单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 12861 - 12880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12861 | 2024-08-05 |
Establishment of a cholangiocarcinoma risk evaluation model based on mucin expression levels
2024-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i4.1344
PMID:38660669
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研究论文 | 本研究建立了一个基于粘蛋白表达水平的胆管癌风险评估模型 | 首次系统性探讨了粘蛋白在胆管癌进展及预后中的作用，建立了风险评估公式 | 尚未完全理解粘蛋白家族如何影响胆管癌的进展和预后 | 研究粘蛋白在胆管癌进展中的作用并建立风险评估模型 | 14个胆管癌样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫组化 | LASSO回归 | RNA数据 | 14个胆管癌样本 |
| 12862 | 2024-08-05 |
Identification of receptors and factors associated with human coronaviruses in the oral cavity using single-cell RNA sequencing
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28280
PMID:38560173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了与人类冠状病毒在口腔中相关的受体和因素 | 本研究整合了多个口腔组织的单细胞RNA测序数据，识别了特定细胞簇及SARS-CoV-2和与冠状病毒相关的受体的表达模式 | SCARFs在其他口腔部位的表达模式相对复杂，可能仅与SARS-CoV-2感染特定相关 | 探究四种人类冠状病毒在口腔中的感染机制和靶细胞特征 | 本研究对象为七种人类口腔组织中的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 七种人类口腔组织的单细胞数据 |
| 12863 | 2024-08-04 |
Staphylococcus aureus induces drug resistance in cancer T cells in Sézary syndrome
2024-Apr-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021671
PMID:38170178
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研究论文 | 本研究报告了金黄色葡萄球菌及其肠毒素在Sézary综合症患者的恶性T细胞中诱导耐药性 | 首次揭示了金黄色葡萄球菌肠毒素诱导的抗药机制及其在Sézary综合症中的影响 | 本研究未涉及多种其他类型的细菌或影响因素 | 探索金黄色葡萄球菌诱导的药物耐受机制及其在SE综合症中的作用 | 对来自Sézary综合症患者的恶性T细胞进行研究 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 来自Sézary综合症患者的多个原代恶性T细胞样本 |
| 12864 | 2024-08-04 |
Spatial motifs reveal patterns in cellular architecture of complex tissues
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588586
PMID:38645046
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研究论文 | 空间组织对保证组织的生理功能和癌症等病理状态至关重要 | 提出了一种新方法，通过空间邻域图检测细胞类型的空间模式 | 未提及该方法在其他组织类型或更复杂条件下的适用性 | 旨在识别细胞类型之间的更高阶关联，以理解复杂组织的发育和功能 | 主要研究小鼠视网膜双极细胞和下丘脑前视区域的空间图谱 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 合成数据和空间图谱 | 使用合成数据进行验证，具体样本量未知 |
| 12865 | 2024-08-04 |
Respiratory viral infection promotes the awakening and outgrowth of dormant metastatic breast cancer cells in lungs
2024-Apr-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4210090/v1
PMID:38645169
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研究论文 | 这篇文章探讨了呼吸道病毒感染如何促进潜伏性转移性乳腺癌细胞在肺部的觉醒和扩展 | 首次揭示呼吸道病毒感染对肺部乳腺癌潜伏细胞表型改变及其扩展的影响 | 本研究主要基于小鼠模型，临床相关性仍需进一步验证 | 研究呼吸道病毒感染如何影响潜伏性转移性乳腺癌细胞的活跃性 | 乳腺癌潜伏转移细胞及其在呼吸道病毒感染下的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 实验数据 | 使用了小鼠模型和人类观察数据 |
| 12866 | 2024-08-05 |
Predictive and Prognostic Biomarkers in Patients With Mycosis Fungoides and Sézary Syndrome (BIO-MUSE): Protocol for a Translational Study
2024-Apr-04, JMIR research protocols
IF:1.4Q3
DOI:10.2196/55723
PMID:38436589
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研究论文 | 本研究旨在识别与真菌病和塞扎里综合症患者相关的预后生物标志物 | 首次综合分析血液和皮肤中的免疫细胞及微生物环境，以发现潜在的新预后生物标志物 | 由于样本数量尚少，可能影响研究结果的普遍适用性和统计学意义 | 识别与真菌病和塞扎里综合症相关的预后生物标志物 | 真菌病和塞扎里综合症患者的血液和皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，数字空间分析 | NA | 血液和皮肤样本 | 正在招募120名真菌病或塞扎里综合症的成年患者以及20名健康志愿者 |
| 12867 | 2024-08-04 |
Quantifying Landscape-Flux via Single-Cell Transcriptomics Uncovers the Underlying Mechanism of Cell Cycle
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308879
PMID:38353329
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示细胞周期的潜在机制 | 该研究重建了细胞周期的连续向量场，量化了单细胞的动态景观流，并揭示了关键基因在维持细胞周期动力学中扮演的角色 | 未提及具体的实验验证过程 | 探讨细胞周期的转录调控机制 | 单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12868 | 2024-08-05 |
Circulating immune cell landscape and T-cell abnormalities in patients with moyamoya disease
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1647
PMID:38566524
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研究论文 | 本研究揭示了与 moya moya 病相关的循环免疫细胞景观和 T 细胞异常 | 首次全面描绘了 moya moya 病患者的循环免疫细胞的变化及其潜在的免疫失调机制 | 缺乏对其他人群或地域的比较分析，可能限制研究结果的广泛适用性 | 探讨 moya moya 病患者中循环免疫细胞及 T 细胞的变化 | 监测 moya moya 病患者与年龄匹配的健康对照之间的外周血免疫细胞特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序、质谱细胞计数、RNA 测序 | NA | 外周血样本 | 来源于 moya moya 病患者和健康对照的外周血样本 |
| 12869 | 2024-08-05 |
Spatially resolved single-cell atlas of ascidian endostyle provides insight into the origin of vertebrate pharyngeal organs
2024-Mar-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi9035
PMID:38552007
|
研究论文 | 这篇文章构建了小管状动物内腺的空间分辨率单细胞图谱，以揭示脊椎动物咽器官的起源 | 首次利用Stereo-seq和单细胞RNA测序揭示了小管状动物内腺的细胞组成和进化特征 | 研究主要集中在一种小管状动物身上，可能无法普遍适用于所有基底和声门生物 | 探讨脊椎动物咽器官的进化起源 | 小管状动物的内腺 | 数字病理学 | NA | Stereo-seq和单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 小管状动物的内腺细胞集合 |
| 12870 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional signature-based drug repurposing and in vitro evaluation in colorectal cancer
2024-Mar-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12142-8
PMID:38528462
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组特征进行药物重定位与结直肠癌的体外评估 | 使用单细胞RNA测序数据和转录特征进行药物重定位，发现12种FDA批准的新药用于结直肠癌治疗 | 虽然进行了体外评估，但缺乏体内评估数据 | 探索通过转录特征进行的药物重定位以提高结直肠癌的治疗效果 | 使用来自29名结直肠癌患者的91,103个单细胞RNA测序样本进行药物筛选 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 91,103个样本来自29名结直肠癌患者 |
| 12871 | 2024-08-05 |
hsa-miR-34a-5p enhances temozolomide anti-tumoral effects on glioblastoma: in-silico and in-vitro study
2024, EXCLI journal
IF:3.8Q1
DOI:10.17179/excli2023-6404
PMID:38655096
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研究论文 | 本研究探讨了hsa-miR-34a-5p及其与替莫唑胺组合对胶质母细胞瘤的影响及相关分子机制 | 本研究验证了hsa-miR-34a-5p在增强替莫唑胺抗肿瘤效应中的作用，并揭示了其通过MAPK通路的机制 | 研究未提及样本的临床前验证和长期效果 | 研究hsa-miR-34a-5p及其与替莫唑胺组合在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤效果 | 胶质母细胞瘤细胞系A172及TCGA-GTEx, CGGA等多个数据集 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | qRT-PCR, MTT, 流式细胞术, 克隆形成实验, Annexin V/PI分析 | NA | RNA测序 | 使用了多个数据集及A172细胞系进行分析 |
| 12872 | 2024-08-05 |
Investigating the Cell Origin and Liver Metastasis Factors of Colorectal Cancer by Single-Cell Transcriptome Analysis
2024, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S454295
PMID:38644955
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌肝转移的细胞来源和驱动因素 | 本研究首次利用单细胞分析中发现了与肝转移相关的上皮细胞，并建立了LM指数预测肝转移风险 | 本研究的功能实验仅在体外进行，尚未在体内验证 | 研究结直肠癌肝转移风险相关的细胞来源和生物标志物 | 结直肠癌患者特别是高风险肝转移的患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12873 | 2024-08-05 |
Identification of tumor heterogeneity associated with KRAS/TP53 co-mutation status in lung adenocarcinoma based on single-cell RNA sequencing
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38455404
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序研究KRAS/TP53共突变状态对肺腺癌的影响 | 提出了一种包含七个预后基因的新预测风险模型，并通过LASSO回归验证其预测能力 | NA | 探讨KRAS/TP53共突变状态对肺腺癌肿瘤微环境的影响 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 12874 | 2024-08-05 |
Single-cell type annotation with deep learning in 265 cell types for humans
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae054
PMID:38645719
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研究论文 | 本文开发了一个基于深度学习的单细胞类型预测工具，能够为人类的265种不同细胞类型赋予类型标签 | 该工具首先通过对约五百万个细胞的数据进行处理，并利用细胞本体校正注释，从而显著提高了模型的准确性 | 目前数据库中的不一致标记影响了模型的准确性，并且依赖于现有数据库的注释限制了未来的应用 | 旨在通过深度学习工具提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释准确性 | 研究对象为265种不同的人类细胞类型 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | RNA测序数据 | 约五百万个细胞 |
| 12875 | 2024-08-05 |
The functional role of L-fucose on dendritic cell function and polarization
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1353570
PMID:38646527
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研究论文 | 本文报告了饮食糖L-岩藻糖对树突细胞功能和极化的影响 | 提供了L-岩藻糖增强树突细胞功能的新机制，首次证明其能提高抗肿瘤免疫反应 | 研究中未提及样本规模或长期效果评估 | 探讨如何利用L-岩藻糖提升树突细胞的功能以增强免疫治疗 | 研究了L-岩藻糖对树突细胞的极化和免疫刺激活性的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和分子数据 | 小鼠模型中的肿瘤浸润树突细胞 |
| 12876 | 2024-08-05 |
Trem2 promotes foamy macrophage lipid uptake and survival in atherosclerosis
2023-Nov, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00354-3
PMID:38646596
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研究论文 | 本研究揭示了Trem2在动脉粥样硬化中对泡沫巨噬细胞分化和生存的调节作用 | 首次确定Trem2作为泡沫巨噬细胞特性的调节因子，并揭示其作为动脉粥样硬化潜在治疗靶点的可能性 | 本研究可能未能充分考虑动脉粥样硬化中其他潜在调节因子的影响 | 探讨Trem2在动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞的角色 | 泡沫巨噬细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因组范围的CRISPR筛选 | NA | NA | NA |
| 12877 | 2024-08-05 |
Cell-type specific molecular architecture for mu opioid receptor function in pain and addiction circuits
2023-11-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2023.109597
PMID:37271281
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研究论文 | 该文章描述了在疼痛和成瘾电路中，特定细胞类型的μ阿片受体功能的分子结构。 | 研究中使用单细胞RNA测序技术识别了整个神经系统中表达μ阿片受体的细胞类型，提供了将阿片类药物影响映射到新发现细胞类型的新机会。 | 该研究可能在细胞特征与阿片类药物作用之间的因果关系上存在探索的局限性 | 阐明与阿片类药物相关的细胞类型和神经电路，以促进安全的疼痛管理和阿片使用障碍的治疗。 | 研究对象为表达μ阿片受体的神经元细胞类型。 | 数字病理学 | 阿片类药物使用障碍 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 12878 | 2024-08-05 |
Illuminating the Terminal Nerve: Uncovering the Link between GnRH-1 and Olfactory Development
2023-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.31.555770
PMID:37693459
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研究论文 | 该研究揭示了GnRH-1神经元与嗅觉发育之间的联系 | 首次发现Prokr2在终末神经元中的表达与GnRH-1神经元形成及迁徙的关键时期相关 | 研究主要依赖于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨嗅觉系统与GnRH-1发育之间的机制联系 | 重点研究终末神经元及其在嗅觉发育中的作用 | 数字病理学 | Kallmann综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 12879 | 2024-08-05 |
CXCL9 influences the tumor immune microenvironment by stimulating JAK/STAT pathway in triple-negative breast cancer
2023-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03343-w
PMID:36472587
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研究论文 | 这项研究探讨了CXCL9在三阴性乳腺癌中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 发现CXCL9通过刺激JAK/STAT信号通路在三阴性乳腺癌中影响肿瘤免疫微环境，并可能作为临床预后和免疫治疗疗效的生物标志物 | 研究未提及样本规模和临床数据的全面性 | 探讨CXCL9在三阴性乳腺癌中对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究对象为三阴性乳腺癌中的M1和M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 在研究中包含了三阴性乳腺癌样本，但具体样本数量未提及 |
| 12880 | 2024-08-05 |
Immunosuppressive TREM2(+) macrophages are associated with undesirable prognosis and responses to anti-PD-1 immunotherapy in non-small cell lung cancer
2022-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03173-w
PMID:35278107
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研究论文 | 这项研究探讨了TREM2阳性巨噬细胞在非小细胞肺癌中的免疫抑制作用及其与免疫治疗反应的关系 | 首次识别出TREM2阳性巨噬细胞亚型与免疫疗法反应相关，并揭示其在肿瘤进展中的作用 | 未在外周血中发现TREM2+ TAMs，可能限制了其作为通用生物标志物的适用性 | 研究TAM亚型与非小细胞肺癌免疫治疗反应之间的关系 | 涉及341个手术样本和40个接受免疫治疗的NSCLC患者的组织样本 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 341个手术样本和40个免疫治疗组织样本 |