单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 12721 - 12740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12721 | 2024-11-27 |
FOS+ B cells: Key mediators of immunotherapy resistance in diverse cancer types
2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200895
PMID:39583007
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析免疫治疗患者，探讨了FOS B细胞在多种癌症类型中作为免疫治疗抵抗关键介质的作用 | 发现了FOS B细胞与免疫治疗抵抗的关联，并揭示了其潜在机制，为预测治疗反应提供了新的生物标志物 | NA | 探讨FOS B细胞在免疫治疗抵抗中的作用及其潜在机制 | FOS B细胞在多种癌症类型中的作用 | NA | 多种癌症类型 | 单细胞RNA测序、空间转录组分析、免疫荧光分析 | NA | RNA测序数据 | 25名免疫治疗患者和1,253例多癌症免疫治疗转录组分析 | NA | NA | NA | NA |
| 12722 | 2024-11-27 |
Analysis of population heterogeneity in CHO cells by genome-wide DNA methylation analysis and by multi-modal single-cell sequencing
2024-Dec-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.10.012
PMID:39488254
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研究论文 | 通过全基因组DNA甲基化分析和多模态单细胞测序分析CHO细胞的群体异质性 | 首次通过全基因组亚硫酸氢盐测序建立了CHO细胞的单碱基甲基化图谱，并揭示了DNA甲基化模式在CHO进化中的集群现象 | 研究仅限于CHO细胞系，未涉及其他细胞类型 | 探讨CHO细胞的非遗传机制，特别是DNA甲基化在细胞异质性中的作用 | CHO细胞的DNA甲基化和单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 全基因组亚硫酸氢盐测序和多模态单细胞测序 | NA | DNA甲基化数据和单细胞测序数据 | 8个独立的CHO细胞系和3个独立培养的9833个细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 12723 | 2024-11-27 |
Predicting survival in bladder cancer with a novel apoptotic gene-related prognostic model
2024-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01575-z
PMID:39580765
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研究论文 | 本文建立了一种基于凋亡基因的新型膀胱癌预后模型，并通过多种分析方法验证了其预测生存率和免疫治疗反应的能力 | 首次基于凋亡基因建立了膀胱癌的预后模型，并验证了其在预测生存率和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 建立并验证一种基于凋亡基因的膀胱癌预后模型，评估其在预测患者生存率和免疫治疗反应中的作用 | 膀胱癌患者的生存率和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | Cox回归分析 | mRNA表达数据 | TCGA和GEO数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 12724 | 2024-11-27 |
Exploring new mechanisms in cancer molecular pathways and pathogenic cell transformation: PIP4K2A as a prognostic marker and therapeutic target in cutaneous malignant melanoma
2024-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01555-3
PMID:39579298
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研究论文 | 研究探讨了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 利用单细胞测序和机器学习技术，研究了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | NA | 探讨PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自皮肤黑色素瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 12725 | 2024-11-27 |
Integration of the bulk transcriptome and single-cell transcriptome reveals efferocytosis features in lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy by combining deep learning
2024-Nov-23, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03571-3
PMID:39580462
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研究论文 | 本研究整合了大量转录组和单细胞转录组数据，通过深度学习揭示了肺腺癌预后和免疫治疗中的吞噬作用特征 | 开发了一种新的与吞噬作用相关的基因预后特征，能够准确预测肺腺癌患者的生存预后和治疗效果 | NA | 研究吞噬作用在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 肺腺癌患者及其相关基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | NA | 转录组数据 | 涉及TCGA、GEO和CTRP数据库中的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 12726 | 2024-11-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment niche transitions during the invasive and metastatic processes of ground-glass nodules and part-solid nodules in lung adenocarcinoma
2024-Nov-23, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02177-7
PMID:39580469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺腺癌中磨玻璃结节和部分实性结节在侵袭和转移过程中的免疫微环境转变 | 首次揭示了CXCL9+和TREM2+肿瘤相关巨噬细胞在不同阶段的显著富集变化，并发现GGN-LUAD在侵袭阶段表现出更强的免疫反应 | 样本量较小，仅包括8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD，可能影响结果的普适性 | 探索肺腺癌不同放射学表型的异质性及其影响肿瘤演变的关联因素 | 肺腺癌中的磨玻璃结节和部分实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD，以及4例邻近正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 12727 | 2024-11-27 |
Regulation of disease-associated microglia in the optic nerve by lipoxin B4 and ocular hypertension
2024-Nov-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-024-00775-z
PMID:39568070
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研究论文 | 研究了脂氧素B4和眼压对视神经中疾病相关小胶质细胞的调控作用 | 首次揭示了脂氧素B4在视网膜和视神经中对小胶质细胞的调控作用，并发现其在眼压诱导的神经退行性病变中的神经保护机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步验证在人类中的适用性 | 探讨脂氧素B4在眼压诱导的神经退行性病变中对小胶质细胞的调控作用 | 视网膜和视神经中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、qPCR、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠眼模型 | NA | NA | NA | NA |
| 12728 | 2024-11-27 |
TARGET-seq: Linking single-cell transcriptomics of human dopaminergic neurons with their target specificity
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2410331121
PMID:39541349
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TARGET-seq的新方法，用于将人类多巴胺能神经元的单细胞转录组与其目标特异性联系起来 | 开发了TARGET-seq技术，通过AAV介导的逆行富集转录组来标记投射，从而将多巴胺能神经元的转录组与其在大脑前部的特定目标结构联系起来 | NA | 探讨不同多巴胺能神经元的分子表达谱与其特定功能或经典分类（如mesolimbic和nigrostriatal）之间的关系 | 人类多巴胺能神经元的单细胞转录组及其目标特异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12729 | 2024-11-27 |
Clustering-independent estimation of cell abundances in bulk tissues using single-cell RNA-seq data
2024-Nov-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100905
PMID:39561717
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ConDecon的聚类无关方法，用于从单细胞RNA测序数据中估计批量组织中的细胞丰度 | ConDecon方法在表型分辨率和功能上相对于基于回归的方法有所改进，能够推断单细胞数据集中每个细胞在批量组织中的存在可能性，并应用于神经退行性微胶质炎症途径在儿童室管膜瘤间充质转化中的作用研究 | NA | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据中推断批量组织中的细胞组成 | 单细胞RNA测序数据和批量组织数据 | 生物信息学 | 儿童室管膜瘤 | 单细胞RNA测序 | ConDecon方法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12730 | 2024-11-27 |
Non-coding RNAs in oral cancer: Emerging biomarkers and therapeutic frontier
2024-Nov-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40096
PMID:39583806
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研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在口腔癌中的潜在诊断和治疗作用 | 结合空间转录组学和空间代谢组学与单细胞RNA测序，深入研究肿瘤微环境，提高诊断和治疗的精准度 | NA | 探讨非编码RNA作为口腔癌诊断和治疗工具的潜力 | 口腔癌及其相关非编码RNA | 数字病理学 | 口腔癌 | 空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12731 | 2024-11-27 |
A signal-diffusion-based unsupervised contrastive representation learning for spatial transcriptomics analysis
2024-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae663
PMID:39546378
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研究论文 | 提出了一种基于信号扩散的无监督对比表示学习方法（SDUCL），用于空间转录组学分析 | 设计了一种信号扩散微环境发现算法，通过模拟生物信号扩散过程，有效捕捉和整合细胞微环境中的交互信息 | 未提及具体局限性 | 学习细胞/位点的低维潜在嵌入，以解析组织异质性和分析生物功能 | 空间转录组学数据，包括正常和肿瘤组织 | 生物信息学 | 肿瘤 | 信号扩散 | 无监督对比学习 | 基因表达数据、空间信息、图像数据 | 涉及多个物种的空间转录组学数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 12732 | 2024-11-27 |
