单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12761 - 12780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12761 | 2024-08-04 |
Elucidating key immunological biomarkers and immune microenvironment dynamics in aging-related intracranial aneurysm through integrated multi-omics analysis
2024-May, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24117
PMID:38214030
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研究论文 | 本文通过整合多组学分析阐明了与衰老相关的颅内动脉瘤中的关键免疫生物标志物和免疫微环境动态 | 通过对小鼠脑动脉瘤模型的单细胞测序数据进行分析，识别了重要的免疫细胞亚群及其相互作用，有助于揭示免疫微环境的变化 | 该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的临床情况 | 本研究旨在探讨颅内动脉瘤的免疫微环境及其动态变化 | 研究对象为小鼠模型中诱导的Willis动脉瘤及其免疫细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，RNA测序 | NA | 细胞数据，基因表达数据 | 97个颅内动脉瘤样本 |
| 12762 | 2024-08-04 |
Unraveling neoantigen-associated genes in bladder cancer: An in-depth analysis employing 101 machine learning algorithms
2024-May, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24123
PMID:38189174
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研究论文 | 本研究探讨了与膀胱癌相关的新抗原基因及其对预后的影响 | 采用101种机器学习算法组合进行全面分析，构建了包含九个基因的预后模型 | 模型的有效性需要在更大规模和多样化的人群中进一步验证 | 探索膀胱癌中新抗原相关基因的机制及其对预后的影响 | 主要研究对象为膀胱癌的相关新抗原基因及其在预后中的作用 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞测序与大规模测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 来自公共数据库的多个样本 |
| 12763 | 2024-08-04 |
PANoptosis-related signature in melanoma: Transcriptomic mapping and clinical prognostication
2024-May, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24126
PMID:38189554
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis在黑色素瘤中的作用及其与临床预后之间的关系 | 首次将PANoptosis的基因特征与黑色素瘤预后相关联，并建立了预测模型 | 未明确指出具体的样本来源和数量限制，可能影响结果的普适性 | 研究PANoptosis在黑色素瘤中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 黑色素瘤细胞及患者样本 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组分析、机器学习建模 | NA | 转录组数据 | 多种患者队列的样本，具体数量未说明 |
| 12764 | 2024-08-07 |
Ferroptosis heterogeneity within the tumor microenvironment revealed a genetic blueprint of breast cancer
2024-May, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24142
PMID:38251953
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研究论文 | 本研究通过分析大量RNA和单细胞RNA测序数据，揭示了铁死亡在乳腺癌肿瘤微环境中的异质性及其遗传基础 | 首次构建了基于铁死亡和浸润免疫细胞的乳腺癌预后模型，并揭示了SLC39A7基因在乳腺癌发病机制中的作用 | 研究主要基于数据分析，未来需要实验验证结果的可靠性 | 探索铁死亡与免疫检查点阻断反应在乳腺癌中的关系 | 乳腺癌患者的肿瘤微环境和铁死亡相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | LASSO回归 | RNA | 1217个样本，包括1104名乳腺癌患者和113名对照 |
| 12765 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of biomarker in allergic rhinitis patient undergoing intracervical lymphatic immunotherapy and related pan-cancer analysis
2024-May, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24151
PMID:38291708
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了过敏性鼻炎患者在接受宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化，并进行了相关的泛癌分析 | 首次采用宫颈淋巴免疫治疗（ICLIT）方法，并利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫细胞反应的分子机制 | NA | 探究过敏性鼻炎患者在接受宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化及其与肿瘤的关联 | 过敏性鼻炎患者的B细胞及其在宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12766 | 2024-08-07 |
Tumor markers for lipid metabolism-related genes: Based on small cell lung cancer and bronchial asthma dual analysis
2024-May, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24152
PMID:38293814
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研究论文 | 本研究通过分析小细胞肺癌和哮喘的scRNA-seq数据，探讨了脂质代谢相关基因在哮喘向小细胞肺癌转变中的作用 | 提出了一个新的脂质代谢相关基因标记，有助于深入理解哮喘向小细胞肺癌发展的机制 | 研究未直接关注衰老相关的分子改变 | 旨在开发更准确的预测模型，揭示哮喘与小细胞肺癌之间免疫信号通路的潜在联系 | 小细胞肺癌和哮喘的脂质代谢相关基因 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE164404（小细胞肺癌）和GSE145013（严重哮喘）的scRNA-seq数据 |
| 12767 | 2024-08-07 |
Treatment resistance in pancreatic and biliary tract cancer: molecular and clinical pharmacology perspectives
2024-Apr, Expert review of clinical pharmacology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/17512433.2024.2319340
PMID:38413373
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研究论文 | 本文综述了胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子和临床药理学视角，探讨了当前治疗方案及其抵抗机制，并提出了克服这些障碍的策略。 | 本文提出了通过个性化患者方法和人工智能应用来指导有效治疗策略的新思路。 | 目前尚未形成统一的治疗抵抗理论，进展有限。 | 旨在识别和克服胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子机制，以改善患者治疗效果。 | 胆道癌和胰腺癌的治疗抵抗机制及其克服策略。 | NA | 胆道癌、胰腺癌 | NA | NA | NA | NA |
| 12768 | 2024-08-07 |
Irisin delays the onset of type 1 diabetes in NOD mice by enhancing intestinal barrier
2024-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.130857
PMID:38493812
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研究论文 | 本研究探讨了irisin激素通过增强结肠肠屏障功能来延缓1型糖尿病（T1D）在NOD小鼠中的发病 | 首次揭示了irisin通过调节AMPK/PI3K/AKT通路和增加MUC3表达来增强结肠肠屏障功能，从而延缓T1D的发病 | NA | 研究irisin是否能通过增强结肠肠屏障来延缓T1D的发病 | 1型糖尿病（T1D）患者和非肥胖糖尿病（NOD）小鼠 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 12769 | 2024-08-04 |
Deciphering the molecular landscape: integrating single-cell transcriptomics to unravel myofibroblast dynamics and therapeutic targets in clear cell renal cell carcinomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374931
PMID:38562930
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研究论文 | 该文章探讨了在透明细胞肾细胞癌中，单细胞转录组学揭示的肌成纤维细胞动态及治疗靶点 | 首次利用单细胞转录组分析深入探讨肌成纤维细胞与肿瘤细胞的相互作用和信号通路 | 目前缺乏对其他细胞类型相互作用的详细分析 | 揭示透明细胞肾细胞癌中肌成纤维细胞的动态及其作为治疗靶点的潜力 | 透明细胞肾细胞癌中的肌成纤维细胞亚群及其与肿瘤的相互作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组分析 | NA | RNA-seq | ccRCC人群中涉及大量样本 |
| 12770 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine-learning models revealed the cellular crosstalk of dendritic cells and identified FABP5 and KLRB1 as novel biomarkers for psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374763
PMID:38596682
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研究论文 | 本研究分析了树突状细胞与T细胞在牛皮癣中的相互作用，并确定FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 揭示了FABP5和KLRB1在牛皮癣发病机制中的新角色，并提出了它们作为潜在生物标志物的可能性 | 研究可能受到样本数量或样本多样性的限制 | 识别牛皮癣的关键生物标志物并阐明其发病机制 | 研究对象为牛皮癣患者的皮肤组织和相关细胞 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞测序、机器学习 | NA | 多层次数据 | 牛皮癣皮肤组织样本和M5诱导的HaCaT细胞 |
| 12771 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals SERPINE1-expressing CAFs remodelling tumour microenvironment in recurrent osteosarcoma
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1527
PMID:38193644
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12772 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of the cellular microenvironment in three different colonic polyp subtypes in children
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1535
PMID:38264936
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学分析，探讨了儿童结肠息肉不同亚型的细胞微环境特征 | 识别了不同结肠息肉亚型中共有的和疾病特异性的细胞亚群及表达模式，揭示了这些细胞在塑造独特细胞微环境中的重要作用 | NA | 加深对儿童结肠息肉异质性细胞微环境的理解，并识别潜在的治疗策略以减少息肉的复发 | 儿童结肠息肉的三种不同亚型：孤立性幼年息肉（SJPs）、息肉病综合征（PJS）和Peutz-Jeghers综合征（PJS） | 数字病理学 | 结肠息肉 | 单细胞RNA测序，多重免疫组织化学（mIHC） | NA | 细胞 | 从儿童患者中获得的正常结肠组织和不同类型的结肠息肉样本 |
| 12773 | 2024-08-07 |
Cellular plasticity in the breast cancer ecosystem
2024, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v129.10629
PMID:38571887
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综述 | 本文综述了乳腺癌生态系统中细胞可塑性和异质性的最新发现，重点讨论了癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的作用。 | 文章揭示了乳腺癌细胞表现出由内在遗传因素和外部微环境信号驱动的表型可塑性，并探讨了单细胞RNA测序研究揭示的CAFs和TAMs的多样性亚型及其在肿瘤微环境中的功能基因表达程序和空间组织。 | NA | 理解细胞表型的层次关系和微环境信号，为靶向治疗干预提供新机会。 | 乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12774 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal POSTN+ cancer-associated fibroblasts correlated with immune suppression and tumour progression in non-small cell lung cancer
2023-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1515
PMID:38115703
|
研究论文 | 本研究揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞与非小细胞肺癌中的免疫抑制和肿瘤进展的相关性 | 识别了POSTN+成纤维细胞亚群，与肿瘤进展和免疫抑制相关 | 研究局限于16例NSCLC患者的样本，且仅分析特定的CAF亚群 | 探讨癌症相关成纤维细胞在非小细胞肺癌进展中的作用 | 对16例非小细胞肺癌患者的肿瘤及其相邻样本进行单细胞转录组测序 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，SpaTial增强分辨率组学测序，免疫组化 | NA | RNA数据 | 16名非小细胞肺癌患者的肿瘤和相邻样本 |
| 12775 | 2024-08-07 |
Immunological link between periodontitis and type 2 diabetes deciphered by single-cell RNA analysis
2023-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1503
PMID:38082425
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了牙周炎与2型糖尿病之间的免疫学联系 | 首次揭示了2型糖尿病如何加剧T/NK细胞免疫的恶化以及牙周炎与糖尿病之间的免疫学基础 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在比较单纯牙周炎患者与同时患有牙周炎和2型糖尿病患者的免疫反应，以扩展对牙周炎与糖尿病复杂联系的理解 | 外周血单个核细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11名健康对照者，10名单纯牙周炎患者，6名同时患有牙周炎和2型糖尿病的患者 |
| 12776 | 2024-08-04 |
Crosstalk between alternative splicing and inflammatory bowel disease: Basic mechanisms, biotechnological progresses and future perspectives
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1479
PMID:37983927
|
综述 | 这篇文章总结了替代剪接与炎症性肠病之间的关系，以及相关的生物技术进展和未来的前景 | 这是首个评估替代剪接事件在炎症性肠病中潜在调控机制的综述 | 文章未详细讨论所有潜在的异常剪接基因及其机制 | 探讨替代剪接在炎症性肠病发病机制中的作用 | 涉及炎症性肠病中的异常替代剪接事件及其相关分子 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 下一代测序（NGS）、微阵列、第三代测序（TGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 数据 | NA |
| 12777 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing of multi-region resolves geospatial architecture and therapeutic target of endothelial cells in esophageal squamous cell carcinoma
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1487
PMID:37987158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12778 | 2024-08-04 |
A unified pipeline for FISH spatial transcriptomics
2023-Sep-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100384
PMID:37719153
|
研究论文 | 本文提出了一个名为PIPEFISH的统一分析管道，用于FISH空间转录组学的转录注释 | PIPEFISH是一个半自动化且可推广的管道，改进了已有的starfish库，以解决空间转录组学数据分析缺乏标准化工具的问题 | 该论文未提及PIPEFISH在特定情况下的性能限制或适用範围 | 旨在提供一种标准化的工具来分析FISH空间转录组学数据 | 使用PIPEFISH对来自三种不同FISH图像实验的真实数据集进行转录注释 | 数字病理学 | NA | FISH | NA | 图像 | 三个不同类型的FISH图像实验的真实数据集 |
| 12779 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis reveals the multiple patterns of immune escape in the nasopharyngeal carcinoma microenvironment
2023-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1315
PMID:37349991
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研究论文 | 该研究揭示了鼻咽癌微环境中免疫逃逸的多种模式。 | 首次识别了特定于鼻咽癌微环境的CD8+自然杀伤细胞集群，并展示了肿瘤细胞中主要组织相容性复合体分子的丧失等免疫逃逸机制。 | 该技术未能捕捉到上皮/肿瘤细胞，限制了对肿瘤异质性和免疫逃逸的进一步研究。 | 分析鼻咽癌肿瘤细胞的转录组和空间特性。 | 鼻咽癌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | scRNA/snRNA-seq和成像质谱细胞术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12780 | 2024-08-04 |
Prioritization of Monogenic Congenital Anomalies of the Kidney and Urinary Tract Candidate Genes with Existing Single-Cell Transcriptomics Data of the Human Fetal Kidney
2023, Nephron
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000531770
PMID:37499630
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研究论文 | 本研究利用人类胎儿肾脏的单细胞转录组学数据，优先考虑单基因先天性肾脏和尿道异常（CAKUT）候选基因。 | 提出了通过时间轴上的共表达模式来优先选择CAKUT候选基因的独立方法，识别出新的CAKUT候选基因 | 仅分析了已知CAKUT基因的共表达，可能未考虑所有潜在的候选基因 | 优先考虑人类先天性肾脏和尿道异常的候选基因 | 已知的40个CAKUT基因及其在肾脏发育中的共表达模式 | 数字病理学 | 先天性肾脏和尿道异常 | 单细胞mRNA转录组学 | NA | RNA数据 | 研究了40个已知基因和100个在肾小管祖细胞中高表达的基因 |