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当前共找到 41197 篇文献，本页显示第 1261 - 1280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2026-06-19 |
Integrated Multi-Omics Analysis and Experimental Validation Identify BCAT1 as a Critical Driver of Hepatocyte Pyroptosis in Acute-On-Chronic Liver Failure
2026-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600199RR
PMID:42258325
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研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证，发现BCAT1是慢加急性肝衰竭中肝细胞焦亡的关键驱动因子 | 首次结合WGCNA、三种机器学习算法和单细胞RNA-seq，系统鉴定出BCAT1作为肝细胞特异性焦亡调控因子，并揭示其通过GSDMD/Caspase-1通路驱动肝损伤的机制 | 具体局限性未在摘要中提及，可能包括样本量有限、动物模型与人类ACLF的差异、以及BCAT1在其他肝细胞类型中的功能未充分探讨 | 探索氨基酸代谢相关基因在慢加急性肝衰竭（ACLF）发病机制中的关键作用，并鉴定诊断和治疗靶点 | ACLF患者的转录组数据和肝细胞，以及APAP诱导的ACLF小鼠模型 | 机器学习 | 慢加急性肝衰竭 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析 | 随机森林, SVM-RFE, Boruta | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 未在摘要中明确提及，但包括ACLF患者的转录组数据和单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1262 | 2026-06-19 |
Plasmodium falciparum leucine-rich repeat 5 disruption alters the transcription progression during asexual and sexual stage development
2026-Jun-15, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00186-26
PMID:42294623
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研究论文 | 研究了恶性疟原虫富含亮氨酸重复蛋白LRR5（PF3D7_1432400）在无性和有性阶段发育中对转录进程的影响 | 利用优化的单细胞RNA测序方法分析非同步培养的寄生虫，首次揭示LRR5破坏如何改变寄生虫的转录异质性、压力反应途径和配子体形成的早期激活 | 未提供具体局限性信息 | 探索LRR5蛋白在寄生虫发育应激反应和配子体形成中的作用 | 恶性疟原虫的野生型NF54品系和等基因LRR5突变体（LRR5pB） | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非同步培养的寄生虫样本，涉及野生型和突变体群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 优化的单细胞RNA测序方法 |
| 1263 | 2026-06-19 |
Systematic characterization of pyroptosis-related gene patterns identifies potential prognostic inflammatory phenotypes in sepsis
2026-Jun-13, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01913-0
PMID:42286183
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研究论文 | 基于焦亡相关基因特征系统分析脓毒症预后炎症表型 | 首次构建了7基因焦亡相关基因评分模型，该模型在多个独立队列中验证了良好的短期死亡预测性能，并结合单细胞RNA测序揭示了基因评分在存活与非存活患者中的动态变化 | 研究基于公共数据集，样本量有限，临床推广应用需进一步前瞻性验证 | 探索焦亡相关基因在脓毒症中的分子亚型分型及预后预测价值 | 脓毒症患者及脓毒性休克患者 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据 | 主队列GSE65682（有明确定义），独立队列GSE95233（脓毒性休克），单细胞数据GSE167363（需进一步说明具体样本量） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1264 | 2026-06-19 |
REGγ Links Inflammation to Fibrosis in Post-Necrotizing Enterocolitis Intestinal Strictures by Activating Transforming Growth Factor-β/Smad3 Signaling
2026-Jun-10, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.05.003
PMID:42270073
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研究论文 | 研究表明REGγ通过激活TGF-β/Smad3信号通路，在坏死性小肠结肠炎后肠狭窄中连接炎症与纤维化 | 首次揭示REGγ作为炎症-纤维化串扰的关键介质，并通过单细胞RNA测序确认其在成纤维细胞中的富集，为治疗提供新靶点 | 无法从标题和摘要中明确获取 | 阐明坏死性小肠结肠炎后肠狭窄中炎症驱动纤维化的分子机制 | 人类NEC肠狭窄标本、小鼠模型和成纤维细胞 | NA | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 人类标本（数量未指定）和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1265 | 2026-06-19 |
Dynamic urinary proteomics integrates single-cell and spatial transcriptomics to reveal tumour microenvironment and predict immunotherapy response in biliary tract cancer
2026-Jun-09, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335513
PMID:41151791
