单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
12861 2024-08-04
Stigmasterol alleviates neuropathic pain by reducing Schwann cell-macrophage cascade in DRG by modulating IL-34/CSF1R
2024-04, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了甾醇在治疗神经性疼痛中的潜在治疗应用 首先揭示了甾醇通过调节IL-34/CSF1R轴减少Schwann细胞-巨噬细胞级联反应的机制 该研究主要集中在动物实验上,尚需在人类中进一步验证 研究甾醇在治疗神经性疼痛中的有效性和机制 主要针对 male Sprague-Dawley 大鼠进行实验 数字病理学 神经性疼痛 单细胞测序分析,ELISA,免疫组化,西方印迹 NA 细胞,血清 32只雄性Sprague-Dawley大鼠
12862 2024-08-05
SUMOylation inhibitors activate anti-tumor immunity by reshaping the immune microenvironment in a preclinical model of hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cellular oncology (Dordrecht)
研究论文 本文研究了SUMO化抑制剂在肝细胞癌模型中激活抗肿瘤免疫的机制 发现SUMO化抑制剂可以通过重塑免疫微环境来改善肝细胞癌的免疫应答 该研究限于小鼠模型,尚需在人类肝细胞癌患者中验证有效性 探索新的小分子疗法治疗肝细胞癌 评估SUMO化抑制剂在预临床小鼠肝细胞癌模型中的应用 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质量细胞术(CyTOF)、流式细胞术和多重免疫荧光(mIF) NA 细胞样本 使用了多种肝细胞癌小鼠模型进行研究
12863 2024-08-05
Molecular mechanism analyses of post-traumatic epilepsy and hereditary epilepsy based on 10× single-cell transcriptome sequencing technology
2024-04, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究基于10×单细胞转录组测序技术分析了创伤后癫痫和遗传性癫痫的分子机制 首次分析了创伤性颞叶癫痫患者不同细胞中的转录组差异 样本量较少,仅包括一名创伤后癫痫患者和一名遗传性癫痫患者 研究创伤后癫痫与遗传性癫痫患者在单细胞层面上的不同 一名创伤后癫痫患者和一名遗传性癫痫患者的海马组织 数字病理学 癫痫 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 2个样本(1名创伤后癫痫患者和1名遗传性癫痫患者)
12864 2024-08-05
Terminally differentiated cytotoxic CD4+ T cells were clonally expanded in the brain lesion of radiation-induced brain injury
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究调查了放射性脑损伤中细胞毒性CD4+ T细胞的存在及其潜在作用 首次描述了放射性脑损伤病变中克隆扩增的CD4+ CTL亚群 样本规模仅限于四名RIBI患者,可能影响结果的普遍性 旨在更全面地理解放射性脑损伤中适应性免疫的作用 重点研究放射性脑损伤(RIBI)患者的细胞毒性CD4+ T细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 单细胞数据 3934个CD4+ T细胞来自四名RIBI患者
12865 2024-08-04
Neural cell diversity in the light of single-cell transcriptomics
2023 Jun-Oct, Transcription
review 本文总结了单细胞转录组学如何改变我们对人脑细胞多样性的看法 探讨了单细胞转录组学对以前认为同质的细胞类型的重新审视,揭示了性别、年龄和脑部位置等因素的影响 NA 介绍单细胞转录组学对神经退行性疾病研究的潜在影响 人脑中的细胞多样性及其调控程序 NA 神经退行性疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
12866 2024-08-05
Pancreatic islet cell type-specific transcriptomic changes during pregnancy and postpartum
2023-Apr-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究发现孕期及产后胰岛细胞特定的转录组变化 首次通过单细胞RNA测序揭示了β细胞及其他胰岛细胞在孕期和产后特有的转录特征 研究只针对小鼠模型,结果可能不适用于人类 理解在孕期和产后胰岛细胞转录变化的驱动因素 对处于不同生理阶段的小鼠胰岛细胞进行分析 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 从处女、小鼠孕晚期及早期产后小鼠的胰岛中获取样本
12867 2024-08-05
Omega-3/Omega-6 Long-Chain Fatty Acid Imbalance in Phase I Retinopathy of Prematurity
2022-Mar-23, Nutrients IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了ω-3和ω-6长链多不饱和脂肪酸在早产儿童第I期视网膜病变中的作用 研究首次揭示了ω-3和ω-6长链脂肪酸在保护视网膜神经血管功能中的重要性 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全代表人类的生理反应 探讨ω-3和ω-6长链脂肪酸对早产儿童第I期视网膜病变的影响 研究对象为糖尿病相关的早产小鼠模型 数字病理学 早产视网膜病变 单细胞转录组学 小鼠模型 生物学数据 NA
12868 2024-08-04
Exploring the molecular mechanisms and shared gene signatures between celiac disease and ulcerative colitis based on bulk RNA and single-cell sequencing: Experimental verification
2024-May-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了乳糜泻(CeD)和溃疡性结肠炎(UC)之间的分子机制和共享基因特征 识别了REG4作为UC和CeD的共享基因,并提出它可能是一个潜在的生物标志物和治疗靶点 对疾病病因及免疫病理机制的理解仍不完全 进一步阐明UC和CeD之间的关系 研究乳糜泻和溃疡性结肠炎的毫无例外的共享基因表达特征 数字病理学 乳糜泻与溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序与基因表达谱分析 LASSO分析 基因表达数据 使用了两个数据库的基因表达数据集,具体样本量未详细说明
12869 2024-08-05
Single-cell transcriptome profiling reveals cell type-specific variation and development in HLA expression of human skin
2024-May-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究揭示了人类皮肤中HLA基因表达的细胞类型特异性变化与发育过程 首次全面分析了皮肤不同细胞类型中HLA基因表达的变异,特别关注了基质细胞的角色 研究中对免疫细胞和基质细胞的比较可能存在偏差,且样本量相对较少 该研究旨在揭示皮肤不同细胞类型中HLA表达的特征及其在皮肤发育中的动态变化 研究对象为人类皮肤中的多个细胞类型,包括正常成人皮肤、胎儿皮肤及毛囊 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涵盖成人和胎儿皮肤样本,及15、17和22孕周的胎儿皮肤
12870 2024-08-04
Large-scale deorphanization of Nematostella vectensis neuropeptide G protein-coupled receptors supports the independent expansion of bilaterian and cnidarian peptidergic systems
2024-May-10, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究对海葵中的神经肽G蛋白偶联受体进行了大规模去孤儿化,揭示了腔肠动物和双侧动物神经肽系统的独立扩展 研究发现了31个受体被特定的神经肽激活,并揭示了腔肠动物中神经肽信号传导的独立扩展 没有直接的双侧动物神经肽系统的同源性支持 探索腔肠动物中神经肽及其受体的扩展 海葵中的神经肽及其G蛋白偶联受体 NA NA 药理学筛选 NA 单细胞测序数据 64个肽,来自33个前体
12871 2024-08-05
Aberrant cell state plasticity mediated by developmental reprogramming precedes colorectal cancer initiation
2023-03-29, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 该文章探讨了细胞状态可塑性的改变如何在结直肠癌发生之前发挥作用 提出了通过再生活性和发育重编程介导的异常细胞状态可塑性在癌症发生前的作用 研究主要基于小鼠模型,临床应用需进一步验证 研究细胞状态可塑性在结直肠癌发生中的角色 基因工程和致癌物诱导的小鼠模型和患者样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 基因组数据 来自小鼠模型的前癌变病变和一个患者的样本
12872 2024-08-05
Dysregulated miRNAs modulate tumor microenvironment associated signaling networks in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Mar, Precision clinical medicine IF:5.1Q1
研究论文 该文章探讨了微调miRNAs在胰腺导管腺癌(Tumor Microenvironment, TME)中的作用 本文创新性地重点分析了miRNAs如何影响胰腺导管腺癌微环境的信号网络,并提出了它们作为潜在的诊断和预后生物标志物的应用 研究主要集中于PDAC的miRNA表达,限制了对其他癌症类型的比较和理解 旨在深入理解miRNAs对胰腺导管腺癌微环境重塑的影响 主要研究来自胰腺导管腺癌患者的plasma和肿瘤组织中的miRNAs及其调控的信号通路 数字病理学 胰腺癌 RNA-seq, miRNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) NA RNA数据 在研究中涉及了PDAC患者的plasma和肿瘤组织样本
12873 2024-08-05
Culture shock: microglial heterogeneity, activation, and disrupted single-cell microglial networks in vitro
2022-03-28, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 本研究探讨了微胶质细胞在离体培养条件下的异质性和激活情况 揭示了培养的微胶质细胞在转录上表现出显著的异质性,并且在激活的表型与其正常状态之间转变的关键驱动因素 离体培养的微胶质细胞不能完全代表体内的微胶质细胞特性 研究离体培养的微胶质细胞是否能够再现体内微胶质细胞的特征 基于单细胞RNA测序比较从大脑新鲜分离的微胶质细胞与初级微胶质细胞培养物 数字病理学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 (scRNAseq) CAUSAL PREDICTIVE NETWORK MODELS 基因表达数据 比较了新鲜分离的微胶质细胞与初级微胶质细胞培养物的样本
12874 2024-08-05
Lysosomal exocytosis of HSP70 stimulates monocytic BMP6 expression in Sjögren's syndrome
2022-03-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示了HSP70的溶酶体外排对干燥综合症中的BMP6表达的刺激作用 首次确认HSP70作为TLR4的内源性配体,揭示了LAMP3/HSP70/BMP6在干燥综合症中的作用机制 研究主要依赖于细胞实验和小鼠模型,缺乏大规模临床验证 探讨干燥综合症中BMP6的产生机制及其调控因子 主要研究SS患者的唾液腺以及与之相关的细胞机制 数字病理学 干燥综合症 RNA测序, 反转录PCR NA RNA 使用SS患者的唾液腺样本及小鼠实验
12875 2024-08-05
Single-cell transcriptomics reveals expression profiles of Trypanosoma brucei sexual stages
2022-03, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究揭示了植物瘤虫Trypanosoma brucei性阶段的表达谱。 使用单细胞RNA测序技术分析了感染了茧蝇的三种不同组织中的植物瘤虫,通过电子基因表达来识别组织特异性细胞类型 需要进一步实验以确定未知功能的蛋白质是否在配子形成和/或融合中起到作用 本研究旨在探索植物瘤虫的性生殖分子特征及其进化 研究对象为388个来自感染茧蝇的不同组织的单个植物瘤虫 生物信息学 非洲锥虫病 单细胞RNA测序 NA RNA表达数据 388个植物瘤虫样本
12876 2024-08-05
Endothelial Reprogramming by Disturbed Flow Revealed by Single-Cell RNA and Chromatin Accessibility Study
2020-12-15, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 这篇文章研究了受扰流对内皮细胞的重编程影响 该研究揭示了扰流如何导致内皮细胞从抗动脉粥样硬化表型转变为促动脉粥样硬化表型及其潜在的新型免疫细胞样表型 NA 深入理解扰流对内皮细胞基因表达的机制 来自小鼠部分颈动脉结扎模型的内皮细胞 数字病理学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq) NA 细胞数据 来自左侧和右侧颈动脉的内皮细胞
12877 2024-08-04
The role of FERMT2 in the tumor microenvironment and immunotherapy in pan-cancer using comprehensive single-cell and bulk sequencing
2024-May-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 该文章探讨了FERMT2在肿瘤微环境及免疫治疗中的作用 该研究结合单细胞和大规模测序技术,首次全面分析了FERMT2在不同癌症类型中的免疫特征和预后意义 研究的具体方法和样本数量在摘要中未提及,可能影响结果的普适性 本研究旨在评估FERMT2在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 研究对象为在肿瘤微环境中表达FERMT2的不同癌症类型的细胞 数字病理学 泛癌症 单细胞测序、复合免疫荧光染色 NA 组织切片数据 NA
12878 2024-08-04
Pan-cancer analysis for the prognostic and immunological role of CD47: interact with TNFRSF9 inducing CD8 + T cell exhaustion
2024-May-08, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究探讨了CD47在癌症免疫治疗中的作用及其与CD8+ T细胞耗竭的关系 揭示了CD47影响多种癌症类型中CD8+ T细胞耗竭的机制,并提出将CD47和TNFRSF9作为免疫治疗的新靶点 未详细讨论CD47在不同癌症微环境中的具体作用机制 阐明CD47在癌症免疫微环境中的预后和免疫学相关性 本研究对象包括多种癌症类型的患者及其肿瘤样本 数字病理学 泛癌症 单细胞测序技术 NA 基因表达数据 多个癌症类型的患者队列
12879 2024-08-05
Transcriptomic imputation of genetic risk variants uncovers novel whole-blood biomarkers of Parkinson's disease
2024-May-08, NPJ Parkinson's disease
研究论文 本研究探讨了基因表达特征作为帕金森病生物标志物的潜力 发现PATL2基因作为临床和前驱性帕金森病的潜在生物标志物 未在不同人群中验证结果的广泛性 通过转录组插补发现新的全血生物标志物用于帕金森病 转录组插补生成的全血基因表达签名 数字病理学 帕金森病 RNA测序 随机森林分类器 基因表达数据 1176个帕金森病患者、254个前驱症状患者和860个健康对照
12880 2024-08-05
Molecular Basis of Neuronal and Microglial States in the Aging Brain and Impact on Cerebral Blood Vessels
2024-Apr-18, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文介绍了神经元和胶质细胞在衰老过程中的变化及其对大脑微环境的影响 探讨了单细胞RNA测序和蛋白质组学等技术在研究大脑衰老过程中动态变化的应用 未明确指出具体的研究限制 理解大脑衰老过程中神经元和胶质细胞的状态变化 研究大脑衰老中神经元、胶质细胞及其相互作用 数字病理学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA NA NA
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