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当前共找到 39243 篇文献，本页显示第 12861 - 12880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12861 | 2025-10-06 |
ARTEMIS integrates autoencoders and Schrödinger Bridges to predict continuous dynamics of gene expression, cell population, and perturbation from time-series single-cell data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf218
PMID:40662824
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研究论文 | 提出ARTEMIS生成模型，整合变分自编码器和薛定谔桥来预测基因表达、细胞群体和扰动的连续动态 | 将变分自编码器与不平衡扩散薛定谔桥结合，首次在连续潜空间中重建细胞轨迹并估计时间依赖性细胞死亡率 | 基于单时间点快照数据推断连续动态，可能受限于数据稀疏性和技术噪声 | 从时间序列单细胞数据重建细胞轨迹、揭示基因表达动态和恢复细胞群体变化 | 胰腺β细胞分化、斑马鱼胚胎发生、癌细胞上皮间质转化过程 | 单细胞数据分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE), 薛定谔桥, 随机微分方程(SDEs) | 单细胞基因表达数据 | 三个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12862 | 2025-10-06 |
Transcriptome assembly at single-cell resolution with Beaver
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf236
PMID:40662838
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研究论文 | 开发了一种名为Beaver的单细胞特异性转录本组装工具，用于短读长单细胞RNA测序数据 | 设计了转录本片段图组织个体组装，采用动态规划算法搜索全长转录本，并整合两个随机森林模型准确估计候选转录本在单个细胞中的表达可能性 | 仅针对短读长scRNA-seq数据设计，未验证在其他单细胞测序技术上的表现 | 解决单细胞分辨率下全长转录本重建的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3单细胞RNA测序技术 |
| 12863 | 2025-10-06 |
Biallelic Mutations in the Otogelin-Like Gene (OTOGL) Associated With Congenital Non-Syndromic Sensorineural Hearing Loss in a Chinese Family
2025-Jul, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.70122
PMID:40682330
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研究论文 | 通过全外显子测序在中国家庭中发现OTOGL基因双等位基因突变与非综合征性先天性听力损失相关 | 首次在中国家庭中鉴定出OTOGL基因复合杂合突变(p.Ile34Val和p.Phe319del)与先天性听力损失的关联 | 研究仅针对单个中国家庭，OTOGL基因突变谱和功能相关性仍需进一步研究 | 探索OTOGL基因突变与非综合征性感觉神经性听力损失的遗传机制 | 患有不明原因听力损失的中国家庭成员 | 遗传学 | 听力损失 | 全外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 1个中国家庭(先证者为6岁男孩) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12864 | 2025-10-06 |
T Cells Enhance Tissue Complexity and Function to Study Fibrosis in 3D Skin-Like Tissue Models
2025-Jul, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1177/19373341251360742
PMID:40690724
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研究论文 | 本研究开发了含有T细胞的3D皮肤样组织模型，用于研究纤维化疾病中T细胞的作用机制 | 首次在3D皮肤样组织中整合自体T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞，并通过单细胞RNA测序鉴定T细胞亚群 | 模型仍需进一步验证其在其他器官纤维化研究中的适用性 | 研究T细胞在组织纤维化发病机制中的作用 | 硬皮病患者的血液来源T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞 | 组织工程 | 硬皮病、特发性肺纤维化、肝纤维化、肾纤维化 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、组织分析 | 3D组织工程模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织形态数据 | 硬皮病患者来源的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12865 | 2025-10-06 |
Iterative transcription factor screening enables rapid generation of microglia-like cells from human iPSC
2025-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59596-3
PMID:40494892
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研究论文 | 开发了一种迭代高通量单细胞转录因子筛选方法，用于快速将人类iPSC分化为小胶质细胞样细胞 | 提出迭代转录因子筛选方法，可在4天内通过六个转录因子将iPSC分化为小胶质细胞样细胞，并开发了新的计算方法构建基因调控网络 | NA | 开发高效的人类iPSC向特定细胞类型分化的方法 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)和小胶质细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，转录因子扰动实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12866 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Host Responses in Bovine Milk Somatic Cells (bMSCs) Following HPAIV Bovine H5N1 Influenza Exposure
2025-06-03, Viruses
DOI:10.3390/v17060811
PMID:40573402
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牛乳体细胞在H5N1禽流感病毒暴露后的宿主免疫反应 | 首次对H5N1病毒暴露的牛乳体细胞进行单细胞分析，揭示了乳腺免疫反应向2型免疫转变的动态特征 | 单细胞测序数据中未检测到病毒读数，免疫反应可能仅源于病毒成分暴露而非生产性感染 | 理解牛乳腺对H5N1病毒暴露的宿主免疫反应机制 | 体外暴露于H5N1病毒的牛乳体细胞(bMSCs) | 单细胞组学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12867 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals transcriptional plasticity of var gene expression in Plasmodium falciparum for host immune avoidance
2025-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02008-5
PMID:40379932
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫var基因表达的可塑性及其在宿主免疫逃避中的作用 | 首次在单细胞水平证明恶性疟原虫除了单等位基因var基因表达外，还能同时表达多个var基因或进入低/无表达状态 | 研究仅使用了3D7和IT4两个克隆寄生虫系，可能需要更多寄生虫株验证 | 探究恶性疟原虫var基因表达机制及其在免疫逃避中的作用 | 恶性疟原虫克隆株3D7和IT4 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个克隆寄生虫系(3D7和IT4) | NA | 单细胞RNA-seq | 便携式微孔系统 | 使用富集探针和便携式微孔系统的单细胞转录组学技术 |
| 12868 | 2025-10-06 |
Exploring the immune environment of glioblastoma through single-cell RNA sequencing in humanized mouse models
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.17.654526
PMID:40475625
|
研究论文 | 通过人源化小鼠模型中的单细胞RNA测序探索胶质母细胞瘤的免疫环境 | 建立了利用患者来源异种移植的人源化小鼠胶质母细胞瘤模型，该模型能更好地模拟复发性胶质母细胞瘤的免疫特征 | 模型基于免疫缺陷小鼠，可能无法完全模拟人类完整的免疫系统功能 | 研究胶质母细胞瘤的肿瘤免疫微环境并评估新疗法 | 人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤患者来源异种移植 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个免疫缺陷小鼠模型，使用人脐带血来源的CD34+造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12869 | 2025-10-06 |
Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112418
PMID:40343269
|
研究论文 | 本研究揭示腺苷脱氨酶活性性别差异与SARS-CoV-2先天免疫差异的关联机制 | 首次发现女性ADA活性较低与内源性逆转录病毒-干扰素刺激基因信号增强的关联，并阐明IL-18驱动性别特异性ADA2表达的机制 | 样本来源和数量未明确说明，机制研究仍需进一步验证 | 探究抗病毒免疫性别差异的分子机制 | 健康人群和COVID-19患者的血液、肺组织和呼吸道细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12870 | 2025-10-06 |
Investigative needle core biopsies support multimodal deep-data generation in glioblastoma
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58452-8
PMID:40295505
|
研究论文 | 本研究展示了通过常规立体定向穿刺活检获取的胶质母细胞瘤组织可进行多组学深度数据分析 | 首次系统验证立体定向穿刺活检在生成多组学数据和监测治疗反应方面的可行性 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索立体定向穿刺活检在胶质母细胞瘤多组学分析和治疗监测中的应用价值 | 胶质母细胞瘤患者术中获取的穿刺活检组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,T细胞克隆型分析,MHC I类免疫肽组学 | NA | 多组学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,免疫肽组学 | NA | NA |
| 12871 | 2025-10-06 |
An atlas of single-cell eQTLs dissects autoimmune disease genes and identifies novel drug classes for treatment
2025-Apr-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100820
PMID:40154479
|
研究论文 | 通过单细胞eQTL图谱解析自身免疫疾病基因并识别新型治疗药物类别 | 提出JOBS联合模型将bulk eQTL建模为单细胞eQTL的加权和，显著提高eQTL检测能力 | 单细胞eQTL数据集规模相对较小 | 解析自身免疫疾病遗传机制并识别潜在治疗药物 | 14种免疫介导疾病 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，全基因组关联分析 | JOBS联合模型 | 基因表达数据，基因组变异数据 | OneK1K和eQTLGen数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12872 | 2025-10-06 |
Crosstalk Signaling Between the Epithelial and Non-Epithelial Compartments of the Mouse Inner Ear
2025-Apr, Journal of the Association for Research in Otolaryngology : JARO
DOI:10.1007/s10162-025-00980-7
PMID:40080263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索小鼠内耳前庭器官中上皮细胞与非上皮间充质细胞之间的信号串扰 | 首次在新生小鼠椭圆囊中系统揭示上皮与非上皮细胞区室间的动态信号交流，特别是间充质细胞在出生后发育中的主导信号发送作用 | 研究仅关注出生后第4天和第6天两个时间点，未能覆盖更完整的发育时间序列 | 探索内耳前庭器官发育过程中上皮与非上皮细胞区室间的相互作用机制 | 新生小鼠内耳椭圆囊细胞 | 单细胞生物学 | 前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，定量多重原位杂交 | 多种计算方法 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 955个细胞，来自12个注释细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | 全长Smart-seq2单细胞RNA测序 |
| 12873 | 2025-10-06 |
The dynamic and diverse nature of parenchyma cells in the Arabidopsis root during secondary growth
2025-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-01938-6
PMID:40140531
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和谱系追踪技术，揭示了拟南芥根次生生长过程中薄壁细胞的多样性和功能动态 | 首次通过单细胞RNA测序与谱系追踪相结合的方法，重建了拟南芥根次生生长过程中的细胞发育轨迹，发现了20种先前未描述的细胞类型或状态 | 研究仅限于拟南芥根部，结果在其他植物或组织中的普适性需要进一步验证 | 探究拟南芥根次生生长过程中薄壁细胞的多样性和功能特性 | 拟南芥根部在次生生长过程中的薄壁细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 93个报告基因系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12874 | 2025-10-06 |
MYB74 transcription factor guides de novo specification of epidermal cells in the abscission zone of Arabidopsis
2025-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-01976-0
PMID:40181105
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥脱落区非表皮残留细胞通过转分化形成表皮细胞的发育程序 | 首次发现MYB74转录因子指导脱落区表皮细胞的从头特化，揭示了植物通过转分化途径同时实现保护和促进生长的机制 | NA | 探究植物脱落区表皮细胞从头特化的分子机制和生物学意义 | 拟南芥脱落区的非表皮残留细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12875 | 2025-10-06 |
Islet single-cell transcriptomic profiling during obesity-induced beta cell expansion in female mice
2025-Mar-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112031
PMID:40104055
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术揭示了肥胖雌性小鼠中胰岛β细胞增殖的协调转录机制 | 首次在肥胖雌性小鼠模型中通过单细胞转录组学识别出经历未折叠蛋白反应、应激解决和细胞周期进程的不同β细胞群体，并发现Xbp1和Myc在缓解UPR和刺激β细胞增殖中的协调作用 | 研究仅针对雌性小鼠模型，结果可能不适用于雄性或其他物种 | 探索肥胖诱导的β细胞增殖的分子机制 | 雌性基因敲除小鼠的胰岛β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 雌性基因敲除小鼠胰岛 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12876 | 2025-10-06 |
Alevin-fry-atac enables rapid and memory frugal mapping of single-cell ATAC-seq data using virtual colors for accurate genomic pseudoalignment
2025-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625771
PMID:39677745
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞ATAC-seq数据快速映射的新工具alevin-fry-atac，采用虚拟颜色增强的伪对齐方案 | 提出了一种改进的伪对齐方案，通过将参考基因组划分为'虚拟颜色'（重叠的固定最大范围区域），解决了大基因组参考映射的挑战 | NA | 开发快速、内存高效且准确的单细胞ATAC-seq数据处理方法 | 单细胞ATAC-seq数据的映射和处理 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | 伪对齐算法 | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 12877 | 2025-10-06 |
Radiation-induced cellular plasticity primes glioblastoma for forskolin-mediated differentiation
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2415557122
PMID:40009641
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研究论文 | 本研究利用辐射诱导的细胞可塑性状态，联合毛喉素促进胶质母细胞瘤细胞分化 | 发现辐射可诱导胶质瘤细胞进入多能状态，为毛喉素介导的分化治疗创造机会 | NA | 探索辐射联合毛喉素对胶质母细胞瘤分化治疗的效果 | 胶质母细胞瘤细胞系、胶质瘤干细胞、小鼠模型 | 肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 极限稀释实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12878 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics identifies molecular niche dysregulation associated with distal lung remodeling in pulmonary fibrosis
2025-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02080-x
PMID:39901013
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了肺纤维化中远端肺重塑相关的分子生态位失调 | 开发了基于图像的空间转录组学方法，结合细胞基础和细胞不可知分析，首次在肺纤维化中识别出分子定义的多样化空间生态位 | 研究样本数量相对有限（35个肺组织），且主要关注肺纤维化特定病理阶段 | 解析肺纤维化疾病发病机制中的空间背景和分子变化 | 人类肺组织样本，包括对照和肺纤维化患者的远端肺组织 | 空间转录组学 | 肺纤维化 | 空间转录组学，机器学习，轨迹分析 | 机器学习模型 | 空间基因表达数据，图像数据 | 35个独特肺组织的160万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 12879 | 2025-10-06 |
Batch correcting single-cell spatial transcriptomics count data with Crescendo improves visualization and detection of spatial gene patterns
2025-Feb-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03479-9
PMID:40001084
|
研究论文 | 提出Crescendo算法用于校正单细胞空间转录组数据中的批次效应，改善基因空间模式的可视化和检测 | 开发了专门针对空间转录组数据的批次效应校正算法，能够在基因表达水平进行校正，支持跨样本和跨技术的信息整合 | NA | 解决空间转录组数据中的批次效应问题，提高基因空间模式分析的准确性 | 单细胞空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | Crescendo算法 | 基因表达计数数据 | 三个数据集，包含17万至700万个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 12880 | 2025-10-06 |
NKG2D blockade impairs tissue-resident memory T cell accumulation and reduces chronic lung allograft dysfunction
2025-Feb-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.184048
PMID:39989456
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现NKG2D阻断可抑制组织驻留记忆T细胞积累并减轻慢性肺移植功能障碍 | 首次揭示CLAD中细胞毒性CD8+ TRM通过NKG2D介导的克隆扩增机制及其在慢性排斥中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证NKG2D阻断的治疗效果 | 探索慢性肺移植功能障碍的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 肺移植患者的CLAD肺组织、肺引流淋巴结及小鼠原位肺移植模型 | 单细胞生物学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | CLAD肺组织、肺引流淋巴结及对照组组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |