单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12821 - 12840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12821 | 2024-08-04 |
Comparative analysis of single-cell transcriptome reveals heterogeneity and commonality in the immune microenvironment of colorectal cancer and inflammatory bowel disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1356075
PMID:38529274
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研究论文 | 本文分析了结直肠癌（CRC）和炎症性肠病（IBD）免疫微环境的异质性和共性 | 首次通过单细胞转录组分析深入探讨了CRC和IBD的细胞通信及其与衰老和炎症反应的关系 | 未详细阐明分子机制，且样本数虽大但仍可能不足以覆盖所有变异 | 旨在理解衰老、炎症与肿瘤在CRC和IBD中的特征 | 研究对象为92名CRC患者和24名IBD患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 432,314个单细胞，来自92名CRC患者和24名IBD患者 |
| 12822 | 2024-08-04 |
Spatially distinct molecular patterns of gene expression in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Nov-17, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02572-6
PMID:37978501
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研究论文 | 本研究展示了特发性肺纤维化（IPF）中表面正常的肺组织在转录上的差异 | 应用空间转录组学平台识别了IPF与正常对照组在不同肺区域的转录差异 | 样本量相对较小，仅包括32个IPF和12个对照受试者 | 旨在理解IPF肺部的病理异质性及其可能的治疗靶点 | 研究对象为特发性肺纤维化患者及正常对照的肺组织样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学 (GeoMx Nanostring Digital Spatial Profiling) | NA | 组织样本 | 32个IPF样本和12个对照样本 |
| 12823 | 2024-08-05 |
Phylogenomics of novel ploeotid taxa contribute to the backbone of the euglenid tree
2023 Jul-Aug, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.12973
PMID:36912454
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研究论文 | 这篇文章描述了新的ploeotid类群在euglenid谱系中的重要性和演化关系。 | 该研究通过光学显微镜和单细胞转录组学特征分析新的ploeotid类群，并在多基因系统发育框架中定位它们。 | 尚有一些taxa未被纳入多基因系统发育的分析，可能影响对谱系的全面理解。 | 研究ploeotid类群在euglenid演化中的角色和关系。 | 重点研究了五个新的ploeotid euglena，并将其放入多基因系统发育框架。 | 生物信息学 | NA | 光学显微镜和单细胞转录组学 | 多基因系统发育模型 | NA | 五个ploeotid euglena |
| 12824 | 2024-08-07 |
Estradiol Augments Tumor-Induced Neutrophil Production to Promote Tumor Cell Actions in Lymphangioleiomyomatosis Models
2023-04-17, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad061
PMID:37042477
|
研究论文 | 本文研究了雌二醇在淋巴管平滑肌瘤病模型中通过促进中性粒细胞产生来增强肿瘤细胞作用的现象 | 首次报道了雌二醇通过促进中性粒细胞产生来间接促进肿瘤生长的机制 | NA | 探究雌二醇在淋巴管平滑肌瘤病中的作用机制 | 淋巴管平滑肌瘤病模型中的肿瘤细胞和中性粒细胞 | 数字病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用TSC2-null小鼠子宫肌细胞系和来自淋巴管平滑肌瘤病患者的单细胞RNA测序数据 |
| 12825 | 2024-08-07 |
A convolutional neural network for common coordinate registration of high-resolution histology images
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab447
PMID:34128955
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的卷积神经网络（CNN）架构，用于高分辨率组织学图像的通用坐标注册 | 提出了一种结合局部分类CNN和全局分割CNN的混合网络架构，能够以端到端的方式训练，并在多个数据集上展示了其相对于竞争方法的优势 | NA | 解决大规模空间组学数据研究中组织学图像从多源注册的紧迫问题 | 高分辨率组织学图像的注册 | 计算机视觉 | NA | 卷积神经网络（CNN） | CNN | 图像 | 参考组织学数据集以及两个已发表的空间转录组数据集 |
| 12826 | 2024-08-07 |
An Nfil3-Zeb2-Id2 pathway imposes Irf8 enhancer switching during cDC1 development
2019-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0449-3
PMID:31406377
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研究论文 | 本文研究了经典类型1树突状细胞（cDC1s）发育过程中的Irf8增强子切换机制 | 发现了Nfil3-Zeb2-Id2信号通路在cDC1发育中调控Irf8增强子切换的作用 | NA | 理解cDC1发育过程中的Irf8增强子切换机制 | cDC1树突状细胞的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 12827 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of fate-mapped macrophages reveals heterogeneity, including stem-like properties, during atherosclerosis progression and regression
2019-02-21, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.124574
PMID:30830865
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术，首次分析了在小鼠动脉粥样硬化进展和消退过程中，由CX3CR1+前体细胞衍生的斑块细胞的特征 | 研究揭示了比传统M1和M2极化状态更为复杂的巨噬细胞激活状态，并发现了一个意外的增殖性单核细胞簇，具有类似干细胞的特征 | NA | 探讨动脉粥样硬化进展和消退过程中巨噬细胞的异质性和特征 | 小鼠动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 12828 | 2024-08-07 |
Lung type 3 innate lymphoid cells respond early following Mycobacterium tuberculosis infection
2024-Apr-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03299-23
PMID:38407132
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研究论文 | 研究探讨了肺部类型3先天淋巴细胞（ILC3s）在结核分枝杆菌感染早期的反应机制 | 揭示了ILC3在结核分枝杆菌感染早期的激活和招募机制，特别是IL-1R信号通路和CXCR5信号通路的作用 | NA | 研究ILC3在结核分枝杆菌感染早期的反应机制及其作为潜在疫苗靶点的可能性 | 肺部类型3先天淋巴细胞（ILC3s）及其在结核分枝杆菌感染中的作用 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的肺部先天淋巴细胞（ILCs） |
| 12829 | 2024-08-07 |
Interferon Regulatory Factor 6 Determines Intestinal Epithelial Cell Development and Immunity
2024-Apr-09, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.03.013
PMID:38604478
|
研究论文 | 研究探讨了干扰素调节因子6（IRF6）在肠道上皮细胞（IEC）发育和免疫中的作用 | 首次揭示了IRF6在IEC生物学中的作用，包括调节上皮细胞发育和调节先天免疫反应以减少细胞毒性和维持屏障功能 | NA | 研究IRF6在肠道上皮细胞发育和免疫中的具体作用 | 肠道上皮细胞（IEC）和IRF6的功能 | NA | NA | CRISPR筛选，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及转化的鼠IEC和IEC类器官 |
| 12830 | 2024-08-04 |
Deciphering the cellular heterogeneity of the insect brain with single-cell RNA sequencing
2024-Apr, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.13270
PMID:37702319
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综述 | 本文回顾了昆虫大脑的基本结构及其与行为的关联，重点探讨学习和记忆相关的方面 | 介绍了单细胞RNA测序在昆虫大脑研究中的应用，揭示了细胞亚群的分类及发育轨迹 | 缺乏关于昆虫大脑功能调节如何具体作用的更深入解析 | 探讨昆虫大脑的细胞异质性及其对行为的影响 | 昆虫大脑的不同细胞类型及其连接和功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 12831 | 2024-08-04 |
Tumor-specific activation of folate receptor beta enables reprogramming of immune cells in the tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354735
PMID:38384467
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研究论文 | 该文章展示了肿瘤特异性激活叶酸受体β如何重编程肿瘤微环境中的免疫细胞 | 阐明了FRβ在肿瘤微环境中的特定作用以及其对免疫细胞重编程的影响 | 未明确提及研究的局限性 | 研究FRβ在肿瘤相关巨噬细胞中的功能及其对肿瘤微环境的重编程作用 | 主要研究肿瘤微环境中的免疫抑制性巨噬细胞及其功能变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12832 | 2024-08-07 |
Decoding the tumor microenvironment and molecular mechanism: unraveling cervical cancer subpopulations and prognostic signatures through scRNA-Seq and bulk RNA-seq analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1351287
PMID:38482016
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，深入分析宫颈癌的肿瘤微环境和分子机制，识别关键的肿瘤上皮细胞亚群及其对宫颈癌进展的影响 | 首次识别出C3 PLP2+肿瘤上皮祖细胞作为宫颈癌中的一个重要亚群，并建立了独立的预后指标PLP2+肿瘤EPCs评分 | NA | 深入理解影响宫颈癌进展的决定因素，提高对宫颈癌肿瘤微环境的认识，并为未来的宫颈癌治疗提供有价值的见解 | 宫颈癌的肿瘤上皮细胞亚群及其对疾病进展的影响 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq） | NA | RNA | 四份宫颈癌患者样本 |
| 12833 | 2024-08-07 |
Innovative prognostic modeling in ESCC: leveraging scRNA-seq and bulk-RNA for dendritic cell heterogeneity analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1352454
PMID:38515748
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA分析，深入探讨了食管鳞状细胞癌（ESCC）中树突状细胞的异质性及其对患者预后的影响 | 本研究通过scRNA-seq和批量RNA分析，揭示了树突状细胞在ESCC中的异质性，并开发了基于树突状细胞相关基因签名的预后模型 | NA | 深入研究食管鳞状细胞癌中树突状细胞的异质性及其对患者预后的影响 | 食管鳞状细胞癌中的树突状细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA分析 | NA | RNA | GSE53624队列（n = 119）、TCGA-ESCC队列（n = 139）、IMvigor210免疫治疗队列（n = 298） |
| 12834 | 2024-08-04 |
Cerebral organoids derived from patients with Alzheimer's disease with PSEN1/2 mutations have defective tissue patterning and altered development
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113310
PMID:37864790
