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当前共找到 34800 篇文献，本页显示第 1261 - 1280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2025-12-16 |
Brain tumors induce immunoregulatory dendritic cells in draining lymph nodes that can be targeted by OX40 agonist treatment
2025-May-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011548
PMID:40389372
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研究论文 | 本研究探讨了脑肿瘤如何诱导引流淋巴结中的免疫调节性树突状细胞，并发现OX40激动剂治疗可靶向这些细胞 | 揭示了脑肿瘤引流淋巴结中树突状细胞的独特免疫调节功能，并首次将OX40信号通路与CCR7+OX40+树突状细胞的直接作用及对T细胞的间接影响联系起来 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；未详细探讨其他免疫细胞或信号通路在脑肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 研究脑肿瘤免疫微环境中树突状细胞的免疫调节功能及其对治疗反应的影响 | 小鼠胶质瘤和淋巴瘤模型中的树突状细胞及T细胞 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 高分辨率流式细胞术、单细胞RNA测序、体外和体内功能表征 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1262 | 2025-12-15 |
EnsembleRegNet: Interpretable deep learning for transcriptional network inference from single-cell RNA-seq
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了EnsembleRegNet，一种用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络的深度学习框架 | 通过集成编码器-解码器和多层感知机架构，结合Hodges-Lehmann估计器二值化、案例删除分析、RcisTarget基序富集和AUCell调控子活性评分，增强了模型的鲁棒性和生物学可解释性 | 未明确提及具体限制 | 从高维单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络结构 | 转录因子与靶基因关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成编码器-解码器, 多层感知机 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1263 | 2025-12-15 |
Single-cell sequencing analysis reveals CHURC1 as a non-canonical oncoprotein governing goblet cell-driven colorectal tumorigenesis
2026-Feb, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112197
PMID:41177418
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌样本，发现杯状细胞是结直肠癌的潜在细胞起源，并鉴定出CHURC1作为一种新型致癌基因，促进结直肠癌增殖和转移 | 首次将杯状细胞确定为结直肠癌的潜在细胞起源，并发现CHURC1作为一种非经典致癌蛋白，影响肿瘤免疫微环境中的免疫细胞因子释放 | 样本量较小（仅4名患者的14个样本），且研究未涉及更广泛的验证队列或功能机制深度探索 | 探究结直肠癌的细胞起源和致癌机制，以寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌肿瘤、肠道息肉及癌旁正常组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4名患者的14个样本（包括肿瘤、息肉和正常组织） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1264 | 2025-12-15 |
Transcriptional and post-transcriptional convergence of HES1 and IGF2BP2 sustains CSF2-dependent metabolic adaptability in gastric Cancer
2026-Feb, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112234
PMID:41213416
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和功能分析，揭示了一个驱动胃癌进展的层级信号轴，即HES1-IGF2BP2-CSF2轴，该轴通过转录和转录后调控汇聚，维持CSF2依赖的代谢适应性 | 首次阐明HES1通过转录激活IGF2BP2，后者再通过m6A修饰稳定CSF2 mRNA，从而将转录因子调控与m6A表观转录组学及糖酵解重编程整合成一个新的信号级联，驱动胃癌进展 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏在更复杂的人体肿瘤微环境或临床队列中的直接验证，且对轴上游的调控机制和下游更广泛的代谢网络探索有限 | 探究驱动胃癌进展的关键分子机制，特别是转录与转录后调控如何协同影响肿瘤代谢和恶性表型 | 胃癌细胞、胃癌异种移植模型 | 癌症生物学、分子生物学 | 胃癌 | 单细胞测序、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因检测、RNA免疫沉淀、mRNA衰变动力学分析、免疫组织化学 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、TCGA公共数据库数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1265 | 2025-12-15 |
Caveolin-1 drives vasculogenic mimicry in lung adenocarcinoma through autophagy-mediated glycolytic reprogramming
2026-Feb, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112198
PMID:41224162
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研究论文 | 本研究揭示了Caveolin-1通过自噬介导的糖酵解重编程驱动肺腺癌血管生成拟态形成的机制 | 首次阐明Cav-1通过激活自噬促进糖酵解重编程，进而驱动肺腺癌血管生成拟态形成的分子轴，并提出联合靶向自噬和糖酵解的治疗策略 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床转化效果需进一步验证；联合治疗策略的具体剂量和毒性需深入评估 | 探究Caveolin-1在肺腺癌血管生成拟态形成中的作用及分子机制 | 肺腺癌细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1266 | 2025-12-15 |
Renal tubular-derived retinoic acid drives renal fibrosis via a RAI14-TRIOBP-YAP mechanotransduction axis
2026-Feb, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112246
PMID:41242366
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研究论文 | 本文揭示了肾小管来源的视黄酸通过RAI14-TRIOBP-YAP机械转导轴驱动肾纤维化的机制 | 首次发现视黄酸作为旁分泌信号连接肾小管损伤与成纤维细胞激活，并阐明RAI14-TRIOBP-YAP轴在纤维化中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类临床相关性需进一步验证 | 探究视黄酸在肾纤维化中的功能转换机制及治疗靶点 | 肾小管上皮细胞和间质成纤维细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间代谢组学、单细胞转录组学 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1267 | 2025-12-15 |
Integrative genomic and transcriptomic profiling identifies HSPA5 as a central player in hepatocellular carcinoma pathogenesis
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过整合基因组学和转录组学分析，识别出HSPA5作为肝细胞癌发病机制中的关键因子 | 采用多组学方法（包括外显子测序、单细胞RNA-seq和空间转录组学）系统性地筛选并验证了HSPA5在肝细胞癌中的核心作用 | 未明确提及研究的样本量限制或验证队列的规模，可能影响结果的普适性 | 探索肝细胞癌的新生物标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC）患者样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 外显子测序、GO分析、PPI网络分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学、Venn分析、生存分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1268 | 2025-12-15 |
scREPA: Predicting single-cell perturbation responses with cycle-consistent representation alignment
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scREPA的新框架，用于预测单细胞扰动响应，通过将基于变分自编码器的内部表征与预训练的单细胞基础模型的高质量外部表征进行对齐来实现 | 提出了scREPA框架，首次将生成扩散模型中的表征对齐思想应用于单细胞扰动预测，并引入了循环一致表征对齐机制，通过双重一致性约束提升表征质量 | 未明确说明模型在跨物种或跨组织类型泛化能力的具体评估，也未讨论计算复杂度或运行时间 | 开发一种能够从稀疏、嘈杂、高维且数据量有限的单细胞RNA测序数据中准确预测细胞扰动响应的计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 生成扩散模型 | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1269 | 2025-12-15 |
DiffuScope: A diffusion-regularized autoencoder for spatial transcriptomic clustering
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为DiffuScope的基于图卷积变分自编码器的空间转录组学聚类框架，旨在解决数据异质性带来的挑战并提升聚类准确性和跨数据集泛化能力 | 提出了结合自监督学习、重构损失和扩散一致性损失的双重损失函数设计，以增强特征学习并改善聚类性能 | NA | 开发一种能够适应空间转录组学数据生物和技术异质性的通用聚类算法 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胃癌 | 空间转录组学 | 图卷积变分自编码器 (GC-VAE) | 空间表达数据 | 12个公开数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1270 | 2025-12-15 |
Molecular, metabolic, and histological subtypes of pancreatic ductal adenocarcinoma and its tumor microenvironment: Insights into tumor heterogeneity and clinical implications
2026-Jan, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108946
PMID:41183744
|
综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌（PDAC）在分子、代谢和组织学层面的分型方法，及其与肿瘤微环境的相互作用，旨在为精准诊断和个性化治疗提供见解 | 整合了单细胞/空间转录组学、代谢组学和深度学习病理分析等多维度技术，系统阐述了PDAC的异质性、可塑性及亚型特异性特征，重塑了PDAC的分类体系 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或模型，主要基于现有研究进行整合分析 | 阐明PDAC的肿瘤异质性，整合多组学数据以推动亚型指导的精准治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 转录组数据, 代谢组数据, 组织病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 1271 | 2025-12-15 |
APOBEC3 promotes squamous differentiation via IL-1A/AP-1 signaling
2025-Dec-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67033-8
PMID:41390483
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研究论文 | 本研究揭示了APOBEC3家族成员（特别是APOBEC3A）通过IL-1α/AP-1信号通路促进膀胱尿路上皮癌的鳞状分化和肿瘤进展 | 首次建立了结合Pten/Trp53条件性敲除和Apobec3过表达的基因工程小鼠模型（UPPA），并系统阐明了APOBEC3通过IL-1α/AP-1信号轴驱动鳞状分化的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本的验证仍需扩大；IL-1α靶向治疗在膀胱癌中的具体疗效尚未进行临床前或临床试验评估 | 探究APOBEC3在膀胱尿路上皮癌发生发展中的生物学功能及其促进鳞状分化的分子机制 | 膀胱尿路上皮癌（UC） | 肿瘤生物学 | 膀胱癌 | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 基因工程小鼠模型（UPPA） | RNA-seq数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | UPPA小鼠膀胱肿瘤样本及人类UC样本（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1272 | 2025-12-15 |
Ferroptosis inhibition protects against α-synuclein-related neuronal cell death
2025-Dec-14, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08319-z
PMID:41390672
|
研究论文 | 本研究探讨了铁死亡在帕金森病（PD）α-突触核蛋白（α-syn）相关神经元死亡中的作用，并通过体外模型和线虫模型验证了铁死亡抑制剂的保护效果 | 首次在人类PD患者死后脑组织中系统评估了多个铁死亡相关标志物的表达，并结合数字空间转录组学揭示了PD中铁死亡易感性增加的基因表达特征，同时通过多模型验证了α-syn与铁死亡通路之间的相互作用 | 铁死亡易感性存在细胞和模型依赖性，提示有效治疗策略可能需要更全面的方法，针对通路的多个方面并考虑干预时机 | 探究铁死亡在帕金森病α-突触核蛋白相关神经元死亡中的作用，并评估铁死亡抑制的神经保护潜力 | 帕金森病患者死后中脑组织、LUHMES神经元、小鼠皮层神经元（PCNs）、过表达α-syn的线虫模型 | 神经科学， 分子病理学 | 帕金森病 | 数字空间转录组学， 免疫组织化学， 体外细胞模型， 线虫模型 | NA | 组织样本， 基因表达数据， 细胞成像数据 | 10名PD患者和11名年龄匹配对照的死后中脑组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1273 | 2025-12-15 |
Fibroblast pentose phosphate pathway activation upon decreased circPLCE1 exacerbates intestinal fibrosis in Crohn's disease
2025-Dec-13, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336415
PMID:41390174
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研究论文 | 本研究探讨了克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控机制，揭示了circPLCE1/XYLB/Xu5P轴在调节磷酸戊糖途径和纤维生成中的作用 | 首次通过多层整合分析发现成纤维细胞中磷酸戊糖途径在克罗恩病肠道纤维化中的激活，并揭示了circPLCE1通过直接结合XYLB抑制其酶活性来调控该途径的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型和动物模型，人类样本验证相对有限，且未探讨其他潜在调控因子或信号通路 | 探索克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控机制 | 人类肠道成纤维细胞、小鼠肠道纤维化模型、配对黏膜和黏膜下组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 代谢组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、circRNA转录组学、代谢通量分析、Seahorse分析、RNA pull-down实验 | NA | 代谢组数据、转录组数据、空间转录组数据、circRNA数据 | 配对狭窄和非狭窄肠道段组织、原代人肠道肌成纤维细胞、葡聚糖硫酸钠诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1274 | 2025-12-15 |
Deciphering the gonadal cell atlas of Monopterus albus and cell fate during sex reversal based on single-cell RNA sequencing
2025-Dec-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04810-8
PMID:41390424
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了黄鳝性腺细胞图谱，揭示了性逆转过程中生殖细胞和体细胞的命运决定机制 | 首次在黄鳝中利用单细胞RNA测序技术全面解析性逆转过程中的性腺细胞动态，识别了具有双潜能分化能力的生殖干细胞亚群，并揭示了体细胞（如鞘细胞、间质细胞）在性逆转中的起源和功能转变 | 研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限；样本可能受个体差异影响；未深入探讨环境因素对性逆转的调控 | 解析黄鳝性逆转过程中生殖干细胞起源及体细胞角色，为脊椎动物性逆转和性发育障碍提供新见解 | 黄鳝的卵巢、卵睾和睾丸组织 | 单细胞组学 | 性发育障碍 | 单细胞RNA测序，RNA荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 卵巢、卵睾和睾丸组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1275 | 2025-12-15 |
Caspase 6 deficiency exacerbates inflammatory bowel disease via enterocyte necroptosis and bacterial translocation
2025-Dec-13, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02877-z
PMID:41390757
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研究论文 | 本研究揭示了Caspase 6在炎症性肠病中的作用机制，发现其缺失会通过上调IECs中的RIPK1激活坏死性凋亡通路，并损害巨噬细胞的细菌清除能力 | 首次阐明Caspase 6通过调控肠上皮细胞坏死性凋亡和巨噬细胞杀菌功能在IBD中的保护作用，并发现其作用依赖于组织蛋白酶L | 研究主要基于小鼠模型，在人体中的直接验证尚不充分；具体分子调控网络有待进一步解析 | 探究Caspase 6在炎症性肠病发生发展中的作用机制 | IBD患者结肠组织、DSS诱导的IBD小鼠模型（全身性敲除和肠上皮细胞特异性敲除） | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1276 | 2025-12-15 |
SpatialRNA: a Python package for easy application of Graph Neural Network models on single-molecule spatial transcriptomics dataset
2025-Dec-13, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf659
PMID:41390915
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SpatialRNA的Python包，用于在单分子空间转录组学数据上轻松应用图神经网络模型 | 开发了一个高度可扩展的工具，能够从组织样本中轻松生成（子）图，并提供了在PyG框架下方便高效应用图神经网络模型的全面教程 | 未在摘要中明确提及 | 旨在促进图神经网络模型在单分子空间转录组学数据上的应用，以全面分割组织空间域并辅助生物学解释 | 单分子空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | NA | 图像空间转录组学 | 图神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 单分子空间转录组学 | NA | NA |
| 1277 | 2025-12-15 |
Untangling the fusion of spatial omics and mechanobiology
2025-Dec-12, Progress in biomedical engineering (Bristol, England)
DOI:10.1088/2516-1091/ae16f2
PMID:41130259
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综述 | 本文探讨了空间转录组学与力学生物学的融合，提出了一种名为空间机械转录组学的整合平台，用于研究细胞物理特性与转录谱之间的关系 | 首次提出将空间转录组学与力学生物学数据整合在同一细胞中，创建空间机械转录组学平台，以关联细胞机械特性与转录差异 | 未提及具体实验验证或技术实施细节，目前仍处于概念探索阶段 | 探索整合空间转录组学和力学生物学数据，以预测疾病状态并推动精准诊断 | 细胞（特别是其物理特性和转录谱） | 空间转录组学 | 肌肉萎缩症、癌症、青光眼等 | 空间转录组学、力学生物学测量 | NA | 空间转录组数据、机械数据（如细胞膜硬度） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1278 | 2025-12-15 |
Immune cell uptake of glycinated nanoparticles conjugated to anti-fibrotic peptides enables their prolonged activity and oral administration
2025-Dec-12, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-025-01198-8
PMID:41382190
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研究论文 | 本研究开发了一种结合甘氨酸功能化可生物降解纳米颗粒与抗纤维化肽的递送平台，以实现肽类药物的口服给药和延长活性 | 首次将松弛素及其类似物与甘氨酸功能化的超顺磁性氧化铁纳米颗粒结合，通过口服给药实现抗纤维化疗效，并利用单细胞转录组学揭示了其被树突状细胞摄取的机制 | 研究仅在心肌病小鼠模型中进行，尚未在人体中验证；长期安全性和免疫原性未充分评估 | 开发一种口服给药的抗纤维化肽类药物递送系统，以替代传统的注射给药方式 | 心肌病小鼠模型、松弛素（RLX）及其类似物B7-33、甘氨酸功能化超顺磁性氧化铁纳米颗粒（SPIONs） | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1279 | 2025-12-15 |
CD44-mediated copper accumulation drives Ly6Chi macrophages activation in ulcerative colitis
2025-Dec-11, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112315
PMID:41389969
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研究论文 | 本研究揭示了在溃疡性结肠炎中，CD44介导的铜积累驱动Ly6Chi巨噬细胞活化的关键机制 | 首次阐明CD44通过调控铜积累和ATP7A表达来激活Ly6Chi巨噬细胞，为溃疡性结肠炎的炎症发病机制提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证不足，且具体信号通路细节有待进一步探索 | 阐明CD44介导的铜积累在驱动溃疡性结肠炎中Ly6Chi巨噬细胞活化中的作用 | Ly6Chi巨噬细胞、溃疡性结肠炎小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 | 基于公共数据集GSE264408和小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1280 | 2025-12-15 |
Expression profiles of GPR56 and CD99 in T cells of AIDS patients and assessment of diagnostic value
2025-Dec-09, Diagnostic microbiology and infectious disease
IF:2.1Q3
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，分析了GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞亚群中的表达动态，评估其作为疾病进展和诊断生物标志物的潜力 | 首次系统评估了GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞亚群中的共表达模式，并发现CD8⁺GPR56⁺CD99⁺ T细胞亚群作为高诊断准确性的生物标志物 | 样本量相对较小（36名患者和35名健康对照），且年龄和性别分布存在差异，可能影响结果的普遍性 | 研究GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞中的表达动态，评估其作为疾病进展和诊断生物标志物的价值 | 艾滋病患者的T细胞亚群，特别是CD8⁺和CD4⁺ T细胞 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 36名艾滋病患者（31名男性，5名女性，年龄41.58±12.42岁）和35名健康对照（25名男性，10名女性，年龄32.17±12.09岁） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |