单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27783 篇文献，本页显示第 12821 - 12840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12821 | 2024-08-05 |
High-Frequency Spinal Stimulation Suppresses Microglial Kaiso-P2X7 Receptor Axis-Induced Inflammation to Alleviate Neuropathic Pain in Rats
2024-May, Annals of neurology
IF:8.1Q1
DOI:10.1002/ana.26898
PMID:38450773
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研究论文 | 本研究探讨了高频脊髓刺激对神经病理性疼痛的减轻效果及其机制 | 揭示了HF10 SCS通过抑制小胶质细胞的Kaiso-P2X7受体病理轴来减少免疫反应，从而提供持久的疼痛缓解 | 仅在动物模型中进行试验，尚需在人类临床研究中验证结果 | 探讨10kHz HF SCS在疼痛缓解中的作用机制 | 以神经病理性疼痛大鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用大鼠模型进行测试，具体样本数量未提及 |
| 12822 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic landscape of peripheral blood cells provides insights into adaptation of red-eared sliders (Trachemys scripta elegans)
2024-May, Integrative zoology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/1749-4877.12725
PMID:37226359
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研究论文 | 本研究描绘了红耳龟外周血细胞的单细胞转录组图谱，探讨了其环境适应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术对红耳龟外周血细胞进行转录组分析，发现新的免疫信号类型 | 目前的研究主要集中在外周血细胞的转录组分析，未深入探讨其功能和机制 | 研究红耳龟在环境压力下的适应机制，主要通过血液学角度进行探索 | 红耳龟外周血细胞的多种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12823 | 2024-08-05 |
Novel Phosphate Transporter-B PvPTB1;1/1;2 Contribute to Efficient Phosphate Uptake and Arsenic Accumulation in As-Hyperaccumulator Pteris vittata
2024-Apr-30, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c09335
PMID:38624169
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研究论文 | 本研究揭示了低亲和力磷转运体-B 1家族介导的新型磷/砷运输系统在As-超积累植物中的作用 | 首次在维管植物中识别出两种膜蛋白基因，并确认其在磷摄取和砷积累中的作用 | 未提供关于其他植物转运体的对比分析数据 | 研究磷和砷在As-超积累植物中的摄取机制 | As-超积累植物Pteris vittata及其低亲和力磷转运体-B 1家族 | 植物生理学 | NA | 功能补偿实验和转基因分析 | NA | 基因表达数据和细胞转录组数据 | NA |
| 12824 | 2024-08-05 |
Cauchy hyper-graph Laplacian nonnegative matrix factorization for single-cell RNA-sequencing data analysis
2024-Apr-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05797-4
PMID:38684942
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研究论文 | 本文提出了一种Cauchy超图拉普拉斯非负矩阵分解方法用于单细胞RNA测序数据分析 | 使用Cauchy损失函数替代传统非负矩阵分解中的欧几里得距离，大大降低噪声影响，并结合超图约束。 | 至于模型的训练和优化过程的复杂性，具体应用于更大规模数据时的表现尚未讨论 | 探讨和改善单细胞数据分析中的聚类准确性 | 七个单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解 | Cauchy超图拉普拉斯非负矩阵分解 | RNA测序数据 | 七个数据集 |
| 12825 | 2024-08-05 |
A novel defined programmed cell death related gene signature for predicting the prognosis of serous ovarian cancer
2024-Apr-29, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01419-y
PMID:38685095
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研究论文 | 本研究探讨了差异表达的程序性细胞死亡基因在浆液性卵巢癌中的作用及其作为临床预后预测因子的潜力 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定了48个与凋亡信号和氧化应激通路显著相关的差异表达程序性细胞死亡基因，并发现GNA15作为独立预后标志物 | 研究的局限性在于主要依赖于公开数据库的数据，可能存在样本偏差或数据不完整的情况 | 研究旨在探讨程序性细胞死亡基因在浆液性卵巢癌异质性中的贡献以及其作为预后标志的潜力 | 研究对象为浆液性卵巢癌患者的细胞和基因数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Cox模型 | 基因表达数据 | 研究涉及的样本数量未具体说明，主要利用两组大型社会数据集进行验证 |
| 12826 | 2024-08-05 |
scCompressSA: dual-channel self-attention based deep autoencoder model for single-cell clustering by compressing gene-gene interactions
2024-Apr-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10286-2
PMID:38684946
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研究论文 | 提出了一种基于自注意力的深度自编码器模型scCompressSA，用于单细胞聚类，通过压缩基因间相互作用来增强聚类精度 | 该研究提出的双通道自注意力块能够有效整合拓扑特征，从而提高单细胞聚类的准确性 | 对于RNA测序数据的高随机性仍然是细胞类型检测面临的挑战 | 研究单细胞聚类的分子机制并提高细胞类型的检测精度 | 利用scRNA-seq数据中的基因间相互作用来提取特征进行细胞聚类 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度自编码器 | 基因表达数据 | 多个基准scRNA-seq数据集 |
| 12827 | 2024-08-04 |
Targeting nucleotide metabolic pathways in colorectal cancer by integrating scRNA-seq, spatial transcriptome, and bulk RNA-seq data
2024-Apr-10, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01356-5
PMID:38594466
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模RNA测序数据，对结直肠癌中的核苷酸代谢途径进行分析 | 通过不同的实验方法识别出新的结直肠癌治疗靶点ACO1和CPT2，并建立了以核苷酸代谢相关基因为基础的预后模型 | 研究主要依赖于数据分析和体外实验，临床应用需要进一步验证 | 探索结直肠癌中核苷酸代谢的特征及其对预后的影响 | 结直肠癌（CRC）及其相关的核苷酸代谢基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | 风险预后模型 | 基因表达数据 | 涉及多个结直肠癌样本，具体样本量未详细说明 |
| 12828 | 2024-08-05 |
Ranking of cell clusters in a single-cell RNA-sequencing analysis framework using prior knowledge
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011550
PMID:38635836
|
研究论文 | 本文提出了一种新的方法，通过结合先验知识和用户经验信息来对单细胞RNA测序中的细胞类型进行排名 | 本研究的创新点在于引入先验知识和药物信息，以增强对细胞类型的排名，这在之前的研究中未曾尝试 | 现有的细胞排名技术存在缺陷和局限性，需要更好的新方法来改善细胞排名 | 旨在改进单细胞RNA测序分析中的细胞类型排名 | 研究的对象为在特定疾病下的单细胞类型 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 12829 | 2024-08-04 |
Miracula polaris - A New Species of Miracula from the East Fjords of Iceland
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2333611
PMID:38690034
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research paper | 本研究在冰岛东峡湾发现了一种新物种Miracula polaris。 | 发现了新的寄生生物Miracula polaris，扩展了对早分支卵菌类多样性的理解。 | 研究未深入探讨与已知物种之间的关联性，可能存在未知物种。 | 调查冰岛东峡湾的早分支卵菌类的多样性。 | 研究了寄生在海洋硅藻属中的新寄生物种。 | NA | NA | 分子系统发育学和形态特征分析 | NA | 环境测序数据 | 在冰岛东峡湾的研究站进行了取样，具体样本数量未说明 |
| 12830 | 2024-08-05 |
Coupled scRNA-seq and Bulk-seq reveal the role of HMMR in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363834
PMID:38633247
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研究论文 | 本研究揭示了HMMR在肝细胞癌中的作用，强调其作为诊断和治疗标志物的潜力 | 首次表明HMMR在肝细胞癌中的高表达与肿瘤免疫微环境和预后相关 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，临床应用尚需进一步验证 | 探讨HMMR在肝细胞癌中的角色及其作为潜在分子标志物的可行性 | HMMR在肝细胞癌组织与正常组织的表达及其对HCC细胞增殖和迁移的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, 流式细胞术, 递归分割分析, 体外实验 | NA | RNA测序 | 多个队列研究和HCC组织微阵列 |
| 12831 | 2024-08-05 |
PAGER-scFGA: unveiling cell functions and molecular mechanisms in cell trajectories through single-cell functional genomics analysis
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1336135
PMID:38690527
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞功能基因组分析的新工具 PAGER-scFGA，旨在揭示细胞功能和分子机制。 | PAGER-scFGA 将细胞功能注释和基因集富集分析整合到流行的单细胞分析流程中，以提供细胞轨迹的深入理解。 | 尽管 PAGER-scFGA 在揭示细胞发育过程中的功能上表现出色，但可能存在样本特异性和模型可扩展性的局限性。 | 本研究的目的是开发一个工具以支持单细胞功能基因组学分析，揭示细胞运动轨迹中的分子机制。 | 研究对象为小鼠自然杀伤细胞及其成熟过程中的不同细胞群体。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠自然杀伤细胞的不同细胞簇 |
| 12832 | 2024-08-05 |
Role of proteoglycan synthesis genes in osteosarcoma stem cells
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1325794
PMID:38690160
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研究论文 | 本研究探讨了蛋白多糖合成基因在骨肉瘤干细胞中的作用 | 揭示了蛋白多糖和糖胺聚糖在骨肉瘤干细胞表型及肿瘤恶性程度中的关键作用 | 对蛋白多糖合成机制的了解依然有限 | 研究蛋白多糖/糖胺聚糖生物合成及相关基因在骨肉瘤中的作用 | 骨肉瘤干细胞及其相关临床样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq和传统RNA-seq | NA | 临床样本的基因表达数据 | 临床骨肉瘤标本的多个样本 |
| 12833 | 2024-08-05 |
Macrophage activation drives ovarian failure and masculinization in zebrafish
2023-11-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg7488
PMID:37992158
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研究论文 | 该文章探讨了巨噬细胞活化如何驱动斑马鱼的卵巢衰退和男性化 | 通过建立巨噬细胞活化与卵巢衰退之间的因果关系，确定了促进卵巢衰退和性别逆转的生殖细胞-体细胞信号轴 | 对人类卵巢衰退机制的适用性可能受到限制，因为研究是在斑马鱼模型中进行的 | 研究BMP15突变引起的卵巢衰退和免疫因素的细胞机制 | 主要研究对象为斑马鱼，特别是涉及到巨噬细胞和卵巢细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12834 | 2024-08-04 |
Molecular Evidence for Olfactory Neuroblastoma as a Tumor of Malignant Globose Basal Cells
2023-05, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2023.100122
PMID:36841178
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研究论文 | 本文利用人鼠集成的单细胞图谱识别与嗅神经母细胞瘤的特定干/祖细胞群体相关的转录组程序 | 首次将嗅神经母细胞瘤与特定细胞类型联系起来，并识别出保守的发育通路 | 缺乏对嗅上皮细胞类型标记在临床实践中的应用 | 探讨嗅神经母细胞瘤与嗅上皮中球状基底细胞之间的关系 | 嗅神经母细胞瘤及其与嗅上皮细胞的联系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的鼻粘膜样本 |
| 12835 | 2024-08-05 |
Epigenetic regulation of cancer-associated fibroblast heterogeneity
2023-05, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2023.188901
PMID:37120098
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review | 本文回顾了癌相关成纤维细胞(CAF)成熟过程中的表观遗传变化，重点讨论了DNA甲基化和组蛋白修饰 | 探讨了CAF中表观遗传变化与肿瘤生长之间的关系，提出了一些CAF激活因子与表观遗传改变之间的联系 | 没有提供关于CAF的具体样本数据和实验结果的详细信息 | 旨在深入了解癌相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 集中讨论癌相关成纤维细胞及其成熟过程中的表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
| 12836 | 2024-08-05 |
Spinal astrocytic MeCP2 regulates Kir4.1 for the maintenance of chronic hyperalgesia in neuropathic pain
2023-05, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2023.102436
PMID:36931588
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研究论文 | 本文探讨了脊髓星形胶质细胞中的MeCP2如何调节Kir4.1以维持神经病理性疼痛中的慢性痛觉过敏 | 揭示了Kir4.1通道在慢性神经病理性疼痛中通过MeCP2的调节作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在其他模型中进一步验证 | 探讨脊髓星形胶质细胞在慢性神经病理性疼痛中的作用及其机制 | 脊髓星形胶质细胞和Kir4.1通道 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠模型中观察到的脊髓星形胶质细胞样本 |
| 12837 | 2024-08-05 |
Cytotoxic T Cells Targeting Spike Glycoprotein Are Associated with Hybrid Immunity to SARS-CoV-2
2023-05-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200815
PMID:36961450
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研究论文 | 这篇文章探讨了针对SARS-CoV-2尖峰糖蛋白的细胞毒性T细胞与混合免疫之间的关联 | 这项研究揭示了混合免疫中细胞毒性T细胞的重要性，并比较了带有和没有既往感染的个体的T细胞反应 | 样本数量相对较小，且未足够探讨其他可能影响免疫反应的因素 | 研究混合免疫的免疫机制及其对SARS-CoV-2突破性感染的保护作用 | 参与者分为SARS-CoV-2未感染和康复个体，均接受了两剂mRNA疫苗接种 | 免疫学 | SARS-CoV-2 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 生物数据 | 30名个体 (13名未感染者，17名康复者) |
| 12838 | 2024-08-05 |
An update in club cell biology and its potential relevance to chronic obstructive pulmonary disease
2023-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00192.2022
PMID:36942863
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评论 | 本综述整合了俱乐部细胞的最新研究发现及其与慢性阻塞性肺病的潜在关联 | 通过整合单细胞RNA测序数据，提供了俱乐部细胞异质性和功能的新见解 | 缺乏对俱乐部细胞在COPD患者中的具体机制的深入探讨 | 探讨俱乐部细胞的生物学及其在慢性阻塞性肺病中的潜在重要性 | 俱乐部细胞及其在小气道中的功能 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12839 | 2024-08-05 |
Immune Checkpoint Molecule TIGIT Regulates Kidney T Cell Functions and Contributes to AKI
2023-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000063
PMID:36747315
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研究论文 | 本研究揭示了免疫检查点分子TIGIT在肾脏T细胞功能中的调节作用，并探讨其在急性肾损伤（AKI）中的贡献 | 发现TIGIT在小鼠及人类肾脏T细胞中的上调，并揭示其通过影响T细胞的效应特征和细胞因子产生来调节AKI病理生理 | 该研究主要在小鼠模型中进行，尚需进一步验证人类中的具体机制和临床相关性 | 探讨TIGIT在肾脏T细胞中的作用及其对AKI结果的影响 | 针对小鼠及人类肾脏T细胞进行的研究 | NA | 急性肾损伤 | RNA测序（RNA-Seq），流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 小鼠和人类样本，包括缺失TIGIT的小鼠和来自肾脏切除术样本的人类T细胞 |
| 12840 | 2024-08-05 |
A Salivary Gland Resident Macrophage Subset Regulating Radiation Responses
2023-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221150005
PMID:36883649
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研究论文 | 本研究发现唾液腺驻留巨噬细胞亚群在放射反应中起调节作用 | 首次报告了具有不同功能或转录谱的唾液腺驻留巨噬细胞亚群 | 研究主要在小鼠模型中进行，临床转化需进一步验证 | 揭示唾液腺驻留巨噬细胞亚群的功能及其对放射影响的调节作用 | 小鼠下颌唾液腺中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠下颌唾液腺样本 |