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当前共找到 38003 篇文献,本页显示第 1261 - 1280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1261 2026-03-18
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种名为HIV-seq的新方法,用于更有效地捕获HIV转录本,并通过单细胞RNA-seq分析HIV感染者细胞,揭示了病毒转录细胞在病毒血症和抑制期间的基因表达差异 开发了HIV-seq方法,通过添加针对HIV基因组保守区域的自定义捕获序列,提高了HIV RNA+细胞的检测效率达44%,并结合CITE-seq进行表面表型分析,首次系统比较了病毒血症和ART抑制期间HIV转录细胞的转录特征 样本量相对较小,仅基于配对血液样本,可能无法完全代表所有组织中的HIV转录细胞,且方法依赖于自定义捕获序列的设计,可能对HIV变异株的覆盖不完全 研究HIV感染者中病毒转录细胞的基因表达差异,特别是在病毒血症和抗逆转录病毒治疗抑制期间的比较,以理解活跃病毒库细胞的持久性机制 HIV感染者的血液样本,包括病毒血症和ART抑制期间的配对样本 单细胞测序 HIV感染 单细胞RNA-seq, CITE-seq NA 单细胞转录组数据, 表面表型数据 配对血液样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 表面表型分析 NA NA
1262 2026-03-18
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过BCR受体克隆、表达及单细胞转录组学分析,探讨了人类对普遍存在的N-乙酰-D-葡萄糖胺(GlcNAc)表位的B细胞库,并揭示了抗糖抗体在生发中心依赖的亲和力成熟过程 结合BCR克隆表达与单细胞转录组学,首次系统分析了人类抗GlcNAc B细胞库的免疫系统发育史,揭示了其在早期儿童期通过生发中心进行亲和力成熟的新机制 研究主要关注GlcNAc表位,可能未全面覆盖其他糖类抗原;样本队列和年龄范围可能限制结论的普遍性 解析人类抗体库对碳水化合物抗原的广泛反应性机制,特别是针对GlcNAc表位的B细胞选择与成熟过程 人类队列中的循环抗GlcNAc B细胞及其BCR受体 免疫学 NA BCR受体克隆与表达、单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据、BCR序列数据 人类队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1263 2026-03-18
Single-cell multidimensional profiling of tumor cell heterogeneity in supratentorial ependymomas
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和活细胞成像技术,系统描绘了幕上室管膜瘤的肿瘤细胞异质性、空间组织和动态行为 首次在单细胞和空间维度上整合分析了幕上室管膜瘤的细胞状态、空间架构及微环境影响,揭示了肿瘤内两种不同的祖细胞样状态,并发现了脑内常驻细胞对肿瘤细胞向神经元样表型转化的新作用 未明确说明样本数量及具体技术平台细节,且研究聚焦于特定亚型,结论的普适性有待进一步验证 解析幕上室管膜瘤的肿瘤异质性、空间组织模式及其与神经微环境的相互作用 幕上室管膜瘤(一种儿童侵袭性脑肿瘤)的肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 脑肿瘤(幕上室管膜瘤) 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 活细胞成像 NA 转录组数据, 空间位置数据, 影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1264 2026-03-18
Development of robust antiviral assays using relevant apical-out human airway organoids
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种使用顶端向外人类气道类器官进行高通量抗病毒药物筛选的标准化方法 引入了具有反向双极性的气道类器官,实现了单类器官每孔的高通量培养和分析,提高了病毒感染效率和药物筛选的标准化水平 研究主要作为SARS-CoV-2的概念验证应用,尚未广泛扩展到其他病毒或疾病模型 开发标准化的类器官平台用于抗病毒药物发现和评估 人类气道类器官和SARS-CoV-2病毒株 数字病理学 呼吸道疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学 类器官模型 转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1265 2026-03-18
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了黑色素瘤中预后和预测性免疫生物标志物检测的最新方法 整合了从批量组织基因表达谱到单细胞空间转录组学和基于人工智能的图像分析等多种技术,以全面表征黑色素瘤免疫微环境 作为综述文章,未提供原始实验数据或新方法验证,主要总结现有研究 改进黑色素瘤的免疫基础预测和预后生物标志物检测方法 黑色素瘤患者,特别是II-IV期患者 数字病理学 黑色素瘤 基因表达谱分析,空间转录组学,人工智能图像分析 NA 图像,文本(基因表达数据) NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1266 2026-03-18
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了长链非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用及其治疗潜力 首次揭示了lncR-APDC在牙周炎中的关键调控作用,发现了一个新的上皮细胞亚群,并提出了lncR-APDC与特定蛋白直接结合的可能性 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证;部分分子相互作用机制尚未完全阐明 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 lncR-APDC基因敲除小鼠、实验性牙周炎模型、牙周组织免疫细胞 表观遗传学 牙周炎 单细胞RNA测序、基因敲除、AAV9介导的基因治疗 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1267 2026-03-18
Manifold Interpolating Optimal-Transport Flows for Trajectory Inference
2022-Dec, Advances in neural information processing systems
PMID:37397786
研究论文 提出了一种名为MIOFlow的方法,用于从稀疏时间点采集的静态快照样本中学习随机、连续的群体动态 结合动态模型、流形学习和最优传输,通过训练神经常微分方程在静态群体快照之间进行插值,并利用流形地面距离的最优传输进行惩罚 未在摘要中明确说明 从静态快照样本推断连续群体动态轨迹 模拟数据(含分叉与合并)和scRNA-seq数据(胚状体分化和急性髓系白血病治疗) 机器学习 急性髓系白血病 scRNA-seq 神经常微分方程(Neural ODE)、自编码器(GAE) 单细胞RNA测序数据、模拟数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1268 2026-03-17
Integrative single-cell and spatial transcriptomic reveals S100A16+ tumor endothelial cells drive angiogenesis and immunosuppression in hepatocellular carcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学,揭示了S100A16+肿瘤内皮细胞在肝细胞癌中驱动血管生成和免疫抑制的关键作用 首次在肝细胞癌中鉴定出S100A16+肿瘤内皮细胞亚群,并阐明其通过CCL20和TGF-β2促进血管生成和Treg分化、导致免疫抑制的双重机制 样本量相对有限(49个单细胞样本,12个空间样本),临床验证队列规模较小,机制研究主要在体外和动物模型中进行 探究肝细胞癌中肿瘤相关内皮细胞的分子特征、功能及其在肿瘤进展中的作用 肝细胞癌组织、正常肝组织、肿瘤边界区域、人脐静脉内皮细胞、内皮细胞特异性敲除小鼠 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNA测序,多重免疫荧光分析 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,临床数据 49个样本(145,692个高质量单细胞),12个空间样本(49,091个空间点),90对配对HCC样本的组织微阵列,一个免疫治疗晚期HCC队列 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1269 2026-03-17
Aflatoxin B1 accelerates diabetic nephropathy progression via ITGA11/LTBP1-dependent oxidative and fibrotic pathways: Evidence from multi-omics and molecular simulations
2026-May-01, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过多组学和分子模拟揭示了黄曲霉毒素B1通过ITGA11/LTBP1依赖的氧化和纤维化通路加速糖尿病肾病进展的机制 首次系统性地整合了批量转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学及分子模拟技术,全面解析了AFB1在糖尿病肾病中的分子调控网络,并识别出ITGA11和LTBP1作为关键分子介导物 研究主要基于计算和模拟分析,缺乏体内或体外实验验证AFB1与ITGA11/LTBP1的直接相互作用及其功能影响 阐明AFB1在糖尿病肾病进展中的作用机制,识别相关的分子通路和细胞间通讯轴 糖尿病肾病相关的分子和细胞通路,特别是AFB1响应的基因和蛋白 计算生物学 糖尿病肾病 批量转录组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 免疫去卷积, 细胞间通讯推断, 伪时间轨迹分析, 分子对接, 分子动力学模拟 NA 转录组数据, 空间数据, 模拟数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1270 2026-03-17
MIF-CD74 axis facilitates MDSC infiltration in the tumor microenvironment of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中MIF-CD74轴如何促进髓源性抑制细胞(MDSCs)浸润,揭示了其与癌症相关成纤维细胞(CAFs)的相互作用及其对免疫抑制微环境的影响 首次在PDAC组织中通过单细胞RNA测序和空间转录组学发现MDSCs特征性表达CD74,并揭示MIF-CD74轴在CAFs与MDSCs相互作用中的关键作用,为免疫治疗提供了新靶点 研究主要基于手术标本和鼠模型,临床样本量有限,且未深入探讨MIF-CD74轴在其他癌症类型中的普适性 研究PDAC肿瘤微环境的免疫抑制特性,特别是MDSCs的浸润机制及其与CAFs的相互作用 胰腺导管腺癌(PDAC)组织样本、髓源性抑制细胞(MDSCs)、癌症相关成纤维细胞(CAFs) 数字病理学 胰腺癌 流式细胞术(FCM)、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据、流式细胞术数据 PDAC手术标本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1271 2026-03-17
Formononetin, an active component of RAS-RH, ameliorates radiation-induced mitochondrial fission dysfunction in endothelial cells via TCs-ECs crosstalk
2026-May, Microvascular research IF:2.9Q2
研究论文 本研究揭示了中药复方RAS-RH的活性成分芒柄花素通过调控心脏端细胞介导的旁分泌信号,减轻X射线辐射诱导的大鼠心脏微血管内皮细胞损伤的机制 首次阐明了芒柄花素通过AR/miR-151a-5p/Fis1轴介导心脏端细胞与内皮细胞之间的串扰,抑制线粒体过度分裂的核心机制 研究为体外细胞模型,缺乏体内实验验证;机制研究主要聚焦于Fis1通路,可能存在其他调控途径 探究RAS-RH及其活性成分芒柄花素缓解辐射诱导内皮细胞损伤的作用机制 大鼠心脏微血管内皮细胞、心脏端细胞 细胞生物学 辐射损伤 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、Western blot、免疫荧光、流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1272 2026-03-17
BRIP1-mediated RINT1 acetylation and NF-κB activation promote DNA repair and immunosuppressive microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了BRIP1通过调控RINT1乙酰化和NF-κB信号通路,促进肺腺癌DNA修复和免疫抑制微环境形成的分子机制 首次发现BRIP1通过两条相互关联的通路协调DNA修复能力和先天免疫抑制,并建立了BRIP1作为DNA修复能力与免疫抑制之间分子联系的新角色 研究主要在细胞和动物模型中进行,临床转化效果需进一步验证;BRIP1调控的具体分子细节仍需深入探索 探究BRIP1在肺腺癌DNA修复和免疫逃逸中的作用机制,为联合免疫治疗提供新靶点 肺腺癌细胞、肿瘤组织、动物模型 肿瘤免疫学 肺腺癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫组化、功能实验 NA 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 未明确说明具体样本数量,涉及肿瘤组织和多个细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1273 2026-03-17
BPHL promotes TNBC stemness by resolving R-loops via POLR2A lactylation inhibition and BARD1-mediated ubiquitination
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本文揭示了BPHL通过调控R-loop稳态来维持三阴性乳腺癌干细胞干性的新机制 首次发现BPHL通过抑制POLR2A乳酰化并促进BARD1介导的泛素化来解析R-loops,从而驱动Wnt信号通路和肿瘤干细胞干性 研究主要基于体外和动物模型,临床转化潜力需进一步验证 探究BPHL在调控三阴性乳腺癌干细胞干性中的作用机制 三阴性乳腺癌细胞和肿瘤干细胞 癌症生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 26个乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1274 2026-03-17
PH2ST: Prompt-guided hypergraph learning for spatial transcriptomics prediction in whole slide images
2026-May, Medical image analysis IF:10.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为PH2ST的提示引导超图学习框架,用于从H&E染色组织学图像中预测空间转录组学数据 利用提示引导超图学习框架,结合有限的空间转录组学信号来指导多尺度组织学表示学习,以实现准确且稳健的空间基因表达预测 NA 解决当前空间转录组学技术成本高、覆盖范围有限和技术复杂性的问题,通过预测方法实现可扩展且经济高效的空间基因表达图谱构建 H&E染色组织学图像与空间转录组学数据之间的关系 数字病理学 NA 空间转录组学 超图学习框架 图像 两个公共空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
1275 2026-03-17
Unraveling pancreatic ductal adenocarcinoma at single-cell resolution with spatial insights: From mechanisms to clinical translation
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 本文系统总结了基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)的胰腺导管腺癌(PDAC)研究,并讨论了整合单细胞与空间多组学方法在解析PDAC肿瘤微环境中的应用 整合了单细胞测序与空间多组学技术,为理解PDAC的细胞异质性、肿瘤微环境动态交互和临床转化提供了新的框架 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 系统总结PDAC在单细胞分辨率下的研究进展,并探讨从机制到临床转化的路径 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境,包括T细胞、髓系细胞、成纤维细胞和恶性上皮细胞等 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间多组学 NA 单细胞转录组数据,空间多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1276 2026-03-17
Targeting ACSS2 disrupts metabolic-epigenetic crosstalk to restore apoptosis and temozolomide chemosensitivity in pancreatic neuroendocrine tumors
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了胰腺神经内分泌肿瘤(PNETs)中ACSS2通过代谢-表观遗传信号轴驱动替莫唑胺(TMZ)耐药的新机制,并提出了靶向ACSS2/BCL6/P53轴以恢复化疗敏感性的治疗策略 首次在PNETs中发现ACSS2通过介导乙酸盐代谢促进组蛋白高乙酰化,进而上调BCL6并抑制TP53表达,从而驱动TMZ耐药的非冗余代谢-表观遗传屏障 研究主要基于临床队列分析、细胞模型、患者来源类器官和小鼠模型,仍需在更大规模的前瞻性临床试验中验证靶向ACSS2/BCL6轴的治疗效果 阐明胰腺神经内分泌肿瘤对替莫唑胺化疗耐药的分子机制,并探索克服耐药性的新治疗策略 胰腺神经内分泌肿瘤(PNETs)细胞、患者来源类器官、Rip1-Tag2免疫活性小鼠模型 肿瘤代谢与表观遗传学 胰腺神经内分泌肿瘤 单细胞RNA测序、临床队列分析、药理学抑制、基因敲除、免疫治疗联合 NA 单细胞转录组数据、临床数据、类器官实验数据、小鼠模型数据 未明确指定具体样本数量,但涉及临床队列、患者来源类器官和Rip1-Tag2小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1277 2026-03-17
The underlying mechanism of cardiac injury in exertional heat stroke rats based on the scRNA-seq analysis
2026-04-09, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序分析,探讨了劳力性热射病大鼠心脏损伤的潜在机制 首次在劳力性热射病模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地鉴定了不同细胞类型中的差异表达基因,并验证了Hspa8、Hspe1、Id1、Ndufa4和Cd36等关键基因在心脏损伤机制中的作用 研究基于大鼠模型,其结果向人类临床应用的转化需要进一步验证;单细胞测序分析仅聚焦于基因表达层面,未深入探究蛋白质功能或翻译后修饰的影响 探究劳力性热射病中心脏损伤的细胞信号通路和关键基因,为早期识别心脏损伤生物标志物提供理论依据 劳力性热射病大鼠模型的心脏组织 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,基因表达定量数据,组织切片图像 未明确说明具体样本数量的大鼠心脏组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1278 2026-03-17
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2026-Apr, Human immunology IF:3.1Q3
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,探究了SOCE阻断剂BTP2和CM4620在PHA驱动的T细胞活化模型中,对人类外周血单个核细胞炎症反应的特异性调控作用 首次在单细胞分辨率下揭示了SOCE阻断剂对特定免疫细胞亚群(CD8效应T细胞、NK细胞和CD4调节性T细胞)转录程序的特异性调控,为靶向免疫调节提供了新见解 研究基于体外PHA驱动的T细胞活化模型,可能无法完全反映体内复杂免疫环境;需要未来与常规免疫抑制剂进行头对头比较研究 探究SOCE阻断在特定活化背景下对免疫细胞功能的细胞类型特异性影响 正常人外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 免疫介导性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1279 2026-03-17
Exploring estrogen synthesis and metabolism related markers and immune dynamics in osteoporosis-insights from single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization
2026-Apr, Experimental gerontology IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关标志物及免疫动态 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别出CCND1、SCGB1A1和DDIT4作为骨质疏松症的新型生物标志物 样本量可能有限,且研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证其临床适用性 探索骨质疏松症中雌激素相关标志物以改善诊断和治疗 骨质疏松症患者 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blot 机器学习 RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1280 2026-03-17
Hot Zones for Liver Cancer: Metabolic Zonation, Ferroptosis, and the Origins of HCC
2026-Mar-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠遗传学与空间转录组学结合,揭示了肝癌(HCC)起源于肝脏特定代谢区域(区域3)的机制,并识别出Gstm2和Gstm3酶在抑制铁死亡和促进肿瘤形成中的关键作用 首次通过空间转录组学追踪肝脏特定区域的癌前肝细胞,发现肝癌主要起源于区域3,揭示了克隆扩张与肿瘤发生潜力之间的脱节,并识别出GSTMs酶在维持氧化还原平衡和抑制铁死亡中的核心作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类肝癌中的直接适用性需进一步验证,且未详细探讨其他潜在影响因素 探究肝癌在肝脏代谢异质性区域中的起源机制,并识别关键调控因子 小鼠肝脏的特定代谢区域(区域1和区域3)及其癌前肝细胞 空间转录组学 肝癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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