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研究论文 | 该研究通过动态尿液蛋白质组学整合单细胞和空间转录组学，揭示了胆道癌的肿瘤微环境并预测免疫治疗反应 | 首次将尿液蛋白质组学应用于免疫肿瘤学，建立无创预测免疫检查点抑制剂反应的工具，并整合单细胞和空间转录组学探索肿瘤微环境机制 | 未提及具体局限性，但样本量相对较小（97名患者）且验证队列仅24名，可能影响普适性 | 建立尿液蛋白质组学作为胆道癌免疫检查点抑制剂反应的预测工具，并阐明其与肿瘤动态和肿瘤微环境重塑的关系 | 97名接受免疫检查点抑制剂治疗的初治胆道癌患者的211份尿液样本以及11份肿瘤活检样本 | 机器学习 | 胆道癌 | 质谱（MS）、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习模型 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 97名患者的211份尿液样本和11份肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1266 | 2026-06-19 |
Neutrophil-Mimetic MRI Enables Ultra-Early Detection of Vascular Inflammation After Stroke
2026-Jun-08, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.71325
PMID:42260622
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研究论文 | 开发一种模拟中性粒细胞的磁共振成像探针，用于超早期检测中风后血管炎症 | 利用单细胞RNA测序数据分析发现E-selectin是早期激活内皮细胞的标志，并据此设计模拟中性粒细胞粘附的铁氧化物微粒作为MRI探针，实现超早期（中风后4小时）的炎症成像 | 未提及研究限制 | 开发一种超早期检测中风后血管炎症的磁共振成像方法，以识别可能受益于免疫调节治疗的患者 | 脑组织中的E-selectin表达和中性粒细胞粘附过程 | 计算机视觉, 机器学习 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1267 | 2026-06-19 |
Multi-omics profiling identifies ACP2 as a lysosome-associated biomarker linked to immune dynamics and clinical outcomes in glioma
2026-Jun-07, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定ACP2作为胶质瘤中与免疫动态和临床结局相关的溶酶体生物标志物 | 首次系统揭示溶酶体酸性磷酸酶2（ACP2）在胶质瘤中的表达模式、预后价值及免疫关联，并整合多组学数据构建其功能网络 | 未对ACP2的功能机制进行实验验证，且基于公共数据库的分析可能存在样本异质性和偏倚 | 明确ACP2在胶质瘤恶性进展和免疫微环境重塑中的作用，评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 胶质瘤患者样本及多组学数据（包括TCGA和CGGA的bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq及单核RNA-seq数据） | 机器学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 分子对接 | NA | 转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 药物基因组学数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 1268 | 2026-06-19 |
Mitochondrial potential reflects T cell fitness and function during cancer immunotherapy
2026-Jun-07, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag120
PMID:42310166
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研究论文 | 研究线粒体膜电位作为T细胞适应性和免疫治疗反应指标的潜力 | 首次将线粒体膜电位与T细胞耗竭样转录状态及免疫治疗反应不佳相关联 | 未提及具体局限性 | 探究线粒体膜电位作为T细胞表型和免疫治疗反应指标的作用 | 非小细胞肺癌和透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤相关T细胞 | 机器学习 | 肺癌, 肾癌 | 单细胞RNA测序, TCRβ测序 | NA | 基因表达数据 | 非小细胞肺癌和透明细胞肾细胞癌患者的外周血单核细胞和原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1269 | 2026-06-19 |
Integrating Radiomics and Computational Pathology to Predict Early Recurrence of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Uncover Its Biological Basis in Tumor Microenvironment
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523985
PMID:41969272
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research paper | 结合影像组学和计算病理学预测胰腺导管腺癌早期复发并揭示其肿瘤微环境中的生物学基础 | 首次将影像组学与计算病理学特征整合，构建多模态预测模型，并通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示模型背后的细胞和分子机制 | 回顾性研究设计和有限的样本量可能需要前瞻性验证来确认结果 | 开发并验证整合影像组学与病理组学的模型用于预测胰腺导管腺癌术后早期复发，并阐明其潜在的生物学机制 | 接受R0切除的225名胰腺导管腺癌患者 | 计算机视觉, 数字病理学 | 胰腺癌 | 影像组学, 计算病理学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 多种机器学习模型（11种） | CT影像, 全切片图像, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 225名患者（回顾性队列），前瞻性收集标本用于单细胞和空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1270 | 2026-06-19 |
Single-cell RNA-seq reveals a persistent interferon signature in immune cells from systemic lupus erythematosus patients with high versus low polygenic risk scores despite antimalarial treatment
2026-Jun, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2026.103575
PMID:42119160
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析，揭示了系统性红斑狼疮患者中高与低多基因风险评分相关的持续干扰素信号特征，即使接受抗疟治疗也未能完全抑制 | 首次在单细胞层面，结合多基因风险评分（PRS）分层，揭示系统性红斑狼疮（SLE）高遗传风险患者（即使处于疾病低活动度并接受抗疟治疗）仍存在持续的干扰素信号激活，并鉴定出pDC和单核细胞中ISG15、USP18等关键基因及IRF7、BATF3等转录因子 | 样本量较小（仅16名SLE患者和6名健康对照），且仅限于女性患者；未涵盖高疾病活动度或未治疗患者，无法评估基因风险与治疗反应的完整交互 | 探讨多基因遗传风险对系统性红斑狼疮免疫细胞分子表型的影响，特别关注干扰素信号通路的激活状态 | 16名接受抗疟治疗且处于低疾病活动度的女性SLE患者（根据加权多基因风险评分分层为高PRS和低PRS组）及6名健康对照 | 单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 16名SLE患者（高PRS和低PRS组）和6名健康对照，总共22个新鲜外周血单个核细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1271 | 2026-06-19 |
Prognostic impact of vascular CXCR4 expression in colorectal carcinoma
2026-Jun, Experimental and molecular pathology
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.yexmp.2026.105043
PMID:41980570
|
研究论文 | 评估结直肠癌血管微环境中CXCR4表达的临床病理学意义及其对预后的影响 | 首次聚焦于结直肠癌肿瘤侵袭前沿的血管结构中CXCR4的表达，并通过单细胞RNA测序鉴定出内皮细胞是其主要细胞来源 | 未阐明CXCR4在血管中高表达导致侵袭性肿瘤行为和不良临床结局的具体分子机制 | 探讨结直肠癌血管微环境中CXCR4表达的临床病理学意义及其作为预后生物标志物的潜力 | 250例手术切除的原发性结直肠癌标本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 250例结直肠癌组织标本及公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用公开数据集进行单细胞RNA测序分析 |
| 1272 | 2026-06-19 |
Inhibition of endothelial S1PR2 preserves blood-brain barrier integrity after traumatic brain injury through activating the PI3K-AKT signaling pathway
2026-Jun, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05546-6
PMID:42101792
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研究论文 | 研究内皮细胞S1PR2通过激活PI3K-AKT信号通路在创伤性脑损伤后保护血脑屏障完整性的机制 | 首次揭示内皮细胞中S1PR2通过调控PI3K-AKT通路在脑损伤后血脑屏障保护中的关键作用，并利用单细胞RNA测序验证细胞特异性表达 | 未在人体样本中验证结果，以及S1PR2抑制剂的长期疗效和安全性有待进一步评估 | 阐明S1PR2在保护脑损伤后血脑屏障完整性中的机制并评估其治疗潜力 | 小鼠创伤性脑损伤模型和人脐静脉内皮细胞（HUVECs） | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、shRNA敲低、Western blotting | NA | 图像、测序数据、行为数据 | 小鼠模型及体外HUVECs细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集GSE269748 |
| 1273 | 2026-06-19 |
Distinct stem cell identities converge into shared erythroid stress in ERCC6L2 disease and Shwachman-Diamond syndrome
2026-Jun, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70374
PMID:42311431
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，揭示ERCC6L2疾病与Shwachman-Diamond综合征在红细胞生成应激中的共享和特有转录程序 | 首次建立ERCC6L2疾病患者层面的单细胞图谱，并比较两种罕见骨髓衰竭综合征在红细胞生成应激中的共享机制与疾病特异性模式 | 未详细说明样本量及验证实验的局限性 | 阐明ERCC6L2疾病中延迟红细胞生成和白血病进展的转录组事件，并与Shwachman-Diamond综合征进行比较 | ERCC6L2疾病和Shwachman-Diamond综合征患者的成纤维细胞、骨髓和外周血样本 | 单细胞转录组学、医学遗传学 | 骨髓衰竭综合征、急性髓系白血病 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、单细胞基因分型 | NA | 转录组数据 | 患者成纤维细胞、骨髓和外周血样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1274 | 2026-06-19 |
Comparative single-cell transcriptomics of orthotopic and subcutaneous gastric tumors reveal immune and stromal heterogeneity
2026-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.03.680400
PMID:42239432
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研究论文 | 通过比较原位和皮下胃癌肿瘤的单细胞转录组，揭示免疫和基质异质性 | 首次在单细胞分辨率下系统比较原位和皮下植入模型的肿瘤微环境差异，发现原位肿瘤具有更强的基质激活、协调的成纤维细胞和内皮细胞信号传导以及IgA偏向的B细胞浆细胞程序，而皮下肿瘤表现出更高的CD8+ T细胞耗竭 | 研究仅限于单一同系胃癌模型CKP，可能无法推广到其他肿瘤类型或人类肿瘤 | 解析原位与皮下肿瘤微环境的细胞组成和分子差异，为临床前模型选择提供指导 | CKP同系胃癌模型的原位和皮下植入肿瘤 | 机器学习和生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 配对的原位和皮下CKP肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1275 | 2026-06-19 |
Integrated spatial transcriptomic and metabolic profiling identifies molecular networks associated with cognitive performance in the porcine prefrontal cortex
2026-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和代谢组学，生成了猪前额叶皮层的高分辨率多维分子图谱，揭示了与认知表现相关的分子网络 | 首次在有沟回的大型动物大脑中建立空间解析的多组学框架，用于研究认知功能 | NA | 阐明认知功能背后的分子结构 | 猪前额叶皮层组织 | NA | 认知障碍 | 空间转录组学、代谢组学、免疫组化分析 | NA | 空间转录组数据、代谢组数据 | 猪和分层小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1276 | 2026-06-19 |
Workload-induced changes to cell state contribute to β-cell failure in diabetes
2026-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.13.725004
PMID:42239070
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示工作负荷诱导的β细胞状态变化在糖尿病发病中的作用 | 首次发现工作负荷诱导的β细胞过度刺激会导致失代偿，并鉴定出一种与应激状态不同的新型补偿状态 | 未提及具体局限性 | 研究β细胞从功能正常到失代偿状态转变的机制，特别是工作负荷诱导的过度刺激的作用 | 胰岛素分泌β细胞 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠糖尿病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1277 | 2026-06-19 |
Immune cells during compensatory renal hypertrophy after unilateral nephrectomy
2026-May-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9568023/v1
PMID:42183369
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研究论文 | 探讨单侧肾切除后代偿性肾肥大的免疫细胞动态变化及其对肾功能的影响 | 首次系统揭示单侧肾切除后残余肾脏中免疫细胞的多阶段动态变化，包括先天性免疫快速激活、适应性免疫逐步调控以及免疫检查点水平变化，并发现Rag1小鼠中GFR恢复更显著 | 研究基于小鼠模型，结果需在人体中验证；未深入探讨具体免疫细胞亚群的分子机制 | 阐明单侧肾切除后代偿性肾肥大中免疫细胞的作用及机制 | 小鼠（野生型C57BL/6和Rag1小鼠） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、肾小球滤过率测量 | 无特定模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型，具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1278 | 2026-06-19 |
GatorSC: multi-scale cell and gene graphs with mixture-of-experts fusion for single-cell transcriptomics
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag330
PMID:42308421
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研究论文 | 提出GatorSC框架，通过多尺度细胞和基因图与混合专家融合进行单细胞转录组学表示学习 | 首次将多尺度细胞图和基因图与混合专家架构结合，通过图重建和图对比学习的自监督目标实现噪声鲁棒和结构保持的表示学习 | 未明确讨论计算效率或大规模数据集的扩展性 | 开发统一的表示学习框架，有效利用单细胞转录组数据中跨细胞和基因的多尺度结构信息进行综合分析 | 单细胞转录组数据中的细胞和基因 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | 图神经网络、混合专家模型 | 单细胞基因表达数据 | 19个公开scRNA-seq数据集，涵盖不同组织、物种和测序平台；一个阿尔茨海默病单细胞核数据集 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 1279 | 2026-06-19 |
Current trends and challenges in deciphering single molecule resolution maps of single cell transcriptomes
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag323
PMID:42308418
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综述 | 回顾单细胞RNA测序技术从手动分离到高通量短读和长读测序的演变，并讨论其在单分子分辨率下解析单细胞转录组的当前趋势与挑战 | 整合技术、计算和生物学视角，系统阐述长读长测序与高通量条形码结合后对细胞异质性和转录动态研究的变革潜力 | 文中未提及自身局限性，但长读长测序仍面临碱基识别准确性较低和通量相对短读技术不足等问题 | 总结单细胞RNA测序技术发展历程并探讨长读长测序在单细胞转录组学中的应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在细胞异质性、转录动态及相关计算工具中的应用 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq, scRNA-seq, 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, 组合条形码平台 | 高通量短读液滴与组合条形码平台，结合长读长测序协议 |
| 1280 | 2026-06-19 |
Machine learning-guided multimodal profiling defines perturbed immune states at the time of cancer diagnosis
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag320
PMID:42308424
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研究论文 | 利用机器学习引导的多模态分析，在癌症诊断时描绘外周血单个核细胞的免疫状态变化 | 首次整合流式细胞术、多重细胞因子分析和单细胞RNA测序的多组学数据，并结合机器学习模型对初治癌症患者的免疫状态进行系统性刻画，且模型可解释性强 | 未在独立外部队列中验证模型的泛化能力，样本量可能有限，且仅聚焦于外周血而未能涵盖肿瘤微环境 | 阐明癌症诊断时全身免疫状态的扰动特征，并建立基于免疫的多组学分析方法 | 初治癌症患者的血液样本，包括外周血单个核细胞和血浆 | 机器学习 | 癌症 | 流式细胞术、多重细胞因子分析、单细胞RNA测序 | 机器学习模型（具体类型未明确） | 单细胞多组学数据（流式细胞术和单细胞RNA测序）、血浆细胞因子数据 | 初治癌症患者与健康供者，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |