单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12801 - 12820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12801 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
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研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的耐药性问题 | 发现使用temsirolimus靶向阻断mTORC1可以克服PRMT5抑制剂的耐药性，并在耐药的MCL细胞系中显示出治疗协同作用 | 研究主要基于患者来源的异种移植（PDX）模型和细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的耐药机制并寻找克服耐药性的策略 | 套细胞淋巴瘤（MCL）及其对PRMT5抑制剂的耐药性 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级耐药细胞系4个，耐药PDX模型若干 |
| 12802 | 2024-08-04 |
Comprehensive molecular and cellular characterization of endoplasmic reticulum stress-related key genes in renal ischemia/reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1340997
PMID:38495888
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研究论文 | 本研究全面表征了与内质网应激相关的三种关键基因在肾脏缺血/再灌注损伤中的作用 | 该研究首次确定了与内质网应激相关的三种关键基因，并探讨了它们在肾脏移植后愈后预后的价值 | 研究的限制在于使用了已有的数据集，可能无法完全捕捉肾脏缺血/再灌注损伤的所有机制 | 研究旨在揭示肾脏缺血/再灌注损伤的潜在机制，以发现有效的肾脏保护靶点 | 研究对象为在肾脏缺血/再灌注损伤中涉及的关键基因及其相关途径 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从GEO数据库收集了495个肾脏样本进行研究 |
| 12803 | 2024-08-05 |
Apolipoprotein L genes are novel mediators of inflammation in beta cells
2024-Jan, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-06033-z
PMID:37924378
|
研究论文 | 本文研究了载脂蛋白L基因在炎症引起的β细胞损伤中的新作用 | 发现APOL基因在β细胞中的表达受到炎症的显著上调，揭示了它们在胰腺炎症中的新调节作用 | 研究主要集中在单一细胞模型，可能无法全面反映复杂的体内环境 | 探讨载脂蛋白L基因在β细胞炎症损伤中的作用机制 | 主要研究人类胰腺β细胞以及与糖尿病相关的细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了原代人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞 |
| 12804 | 2024-08-07 |
Multi-omics and tumor immune microenvironment characterization of a prognostic model based on aging-related genes in melanoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/UZGP9704
PMID:38590405
|
研究论文 | 本文通过分析与衰老相关的基因，构建了一个针对黑色素瘤的预后模型，并探讨了其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次基于衰老相关基因构建黑色素瘤预后模型，并展示了其在预测患者死亡率方面的高准确性 | NA | 构建一个基于衰老相关基因的黑色素瘤预后模型，并探讨其在免疫治疗中的潜在应用 | 黑色素瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 12805 | 2024-08-05 |
Human monoclonal antibodies against Staphylococcus aureus A protein identified by high-throughput single-cell sequencing of phase I clinical volunteers' B cells
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109843
PMID:37981106
|
研究论文 | 本研究通过高通量单细胞测序识别出对抗金黄色葡萄球菌A蛋白的人源单克隆抗体 | 发现了一种特异性针对金黄色葡萄球菌A蛋白的高表达的人单克隆抗体IgG-6 | 本研究仅在I期临床试验中进行，样本量相对较小，长期效果尚未验证 | 研究人源单克隆抗体作为对付金黄色葡萄球菌感染的新策略 | 从64名志愿者的外周血淋巴细胞中分离的抗原特异性记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 64名临床志愿者的外周血淋巴细胞 |
| 12806 | 2024-08-07 |
Ruxolitinib attenuates acute rejection and can serve as an immune induction therapy in heart transplantation
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109851
PMID:38008145
|
研究论文 | 研究探讨了IL2RA拮抗剂在心脏移植患者中的效果，并发现鲁索利替尼可能是一种新的免疫诱导治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了IL2RA拮抗剂治疗后免疫细胞的动态变化，并发现鲁索利替尼可作为新的免疫诱导治疗药物，不影响调节性T细胞的激活 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 阐明IL2RA拮抗剂的效果并寻找优于IL2RA拮抗剂的治疗目标 | 心脏移植患者及IL2RA拮抗剂治疗后的免疫细胞 | NA | 心脏移植 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十九种细胞类型 |
| 12807 | 2024-08-07 |
Single-cell dissection, hdWGCNA and deep learning reveal the role of oxidatively stressed plasma cells in ulcerative colitis
2023-11-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023237
PMID:37814814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高级加权基因共表达网络分析，揭示了氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的作用，并利用深度学习模型进行诊断 | 首次通过单细胞水平分析和多种机器学习方法，识别出氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的关键作用，并开发了用于诊断的深度学习模型 | NA | 阐明溃疡性结肠炎在单细胞水平的发病机制及其临床意义 | 溃疡性结肠炎中的氧化应激浆细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 转录组数据 | NA |
| 12808 | 2024-08-07 |
scAce: an adaptive embedding and clustering method for single-cell gene expression data
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad546
PMID:37672035
|
research paper | 本文提出了一种名为scAce的自适应嵌入和聚类方法，用于单细胞基因表达数据的分析 | scAce方法通过构建变分自编码器同时学习细胞嵌入和聚类分配，并开发了一种自适应聚类合并方法，无需预先估计聚类数量 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析，区分细胞类型并发现新的细胞类型 | 单细胞基因表达数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | variational autoencoder | gene expression data | NA |
| 12809 | 2024-08-07 |
NMFClustering: Accessible NMF-based clustering utilizing GPU acceleration
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545370
PMID:37398372
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于非负矩阵分解（NMF）的聚类方法，通过GPU加速提高了计算效率 | 实现了基于NMF的聚类方法在GPU计算节点上的运行，使用Cupy库和消息传递接口（MPI），显著减少了计算时间 | NA | 旨在解决非负矩阵分解在处理大规模基因表达数据时的计算密集问题 | 基因表达数据，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）计数矩阵 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 基因表达数据 | 涉及数万个基因的高维数据集 |
| 12810 | 2024-08-04 |
Cellular states are coupled to genomic and viral heterogeneity in HPV-related oropharyngeal carcinoma
2023-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01357-3
PMID:37012457
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析HPV阳性和阴性口咽肿瘤，揭示肿瘤内外的细胞多样性。 | 首次揭示了口咽癌细胞状态与基因组和病毒异质性的关系 | 研究中未明确涉及样本的具体数量和来源 | 探索HPV相关的口咽癌细胞的多样性及其对预后影响 | HPV阳性和阴性口咽肿瘤 | 数字病理学 | 其他癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12811 | 2024-08-04 |
Antigen/HLA-agnostic strategies for Characterizing Tumor-responsive T cell receptors in PDAC patients via single-cell sequencing and autologous organoid application
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216741
PMID:38395378
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研究论文 | 本研究通过超深度单细胞TCR/RNA测序和自体类器官应用，鉴定并验证胰腺导管腺癌患者的抗肿瘤T细胞受体 | 结合超深度单细胞测序和类器官技术，快速特征化肿瘤响应的TCR，对于制定实用个性化TCR-T疗法具有潜在意义 | 仅在两个PDAC患者中进行，结果可能无法代表更广泛的患者群体 | 识别和验证胰腺导管腺癌患者的抗肿瘤TCRs，以促进个性化TCR-T细胞疗法的发展 | 两名代表性的胰腺导管腺癌患者的T细胞受体 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序，类器官技术 | NA | 细胞 | 超过82,000个细胞 |
| 12812 | 2024-08-04 |
Characterization of the distinct immune microenvironments between hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216799
PMID:38479553
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）之间明显不同的肿瘤免疫微环境 | 研究首次系统性评估了HCC和ICC的肿瘤免疫微环境的相似性和差异性 | 未提及研究的局限性 | 旨在揭示HCC和ICC的肿瘤免疫微环境的细胞组成和相互作用 | 研究对象为来自四种不同组织类型的HCC和ICC的41个单细胞RNA-seq样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 41个单细胞RNA-seq样本 |
| 12813 | 2024-08-04 |
Association of preoperative aspartate aminotransferase to platelet ratio index with outcomes and tumour microenvironment among colorectal cancer with liver metastases
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216778
PMID:38458593
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研究论文 | 本研究旨在探讨可改善结直肠肝转移患者预后预测的生物标志物 | 本研究首次将术前天冬氨酸氨基转移酶与血小板比率指数(APRI)与结直肠肝转移患者的预后及肿瘤微环境关联起来 | 研究可能受到多中心数据的异质性影响，需注意结果的普遍适用性 | 旨在识别可应用的 robust 生物标志物以改善结直肠肝转移患者的预后预测 | 纳入了1323名接受同期切除手术的结直肠肝转移患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞 RNA 测序，复合免疫组化/免疫荧光 | IPTW调整的Cox风险回归分析 | 血液样本，肿瘤样本 | 1323名结直肠肝转移患者 |
| 12814 | 2024-08-07 |
CD63+ cancer-associated fibroblasts confer CDK4/6 inhibitor resistance to breast cancer cells by exosomal miR-20
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216747
PMID:38403110
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研究论文 | 本研究揭示了CD63+癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-20赋予乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性 | 发现CD63 CAFs通过外泌体miR-20促进乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性，并设计合成了cRGD-miR-20海绵纳米粒子以增强CDK4/6抑制剂的治疗效果 | NA | 探讨CDK4/6抑制剂耐药性的机制并寻找新的治疗策略 | 乳腺癌细胞、CD63癌症相关成纤维细胞及外泌体miR-20 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 12815 | 2024-08-07 |
Candida albicans-myeloid cells-T lymphocytes axis in the tumor microenvironment of oral tumor-bearing mice
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216814
PMID:38499264
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研究论文 | 本研究报告了口腔肿瘤小鼠模型中由白色念珠菌感染引起的肿瘤微环境变化 | 首次揭示了白色念珠菌感染下口腔肿瘤微环境中髓系细胞与T淋巴细胞轴的作用 | NA | 探讨白色念珠菌如何通过影响免疫微环境促进口腔癌发展 | 口腔肿瘤小鼠模型中的肿瘤微环境 | NA | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 12816 | 2024-08-07 |
An effective two-stage NMBzA-induced rat esophageal tumor model revealing that the FAT-Hippo-YAP1 axis drives the progression of ESCC
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216813
PMID:38499266
|
研究论文 | 本文报道了一种有效的两阶段NMBzA诱导的大鼠食管癌模型，并揭示了FAT-Hippo-YAP1轴在食管鳞状细胞癌（ESCC）进展中的作用。 | 使用多激酶抑制剂索拉非尼作为肿瘤促进剂，建立了高效的两阶段NMBzA诱导的大鼠ESCC致癌模型，增加了肿瘤发生率和缩短了肿瘤形成时间。 | 模型仍存在时间消耗较长和恶性肿瘤发生率低的问题。 | 研究食管鳞状细胞癌的起始、进展和新治疗策略。 | NMBzA诱导的大鼠食管鳞状细胞癌模型及其相关分子机制。 | 数字病理学 | 食管癌 | 全基因组测序、三维（3-D）器官培养、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、细胞系、组织样本 | 从NMBzA诱导的乳头状瘤和ESCC中生成的肿瘤细胞系，以及三维器官培养和单细胞RNA测序的样本。 |
| 12817 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing explores the evolution of the ecosystem from leukoplakia to head and neck squamous cell carcinoma
2024-04-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58978-9
PMID:38582791
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索从白斑病到头颈鳞状细胞癌的生态系统演变过程 | 发现了在白斑病向头颈鳞状细胞癌进展过程中，与预后相关的多个细胞亚群及其不同的命运走向 | NA | 揭示白斑病向头颈鳞状细胞癌进展的分子机制，并为新治疗策略的开发提供理论基础 | 白斑病和头颈鳞状细胞癌的细胞生态系统 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自基因表达综合数据库和UCSC Xena数据库的样本信息 |
| 12818 | 2024-08-07 |
IRF1 governs the expression of SMARCC1 via the GCN5-SETD2 axis and actively engages in the advancement of osteoarthritis
2024-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.01.002
PMID:38586591
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研究论文 | 本研究分析了IRF1-GCN5-SETD2-SMARCC1轴在骨关节炎（OA）发展中的作用 | 发现IRF1通过GCN5和SETD2调控SMARCC1的表达，进而影响H3K27ac和H3K4me3修饰，促进M1巨噬细胞的极化，推动骨关节炎的进展 | NA | 分析IRF1-GCN5-SETD2-SMARCC1轴在骨关节炎发展中的功能 | IRF1、SMARCC1、GCN5、SETD2以及它们在骨关节炎中的作用 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 13名骨关节炎患者和7名无骨关节炎的骨折患者 |
| 12819 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals altered lipid metabolism and inflammation-related gene expression of sebaceous glands in psoriasis and atopic dermatitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1334844
PMID:38433843
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研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的脂质代谢和炎症相关基因表达的变化 | 首次深入探讨了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用，揭示其与炎症微环境的相互影响 | 未能探讨其他炎症性皮肤疾病对皮脂腺的影响 | 研究皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用 | 银屑病和特应性皮炎患者的人类皮肤样本 | 数字病理学 | 银屑病, 特应性皮炎 | 空间转录组学 | NA | 人类皮肤样本 | 涉及银屑病和特应性皮炎患者的皮肤样本 |
| 12820 | 2024-08-07 |
Unveiling macrophage diversity in myocardial ischemia-reperfusion injury: identification of a distinct lipid-associated macrophage subset
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1335333
PMID:38449872
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在心肌缺血-再灌注损伤中鉴定出一种新型脂质相关巨噬细胞亚型，并探讨了其在心肌重塑中的潜在作用 | 首次在心肌缺血-再灌注损伤中发现并鉴定了一种新型脂质相关巨噬细胞亚型，该亚型具有高表达的Spp1和Trem2等基因 | NA | 旨在识别心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型，并探索其对心脏修复和损伤的双重作用 | 心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用小鼠和人类的心脏样本进行研究 |