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当前共找到 39013 篇文献，本页显示第 12861 - 12880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12861 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Analysis and Real-World Data Validation of Serine Metabolism-Related Genes in Colorectal Cancer
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70721
PMID:40660426
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研究论文 | 通过多组学分析和真实世界数据验证，研究丝氨酸代谢相关基因在结直肠癌中的作用 | 首次对丝氨酸代谢相关基因进行泛癌分析，并在结直肠癌中深入探索其表达模式、预后意义及与肿瘤微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库和回顾性队列，需要进一步前瞻性研究验证 | 阐明丝氨酸代谢相关基因在结直肠癌中的表达模式、遗传改变和临床意义 | 结直肠癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组学、基因组学、表观遗传学、单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的泛癌数据，两个独立的结直肠癌真实世界队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12862 | 2025-10-06 |
Bayesian inference of fitness landscapes via tree-structured branching processes
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf193
PMID:40662787
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研究论文 | 提出了一种基于树结构分支过程的贝叶斯推理方法FiTree，用于从单细胞肿瘤突变树中学习适应性景观 | 将表型适应性参数化与贝叶斯推理方案结合，统一了癌症进展的概率图模型与群体遗传学 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 推断肿瘤进化中的适应性景观，理解突变间的表型相互作用 | 单细胞肿瘤突变树和急性髓系白血病数据集 | 计算生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞测序 | 树结构多类型分支过程模型，贝叶斯推理 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12863 | 2025-10-06 |
Fast and scalable Wasserstein-1 neural optimal transport solver for single-cell perturbation prediction
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf253
PMID:40662778
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研究论文 | 提出一种基于Wasserstein-1的快速可扩展神经最优传输求解器，用于单细胞扰动预测 | 采用Wasserstein-1对偶公式简化优化过程，避免了复杂的极小极大优化问题，并通过对抗训练恢复传输映射 | W1对偶仅揭示传输方向，不直接提供唯一最优传输映射，需要额外步骤确定传输步长 | 开发快速可扩展的最优传输求解器用于单细胞扰动响应预测 | 单细胞扰动数据分布映射 | 机器学习 | NA | 最优传输理论，对抗训练 | 神经网络 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12864 | 2025-10-06 |
Incorporating hierarchical information into multiple instance learning for patient phenotype prediction with single-cell RNA-sequencing data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf241
PMID:40662783
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研究论文 | 提出一种将层次信息整合到基于注意力的多示例学习框架中的新方法，用于单细胞RNA测序数据的患者表型预测 | 在基于注意力的多示例学习框架中同时考虑细胞和细胞类型的层次结构信息 | NA | 提高单细胞RNA测序数据患者表型预测的性能和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞和细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于注意力的多示例学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12865 | 2025-10-06 |
Refinement strategies for Tangram for reliable single-cell to spatial mapping
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf194
PMID:40662790
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研究论文 | 本文改进了Tangram空间映射工具，通过多种策略提高单细胞到空间映射的可靠性 | 提出了四种改进策略：在信息基因子集上训练模型、应用细胞过滤、引入多种正则化形式以及整合邻域信息，显著提高了映射一致性 | 研究主要基于小鼠数据集，在其他物种或组织类型中的适用性需要进一步验证 | 提高单细胞RNA测序与空间转录组学数据整合的可靠性和一致性 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Tangram模型改进 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 真实和模拟的小鼠数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12866 | 2025-10-06 |
Predicting fine-grained cell types from histology images through cross-modal learning in spatial transcriptomics
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf201
PMID:40662792
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研究论文 | 提出一种跨模态统一表示学习框架CUCA，用于从组织学图像预测细粒度细胞类型 | 利用跨模态嵌入对齐范式协调形态学和分子模态的嵌入空间，弥合图像模式与分子表达特征之间的差距 | NA | 从组织学图像识别细粒度细胞类型，为肿瘤生物学研究提供见解 | 细胞类型识别和空间组织结构分析 | 数字病理学 | 肿瘤 | 跨模态表示学习 | 跨模态统一表示学习框架 | 组织学图像、空间转录组数据 | 三个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 12867 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics deconvolution methods generalize well to spatial chromatin accessibility data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf268
PMID:40662813
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研究论文 | 本研究评估了空间转录组学反卷积方法在空间染色质可及性数据上的适用性 | 首次系统评估RNA反卷积方法在染色质可及性数据上的表现，并开发了跨模态模拟框架 | RNA反卷积方法在解析稀有细胞类型时表现略优于染色质可及性方法，表明仍需开发专门方法 | 验证空间转录组反卷积方法在空间染色质可及性数据上的通用性 | 空间染色质可及性数据和空间转录组数据 | 空间组学 | NA | 空间染色质可及性分析, 空间转录组学, 单细胞多组学 | Cell2location, RCTD | 空间染色质可及性数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间染色质可及性分析, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 12868 | 2025-10-06 |
Cancer stem cells: Bridging microenvironmental interactions and clinical therapy
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70406
PMID:40665579
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综述 | 本文系统总结了癌症干细胞（CSCs）的生物学特性、分子调控机制及其与肿瘤微环境的相互作用，并评估了靶向CSCs的临床治疗策略 | 有机整合了CSCs的基础机制与临床转化研究，提出了多组学引导的精准医疗和微环境重塑等解决方案 | NA | 探讨癌症干细胞在肿瘤发生发展中的作用及其临床治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 多组学分析、谱系追踪、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 12869 | 2025-10-06 |
The CXCL16/CXCR6 axis is linked to immune effector cell-associated neurotoxicity in chimeric antigen receptor (CAR) T cell therapy
2025-Jun-30, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01498-6
PMID:40588764
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研究论文 | 本研究探讨CXCL16/CXCR6轴在CAR-T细胞疗法相关神经毒性中的作用机制 | 首次发现CXCR6+细胞毒性T细胞在ICANS脑脊液中富集，并揭示CXCL16/CXCR6轴与神经毒性严重程度的相关性 | 样本量较小（n=11），且严重病例数量有限 | 阐明CAR-T细胞疗法中免疫效应细胞相关神经毒性综合征的发病机制 | 接受CAR-T细胞治疗并发生ICANS的患者外周血和脑脊液样本，以及尸检脉络丛和脑组织 | 单细胞生物学 | 神经毒性综合征 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 多模态空间转录组学, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 11例ICANS患者（分级：1级3例，2级4例，3级1例，4级3例） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12870 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling of senescence effects on blood-brain barrier-related gene expression in brain capillary endothelial cells in a mouse model of paclitaxel-induced chemobrain
2025-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01561-5
PMID:39976844
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析紫杉醇诱导的小鼠脑毛细血管内皮细胞衰老对血脑屏障相关基因表达的影响 | 首次在单细胞水平揭示紫杉醇诱导的内皮细胞衰老通过改变细胞连接组装和细胞外基质重塑相关基因表达导致血脑屏障功能障碍 | 研究仅基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何影响血脑屏障完整性的基因表达模式 | 紫杉醇处理的小鼠脑毛细血管内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 化疗相关认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 紫杉醇处理组和对照组小鼠脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12871 | 2025-10-06 |
Reactivation of CTLA4-expressing T cells accelerates resolution of lung fibrosis in a humanized mouse model
2025-May-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181775
PMID:40100323
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术，揭示了CTLA4阳性T细胞在肺纤维化消退过程中的关键作用 | 首次发现CTLA4在CD8+ T细胞上的表达与纤维化区域相邻，并证明靶向CTLA4的治疗可加速肺上皮再生和纤维化消退 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的直接转化仍需进一步验证 | 探究免疫检查点蛋白CTLA4在肺纤维化消退过程中的作用机制 | 人源化CTLA4敲入小鼠模型、人类特发性肺纤维化组织 | 空间转录组学 | 肺纤维化 | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 人源化小鼠模型和人类肺纤维化组织样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 12872 | 2025-10-06 |
[Single-cell analysis of immune-lineage features in T-cell large granular lymphocytic leukemia]
2025-May-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析T细胞大颗粒淋巴细胞白血病患者的免疫谱系特征 | 首次在单细胞水平揭示T-LGLL的免疫谱系特征，发现效应CD8+ T细胞异常扩增、Treg细胞减少及功能异常等关键免疫失衡特征 | 样本量较小（5例患者和3例健康对照），单中心研究 | 研究T细胞大颗粒淋巴细胞白血病的免疫谱系改变及其致病机制 | T-LGLL患者和健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5例T-LGLL患者（治疗前后配对样本）和3例健康对照 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
| 12873 | 2025-10-06 |
A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466
PMID:40090085
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研究论文 | 本研究在青少年系统性红斑狼疮中发现了一类高度活化的CD99-CD72+B细胞亚群，该细胞群通过表达高水平TLR7促进自身免疫进程 | 首次在青少年系统性红斑狼疮中鉴定出CD72+B细胞这一关键过渡细胞群体，揭示了其在自身免疫反应中的新作用机制 | 研究主要基于测序数据分析，需要进一步实验验证该细胞群体的具体功能机制 | 探究青少年系统性红斑狼疮中B细胞亚群的免疫病理机制 | 青少年系统性红斑狼疮患者的B细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学整合分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 12874 | 2025-10-06 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645566
PMID:40236001
