5-gene molecular prognostic model based on the heterogeneity of thyroid carcinoma endothelial cell
2024-02-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023254
PMID:38186223
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研究论文 | 本研究构建了基于甲状腺癌内皮细胞异质性的5基因分子预后模型 | 揭示内皮细胞与乳头状甲状腺癌进展的强关联，并筛选出5个关键基因 | 对于肿瘤微环境中的细胞关注较少，可能影响研究的全面性 | 探索甲状腺癌的分子预后过程及其内皮细胞的作用 | 甲状腺癌的内皮细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12872 | 2024-08-07 |
Proteomic profiling of aqueous humor-derived exosomes in Vogt-Koyanagi-Harada disease and Behcet's uveitis
2024-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.109895
PMID:38185270
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research paper | 本研究首次对来自Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体进行了无标记定量蛋白质组学分析，以确定其在疾病中的潜在作用 | 首次对房水来源的外泌体进行无标记定量蛋白质组学分析，并发现补体相关通路在这些疾病发病机制中的重要作用 | NA | 探究Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎中房水来源外泌体的蛋白质组学特征及其在疾病发病机制中的作用 | Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体 | NA | Vogt-Koyanagi-Harada病, Behcet氏葡萄膜炎 | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | 84名患者 |
| 12873 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
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研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的耐药性问题 | 发现使用temsirolimus靶向阻断mTORC1可以克服PRMT5抑制剂的耐药性，并在耐药的MCL细胞系中显示出治疗协同作用 | 研究主要基于患者来源的异种移植（PDX）模型和细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的耐药机制并寻找克服耐药性的策略 | 套细胞淋巴瘤（MCL）及其对PRMT5抑制剂的耐药性 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级耐药细胞系4个，耐药PDX模型若干 |
| 12874 | 2024-08-04 |
Comprehensive molecular and cellular characterization of endoplasmic reticulum stress-related key genes in renal ischemia/reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1340997
PMID:38495888
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研究论文 | 本研究全面表征了与内质网应激相关的三种关键基因在肾脏缺血/再灌注损伤中的作用 | 该研究首次确定了与内质网应激相关的三种关键基因，并探讨了它们在肾脏移植后愈后预后的价值 | 研究的限制在于使用了已有的数据集，可能无法完全捕捉肾脏缺血/再灌注损伤的所有机制 | 研究旨在揭示肾脏缺血/再灌注损伤的潜在机制，以发现有效的肾脏保护靶点 | 研究对象为在肾脏缺血/再灌注损伤中涉及的关键基因及其相关途径 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从GEO数据库收集了495个肾脏样本进行研究 |
| 12875 | 2024-08-05 |
Apolipoprotein L genes are novel mediators of inflammation in beta cells
2024-Jan, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-06033-z
PMID:37924378
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研究论文 | 本文研究了载脂蛋白L基因在炎症引起的β细胞损伤中的新作用 | 发现APOL基因在β细胞中的表达受到炎症的显著上调，揭示了它们在胰腺炎症中的新调节作用 | 研究主要集中在单一细胞模型，可能无法全面反映复杂的体内环境 | 探讨载脂蛋白L基因在β细胞炎症损伤中的作用机制 | 主要研究人类胰腺β细胞以及与糖尿病相关的细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了原代人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞 |
| 12876 | 2024-08-07 |
Multi-omics and tumor immune microenvironment characterization of a prognostic model based on aging-related genes in melanoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/UZGP9704
PMID:38590405
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研究论文 | 本文通过分析与衰老相关的基因，构建了一个针对黑色素瘤的预后模型，并探讨了其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次基于衰老相关基因构建黑色素瘤预后模型，并展示了其在预测患者死亡率方面的高准确性 | NA | 构建一个基于衰老相关基因的黑色素瘤预后模型，并探讨其在免疫治疗中的潜在应用 | 黑色素瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 12877 | 2024-08-05 |
Human monoclonal antibodies against Staphylococcus aureus A protein identified by high-throughput single-cell sequencing of phase I clinical volunteers' B cells
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109843
PMID:37981106
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研究论文 | 本研究通过高通量单细胞测序识别出对抗金黄色葡萄球菌A蛋白的人源单克隆抗体 | 发现了一种特异性针对金黄色葡萄球菌A蛋白的高表达的人单克隆抗体IgG-6 | 本研究仅在I期临床试验中进行，样本量相对较小，长期效果尚未验证 | 研究人源单克隆抗体作为对付金黄色葡萄球菌感染的新策略 | 从64名志愿者的外周血淋巴细胞中分离的抗原特异性记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 64名临床志愿者的外周血淋巴细胞 |
| 12878 | 2024-08-07 |
Ruxolitinib attenuates acute rejection and can serve as an immune induction therapy in heart transplantation
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109851
PMID:38008145
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研究论文 | 研究探讨了IL2RA拮抗剂在心脏移植患者中的效果，并发现鲁索利替尼可能是一种新的免疫诱导治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了IL2RA拮抗剂治疗后免疫细胞的动态变化，并发现鲁索利替尼可作为新的免疫诱导治疗药物，不影响调节性T细胞的激活 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 阐明IL2RA拮抗剂的效果并寻找优于IL2RA拮抗剂的治疗目标 | 心脏移植患者及IL2RA拮抗剂治疗后的免疫细胞 | NA | 心脏移植 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十九种细胞类型 |
| 12879 | 2024-08-07 |
Single-cell dissection, hdWGCNA and deep learning reveal the role of oxidatively stressed plasma cells in ulcerative colitis
2023-11-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023237
PMID:37814814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高级加权基因共表达网络分析，揭示了氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的作用，并利用深度学习模型进行诊断 | 首次通过单细胞水平分析和多种机器学习方法，识别出氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的关键作用，并开发了用于诊断的深度学习模型 | NA | 阐明溃疡性结肠炎在单细胞水平的发病机制及其临床意义 | 溃疡性结肠炎中的氧化应激浆细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 转录组数据 | NA |
| 12880 | 2024-08-07 |
scAce: an adaptive embedding and clustering method for single-cell gene expression data
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad546
PMID:37672035
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research paper | 本文提出了一种名为scAce的自适应嵌入和聚类方法，用于单细胞基因表达数据的分析 | scAce方法通过构建变分自编码器同时学习细胞嵌入和聚类分配，并开发了一种自适应聚类合并方法，无需预先估计聚类数量 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析，区分细胞类型并发现新的细胞类型 | 单细胞基因表达数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | variational autoencoder | gene expression data | NA |