单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39398 篇文献，本页显示第 1261 - 1280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2026-05-01 |
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-04-28, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101214
PMID:42055852
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1262 | 2026-05-01 |
Deep profiling of lupus nephritis kidneys reveals dynamic changes in myeloid cells associated with disease progression
2026-Apr-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.004
PMID:42055919
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学深度分析狼疮性肾炎肾脏，揭示与疾病进展相关的髓系细胞动态变化 | 首次大规模结合scRNA-seq和空间转录组学，系统描绘狼疮性肾炎肾脏中髓系细胞亚群的动态变化及其与组织损伤和炎症的关系 | 未明确说明，但样本量有限（6例LN患者和2例对照用于空间转录组学） | 探究狼疮性肾炎中髓系细胞介导的免疫反应及其与组织学异质性的关联 | 狼疮性肾炎患者的肾脏样本（156例患者和30例健康对照用于scRNA-seq；6例患者和2例对照用于空间转录组学） | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 156例LN患者和30例健康对照（scRNA-seq），6例LN患者和2例对照（空间转录组学） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1263 | 2026-05-01 |
Neutrophil-derived reactive oxygen species and bystander tissue damage in inflammatory bowel disease
2026-Apr-22, Free radical biology & medicine
|
综述 | 探讨中性粒细胞来源的活性氧在炎症性肠病中旁观者组织损伤的作用机制 | 整合了氧化还原蛋白质组学、空间转录组学、活体成像和单细胞分析等最新技术，揭示了中性粒细胞氧化损伤并非不可规避的炎症副产物，而是动态、情境依赖且具有治疗靶向潜力的过程 | 未明确指出具体的实验数据或临床验证，属于文献综述，缺乏原创实验证据 | 综述中性粒细胞氧化自由基生物学在胃肠道黏膜中的知识，评估减轻旁观者损伤同时保留宿主防御的治疗策略 | 中性粒细胞及其在炎症性肠病中产生的活性氧和活性氮物种 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 氧化还原蛋白质组学, 空间转录组学, 活体成像, 单细胞分析 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台，Illumina NovaSeq测序系统 |
| 1264 | 2026-05-01 |
Metabolic reprogramming and signalling networks in microglial activation: Implications for neurodegeneration
2026-Apr-22, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103138
PMID:42031319
|
评论 | 综述小胶质细胞激活中的代谢重编程和信号网络，及其在神经退行性疾病中的作用 | 提出将小胶质细胞激活视为代谢-炎症整合网络，并强调炎症消退失败而非持续激活是慢性神经炎症的关键 | 代谢抑制剂的临床不可行性，需转向TREM2免疫调节剂和消退激动剂 | 整合单细胞转录组学、空间蛋白质组学和代谢组学，提供小胶质细胞激活的综合视角 | 小胶质细胞，特别是疾病相关小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1265 | 2026-05-01 |
From inflammation to malignancy: the dynamic evolution of cancer-associated fibroblasts in IBD-CRC
2026-Apr-21, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101310
PMID:42019096
|
综述 | 提出炎症相关结直肠癌中成纤维细胞从炎症到恶变动态演化的概念框架 | 提出“基质炎症记忆”假说，揭示PFKFB3介导的糖酵解转变和aPKC缺失驱动的上皮-基质互作机制 | 部分机制（如基质炎症记忆）仍处于假说阶段，缺乏直接实验证据验证 | 阐明炎症性肠病相关结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的动态演化及其在肿瘤微环境中的作用 | 肠道成纤维细胞、癌症相关成纤维细胞亚群（iCAF、myCAF、apCAF） | 机器学习 | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1266 | 2026-05-01 |
Deciphering IFN signaling in gastric cancer: A single-cell and bulk transcriptomic integration reveals CXCR4 as a key immunomodulator and prognostic determinant
2026-Apr-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102778
PMID:42019279
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学整合，解析胃癌中干扰素信号通路，发现CXCR4作为关键免疫调节因子和预后决定因子 | 首次在单细胞分辨率下深入解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号网络，并识别出CXCR4作为与干扰素信号紧密相关的关键免疫调节因子和预后生物标志物 | 研究主要基于公开数据集和体外细胞实验，缺乏体内验证和临床队列的进一步证实 | 解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号通路的作用，识别可干预的靶点以优化免疫治疗策略 | 胃癌患者的肿瘤组织样本及AGS胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、qRT-PCR、Western blot、流式细胞术、CCK-8、Transwell、划痕实验 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌患者样本数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1267 | 2026-05-01 |
RARG promotes gastric cancer progression by activating PMEPA1 transcription and Wnt/β-catenin signalling
2026-Apr-21, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112552
PMID:42025891
|
research paper | 本研究揭示了RARG通过转录激活PMEPA1及增强Wnt/β-catenin信号通路促进胃癌进展的机制 | 首次发现RARG作为PMEPA1的转录调控因子，并通过双重机制（转录激活PMEPA1和直接结合β-catenin）促进胃癌进展 | 研究中未阐述RARG在胃癌微环境中的免疫调控作用，且临床样本验证规模有限 | 探究RARG在胃癌中的功能及其下游调控机制 | 胃癌细胞系、胃癌临床组织样本、小鼠模型 | machine learning | 胃癌 | CUT&Tag测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 胃癌组织样本（未明确数量） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组分析 |
| 1268 | 2026-05-01 |
Immunoregulatory mechanisms underlying vitexin-mediated attenuation of concanavalin A-induced liver injury
2026-Apr-21, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158231
PMID:42054738
|
研究论文 | 本研究利用单细胞策略，结合质谱流式技术和单细胞RNA测序，系统解析了山奈酚苷在ConA诱导的小鼠自身免疫性肝炎模型中的免疫调节机制 | 首次整合CyTOF和scRNA-seq技术，从单细胞层面全面揭示山奈酚苷对T细胞亚群的重编程作用，特别是其在Runx2+CD4+效应T细胞和Cxcr6+CD4+组织驻留记忆T细胞中抑制IFN信号的新机制 | NA | 阐明山奈酚苷在自身免疫性肝炎中的免疫调节机制及其治疗潜力 | ConA诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型的肝免疫微环境 | 计算生物学 | 自身免疫性肝炎 | 质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1269 | 2026-05-01 |
Single-Cell sequencing investigation of endoplasmic reticulum stress-related genes in gastric cancer prognostic models and identification of NOX5 as a novel therapeutic target
2026-Apr-20, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102780
PMID:42013548
|
研究论文 | 利用单细胞测序研究内质网应激相关基因在胃癌预后模型中的作用，并鉴定NOX5为新治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析构建基于内质网应激的胃癌预后模型，并发现NOX5作为新潜在治疗靶点 | NA | 开发基于单细胞分析的内质网应激相关预后标志物，并鉴定潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和MKN-45 | 机器学习,自然语言处理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1270 | 2026-04-20 |
Deciphering immune and cellular reprogramming during the progression from inflammatory bowel disease to colorectal cancer using multi-omics single-cell and spatial transcriptomics
2026-Apr-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08158-2
PMID:42001187
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1271 | 2026-05-01 |
A self-perpetuating cycle of Type H vessel proliferation and T-2 induced inflammation drives KBD pathogenesis
2026-Apr-16, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2026.04.004
PMID:42000119
|
研究论文 | 本研究探讨了T-2毒素诱导的H型血管增殖与炎症在大骨节病（KBD）发病机制中的作用，并验证了其形成自循环驱动KBD进展 | 首次发现H型血管在大骨节病发病中的关键中介作用，揭示了T-2毒素运输、炎症与软骨损伤之间的恶性循环机制 | 未明确说明 | 探究H型血管在大骨节病（KBD）发病机制中的作用 | 大鼠KBD模型、H型血管 | 机器学习 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qPCR、免疫荧光、组织病理学 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 大鼠分为四组：对照组、低硒+T-2组、低硒+T-2+Roxadustat组、低硒+T-2+Halofuginone组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1272 | 2026-05-01 |
Locat: Joint enrichment and depletion testing identifies localized marker genes in single-cell transcriptomics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.716370
PMID:41993378
|
研究论文 | 提出一种名为Locat的框架，通过联合评估单细胞转录组数据中基因表达的富集和缺失，识别高度特异性的局部化标记基因 | 传统方法仅关注基因在候选群体内的富集，Locat同时检测表达在群体外是否显著缺失，并整合两者形成统一的局部化评分 | NA | 开发一种新的统计框架，以识别单细胞转录组数据中具有高度空间特异性的标记基因 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1273 | 2026-05-01 |
Spatial Transcriptomics and Dual Dye Mapping Identify Wnt-Driven BBB Protection in Endothelial EphA4-Deficiency
2026-Apr-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9261231/v1
PMID:41994141
|
研究论文 | 通过空间转录组学和双染料标记技术，揭示EphA4缺失内皮细胞中Wnt信号驱动的血脑屏障保护机制 | 首次结合双染料标记系统与空间转录组学，解析创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的时空动态及EphA4/Wnt信号通路的作用 | 未明确说明局限性 | 研究创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的分子和空间特征，以及EphA4/Wnt信号在保护血脑屏障中的作用 | 内皮细胞特异性EphA4基因敲除小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学, 双染料标记, 免疫组化 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 小鼠样本，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1274 | 2026-05-01 |
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715992
PMID:41993471
|
研究论文 | 利用人类扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR干扰技术，揭示了衰老通过限制CXCL13+滤泡辅助性T细胞的成熟来影响人类体液免疫 | 首次在人类特异性免疫衰老研究中发现衰老导致CXCL13 GC-Tfh细胞选择性缺失，并鉴定BACH2和SOX4为与年龄相关的分化转录调控因子 | 未明确说明限制条件 | 探究衰老对滤泡辅助性T细胞（Tfh）成熟的影响及其在抗体反应下降中的作用 | T滤泡辅助细胞（Tfh细胞）和B细胞 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序、CRISPR干扰 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 来自年轻和年长供体的人类扁桃体类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1275 | 2026-05-01 |
Defining the RNA Modification Landscape of Multiple Myeloma Reveals METTL3-Dependent m6A Regulation of NEAT1
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716518
PMID:41993494
|
研究论文 | 通过整合质谱、Nanopore直接RNA测序和甲基化RNA免疫沉淀测序，定义了多发性骨髓瘤的RNA修饰景观，并揭示了METTL3依赖的m6A修饰对NEAT1的调控作用 | 首次系统描绘多发性骨髓瘤中RNA修饰的全景图谱，发现了超过15000个m6A位点，并鉴定了m6A修饰的长链非编码RNA NEAT1在疾病中的关键调控作用 | 未明确提及研究的局限点 | 解析多发性骨髓瘤中的RNA修饰图谱及m6A修饰的长链非编码RNA在疾病中的作用机制 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 质谱, Nanopore直接RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞样本 | Oxford Nanopore Technologies | Nanopore直接RNA测序, 单细胞RNA测序 | Nanopore测序平台 | Nanopore直接RNA测序用于鉴定RNA修饰类型和m6A位点 |
| 1276 | 2026-05-01 |
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00387-1
PMID:41764353
|
研究论文 | 本研究揭示RETN通过GBP5/NLRP3信号通路介导巨噬细胞焦亡加重脓毒症的机制 | 首次阐明RETN/GBP5/NLRP3信号轴调控巨噬细胞焦亡从而加重脓毒症的机制，为脓毒症的病理机制研究和临床治疗提供新的潜在靶点和理论支持 | 未明确提及具体局限性 | 探究RETN在脓毒症病理生理过程中的具体作用机制 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型中的巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序、RNA-seq | NA | 单细胞测序和RNA-seq数据 | 脓毒症患者样本及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1277 | 2026-05-01 |
The AICL-KLRF1 axis supports CD4-CD8 T cell communication and cytokine competence in pre-exhausted CD8+ T cells
2026-Apr, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00732-5
PMID:41851343
|
研究论文 | 该研究揭示了AICL-KLRF1轴在晚期分化CD8 T细胞中支持细胞因子产生，并促进CD4-CD8 T细胞通讯 | 首次发现KLRF1作为CD4-CD8通讯轴的一部分，通过识别其配体AICL来支持晚期分化CD8 T细胞的细胞因子产生能力 | 未详细说明研究的具体局限性 | 探究在慢性感染和癌症中，维持前体耗竭CD8 T细胞细胞因子产生的信号机制 | 人类CD8 T细胞、CD4 T细胞、肺腺癌组织及邻近组织 | 免疫学 | 肺癌 | 空间蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 表观遗传组数据 | 肺腺癌和邻近组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞ATAC测序 |
| 1278 | 2026-03-21 |
scZiva: imputation method for single-cell RNA-seq data with zero-inflated variational autoencoder
2026-Mar-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06422-2
PMID:41857511
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1279 | 2026-03-20 |
Lactylation-related gene signature for prognosis prediction and immune infiltration assessment in lung adenocarcinoma via bulk and single-cell RNA sequencing
2026-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04845-0
PMID:41851557
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1280 | 2026-05-01 |
Heterogeneity and Regulatory Mechanisms of ALK-Mutant and Wild-Type Epithelial Cells in Non-Small-Cell Lung Cancer: Single-Cell Transcriptomics and Chromatin Accessibility
2026-Mar-12, Pharmacology
IF:2.9Q2
DOI:10.1159/000550967
PMID:41818350
|
研究论文 | 利用单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示ALK突变型和野生型非小细胞肺癌上皮细胞的异质性与调控机制 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，比较ALK突变与野生型肿瘤的分子差异，并鉴定CEACAM6-AKT-EGR1信号轴在耐药和恶性进展中的作用 | 样本量较小，仅5例野生型和4例ALK突变型样本；未在动物模型中验证CEACAM6靶向治疗的疗效 | 解析ALK突变型和野生型NSCLC肿瘤上皮细胞的异质性和表观遗传调控差异 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本（5例ALK野生型，4例ALK突变型） | 机器学习, 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 9例非小细胞肺癌肿瘤组织样本（5例ALK野生型，4例ALK突变型） | Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | Illumina NovaSeq | 从GEO数据库获取GSE274934数据集的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 |