单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 12721 - 12740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12721 | 2024-08-07 |
ONECUT2 regulates RANKL-dependent enterocyte and microfold cell differentiation in the small intestine; a multi-omics study
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1236
PMID:36625255
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研究论文 | 本研究采用多组学方法探讨了小肠类器官中M细胞分化的分子机制 | 揭示了ONECUT2通过RANK/RANKL信号轴调控小肠中肠上皮细胞和M细胞分化的机制 | NA | 探究小肠中M细胞分化的分子机制及其调控因素 | 小肠类器官中的M细胞分化 | 分子生物学 | NA | 多组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠小肠类器官 |
| 12722 | 2024-08-04 |
The aryl hydrocarbon receptor cell intrinsically promotes resident memory CD8+ T cell differentiation and function
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111963
PMID:36640340
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研究论文 | 该文章探讨了芳香烃受体(Ahr)在CD8 T细胞分化和功能中的内在作用 | 首次揭示了Ahr在CD8 T细胞蕴藏的记忆细胞分化和功能中的促进作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能在转化为人类时受到限制 | 研究Ahr在CD8 T细胞功能及其记忆细胞分化中的作用 | 小鼠CD8 T细胞及人类肠道内的CD8 T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类的CD8 T细胞 |
| 12723 | 2024-08-07 |
Friend leukemia integration 1 overexpression decreases endometrial receptivity and induces embryo implantation failure by promoting PART1 transcription in the endometrial epithelial cells
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16105
PMID:37780395
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研究论文 | 本研究探讨了FLI1在子宫内膜容受性和反复植入失败（RIF）中的作用及其机制 | 发现FLI1通过结合PART1启动子区域促进PART1表达，从而抑制胚胎植入 | NA | 探索FLI1在子宫内膜容受性和反复植入失败中的作用及机制 | 子宫内膜细胞和胚胎植入 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）、定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR）、蛋白质印迹（western blotting）、细胞计数试剂盒（CCK）-8、划痕愈合试验、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告试验 | NA | RNA | 包括RIF患者和对照组的子宫内膜组织样本 |
| 12724 | 2024-08-07 |
Chronic superphysiologic AMH promotes premature luteinization of antral follicles in human ovarian xenografts
2022-03-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi7315
PMID:35263130
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research paper | 研究探讨了超生理水平的抗穆勒氏管激素（AMH）对人类卵巢异种移植中卵泡黄素化的影响 | 首次通过共移植人卵巢皮质与表达AMH的血管内皮细胞，并进行单细胞RNA测序，揭示了超生理水平AMH对卵泡发育的影响 | 研究样本量较小，且仅限于免疫缺陷小鼠模型 | 探究AMH对卵泡发育的影响及其可能导致的排卵功能障碍 | 人卵巢皮质中的卵泡 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共观察了38个卵泡（19个对照组和19个AMH组） |
| 12725 | 2024-08-07 |
Clonal hematopoiesis, myeloid disorders and BAX-mutated myelopoiesis in patients receiving venetoclax for CLL
2022-02-24, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021012775
PMID:34469514
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研究论文 | 研究长期使用BCL2抑制剂venetoclax治疗慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者中出现的骨髓异常和BAX突变情况 | 首次发现BAX突变在venetoclax治疗CLL患者中的骨髓细胞中独立出现，并与BCL2突变在同一患者中同时存在 | 研究样本量有限，且仅限于接受venetoclax治疗的CLL患者 | 探究长期使用venetoclax治疗CLL患者中骨髓细胞的临床和分子异常 | 接受venetoclax治疗的CLL患者及其骨髓细胞 | 血液学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因突变数据 | 89名患者，其中41名患者的骨髓样本进行了详细分析 |
| 12726 | 2024-08-07 |
TIMEx: tumor-immune microenvironment deconvolution web-portal for bulk transcriptomics using pan-cancer scRNA-seq signatures
2021-Oct-25, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab244
PMID:33901274
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研究论文 | 本文介绍了TIMEx，一种新的肿瘤免疫微环境（TIME）反卷积方法，用于使用泛癌单细胞RNA-seq特征的批量转录组学估计浸润性免疫细胞 | 开发了TIMEx，一种新的TIME反卷积方法，强调使用泛癌单细胞RNA-seq特征估计浸润性免疫细胞 | NA | 开发和实现一种新的肿瘤免疫微环境反卷积方法 | 肿瘤免疫微环境中的异质细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 反卷积方法 | 转录组数据 | NA |
| 12727 | 2024-08-07 |
Antibiotic-induced disturbances of the gut microbiota result in accelerated breast tumor growth
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103012
PMID:34522855
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研究论文 | 本研究探讨了抗生素引起的肠道微生物群失调对乳腺癌肿瘤生长的影响 | 发现抗生素诱导的肠道微生物群扰动显著加速了多个乳腺癌小鼠模型的肿瘤进展，并揭示了乳腺癌与微生物群相互作用的新机制 | NA | 研究肠道微生物群在乳腺癌进展中的作用 | 乳腺癌小鼠模型及肠道微生物群 | NA | 乳腺癌 | 宏基因组学, 单细胞转录组学 | NA | 微生物群数据, 细胞转录数据 | 多个乳腺癌小鼠模型 |
| 12728 | 2024-08-07 |
Defining the Design Principles of Skin Epidermis Postnatal Growth
2020-04-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.015
PMID:32259486
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研究论文 | 本文通过结合体内克隆系谱追踪、增殖动力学、单细胞转录组学和体外微图案实验，解析了出生后皮肤表皮扩张过程中的细胞动力学 | 揭示了由单一发育前体细胞群介导的和谐生长机制，这些前体细胞具有固定的命运失衡自我更新分裂和不断降低的增殖率 | NA | 探究出生后器官和组织生长过程中的细胞动力学 | 皮肤表皮在出生后的生长过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 12729 | 2024-08-07 |
Neuroinflammation and EIF2 Signaling Persist despite Antiretroviral Treatment in an hiPSC Tri-culture Model of HIV Infection
2020-04-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.02.010
PMID:32220329
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研究论文 | 本文开发了一种基于人诱导多能干细胞（hiPSC）的三重培养模型，用于研究HIV感染及其抗逆转录病毒治疗（ART）对神经炎症和EIF2信号的影响。 | 首次使用hiPSC三重培养模型来模拟HIV感染及其治疗，揭示了即使在抗逆转录病毒治疗下，神经炎症和EIF2信号仍然持续存在。 | NA | 研究HIV相关神经认知障碍（HAND）的治疗靶点，特别是在抗逆转录病毒治疗下的机制。 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）分化成的神经元、星形胶质细胞和微小胶质细胞的三重培养模型。 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及HIV感染和未感染的微小胶质细胞的三重培养模型 |
| 12730 | 2024-08-07 |
Platform Effects on Regeneration by Pulmonary Basal Cells as Evaluated by Single-Cell RNA Sequencing
2020-03-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.004
PMID:32209482
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估了不同平台对肺基底细胞再生的影响 | 开发了计算流程来比较不同平台样本的全局和群体水平差异 | NA | 阐明体外环境中上皮再生结果的环境效应 | 从大鼠气管中分离并培养的药理学扩增的基底细胞 | 数字病理学 | 慢性肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 从大鼠气管中分离的基底细胞样本 |
| 12731 | 2024-08-07 |
Cortical Foxp2 Supports Behavioral Flexibility and Developmental Dopamine D1 Receptor Expression
2020-03-14, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhz209
PMID:31711176
|
研究论文 | 本研究通过特异性敲除小鼠皮质中的Foxp2基因，探讨了Foxp2在皮质发育和行为灵活性中的作用。 | 首次揭示了Foxp2在皮质中对多巴胺D1受体表达和行为灵活性的调控作用，并通过单细胞转录组学分析了D1R表达细胞类型的变化。 | NA | 探究Foxp2在皮质发育和行为灵活性中的分子和行为功能。 | 皮质特异性Foxp2条件敲除小鼠。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 至少五种兴奋性和三种抑制性D1R表达细胞类型 |
| 12732 | 2024-08-07 |
STAT Signaling Modifies Ascl1 Chromatin Binding and Limits Neural Regeneration from Muller Glia in Adult Mouse Retina
2020-02-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.01.075
PMID:32075759
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研究论文 | 研究探讨了STAT信号通路对Ascl1染色质结合的影响及其在成年小鼠视网膜Müller胶质细胞神经再生中的限制作用 | 发现STAT信号通路可能引导Ascl1至发育不适宜的目标，使用STAT抑制剂结合重编程范式显著增加了Müller胶质细胞生成神经元的能力 | 新神经元仅从Müller胶质细胞的子集中生成，表明存在限制Ascl1介导的Müller胶质细胞重编程的因素 | 测试损伤诱导的STAT激活是否阻碍Ascl1将Müller胶质细胞重编程为视网膜神经元的能力 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, Ascl1-ChIPseq, ATAC-seq | NA | RNA, 染色质结合数据 | 未具体说明样本数量 |
| 12733 | 2024-08-07 |
A single-parasite transcriptional atlas of Toxoplasma Gondii reveals novel control of antigen expression
2020-02-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54129
PMID:32065584
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了弓形虫在速殖子和缓殖子阶段的转录组，揭示了其发育过程中的隐藏状态和转录因子 | 发现了AP2IX-1转录因子控制从普遍表达的SAG1到稀有表面抗原的切换，并构建了一个互动的数据浏览器用于可视化资源 | NA | 揭示弓形虫发育过程中的转录调控机制 | 弓形虫的速殖子和缓殖子阶段 | 分子生物学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过5,400个弓形虫样本，包括三种广泛研究的菌株 |
| 12734 | 2024-08-04 |
[Current status and prospects of genetic research on IgA nephropathy]
2024-Apr-23, Zhonghua yi xue za zhi
|
评论 | 本文讨论了IgA肾病的遗传研究现状和前景 | 提出了基因组医学时代如何通过全基因组测序和多组学研究寻找IgA肾病的易感基因及靶向药物的见解 | 仅讨论了目前的研究进展，未提供新的实验数据或结果 | 探讨IgA肾病的遗传因素及其在发病机制中的作用 | IgA肾病相关的易感基因和临床表型 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序（WGS），单细胞测序，表达数量性性状位点（eQTL） | NA | NA | NA |
| 12735 | 2024-08-07 |
Lamin A upregulation reorganizes the genome during rod photoreceptor degeneration
2023-10-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06224-x
PMID:37880237
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研究论文 | 研究了核纤层在杆状光感受器退化过程中对基因组组织的作用 | 首次展示了在视网膜色素变性模型中，核纤层蛋白A的异常上调与基因组可及性的增加相关，表明异染色质锚定蛋白对基因组可及性有全局影响 | 研究主要集中在杆状光感受器，未涉及其他类型的光感受器或细胞类型 | 探讨核纤层在神经退行性疾病中对基因组组织的影响 | 杆状光感受器及其在视网膜色素变性中的退化过程 | NA | 视网膜色素变性 | scRNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未具体说明样本数量 |
| 12736 | 2024-08-07 |
Comparative analysis of dimension reduction methods for cytometry by time-of-flight data
2023-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37478-w
PMID:37005472
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研究论文 | 本文比较了21种降维方法在110个真实和425个合成CyTOF样本上的性能 | 发现了一些不太知名但表现优异的降维方法，如SAUCIE、SQuaD-MDS和scvis | 选择降维方法应取决于数据结构和分析需求 | 评估和发展适用于CyTOF数据的计算方法 | CyTOF数据的降维方法 | 生物信息学 | NA | CyTOF | NA | 数据 | 110个真实样本和425个合成样本 |
| 12737 | 2024-08-04 |
Compressed Perturb-seq: highly efficient screens for regulatory circuits using random composite perturbations
2023-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.23.525200
PMID:36747806
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研究论文 | 本文提出了一种压缩的Perturb-seq技术，以提高功能基因组学中干扰电路的筛选效率 | 创新性在于通过算法对随机低维观察进行重新设计，显著降低了成本并提高了学习遗传互作的能力 | 该方法在规模上仍受到一定限制，具体的实验规模未在摘要中明确说明 | 研究旨在提高功能基因组学中基因调控电路筛选的效率 | 研究对象为与细菌脂多糖免疫反应相关的598个基因 | 功能基因组学 | 免疫疾病 | CRISPR筛选 | NA | 基因表达数据 | 涉及598个基因 |
| 12738 | 2024-08-07 |
Deconvolution Tactics and Normalization in Renal Spatial Transcriptomics
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.812947
PMID:35095570
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综述 | 本文综述了2021年印第安纳州O'Brien显微镜中心研讨会上讨论的各种去卷积策略，并探讨了肾空间转录组学中的归一化和批次效应校正应用。 | 介绍了Seurat转移评分方法、SPOTlight、鲁棒细胞类型分解和BayesSpace等独特的去卷积技术。 | 文中提到的空间基因表达平台尚未达到单细胞分辨率。 | 探讨肾空间转录组学中的去卷积策略和归一化方法。 | 肾组织中的异质细胞群及其在空间转录组学中的表达特征。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 12739 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a heterogeneous response to Glucocorticoids in breast cancer cells
2020-03-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0837-0
PMID:32170217
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了乳腺癌细胞对糖皮质激素的异质性反应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌细胞对糖皮质激素反应的细胞间转录异质性 | 研究仅限于一种乳腺癌细胞系，可能无法完全代表所有乳腺癌细胞的反应 | 探究乳腺癌细胞对糖皮质激素的个体细胞转录反应 | 乳腺癌细胞对糖皮质激素的反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | RNA | 一种人乳腺癌细胞系 |
| 12740 | 2024-08-07 |
Phagocytosis of Wnt inhibitor SFRP4 by late wound macrophages drives chronic Wnt activity for fibrotic skin healing
2020-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aay3704
PMID:32219160
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序比较了半再生性和纤维化伤口诱导的毛发生成（WIHN）伤口，发现晚期伤口中的巨噬细胞通过吞噬皮肤Wnt抑制因子SFRP4来驱动纤维化愈合 | 揭示了巨噬细胞通过吞噬SFRP4来调节Wnt信号通路，从而影响皮肤伤口愈合的命运 | NA | 探讨巨噬细胞在皮肤伤口愈合中的作用及其机制 | 人及小鼠皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞和纤维化过程 | NA | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |