单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27986 篇文献，本页显示第 12761 - 12780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12761 | 2024-08-05 |
ptx3a+ fibroblast/epicardial cells provide a transient macrophage niche to promote heart regeneration
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114092
PMID:38607913
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研究论文 | 本文探讨了在再生心脏中参与巨噬细胞修复的细胞间相互作用 | 识别了ptx3a+成纤维细胞/心外膜细胞与巨噬细胞间的强交互，并阐明了其在心脏再生中的重要性 | 未详细研究其他细胞类型对巨噬细胞反应的影响 | 研究巨噬细胞在心脏修复中的微环境 | 关注再生斑马鱼心脏中的巨噬细胞以及其周围的细胞 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了斑马鱼模型进行实验 |
| 12762 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing in Organ and Cell Transplantation
2024-Apr-11, Biosensors
DOI:10.3390/bios14040189
PMID:38667182
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在器官和细胞移植中的应用及其潜在影响 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示移植组织转录组以及与移植并发症相关的细胞类型和状态 | 文章未详细讨论单细胞RNA测序技术的挑战和局限性 | 研究单细胞RNA测序在器官和干细胞移植中的应用 | 应用单细胞RNA测序分析被移植组织中的供体和受体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12763 | 2024-08-05 |
Reconstruction Set Test (RESET): A computationally efficient method for single sample gene set testing based on randomized reduced rank reconstruction error
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012084
PMID:38683883
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研究论文 | 本文提出了一种名为重构集测试（RESET）的单样本基因集测试方法 | RESET方法通过随机降秩重构算法提供了一种计算上高效的基因集重要性量化方式 | NA | 研究单样本基因集测试的新方法 | 基因集及其在测量基因值重构中的重要性 | 生物信息学 | NA | 随机降秩重构算法 | NA | scRNA-seq数据 | 真实和模拟的scRNA-seq数据 |
| 12764 | 2024-08-04 |
Predictive biomarkers and initial analysis of maternal immune alterations in postpartum preeclampsia reveal an immune-driven pathology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380629
PMID:38745664
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研究论文 | 本文研究了产后高血压（PPPE）中母体免疫变化及预测生物标志物的潜在性 | 发现胎盘CD163+细胞和初始妊娠期血压可作为非侵入性预测PPPE的生物标志物 | 研究样本的规模和多样性可能限制了结论的普遍性 | 理解PPPE诊断时的免疫贡献及周产期生物标志物的预测潜力 | 通过采集PPPE患者和健康对照组的胎盘和血液样本进行比较分析 | 数字病理学 | 产后高血压 | 单细胞转录组学、流式细胞术、细胞内细胞因子染色 | NA | 血液样本、胎盘组织 | 涉及PPPE患者和健康对照组的样本 |
| 12765 | 2024-08-04 |
Identification of PANoptosis-related predictors for prognosis and tumor microenvironment by multiomics analysis in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94200
PMID:38577605
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在胶质瘤进展中的功能，并识别了预测胶质瘤预后的相关指标 | 本研究首次识别了与PANoptosis相关的四个预测因子，并建立了PANRG评分模型，与肿瘤微环境的关系得到了探讨 | 本研究的局限性在于样本数量和实验验证的范围可能不足 | 研究PANoptosis相关基因在胶质瘤中的预后预测和新治疗靶点的开发 | 胶质瘤患者的基因数据和临床样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | LASSO-Cox回归分析 | 基因数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的胶质瘤患者的bulk和单细胞RNA-seq数据 |
| 12766 | 2024-08-05 |
Prognostic and Immune Landscape Analysis of Ubiquitination-related Genes in Hepatocellular Carcinoma: Based on Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93425
PMID:38577593
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研究论文 | 本研究分析了与泛素化相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫景观 | 本研究首次基于泛素化相关基因建立了肝细胞癌预测模型，并确定了三个关键生物标志物 | 目前仍缺乏关于泛素化相关基因在肝细胞癌免疫疗法中的实际应用验证 | 探讨泛素化相关基因在肝细胞癌预后和免疫治疗中的作用 | 主要研究肝细胞癌中与泛素化相关的基因及其表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，转录组差异表达分析 | 加权基因共表达网络分析，Cox回归，Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，样本大小未具体提及 |
| 12767 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome reveals highly complement activated microglia cells in association with pediatric tuberculous meningitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387808
PMID:38745656
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研究论文 | 该研究揭示了与儿童结核性脑膜炎相关的高度补体激活的微胶质细胞。 | 首次在结核性脑膜炎患儿的脑脊液和外周血单核细胞中发现了33种单核细胞亚群和补体激活的微胶质细胞。 | 样本量仅为6个患儿，可能影响结果的普遍性。 | 揭示结核性脑膜炎中的免疫机制及微胶质细胞的作用。 | 研究对象为患有结核性脑膜炎的儿童及其外周血单核细胞和脑脊液细胞。 | 数字病理学 | 结核性脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 6名儿童 |
| 12768 | 2024-08-05 |
Characteristics of T Cells in Single-Cell Datasets of Peripheral Blood and Cerebrospinal Fluid in Alzheimer's Disease Patients
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230784
PMID:38043012
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的特征 | 揭示了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的扩展及其功能特征 | 没有提及具体的样本量和实验限制 | 探索阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的潜在特征 | 阿尔茨海默病患者的外周血和脑脊液中T细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据集（GSE181279和GSE134578） | NA |
| 12769 | 2024-08-05 |
Copper-binding protein modelling by single-cell transcriptome and Bulk transcriptome to predict overall survival in lung adenocarcinoma patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94588
PMID:38577594
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和大规模转录组模型预测肺腺癌患者的总体生存率 | 提出了一种新的铜结合蛋白模型，显示其在肺腺癌预后中的高预测能力 | 未提及可能的样本选择偏倚或数据集的局限性 | 旨在评估铜结合蛋白在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者的铜结合蛋白及其在生存预测中的表现 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，LASSO-Cox分析，RT-qPCR | CBPRS模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的多个队列，具体样本数量未说明 |
| 12770 | 2024-08-05 |
Disruption of cholangiocyte-B cell crosstalk by blocking the CXCL12-CXCR4 axis alleviates liver fibrosis
2023-Nov-27, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-05032-y
PMID:38010435
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研究论文 | 本研究探讨了阻断CXCL12-CXCR4轴如何通过破坏胆管细胞与B细胞的相互作用来减轻肝纤维化 | 提出了通过干扰胆管细胞和B细胞之间的通讯来减轻肝纤维化的新机制 | 未评估其他潜在的机制或临床应用环境 | 研究B细胞在肝纤维化中的作用及干预策略 | 以小鼠模型为基础，分析了B细胞和胆管细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA序列 | 使用小鼠模型进行实验 |
| 12771 | 2024-08-05 |
NMDAR antagonists suppress tumor progression by regulating tumor-associated macrophages
2023-Nov-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2302126120
PMID:37967215
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研究论文 | 这篇文章探讨了NMDAR在肿瘤微环境中对巨噬细胞的调节作用 | 揭示了NMDAR在肝细胞肉瘤和纤维肉瘤微环境中调节肿瘤相关巨噬细胞的全新作用 | 未明确提及研究的具体局限性 | 研究NMDAR在抗肿瘤免疫中对肿瘤相关巨噬细胞的影响 | 肝细胞肉瘤和纤维肉瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 主要涉及肝细胞肉瘤和纤维肉瘤的预临床肿瘤 |
| 12772 | 2024-08-05 |
Mammalian esophageal stratified tissue homeostasis is maintained distinctively by the epithelial pluripotent p63+Sox2+ and p63-Sox2+ cell populations
2023-Sep-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04952-z
PMID:37752383
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研究论文 | 研究了哺乳动物食管上皮组织的自我更新及其稳态调控机制 | 揭示了p63和Sox2依赖的细胞谱系在维持食管组织稳态中的独特作用 | 未能在食管鳞状细胞癌细胞系形成的类器官中检测到p63Sox2细胞群 | 探讨哺乳动物食管鳞状上皮组织的稳态以及相关的调控机制 | 通过建立大鼠食管类器官体外系统，研究食管上皮细胞群的特性 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了大鼠食管类器官的多个细胞群 |
| 12773 | 2024-08-05 |
Transcriptomic landscape reveals germline potential of porcine skin-derived multipotent dermal fibroblast progenitors
2023-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04869-7
PMID:37480481
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研究论文 | 本研究揭示了猪皮肤来源的多能成纤维母细胞前体的转录组特征及其潜在生殖功能 | 本研究发现猪皮肤来源干细胞（SDSCs）主要源于多能成纤维母细胞前体（MDFPs），并展示了其分化为原始生殖细胞样细胞（PGCLCs）的多能性和转录调控机制 | 尚未讨论SDSCs的细胞起源及其在体外分化成PGCLCs过程中的动态转录特征 | 探讨猪皮肤来源干细胞在不育治疗中的潜在应用 | 研究对象为猪皮肤来源干细胞及其分化过程 | 再生医学 | 不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12774 | 2024-08-04 |
Pancreatic lipase-related protein 2 is selectively expressed by peritubular myoid cells in the murine testis and sustains long-term spermatogenesis
2023-Jul-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04872-y
PMID:37468762
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研究论文 | 研究表明胰脂肪酶相关蛋白2在小鼠睾丸中的周管平滑肌细胞中特异性表达，支持长期的精子发生 | 首次揭示了Pnliprp2在小鼠睾丸中的周管平滑肌细胞中特异性表达及其在精子发生中的新角色 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全推广到其他物种 | 探讨Pnliprp2在小鼠睾丸周管平滑肌细胞中的功能及其对精子发生的影响 | 小鼠睾丸中的周管平滑肌细胞和精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和代谢组学 | NA | 生物样本及代谢物数据 | Pnliprp2基因敲除小鼠的多个样本 |
| 12775 | 2024-08-04 |
Autologous humanized PDX modeling for immuno-oncology recapitulates features of the human tumor microenvironment
2023-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006921
PMID:37487666
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研究论文 | 本研究开发了一种自体人源化PDX模型，旨在模拟个体固体肿瘤的肿瘤微环境 | 创建了一种从患者的骨髓中获取HSPC的自体系统，为肿瘤-免疫相互作用的研究提供了完全基因匹配的模型 | 研究可能受到样本数量和个体差异的限制 | 研究免疫细胞与肿瘤细胞的相互作用及其对癌症进展和治疗反应的影响 | 使用人源化的MISTRG6小鼠和患者来源的肿瘤组织进行研究 | 数字病理学 | NA | HSPC移植 | 人源化PDX模型 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 12776 | 2024-08-05 |
Reconstruction Set Test (RESET): a computationally efficient method for single sample gene set testing based on randomized reduced rank reconstruction error
2023-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535366
PMID:37066315
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研究论文 | 本文介绍了一种名为重建集测试（RESET）的新型单样本基因集测试方法 | RESET在样本级和整个数据集的基因集重要性量化方面具有分析上的创新 | 现有技术在识别差异相关模式、检测竞争场景以及跨样本比较得分方面存在局限性 | 研究旨在提供一种更有效的单样本基因集测试方法 | 本文研究的对象为基因集及其在样本中的重要性体现 | 数字病理学 | NA | 随机降秩重建算法 | NA | 基因表达数据 | 使用了真实和模拟的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 |
| 12777 | 2024-08-05 |
MerlinS13 phosphorylation controls meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2023-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2577844/v1
PMID:36993679
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研究论文 | 本研究揭示了Merlin S13磷酸化对脑膜瘤Wnt信号传导和MRI特征的影响 | 本研究首次明确了Merlin在维持脑膜瘤Wnt信号传导中的作用并提出了一种新的非侵入性影像生物标志物 | 研究中对Merlin完整性的生物化学机制仍存在一定的不完全理解 | 探讨脑膜瘤中Merlin的生化机制及其临床结果的预测 | 研究对象包括脑膜瘤细胞、异种移植模型及人类患者 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序、亲近标记蛋白质组学质谱 | NA | 影像 | 涉及人类患者及异种移植模型的研究样本 |
| 12778 | 2024-08-05 |
Single-Cell B-Cell Sequencing to Generate Natively Paired scFab Yeast Surface Display Libraries
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3279-6_11
PMID:37405649
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研究论文 | 该文章阐述了一种使用单细胞RNA测序生成天然配对的B细胞受体序列的方法。 | 提出了一种简化的工作流程，将单链抗体片段表达在酵母表面用于高通量特征化。 | 章节中并未详细描述具体的实施细节。 | 旨在设计用于治疗和诊断的单克隆抗体。 | 免疫小鼠的天然配对B细胞受体序列。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12779 | 2024-08-05 |
Defining mast cell differentiation and heterogeneity through single-cell transcriptomics analysis
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.08.011
PMID:36205448
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research paper | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了肥大细胞的分化及其异质性 | 揭示了肥大细胞的多样性超出了传统使用的蛋白酶差异，并强调了微环境信号对肥大细胞发展的影响 | 未提及具体的样本数据或实验限制 | 探讨肥大细胞前体的分化特征及健康与疾病中的肥大细胞异质性 | 肥大细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 12780 | 2024-08-05 |
Transcriptional profiling of mouse projection neurons with VECTORseq
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101625
PMID:36035788
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研究论文 | 本文介绍了一种新技术VECTORseq，用于小鼠投射神经元的转录组特征分析 | 开发了VECTORseq技术，可以同时在单个实验中标记多个神经元群体 | 未提及具体的研究限制 | 提高投射神经元转录组特征分析的通量 | 小鼠脑中的不同投射神经元 | 数字病理学 | NA | 病毒条形码传递 | NA | 单细胞测序数据 | NA |