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研究论文 | 本研究创建了一个来自阿尔茨海默病患者的脑类器官模型，探讨了早期事件和病理进程 | 利用来自具有PSEN1/2突变的阿尔茨海默病患者的诱导多能干细胞创建了特定的脑类器官，并发现了组织模式缺陷和发育改变 | 研究主要集中在体外模型上，可能不完全反映体内的病理情况 | 探讨阿尔茨海默病的早期病理事件和进展 | 利用来自家族性阿尔茨海默病患者的诱导多能干细胞生成的脑类器官 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 诱导多能干细胞(iPSC) | 脑类器官(CO) | 单细胞测序数据 | 来自三条阿尔茨海默病-iPSC线的样本 |
| 12835 | 2024-08-07 |
Inverse agonists of retinoic acid receptor/retinoid X receptor signaling as lineage-specific antitumor agents against human adenoid cystic carcinoma
2023-07-06, Journal of the National Cancer Institute
DOI:10.1093/jnci/djad062
PMID:37040084
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和异种移植实验，探讨了人腺样囊性癌中两种不同细胞类型的肿瘤起始能力和分化关系，并测试了视黄酸受体/视黄酸X受体信号通路作为特定治疗靶点的潜力。 | 首次揭示了腺样囊性癌中肌上皮样细胞作为导管样细胞的前体，并发现抑制视黄酸受体/视黄酸X受体信号通路对导管样细胞具有选择性毒性，为治疗提供了新策略。 | NA | 探索人腺样囊性癌中不同细胞类型的肿瘤起始能力和分化关系，并寻找特定治疗靶点。 | 人腺样囊性癌中的肌上皮样细胞和导管样细胞。 | 数字病理学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自人腺样囊性癌的患者源性异种移植模型。 |
| 12836 | 2024-08-07 |
Repression of the aryl-hydrocarbon receptor prevents oxidative stress and ferroptosis of intestinal intraepithelial lymphocytes
2023-04-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.01.023
PMID:36801011
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研究论文 | 研究揭示了芳基烃受体抑制剂（AHRR）对维持肠道上皮内淋巴细胞（IELs）的重要性，以及其缺乏导致的氧化应激和铁死亡 | 首次展示了AHRR在维持IELs中的关键作用，以及其缺乏如何导致氧化应激和铁死亡 | 研究主要集中在实验室模型和小鼠实验上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨AHRR在调节肠道免疫反应和防止氧化应激及铁死亡中的作用 | 肠道上皮内淋巴细胞（IELs）和芳基烃受体（AHR）及其抑制剂（AHRR） | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠模型和炎症性肠病患者的组织样本 |
| 12837 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing Reveals Molecular Mechanisms of Renal Injury in Essential Hypertension
2023, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000530624
PMID:37062270
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探索了原发性高血压肾损伤的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了高血压肾损伤早期细胞特异性基因表达的变化 | 研究仅限于大鼠模型，结果的临床应用需要进一步验证 | 识别高血压肾损伤的早期生物标志物和信号通路 | 高血压肾损伤的大鼠肾脏样本 | 数字病理学 | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 10,602个单细胞转录组来自2个对照组和2个早期高血压肾损伤样本 |
| 12838 | 2024-08-04 |
Unraveling the hidden complexity: Exploring dental tissues through single-cell transcriptional profiling
2024-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2024.03.023
PMID:38596822
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综述 | 本研究探讨了使用单细胞转录组技术对牙齿及周围组织的细胞组成进行分析 | 本文创新地采用单细胞转录组技术，揭示了哺乳动物牙齿和牙周组织的细胞复杂性 | 本综述主要集中在现有的单细胞转录组研究上，可能未涵盖所有相关研究 | 揭示牙齿生物学的复杂性以及相关细胞的组成和功能 | 对小鼠及人类牙齿和牙周组织进行单细胞转录组分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类的健康及龋齿牙齿的单细胞样本 |
| 12839 | 2024-08-07 |
The Impact of FBN1-α5β1 Axis in Fibro/Adipogenic Progenitor Cells (FAPCD9-) on Intramuscular Fat Content in Pigs
2024-Apr-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00059
PMID:38598771
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了广东小耳花猪（高IMF）和约克夏猪（低IMF）的背最长肌，发现高IMF猪具有更多的纤维/脂肪生成祖细胞（FAPs），而低IMF猪则表现出更高的FBN1-整合素α5β1轴表达，抑制了脂肪生成分化。 | 本研究首次揭示了FBN1-α5β1轴在纤维/脂肪生成祖细胞中的作用，及其对猪肌肉内脂肪含量的影响。 | NA | 探讨纤维/脂肪生成祖细胞及其相关分子轴在猪肌肉内脂肪含量中的作用。 | 广东小耳花猪和约克夏猪的背最长肌。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 广东小耳花猪和约克夏猪的背最长肌样本 |
| 12840 | 2024-08-04 |
Single-cell multiomics reveals the interplay of clonal evolution and cellular plasticity in hepatoblastoma
2024-Apr-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47280-x
PMID:38589411
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研究论文 | 该研究利用单细胞多组学策略揭示了肝母细胞瘤中克隆演变与细胞可塑性之间的相互作用 | 通过单细胞测序，研究了HB细胞状态的连续性及其差异化极性，并揭示了基因调控网络与转录因子激活序列 | 具体的机制尚不完全明了，且对临床结果的影响仍需进一步研究 | 解析肝母细胞瘤细胞可塑性的分子决定因素 | 肝母细胞瘤中的不同基因亚克隆及其细胞状态变化 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞多组学 | NA | 基因组数据，空间转录组数据 | NA |