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研究论文 | 本研究通过多模态分析识别胶质瘤中肿瘤浸润淋巴细胞扩增的空间和分子决定因素 | 首次整合光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium原位转录组学和CODEX空间蛋白质组学，建立空间多组学框架分析胶质瘤TIL扩增能力 | 研究聚焦于高级别胶质瘤，结果在其他免疫排斥肿瘤中的普适性需进一步验证 | 识别胶质瘤中肿瘤浸润淋巴细胞扩增的基因组和空间决定因素 | 高级别胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 光谱流式细胞术, TCR测序, 单细胞RNA测序, 原位转录组学, 空间蛋白质组学 | 多组学整合分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据, T细胞受体数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Xenium | Xenium原位转录组学平台 |
| 12875 | 2025-10-06 |
Tracking HIV persistence across T cell lineages during early ART-treated HIV-1-infection using a reservoir-marking humanized mouse model
2025-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57368-7
PMID:40044684
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研究论文 | 开发HIV-1诱导谱系追踪系统，通过单细胞RNA测序追踪早期ART治疗期间HIV在不同T细胞谱系中的持久性 | 首创HIV-1诱导谱系追踪系统，可永久标记感染细胞并检测稀有潜伏感染细胞 | 基于人源化小鼠模型，可能与人类真实感染情况存在差异 | 研究HIV在ART治疗期间在不同T细胞谱系中的持久性机制 | HIV-1感染的人源化小鼠模型中的CD4 T细胞 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人源化小鼠模型中的稀有潜伏感染细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12876 | 2025-10-06 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2025-Mar-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.12.016
PMID:39814010
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPRi筛选的iAssembloids系统，用于研究神经元与胶质细胞相互作用的分子机制 | 首次将CRISPRi筛选技术应用于3D共培养的iPSC衍生神经元和胶质细胞系统，建立了可扩展的因果分子机制研究平台 | 基于体外培养系统，可能无法完全模拟体内大脑环境的复杂性 | 阐明神经元与胶质细胞相互作用的分子机制，特别是对神经元存活和死亡的控制 | iPSC衍生的神经元和胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | CRISPRi筛选，单细胞转录组学 | iAssembloids 3D共培养系统 | 基因表达数据，功能筛选数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12877 | 2025-10-06 |
A single-cell sequencing-based analysis of a 13-year-old with maxillary sinus NUT carcinoma
2025-Mar, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤异质性和免疫微环境特征 | 首次在NUT癌中应用单细胞测序技术揭示肿瘤上皮细胞的异质性和免疫微环境特征 | 仅分析单例患者样本，样本量有限 | 探索NUT癌的肿瘤生物学特性和潜在治疗靶点 | 13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | NUT癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12878 | 2025-10-06 |
SELP+ TEC:CD8+ T cell crosstalk associates with improved radiotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Feb-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02244-7
PMID:39901166
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研究论文 | 本研究探讨了宫颈癌中SELP+肿瘤内皮细胞与CD8+ T细胞通过ACKR1-CCL5轴的相互作用对放疗疗效的影响 | 首次发现SELP在宫颈癌特定内皮细胞亚群中的表达与抗癌免疫反应相关，并揭示了SELP TEC与CD8+ T细胞通过ACKR1-CCL5轴互作的新机制 | SELP影响抗癌免疫的具体机制及其在放疗反应中的确切作用尚未完全阐明 | 探究SELP在宫颈癌中对抗癌免疫的影响及其在放疗反应中的作用机制 | 宫颈癌患者肿瘤组织样本、单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 癌症免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 205例宫颈癌患者肿瘤组织样本，8例患者的42,159个细胞的scRNA-seq数据，187例放疗患者的批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 12879 | 2025-10-06 |
Multimodal hierarchical classification of CITE-seq data delineates immune cell states across lineages and tissues
2025-Jan-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100938
PMID:39814026
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研究论文 | 开发了一种名为MMoCHi的多模态分层分类方法，用于准确注释CITE-seq数据中的免疫细胞状态 | 提出不依赖参考图谱的基于标记物的多模态分类方法，能够整合跨谱系、样本或模态的细胞类型注释 | NA | 开发能够整合多模态单细胞数据的准确细胞类型分类方法 | 免疫细胞，特别是T淋巴细胞亚群和跨组织人类免疫细胞 | 生物信息学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | 分层分类器 | 单细胞转录组数据, 表面蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表面蛋白质组分析 | NA | NA |
| 12880 | 2025-10-06 |
CD8 + T cells mediate vaccination-induced lymphatic containment of latent Mycobacterium tuberculosis infection following immunosuppression, while B cells are dispensable
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634479
PMID:39896630
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CD8+T细胞在疫苗接种预防潜伏结核感染再激活中的关键作用 | 首次发现CD8+T细胞在缺乏CD4+T细胞情况下仍能介导疫苗接种对潜伏结核感染的淋巴控制 | 研究基于小鼠模型，结果需要在人类中进一步验证 | 阐明潜伏结核感染免疫控制与再激活的免疫学机制 | 潜伏结核分枝杆菌感染的小鼠模型 | 免疫学 | 结核病 | 空间转录组学、多参数成像、网络分析、生物信息学整合 | NA | 组织病理学图像、转录组数据 | 多种免疫细胞缺陷小鼠品系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |