单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
12821 2024-08-07
Mechanism and endoscopic-treatment-induced evolution of biliary non-anastomotic stricture after liver transplantation revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝移植后胆道非吻合口狭窄的机制及内镜治疗引起的演变 首次对胆道并发症患者的胆管进行单细胞转录组测序,分析了非吻合口狭窄及内镜治疗期间多种细胞类型的比例和表型变化 样本采集不足且缺乏公认的动物模型 揭示肝移植后胆道非吻合口狭窄的病理生理和遗传机制及内镜治疗引起的演变 肝移植后胆道非吻合口狭窄患者 数字病理学 肝移植并发症 单细胞RNA测序 NA RNA 来自接受连续胆道支架植入的非吻合口狭窄患者的胆管样本
12822 2024-08-07
Integrating single-cell and spatial transcriptomes reveals COL4A1/2 facilitates the spatial organisation of stromal cells differentiation in breast phyllodes tumours
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了COL4A1/2在乳腺叶状肿瘤中促进间质细胞空间组织分化的作用 首次揭示了COL4A1/2在乳腺叶状肿瘤中间质细胞空间组织分化的作用,并发现了新的诊断标志物 NA 阐明乳腺叶状肿瘤中的细胞亚群组成和空间结构,并探索其发病机制中的诊断标志物 乳腺叶状肿瘤及其周围正常组织 数字病理学 乳腺肿瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光实验、激光捕获显微切割、数据非依赖性采集质谱 NA 转录组数据 30个样本来自11个乳腺叶状肿瘤
12823 2024-08-07
Single-cell sequencing reveals alterations in the peripheral blood mononuclear cell landscape and monocyte status during colorectal adenocarcinoma formation
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12824 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing unveils an Odc1-marked endothelial subpopulation critical for pathological angiogenesis
2024-03, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12825 2024-08-04
Spatial transcriptomics reveals heterogeneity of histological subtypes between lepidic and acinar lung adenocarcinoma
2024-02, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文探讨了早期肺腺癌不同组织学亚型之间的异质性。 提出了一种在单细胞水平上评估患者组织学亚型的新方法,揭示了肿瘤内皮细胞对免疫反应的抑制作用。 研究样本量较小,仅包含11名手术后患者,可能限制了结果的普遍适用性。 研究早期肺腺癌不同组织学亚型的临床意义以及其在单细胞层面的异质性。 研究对象为11名病理确认的早期IA期肺腺癌患者。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和数字空间分析(DSP) NA 组织样本 11名早期IA期肺腺癌患者的样本
12826 2024-08-04
Integrative single-cell characterization of a frugivorous and an insectivorous bat kidney and pancreas
2024-01-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该文章研究了蝙蝠的肾脏和胰腺的细胞和分子特点 通过整合的单细胞测序揭示水果食性和昆虫食性蝙蝠在细胞群体、基因表达和调控元素上的关键差异 主要研究限于特定的水果蝙蝠和昆虫蝙蝠,可能无法完全代表其他物种 探究水果食性蝙蝠及其与人类疾病的关系 水果蝙蝠(如牙买加水果蝙蝠)和昆虫蝙蝠(如大棕蝙蝠) NA 糖尿病 scRNA-seq和scATAC-seq NA 细胞 NA
12827 2024-08-04
Molecular features of luminal breast cancer defined through spatial and single-cell transcriptomics
2024-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析了ER+乳腺癌中的细胞群体特征 研究揭示了ER+乳腺癌中四个空间上不同的细胞区室及其功能多样性 研究的结果需在更大样本中进行验证以确保普遍适用性 探讨ER+乳腺癌中细胞空间异质性及其对激素依赖性肿瘤生长的重要性 使用来自患者的异种移植模型(PDXs)进行分析 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 两个ER高的PDX模型和一个ER低的PDX模型
12828 2024-08-04
Digital spatial profiling of segmental outflow regions in trabecular meshwork reveals a role for ADAM15
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究采用空间转录组学方法识别与小梁网中的高或低排出区域相关的基因 研究发现ADAM15及其他基因在不同排出区域的表达有显著差异,揭示了新的与排出段流动相关的基因 研究主要集中于人类前房段的体外培养,可能在体内情况中存在差异 研究小梁网中影响房水排出区域基因的表达 高和低排出区域的基因表达 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 组织切片 人类前房段的组织样本
12829 2024-08-07
Preparation of Healthy Single Neuron or Astrocyte Suspension from Adult Mouse Brain for RNA-seq
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了优化脑切片蛋白酶消化方法,以从成年大脑中获得数百万健康细胞用于单细胞RNA测序 本文提出了一种优化蛋白酶消化脑切片的方法,提高了从成年大脑中获取健康单个神经细胞的效率 NA 研究单细胞RNA测序在神经科学中的应用 成年小鼠大脑中的单个神经元或星形胶质细胞 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 数百万个细胞
12830 2024-08-04
Integrative single-cell characterization of frugivory adaptations in the bat kidney and pancreas
2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 本文使用综合单细胞测序研究了蝙蝠肾脏和胰腺中的果食适应性 研究揭示了与果食适应性相关的关键细胞群体、基因表达和调控元件差异 研究可能只针对特定的蝙蝠种类,结果的普遍性尚待验证 研究果食适应性的细胞和分子机制 研究对象为昆虫食性和果食性蝙蝠的肾脏和胰腺 NA 糖尿病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA
12831 2024-08-04
Single cell and immunity: Better understanding immune cell heterogeneities with single cell sequencing
2023-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 单细胞测序在理解免疫细胞的异质性方面具有科学影响 探讨单细胞测序在免疫细胞功能多样性研究中的新进展和应用 需要更强的程序以及预临床和临床验证的确凿证据 旨在深入了解单细胞基础的免疫细胞异质性和功能 单细胞基础的免疫细胞在发展和疾病中的研究 数字病理学 NA 单细胞测序 NA NA NA
12832 2024-08-07
Fetal vs adult megakaryopoiesis
2022-06-02, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本文探讨了胎儿与成人巨核细胞生成的差异,并指出这些差异反映了发育过程中增殖、多倍体化和细胞质成熟之间的独特解耦 研究挑战了传统的巨核细胞起源范式,并利用单细胞RNA测序技术更好地描述了胚胎、胎儿和成人巨核细胞的特征 NA 研究胎儿与成人巨核细胞生成的差异及其分子机制 胎儿和成人巨核细胞及其前体细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
12833 2024-08-07
Modelling human blastocysts by reprogramming fibroblasts into iBlastoids
2021-Mar, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文描述了将成纤维细胞重编程为体外三维人类囊胚模型(称为iBlastoids)的方法 iBlastoids能够模拟囊胚的整体结构,包括内细胞团样结构、外胚层和原始内胚层样细胞、囊胚腔样腔隙以及滋养层样外层细胞,并能产生多能性和滋养层干细胞,模拟植入早期的几个方面 NA 开发一个可扩展且易于操作的系统来模拟人类囊胚生物学,以促进早期人类发育的研究 人类囊胚的生物学特性 细胞生物学 NA 单细胞转录组学 三维模型 细胞 NA
12834 2024-08-07
Single-cell RNA-Seq analysis identifies a putative epithelial stem cell population in human primary prostate cells in monolayer and organoid culture conditions
2019, American journal of clinical and experimental urology IF:1.5Q3
PMID:31317052
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了在单层和类器官培养条件下的人类原代前列腺上皮细胞中的细胞群体 首次在单层和类器官培养条件下识别出一种潜在的上皮干细胞群体,并验证了其在不同培养条件下的存在 研究仅限于从同一患者获取的样本,且样本数量有限 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和比较单层和类器官培养条件下的人类原代前列腺上皮细胞中的细胞群体 人类原代前列腺上皮细胞在单层和类器官培养条件下的细胞群体 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组 从同一患者获取的样本,以及来自5名额外患者的前列腺上皮样本
12835 2024-08-04
Elucidating key immunological biomarkers and immune microenvironment dynamics in aging-related intracranial aneurysm through integrated multi-omics analysis
2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本文通过整合多组学分析阐明了与衰老相关的颅内动脉瘤中的关键免疫生物标志物和免疫微环境动态 通过对小鼠脑动脉瘤模型的单细胞测序数据进行分析,识别了重要的免疫细胞亚群及其相互作用,有助于揭示免疫微环境的变化 该研究主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类的临床情况 本研究旨在探讨颅内动脉瘤的免疫微环境及其动态变化 研究对象为小鼠模型中诱导的Willis动脉瘤及其免疫细胞组成 数字病理学 NA 单细胞测序,RNA测序 NA 细胞数据,基因表达数据 97个颅内动脉瘤样本
12836 2024-08-04
Unraveling neoantigen-associated genes in bladder cancer: An in-depth analysis employing 101 machine learning algorithms
2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了与膀胱癌相关的新抗原基因及其对预后的影响 采用101种机器学习算法组合进行全面分析,构建了包含九个基因的预后模型 模型的有效性需要在更大规模和多样化的人群中进一步验证 探索膀胱癌中新抗原相关基因的机制及其对预后的影响 主要研究对象为膀胱癌的相关新抗原基因及其在预后中的作用 机器学习 膀胱癌 单细胞测序与大规模测序 机器学习模型 基因组数据 来自公共数据库的多个样本
12837 2024-08-04
PANoptosis-related signature in melanoma: Transcriptomic mapping and clinical prognostication
2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了PANoptosis在黑色素瘤中的作用及其与临床预后之间的关系 首次将PANoptosis的基因特征与黑色素瘤预后相关联,并建立了预测模型 未明确指出具体的样本来源和数量限制,可能影响结果的普适性 研究PANoptosis在黑色素瘤中的作用及其与免疫治疗反应的关系 黑色素瘤细胞及患者样本 数字病理学 皮肤癌 单细胞转录组分析、机器学习建模 NA 转录组数据 多种患者队列的样本,具体数量未说明
12838 2024-08-07
Ferroptosis heterogeneity within the tumor microenvironment revealed a genetic blueprint of breast cancer
2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过分析大量RNA和单细胞RNA测序数据,揭示了铁死亡在乳腺癌肿瘤微环境中的异质性及其遗传基础 首次构建了基于铁死亡和浸润免疫细胞的乳腺癌预后模型,并揭示了SLC39A7基因在乳腺癌发病机制中的作用 研究主要基于数据分析,未来需要实验验证结果的可靠性 探索铁死亡与免疫检查点阻断反应在乳腺癌中的关系 乳腺癌患者的肿瘤微环境和铁死亡相关基因 数字病理学 乳腺癌 RNA测序 LASSO回归 RNA 1217个样本,包括1104名乳腺癌患者和113名对照
12839 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of biomarker in allergic rhinitis patient undergoing intracervical lymphatic immunotherapy and related pan-cancer analysis
2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了过敏性鼻炎患者在接受宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化,并进行了相关的泛癌分析 首次采用宫颈淋巴免疫治疗(ICLIT)方法,并利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫细胞反应的分子机制 NA 探究过敏性鼻炎患者在接受宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化及其与肿瘤的关联 过敏性鼻炎患者的B细胞及其在宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化 数字病理学 过敏性疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
12840 2024-08-07
Tumor markers for lipid metabolism-related genes: Based on small cell lung cancer and bronchial asthma dual analysis
2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过分析小细胞肺癌和哮喘的scRNA-seq数据,探讨了脂质代谢相关基因在哮喘向小细胞肺癌转变中的作用 提出了一个新的脂质代谢相关基因标记,有助于深入理解哮喘向小细胞肺癌发展的机制 研究未直接关注衰老相关的分子改变 旨在开发更准确的预测模型,揭示哮喘与小细胞肺癌之间免疫信号通路的潜在联系 小细胞肺癌和哮喘的脂质代谢相关基因 数字病理学 小细胞肺癌 scRNA-seq NA 基因表达数据 使用了来自GEO数据库的GSE164404(小细胞肺癌)和GSE145013(严重哮喘)的scRNA-seq数据
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