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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2026-02-28 |
N-(1,3-dimethylbutyl)-N'-phenyl-p-phenylenediamine-quinone (6PPD-Q) induces osteoporosis by a mechanism involving CX43-mediated mitochondrial autophagy dysfunction in bone marrow mesenchymal stem cells
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119780
PMID:41690092
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研究论文 | 本研究揭示了环境污染物6PPD-Q通过靶向CX43并导致线粒体自噬功能障碍,从而诱导骨质疏松的机制 | 首次系统性地将6PPD-Q暴露与骨健康联系起来,并通过整合单细胞RNA测序、网络毒理学、分子对接与动力学等多种技术,阐明了其通过CX43介导的线粒体自噬功能障碍导致骨质疏松的新机制 | 研究中使用的6PPD-Q剂量(1或10 mg/kg)高于典型环境暴露水平,尽管与镉暴露研究及小鼠骨毒性研究中的剂量具有可比性,但仍可能限制其直接的环境暴露外推性 | 探究环境污染物6PPD-Q对骨代谢的毒性作用及其分子机制 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)、大鼠胫骨 | 毒理学与骨代谢研究 | 骨质疏松 | 转录组测序、网络毒理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、体内外实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、分子模拟数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1262 | 2026-02-28 |
Adrenocortical cell and macrophage heterogeneity at single-cell spatial resolution in KCNJ5-mutant aldosterone-producing adenomas
2026-Feb-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0246
PMID:41705625
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,分析了KCNJ5突变醛固酮瘤的肾上腺细胞异质性和微环境特征 | 首次在单细胞空间分辨率下揭示了KCNJ5突变醛固酮瘤中肾上腺皮质细胞和巨噬细胞的异质性,并识别了新的TSPAN8阳性球状带细胞群以及APA相关巨噬细胞亚群 | 研究仅分析了三个配对样本,样本量较小,且未涵盖其他基因型APA | 阐明KCNJ5突变醛固酮瘤的细胞异质性、微环境特征及其在疾病发生中的作用 | KCNJ5突变的醛固酮瘤及其远端肾上腺组织 | 数字病理学 | 肾上腺疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 3对KCNJ5突变醛固酮瘤和远端肾上腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1263 | 2026-02-28 |
A multi-omics approach reveals PFHxS as an environmental driver of gastric cancer via KEAP1 downregulation
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119902
PMID:41707531
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研究论文 | 本研究采用多组学方法揭示了环境污染物PFHxS通过下调KEAP1驱动胃癌进展的分子机制 | 首次提供了PFHxS作为胃癌环境驱动因子的分子证据,并开发了具有临床相关性的11基因预后特征 | 研究主要基于计算预测和实验验证,人群流行病学证据有待补充 | 探究PFHxS环境暴露与胃癌发生发展的关联及分子机制 | 胃癌细胞、动物模型、TCGA和GEO队列的转录组数据 | 多组学分析 | 胃癌 | 网络毒理学、转录组分析、单细胞RNA测序、分子模拟、体外和体内验证 | 梯度提升机 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO队列数据,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1264 | 2026-02-28 |
RNA2seg: a generalist model for cell segmentation in image-based spatial transcriptomics
2026-Jan-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03908-9
PMID:41618375
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RNA2seg的通用细胞分割模型,用于基于成像的空间转录组学中的细胞分割 | 提出了一种新颖的细胞分割算法RNA2seg,它整合了RNA点云及所有可用的膜和核染色信息,并采用师生训练方案在超过400万个细胞上进行训练 | NA | 开发一种通用模型,用于在基于成像的空间转录组学中实现准确的细胞分割,以将每个RNA分子正确分配到细胞中 | 来自MERFISH和CosMx数据集的超过400万个细胞,涵盖七个器官 | 数字病理学 | NA | 基于成像的空间转录组学 | 师生训练方案 | 图像、RNA点云、膜和核染色数据 | 超过400万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1265 | 2026-02-28 |
Differentiation in the human urothelia is defined by distinct alternative polyadenylation
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116839
PMID:41533515
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研究论文 | 本研究揭示了在人类输尿管尿路上皮分化过程中,选择性多聚腺苷酸化(APA)作为转录组多样性的主要来源,独立于mRNA水平变化 | 首次在人类尿路上皮分化中系统性地将APA与细胞状态特异性转录组多样性联系起来,并通过单细胞成像和报告基因实验验证了APA对蛋白质表达的空间特异性调控 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未完全捕捉到所有APA事件的动态变化,且机制研究仍处于初步阶段 | 探究人类尿路上皮分化过程中转录组多样性的产生机制 | 人类输尿管尿路上皮细胞,包括基底祖细胞、中间细胞和终末分化的伞状细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞成像,报告基因实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 13,544个尿路上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1266 | 2026-02-28 |
Immunotherapy-driven remodeling of the tumor immune microenvironment: Spatiotemporal heterogeneity and multidimensional dynamics
2026-Jan-27, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189544
PMID:41610921
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综述 | 本文综述了免疫治疗过程中肿瘤免疫微环境的时空异质性和多维动态变化 | 系统整合了scRNA-seq和空间转录组学等前沿技术揭示的TME动态轨迹,并分析了ICB治疗下免疫细胞亚群的时空演化规律 | NA | 阐述免疫治疗过程中肿瘤微环境的动态轨迹和表型变化,为癌症免疫治疗提供见解 | 肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1267 | 2026-02-28 |
Histone demethylase KDM7A negatively regulates fibrotic macrophage polarization and lung fibrosis progression
2026-Jan-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09610-1
PMID:41578150
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去甲基化酶KDM7A通过调控TLR8表达来抑制促纤维化巨噬细胞极化,从而限制肺纤维化进展的表观遗传机制 | 首次发现KDM7A-TLR8轴作为抑制促纤维化巨噬细胞极化的关键表观遗传调控通路,并揭示其表达随年龄下降与临床风险模式的关联 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限;性别差异的机制尚未完全阐明 | 探究表观遗传机制在调控巨噬细胞极化及肺纤维化进展中的作用 | Kdm7a基因敲除小鼠、肺纤维化患者肺组织、巨噬细胞体外培养体系 | 表观遗传学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、巨噬细胞功能实验、表观遗传分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、组织样本数据 | 基因敲除小鼠模型及肺纤维化患者组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1268 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptomics reveals diversity and conservation of chicken lymphocytes
2026-Jan-18, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106475
PMID:41719991
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研究论文 | 本研究构建了鸡三种主要免疫器官的高分辨率单细胞转录组图谱,揭示了淋巴细胞多样性及其进化保守性 | 首次建立了鸡免疫器官的单细胞转录组图谱,系统鉴定了24种免疫和基质细胞类型,揭示了性二态性免疫成熟特征,并通过跨物种比较证明了核心免疫调控回路的进化保守性 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平和功能验证;样本来源限于特定发育阶段;未涉及病原感染等免疫激活状态 | 解析鸡免疫系统的细胞组成、发育轨迹和进化特征 | 家鸡(Gallus gallus)的胸腺、法氏囊和脾脏三种主要免疫器官 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种免疫器官(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1269 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptome analysis reveals critical causative candidates for Down syndrome-related lung diseases
2026-Jan, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.05.009
PMID:40451386
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了唐氏综合征相关肺部疾病的关键致病候选因素 | 利用Dp16小鼠模型结合单细胞RNA测序技术,首次系统性地探索了染色体21三体对肺部疾病的影响,并发现了APP相关相互作用增强、MHC-II信号上调等新机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;样本量相对有限 | 探究唐氏综合征相关肺部疾病的致病机制 | Dp16小鼠模型的肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Dp16小鼠模型(雄性和雌性)的肺部细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1270 | 2026-02-28 |
Fibroblast-driven MMP-9/TIMP-1 imbalance in bronchoalveolar lavage reflects fibrotic progression in interstitial lung disease
2026-Jan, European journal of clinical investigation
IF:4.4Q2
DOI:10.1111/eci.70162
PMID:41354972
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研究论文 | 本研究评估了间质性肺疾病患者支气管肺泡灌洗液中MMP-9/TIMP-1比值与纤维化严重程度的关系,并确定了成纤维细胞/肌成纤维细胞是导致该失衡的主要细胞来源 | 首次在人类ILD患者中系统评估BAL液中MMP-9/TIMP-1比值与纤维化进展的关联,并结合原代细胞培养和单细胞RNA测序数据分析,明确了成纤维细胞是驱动该失衡的关键细胞类型 | 样本量较小(48例),为单中心研究,需要更大规模的多中心研究进行验证 | 阐明MMP-9/TIMP-1平衡在间质性肺疾病纤维化进展中的作用,并探索其作为生物标志物的潜力 | 间质性肺疾病患者(包括非纤维化ILD、纤维化ILD和特发性肺纤维化患者)的支气管肺泡灌洗液样本及从中分离的成纤维细胞/肌成纤维细胞 | NA | 间质性肺疾病 | 酶联免疫吸附试验、明胶酶谱法、免疫荧光、单细胞RNA测序数据分析 | NA | 蛋白质浓度数据、酶活性数据、免疫荧光图像、单细胞RNA测序数据 | 48例连续入组的ILD患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1271 | 2026-02-28 |
Single-cell dissection of hepatocellular carcinoma immunity: from heterogeneous subtypes to precision therapeutics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1744845
PMID:41756301
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综述 | 本文综述了单细胞测序在肝细胞癌肿瘤微环境免疫细胞亚群分析中的应用,旨在总结免疫亚群的主流分类及其功能意义与治疗价值 | 利用单细胞测序技术解析肝细胞癌肿瘤微环境的细胞异质性,并基于生物标志基因分析免疫亚群的功能和治疗潜力 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要依赖现有研究进行综合,可能受限于已发表研究的覆盖范围和深度 | 通过单细胞分辨率分析肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞亚群,以促进精准治疗研究 | 肝细胞癌的肿瘤微环境,特别是其中的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1272 | 2026-02-28 |
Microglial heterogeneity: influence of human 2D, 3D, and co-culture models on gene expression and immune function
2026, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2026.1770518
PMID:41757348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类单核细胞来源的小胶质细胞在不同培养模型(2D、3D单培养及3D神经胶质共培养)中的基因表达和免疫功能异质性 | 首次系统比较了不同培养维度(2D vs 3D)和细胞环境(单培养 vs 共培养)对人类小胶质细胞状态组成的影响,揭示了培养架构对小胶质细胞身份和免疫反应性的决定性作用 | 研究基于体外培养模型,可能无法完全模拟体内复杂的微环境;样本来源和培养条件的具体细节未明确说明 | 探究培养模型的维度(2D/3D)和细胞环境对小胶质细胞状态异质性和功能的影响 | 人类单核细胞来源的小胶质细胞(MDMi) | 单细胞组学 | 神经免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1273 | 2026-02-28 |
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-12, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110925
PMID:41207622
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠皮下白色脂肪组织中胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组动态、细胞亚群及其混合起源 | 首次在单细胞水平上全面解析了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性,并揭示了其混合起源(成年骨髓和胚胎来源) | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;且主要关注急性冷暴露,长期效应未知 | 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性产热反应中的转录组动态、细胞亚群和起源 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞(表达胆碱乙酰转移酶) | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及热中性或急性冷暴露条件下的小鼠脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1274 | 2026-02-28 |
Myocardial reprogramming by HMGN1 underlies heart defects in trisomy 21
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09593-9
PMID:41125893
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研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞和小鼠模型,揭示了HMGN1在唐氏综合征相关先天性心脏缺陷中的关键作用 | 首次将HMGN1鉴定为染色体21上的剂量敏感基因,通过单细胞转录组学和CRISPR激活筛选技术,阐明了其在房室管心肌细胞重编程和心脏间隔缺陷中的机制 | 研究主要基于体外细胞模型和小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 解析唐氏综合征中先天性心脏缺陷的遗传机制 | 人类多能干细胞、小鼠模型、染色体21基因 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞转录组学、CRISPR激活筛选、CROP-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1275 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptomics showed that maternal PCB exposure dysregulated ER stress-mediated cell type-specific responses in the liver of female offspring
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657944
PMID:40501930
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了母体多氯联苯暴露如何通过内质网应激途径,在雌性后代肝脏中引起细胞类型特异性的代谢与免疫功能失调 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明了围产期PCB暴露对雌性后代肝脏不同细胞类型的特异性转录重编程效应,并揭示了内质网应激通路的关键介导作用 | 研究仅针对雌性后代且观察时间点为出生后28天,未评估雄性后代、更长期效应或剂量依赖性反应 | 探究母体多氯联苯暴露对后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 | 围产期暴露于多氯联苯混合物的雌性小鼠(出生后28天)的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 代谢功能障碍 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 围产期PCB暴露的雌性小鼠肝脏组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1276 | 2026-02-28 |
Single-cell profiling of the amphioxus digestive tract reveals conservation of endocrine cells in chordates
2024-12-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq0702
PMID:39705360
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了文昌鱼消化道的细胞特征,包括其分段结构和细胞簇多样性,并强调了内分泌样细胞的保守性 | 首次在文昌鱼消化道中发现并描述了三种分泌胰岛素样、胰高血糖素样和生长抑素样肽的内分泌样细胞,揭示了脊椎动物消化系统进化的关键线索 | 研究基于模型生物文昌鱼,可能不完全代表所有脊椎动物的进化过程,且功能验证仅限于特定基因敲除线 | 探索脊椎动物消化系统的进化起源,通过分析原始脊索动物文昌鱼的消化道细胞特征 | 文昌鱼(amphioxus)的消化道组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,批量组织测序,基因敲除 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1277 | 2026-02-28 |
Chemokine expression profile of an innate granuloma
2024-Nov-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96425
PMID:39541153
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析先天免疫系统在肝脏中形成肉芽肿过程中的趋化因子表达谱 | 首次在先天免疫肉芽肿模型中系统研究CC和CXC趋化因子及其受体的时空动态表达模式 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;仅关注CCR2在单核细胞来源巨噬细胞中的作用,未全面探讨其他趋化因子受体 | 阐明先天免疫肉芽肿形成过程中趋化因子如何指导免疫细胞分层聚集 | 小鼠肝脏中的先天免疫肉芽肿 | 空间转录组学 | 感染性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1278 | 2026-02-28 |
Dual targeting macrophages and microglia is a therapeutic vulnerability in models of PTEN-deficient glioblastoma
2024-Oct-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178628
PMID:39352749
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中巨噬细胞与小胶质细胞的负相关性,并提出了靶向LOX和CLOCK-OLFML3轴的双重抑制联合抗PD1疗法的治疗策略 | 首次发现PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中巨噬细胞与小胶质细胞在肿瘤微环境中呈负相关,并揭示了LOX抑制通过NF-κB-PATZ1信号通路上调OLFML3表达的补偿机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞和小胶质细胞的相互作用机制及联合靶向治疗策略 | PTEN缺陷型胶质母细胞瘤小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞、小胶质细胞及肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学、多重顺序免疫荧光、功能研究 | NA | 转录组数据、免疫荧光图像 | 未明确说明具体样本数量,使用PTEN缺陷型胶质母细胞瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1279 | 2026-02-28 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-06-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,构建了成年雌性埃及伊蚊中肠的细胞图谱 | 首次建立了埃及伊蚊中肠单细胞分离与RNA测序的方案,并系统注释了其细胞类型,为在单细胞水平研究虫媒病毒与中肠的相互作用提供了基础 | 研究未直接应用于病毒-中肠相互作用的实验验证,且为新建立的方法,其广泛适用性有待进一步验证 | 构建埃及伊蚊中肠的单细胞转录组图谱,以支持后续在单细胞水平研究虫媒病毒感染机制 | 成年雌性埃及伊蚊的中肠组织 | 单细胞组学 | 虫媒病毒感染(如登革热、寨卡病毒等) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,研究对象为成年雌性埃及伊蚊中肠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1280 | 2026-02-28 |
Airway injury induces alveolar epithelial and mesenchymal responses mediated by macrophages
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.02.587596
PMID:38617297
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探索了气道特异性上皮损伤如何引发远端肺泡、免疫和间质细胞的广泛反应 | 揭示了气道损伤通过肺泡巨噬细胞介导的Osteopontin上调,诱导远端肺泡II型细胞增殖和新型间质细胞群MANC2的动态变化 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证,且未深入探讨长期疾病发展机制 | 探究气道损伤对远端肺组织细胞反应的影响机制 | 小鼠模型中的气道和肺泡组织细胞 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |