单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
12841 2024-08-07
Unraveling the complex pathophysiology of white matter hemorrhage in intracerebral stroke: A single-cell RNA sequencing approach
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究旨在阐明白质出血(WMH)在脑内出血(ICH)中的细胞动态和病理生理机制 采用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,深入分析了WMH后的细胞变化和基因表达 NA 阐明白质出血在脑内出血中的细胞动态和病理生理机制 脑内出血中的白质出血 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 从脑内出血后第三天的同侧纹状体出血区域提取的单细胞悬液
12842 2024-08-04
Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize
2024-01-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究分析了玉米胚乳分化过程中的基因调控网络 首次利用单细胞转录组技术解剖玉米胚乳的基因调控网络 本研究仅关注于玉米的胚乳,不一定适用于其他作物的研究 揭示玉米胚乳发育过程中的基因调控机制 发育中的玉米胚乳,分析细胞分化的转录组数据 数字病理学 NA 单细胞转录组技术 NA 转录组数据 17,022个单细胞
12843 2024-08-07
Single-cell genome-wide association reveals that a nonsynonymous variant in ERAP1 confers increased susceptibility to influenza virus
2022-Nov-09, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文开发了一种名为scHi-HOST的单细胞高通量人类易感性测试方法,用于快速识别影响抵抗力和易感性的遗传变异,并应用于流感A病毒的研究 scHi-HOST方法结合单细胞RNA测序技术,能够在混合感染的细胞系中同时确定遗传身份,揭示与病毒负担相关的遗传变异,并识别表达数量性状位点 NA 研究流感A病毒的遗传易感性 流感A病毒及相关的遗传变异 基因组学 流感 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA数据 涉及欧洲、非洲和亚洲起源的细胞系及人类志愿者
12844 2024-08-07
Single-cell analysis of angiotensin-converting enzyme II expression in human kidneys and bladders reveals a potential route of 2019 novel coronavirus infection
2021-Apr-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类肾脏和膀胱中血管紧张素转换酶II(ACE2)的表达,探讨了2019新型冠状病毒(2019-nCoV)感染泌尿系统的潜在途径 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了ACE2在肾脏和膀胱细胞中的表达分布,为理解2019-nCoV感染泌尿系统的机制提供了新的视角 研究仅限于健康肾脏和膀胱样本,未涉及疾病状态下的ACE2表达情况 探讨2019-nCoV感染泌尿系统的潜在途径及肾脏损伤的可能原因 人类肾脏和膀胱细胞中ACE2的表达 数字病理学 新型冠状病毒肺炎 单细胞RNA测序 NA RNA 三个已发表的肾脏细胞图谱数据集和两个自产的健康肾脏样本,以及三个膀胱样本
12845 2024-08-07
Disparate Interferon Signaling and Shared Aberrant Basaloid Cells in Single-Cell Profiling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis and Systemic Sclerosis-Associated Interstitial Lung Disease
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了特发性肺纤维化(IPF)和系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)患者的肺组织样本,以分析细胞类型特异性转录组的共性和差异 首次在SSc-ILD中鉴定出表现出细胞衰老和上皮-间质转化标志的异常基底样细胞 NA 探讨IPF和SSc-ILD之间细胞类型和信号通路的差异,以及这些差异在两种疾病中的作用 IPF和SSc-ILD患者的肺组织样本 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 21个移植肺组织样本
12846 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing of lung adenocarcinoma reveals heterogeneity of immune response-related genes
2019-02-21, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌中的免疫反应相关基因的异质性 发现IFN-γ信号通路基因在单个癌细胞中异质表达并与MHC II类基因共同调控,以及肿瘤特异性抗原在单细胞中的表达异质性 尚未完全探索影响临床结果和患者选择的异质性类型 研究肺腺癌中单细胞水平免疫反应相关基因的异质性及其对免疫治疗效果的影响 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据和细胞系 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及肺腺癌患者和细胞系的单细胞RNA测序数据
12847 2024-08-04
Set7 Methyltransferase and Phenotypic Switch in Diabetic Glomerular Endothelial Cells
2024-Apr-17, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了Set7甲基转移酶在糖尿病肾病(DKD)中对肾小管内皮细胞功能的影响 揭示了Set7在糖尿病肾小管内皮细胞表型转变中的调控作用,并表明靶向Set7可能保护肾小管细胞损伤 本研究主要在小鼠模型中进行,未来需要更多人类样本的验证 研究Set7在糖尿病肾病中对内皮细胞功能的作用 以糖尿病小鼠模型为研究对象 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞转录组学 NA RNA-seq 小鼠模型和人类肾脏细胞
12848 2024-08-07
Dynamic Hippo pathway activity underlies mesenchymal differentiation during lung alveolar morphogenesis
2024-Apr-05, Development (Cambridge, England)
研究论文 研究探讨了Hippo信号通路在肺泡形态发生中调节次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)功能的动态变化 首次揭示了Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF功能、增殖和时间身份的调节作用 NA 研究Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF的调节作用 次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)及其在肺泡形态发生中的作用 数字病理学 NA RNA测序 NA RNA 从报告鼠中纯化的SCMF细胞
12849 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing of pediatric renal tissues revealed the potential relationship between immunoglobulin A nephropathy and immunoglobulin A vasculitis with nephritis
2024-04, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12850 2024-08-04
Intermittent fasting promotes type 3 innate lymphoid cells secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-03-27, eLife IF:6.4Q1
研究论文 这篇文章研究了间歇性禁食如何促进3型固有淋巴细胞分泌IL-22,进而有助于白色脂肪组织的变白。 文章首次揭示了肠道ILC3s在白色脂肪组织变白中的作用,以及ILC3/IL-22/IL-22R轴对间歇性禁食代谢益处的贡献 文章未提及临床试验或人类数据的支持 探讨间歇性禁食对代谢的益处及其机制 研究对象为小鼠,特别是饮食诱导肥胖的小鼠 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 生物样本 饮食诱导肥胖的小鼠
12851 2024-08-04
Distinct fibroblast subpopulations associated with bone, brain or intrapulmonary metastasis in advanced non-small-cell lung cancer
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究探讨了与骨、脑或肺内转移相关的非小细胞肺癌中的成纤维细胞亚群。 本研究首次在单细胞水平上区分和分析了与骨转移、大脑转移和肺内转移相关的成纤维细胞亚群。 本研究的样本量较小,仅分析了14个组织活检样本,限制了结果的广泛适用性。 研究非小细胞肺癌中成纤维细胞与转移之间的关系。 重点分析了14例具有骨转移、脑转移或肺内转移的晚期非小细胞肺癌患者的组织样本。 数字病理学 肺癌 单细胞测序 NA 细胞 14个组织活检样本
12852 2024-08-04
Spatial transcriptomics reveals prognosis-associated cellular heterogeneity in the papillary thyroid carcinoma microenvironment
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究利用空间转录组技术揭示了乳头状甲状腺癌微环境中的预后相关细胞异质性 本文通过开发空间RNA临床分析方法,首次揭示了乳头状甲状腺癌微环境中的细胞异质性与预后之间的相关性 研究仅分析了五个乳头状甲状腺癌组织切片,样本量相对较小,可能影响结论的普适性 探讨乳头状甲状腺癌微环境中的细胞异质性及其对预后的影响 乳头状甲状腺癌患者的肿瘤组织切片 数字病理 甲状腺癌 空间转录组技术 NA RNA表达数据 5个乳头状甲状腺癌组织切片
12853 2024-08-07
Unlocking the potential of T-cell metabolism reprogramming: Advancing single-cell approaches for precision immunotherapy in tumour immunity
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文探讨了单细胞RNA测序技术在解析T细胞亚群及其代谢状态中的应用,以及这些代谢途径如何影响肿瘤微环境中的T细胞功能 本文揭示了T细胞代谢重编程与免疫功能之间的相互作用,为精准免疫治疗提供了新的视角 NA 探索T细胞代谢与免疫功能之间的相互作用机制,以推动精准免疫治疗的发展 T细胞的代谢途径及其在肿瘤微环境中的功能 免疫学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA NA
12854 2024-08-07
Mechanism and endoscopic-treatment-induced evolution of biliary non-anastomotic stricture after liver transplantation revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝移植后胆道非吻合口狭窄的机制及内镜治疗引起的演变 首次对胆道并发症患者的胆管进行单细胞转录组测序,分析了非吻合口狭窄及内镜治疗期间多种细胞类型的比例和表型变化 样本采集不足且缺乏公认的动物模型 揭示肝移植后胆道非吻合口狭窄的病理生理和遗传机制及内镜治疗引起的演变 肝移植后胆道非吻合口狭窄患者 数字病理学 肝移植并发症 单细胞RNA测序 NA RNA 来自接受连续胆道支架植入的非吻合口狭窄患者的胆管样本
12855 2024-08-07
Integrating single-cell and spatial transcriptomes reveals COL4A1/2 facilitates the spatial organisation of stromal cells differentiation in breast phyllodes tumours
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了COL4A1/2在乳腺叶状肿瘤中促进间质细胞空间组织分化的作用 首次揭示了COL4A1/2在乳腺叶状肿瘤中间质细胞空间组织分化的作用,并发现了新的诊断标志物 NA 阐明乳腺叶状肿瘤中的细胞亚群组成和空间结构,并探索其发病机制中的诊断标志物 乳腺叶状肿瘤及其周围正常组织 数字病理学 乳腺肿瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光实验、激光捕获显微切割、数据非依赖性采集质谱 NA 转录组数据 30个样本来自11个乳腺叶状肿瘤
12856 2024-08-07
Single-cell sequencing reveals alterations in the peripheral blood mononuclear cell landscape and monocyte status during colorectal adenocarcinoma formation
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12857 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing unveils an Odc1-marked endothelial subpopulation critical for pathological angiogenesis
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12858 2024-08-04
Spatial transcriptomics reveals heterogeneity of histological subtypes between lepidic and acinar lung adenocarcinoma
2024-02, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文探讨了早期肺腺癌不同组织学亚型之间的异质性。 提出了一种在单细胞水平上评估患者组织学亚型的新方法,揭示了肿瘤内皮细胞对免疫反应的抑制作用。 研究样本量较小,仅包含11名手术后患者,可能限制了结果的普遍适用性。 研究早期肺腺癌不同组织学亚型的临床意义以及其在单细胞层面的异质性。 研究对象为11名病理确认的早期IA期肺腺癌患者。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和数字空间分析(DSP) NA 组织样本 11名早期IA期肺腺癌患者的样本
12859 2024-08-04
Integrative single-cell characterization of a frugivorous and an insectivorous bat kidney and pancreas
2024-01-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该文章研究了蝙蝠的肾脏和胰腺的细胞和分子特点 通过整合的单细胞测序揭示水果食性和昆虫食性蝙蝠在细胞群体、基因表达和调控元素上的关键差异 主要研究限于特定的水果蝙蝠和昆虫蝙蝠,可能无法完全代表其他物种 探究水果食性蝙蝠及其与人类疾病的关系 水果蝙蝠(如牙买加水果蝙蝠)和昆虫蝙蝠(如大棕蝙蝠) NA 糖尿病 scRNA-seq和scATAC-seq NA 细胞 NA
12860 2024-08-04
Molecular features of luminal breast cancer defined through spatial and single-cell transcriptomics
2024-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析了ER+乳腺癌中的细胞群体特征 研究揭示了ER+乳腺癌中四个空间上不同的细胞区室及其功能多样性 研究的结果需在更大样本中进行验证以确保普遍适用性 探讨ER+乳腺癌中细胞空间异质性及其对激素依赖性肿瘤生长的重要性 使用来自患者的异种移植模型(PDXs)进行分析 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 两个ER高的PDX模型和一个ER低的PDX模型
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