单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
12841 2024-08-07
Treatment resistance in pancreatic and biliary tract cancer: molecular and clinical pharmacology perspectives
2024-Apr, Expert review of clinical pharmacology IF:3.6Q2
研究论文 本文综述了胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子和临床药理学视角,探讨了当前治疗方案及其抵抗机制,并提出了克服这些障碍的策略。 本文提出了通过个性化患者方法和人工智能应用来指导有效治疗策略的新思路。 目前尚未形成统一的治疗抵抗理论,进展有限。 旨在识别和克服胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子机制,以改善患者治疗效果。 胆道癌和胰腺癌的治疗抵抗机制及其克服策略。 NA 胆道癌、胰腺癌 NA NA NA NA
12842 2024-08-07
Irisin delays the onset of type 1 diabetes in NOD mice by enhancing intestinal barrier
2024-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究探讨了irisin激素通过增强结肠肠屏障功能来延缓1型糖尿病(T1D)在NOD小鼠中的发病 首次揭示了irisin通过调节AMPK/PI3K/AKT通路和增加MUC3表达来增强结肠肠屏障功能,从而延缓T1D的发病 NA 研究irisin是否能通过增强结肠肠屏障来延缓T1D的发病 1型糖尿病(T1D)患者和非肥胖糖尿病(NOD)小鼠 NA 1型糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
12843 2024-08-04
Deciphering the molecular landscape: integrating single-cell transcriptomics to unravel myofibroblast dynamics and therapeutic targets in clear cell renal cell carcinomas
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该文章探讨了在透明细胞肾细胞癌中,单细胞转录组学揭示的肌成纤维细胞动态及治疗靶点 首次利用单细胞转录组分析深入探讨肌成纤维细胞与肿瘤细胞的相互作用和信号通路 目前缺乏对其他细胞类型相互作用的详细分析 揭示透明细胞肾细胞癌中肌成纤维细胞的动态及其作为治疗靶点的潜力 透明细胞肾细胞癌中的肌成纤维细胞亚群及其与肿瘤的相互作用 数字病理学 肾癌 单细胞转录组分析 NA RNA-seq ccRCC人群中涉及大量样本
12844 2024-08-04
Single-cell sequencing analysis and multiple machine-learning models revealed the cellular crosstalk of dendritic cells and identified FABP5 and KLRB1 as novel biomarkers for psoriasis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究分析了树突状细胞与T细胞在牛皮癣中的相互作用,并确定FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 揭示了FABP5和KLRB1在牛皮癣发病机制中的新角色,并提出了它们作为潜在生物标志物的可能性 研究可能受到样本数量或样本多样性的限制 识别牛皮癣的关键生物标志物并阐明其发病机制 研究对象为牛皮癣患者的皮肤组织和相关细胞 数字病理学 牛皮癣 单细胞测序、机器学习 NA 多层次数据 牛皮癣皮肤组织样本和M5诱导的HaCaT细胞
12845 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals SERPINE1-expressing CAFs remodelling tumour microenvironment in recurrent osteosarcoma
2024-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12846 2024-08-07
Single-cell landscape of the cellular microenvironment in three different colonic polyp subtypes in children
2024-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学分析,探讨了儿童结肠息肉不同亚型的细胞微环境特征 识别了不同结肠息肉亚型中共有的和疾病特异性的细胞亚群及表达模式,揭示了这些细胞在塑造独特细胞微环境中的重要作用 NA 加深对儿童结肠息肉异质性细胞微环境的理解,并识别潜在的治疗策略以减少息肉的复发 儿童结肠息肉的三种不同亚型:孤立性幼年息肉(SJPs)、息肉病综合征(PJS)和Peutz-Jeghers综合征(PJS) 数字病理学 结肠息肉 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学(mIHC) NA 细胞 从儿童患者中获得的正常结肠组织和不同类型的结肠息肉样本
12847 2024-08-07
Cellular plasticity in the breast cancer ecosystem
2024, Upsala journal of medical sciences IF:1.5Q2
综述 本文综述了乳腺癌生态系统中细胞可塑性和异质性的最新发现,重点讨论了癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的作用。 文章揭示了乳腺癌细胞表现出由内在遗传因素和外部微环境信号驱动的表型可塑性,并探讨了单细胞RNA测序研究揭示的CAFs和TAMs的多样性亚型及其在肿瘤微环境中的功能基因表达程序和空间组织。 NA 理解细胞表型的层次关系和微环境信号,为靶向治疗干预提供新机会。 乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
12848 2024-08-04
Single-cell and spatial transcriptomics reveal POSTN+ cancer-associated fibroblasts correlated with immune suppression and tumour progression in non-small cell lung cancer
2023-12, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞与非小细胞肺癌中的免疫抑制和肿瘤进展的相关性 识别了POSTN+成纤维细胞亚群,与肿瘤进展和免疫抑制相关 研究局限于16例NSCLC患者的样本,且仅分析特定的CAF亚群 探讨癌症相关成纤维细胞在非小细胞肺癌进展中的作用 对16例非小细胞肺癌患者的肿瘤及其相邻样本进行单细胞转录组测序 数字病理学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序,SpaTial增强分辨率组学测序,免疫组化 NA RNA数据 16名非小细胞肺癌患者的肿瘤和相邻样本
12849 2024-08-07
Immunological link between periodontitis and type 2 diabetes deciphered by single-cell RNA analysis
2023-12, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了牙周炎与2型糖尿病之间的免疫学联系 首次揭示了2型糖尿病如何加剧T/NK细胞免疫的恶化以及牙周炎与糖尿病之间的免疫学基础 样本量较小,可能影响结果的普遍性 旨在比较单纯牙周炎患者与同时患有牙周炎和2型糖尿病患者的免疫反应,以扩展对牙周炎与糖尿病复杂联系的理解 外周血单个核细胞 NA 2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA 11名健康对照者,10名单纯牙周炎患者,6名同时患有牙周炎和2型糖尿病的患者
12850 2024-08-04
Crosstalk between alternative splicing and inflammatory bowel disease: Basic mechanisms, biotechnological progresses and future perspectives
2023-11, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
综述 这篇文章总结了替代剪接与炎症性肠病之间的关系,以及相关的生物技术进展和未来的前景 这是首个评估替代剪接事件在炎症性肠病中潜在调控机制的综述 文章未详细讨论所有潜在的异常剪接基因及其机制 探讨替代剪接在炎症性肠病发病机制中的作用 涉及炎症性肠病中的异常替代剪接事件及其相关分子 数字病理学 炎症性肠病 下一代测序(NGS)、微阵列、第三代测序(TGS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组 数据 NA
12851 2024-08-07
Single-cell sequencing of multi-region resolves geospatial architecture and therapeutic target of endothelial cells in esophageal squamous cell carcinoma
2023-11, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12852 2024-08-04
A unified pipeline for FISH spatial transcriptomics
2023-Sep-13, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文提出了一个名为PIPEFISH的统一分析管道,用于FISH空间转录组学的转录注释 PIPEFISH是一个半自动化且可推广的管道,改进了已有的starfish库,以解决空间转录组学数据分析缺乏标准化工具的问题 该论文未提及PIPEFISH在特定情况下的性能限制或适用範围 旨在提供一种标准化的工具来分析FISH空间转录组学数据 使用PIPEFISH对来自三种不同FISH图像实验的真实数据集进行转录注释 数字病理学 NA FISH NA 图像 三个不同类型的FISH图像实验的真实数据集
12853 2024-08-04
Single-cell analysis reveals the multiple patterns of immune escape in the nasopharyngeal carcinoma microenvironment
2023-06, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 该研究揭示了鼻咽癌微环境中免疫逃逸的多种模式。 首次识别了特定于鼻咽癌微环境的CD8+自然杀伤细胞集群,并展示了肿瘤细胞中主要组织相容性复合体分子的丧失等免疫逃逸机制。 该技术未能捕捉到上皮/肿瘤细胞,限制了对肿瘤异质性和免疫逃逸的进一步研究。 分析鼻咽癌肿瘤细胞的转录组和空间特性。 鼻咽癌肿瘤细胞。 数字病理学 鼻咽癌 scRNA/snRNA-seq和成像质谱细胞术 NA 转录组数据 NA
12854 2024-08-04
Prioritization of Monogenic Congenital Anomalies of the Kidney and Urinary Tract Candidate Genes with Existing Single-Cell Transcriptomics Data of the Human Fetal Kidney
2023, Nephron IF:2.3Q2
研究论文 本研究利用人类胎儿肾脏的单细胞转录组学数据,优先考虑单基因先天性肾脏和尿道异常(CAKUT)候选基因。 提出了通过时间轴上的共表达模式来优先选择CAKUT候选基因的独立方法,识别出新的CAKUT候选基因 仅分析了已知CAKUT基因的共表达,可能未考虑所有潜在的候选基因 优先考虑人类先天性肾脏和尿道异常的候选基因 已知的40个CAKUT基因及其在肾脏发育中的共表达模式 数字病理学 先天性肾脏和尿道异常 单细胞mRNA转录组学 NA RNA数据 研究了40个已知基因和100个在肾小管祖细胞中高表达的基因
12855 2024-08-04
Stemness-related genes revealed by single-cell profiling of naïve and stimulated human CD34+ cells from CB and mPB
2023-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自脐带血和动员外周血的人类CD34+细胞中的干性相关基因 揭示了干性相关基因与细胞来源和培养时间的关系,并发现了小分子药物对扩展HSCs的有效性 本研究中样本数量相对较少,可能影响结果的普遍性 深入理解不同来源的造血干细胞的特性及其干性维持机制 脐带血和动员外周血的人类CD34+细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞数据 超过16000个高质量单细胞数据
12856 2024-08-04
Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression
2024-Apr-16, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 本研究阐明了肝硬化中CD8+ T细胞亚群的异质性及其对疾病进展的影响 首次定义了在肝硬化中具有特殊功能的CD8+ T细胞亚群,特别是与免疫失调和疾病进展相关的CXCL13+ Tex细胞 研究未明确探讨这些细胞在临床治疗中的实际应用 探讨肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 研究了CD8+ T细胞亚群在肝硬化患者中的表达和功能 数字病理学 肝癌 转录组分析和单细胞测序 NA RNA-seq数据和单细胞数据 NA
12857 2024-08-04
Deciphering the prognostic landscape of osteosarcoma: Integrating the roles of hippo pathway genes, programmed cell death, and the tumor immune microenvironment
2024-Apr-15, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了Hippo信号通路基因在骨肉瘤中的预后价值以及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 发现了131个与Hippo通路相关的基因,鉴定了8个与患者预后显著相关的关键基因 本研究可能受到样本量和数据集的限制,可能影响结果的普遍性和适用性 旨在理解骨肉瘤的分子基础及其与肿瘤免疫微环境的关系 研究对象为骨肉瘤患者及其相关的基因表达数据 数字病理学 骨肉瘤 转录组测序 生存分析模型 基因表达数据 涉及TARGET-OS数据集及GTEx控制样本的分析
12858 2024-08-07
Cell Type- and Age-Specific Expression of lncRNAs across Kidney Cell Types
2024-Apr-15, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究采用靶向单细胞RNA测序方法,分析了不同细胞类型和年龄阶段肾脏细胞中长非编码RNA(lncRNA)的表达情况 首次构建了不同细胞类型中lncRNA的转录组图谱,并探讨了lncRNA在肾脏老化中的功能角色 lncRNA的功能仍不完全清楚,需要进一步的研究来阐明其在细胞分化和稳态中的具体作用 揭示lncRNA在肾脏细胞类型和年龄特异性表达中的作用 肾脏细胞中的长非编码RNA(lncRNA) 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 包括正常和老龄小鼠的多种组织
12859 2024-08-07
Single-cell RNA-sequencing of virus-specific cellular immune responses in chronic hepatitis B patients
2024-Apr-08, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术研究慢性乙型肝炎患者的HBV特异性细胞免疫反应 创建了HBV免疫反应的单细胞RNA测序数据集,有助于更好地理解失调的免疫反应 NA 探索慢性乙型肝炎患者中HBV特异性T细胞反应的转录变化 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏组织样本 数字病理学 乙型肝炎 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 21名慢性乙型肝炎患者和10名健康对照者的血液样本,以及5份匹配的肝脏活检样本
12860 2024-08-04
Histone 3 lysine 9 acetylation-specific reprogramming regulates esophageal squamous cell carcinoma progression and metastasis
2024-Apr, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了H3K9ac在食道鳞状细胞癌(ESCC)进展和转移中的特定作用 识别了ESCC中H3K9ac特异性的表观遗传重编程及其与肿瘤发生和转移的关系 仅分析了三个ESCC患者的样本,样本量较小 揭示H3K9ac在食道鳞状细胞癌进展和转移中的作用 食道鳞状细胞癌(ESCC)患者的配对正常组织、原发肿瘤和转移淋巴结组织 数字病理 食道癌 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 3名食道鳞状细胞癌患者的配对样本
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