Identification and analysis of a cell communication prognostic signature for oral squamous cell carcinoma at bulk and single-cell levels
2024-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70166
PMID:39580787
|
研究论文 | 本文通过单细胞和批量测序数据分析，构建了一个新的免疫相关基因预后模型，用于预测口腔鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次整合单细胞和批量测序数据，构建了一个免疫相关基因预后模型，并验证了FCRL4对口腔鳞状细胞癌细胞的影响 | 需要进一步的临床试验来验证模型的实际应用效果 | 开发一个能够有效预测口腔鳞状细胞癌患者预后和免疫治疗反应的预后模型 | 口腔鳞状细胞癌的免疫微环境分析和预后模型构建 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞测序、批量测序、WGCNA分析、XGBoost | XGBoost | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 12733 | 2024-11-27 |
Regulation of Diseases-Associated Microglia in the Optic Nerve by Lipoxin B4 and Ocular Hypertension
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585452
PMID:38562864
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研究论文 | 研究了脂氧素B4和眼压升高对视神经中疾病相关小胶质细胞的调控作用 | 首次揭示了脂氧素B4在视网膜和视神经中对小胶质细胞的调控作用，并发现其在眼压升高诱导的神经退行性变中的神经保护机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨脂氧素B4在眼压升高诱导的视神经退行性变中的作用及其对小胶质细胞的调控机制 | 视网膜和视神经中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、qPCR、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠眼内注射硅油诱导持续稳定的眼压升高 | NA | NA | NA | NA |
| 12734 | 2024-11-27 |
Clustering-independent estimation of cell abundances in bulk tissues using single-cell RNA-seq data
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.06.527318
PMID:36798206
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ConDecon的聚类无关方法，用于从单细胞RNA-seq数据中估计批量组织中的细胞丰度 | ConDecon方法在表型分辨率和功能上相对于基于回归的方法有所改进，并且能够推断连续细胞过程如细胞分化或免疫细胞激活 | NA | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞RNA-seq数据中推断批量组织中的细胞组成 | 单细胞RNA-seq数据和批量组织数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12735 | 2024-11-27 |
CD4+ T cells display a spectrum of recall dynamics during re-infection with malaria parasites
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49879-6
PMID:38944658
|
研究论文 | 研究了在再次感染疟原虫时，CD4+ T细胞的回忆反应动态 | 首次详细描述了在再次感染疟原虫时，不同CD4 T细胞亚群的回忆反应多样性，并提供了用于研究基因表达动态和克隆关系的图形用户界面 | 研究仅在老鼠模型中进行，结果可能不完全适用于人类 | 探讨在再次感染疟原虫时，CD4+ T细胞的回忆反应及其多样性 | CD4+ T细胞及其在再次感染疟原虫时的反应 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、T细胞受体测序（TCR-seq）和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型中的CD4+ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 12736 | 2024-11-27 |
To be or not to be - Decoding the Trabecular Meshwork Cell Identity
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.591346
PMID:38746421
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序比较人小梁网细胞培养与组织，探讨细胞身份和可翻译性 | 首次报道了通过单细胞RNA测序比较人小梁网细胞培养与组织的研究方法 | 研究结果从细胞培养到组织研究的翻译仍存在挑战 | 探讨小梁网细胞的身份及其在组织中的可翻译性 | 人小梁网细胞培养与组织 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 共14个初级人小梁网样本，包括4个青光眼患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 12737 | 2024-11-27 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2024-Mar-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3997426/v1
PMID:38496447
|
研究论文 | 研究了APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达及其在鳞状上皮和鳞状细胞癌中的调控机制 | 首次揭示了GRHL3在调节APOBEC3A表达中的作用，并展示了APOBEC3A在鳞状细胞癌中的表达和活性扩展机制 | NA | 探讨APOBEC3A和APOBEC3B在癌症中的表达及其对肿瘤发展和药物抗性的影响 | 健康和恶性黏膜上皮细胞中的APOBEC3A和APOBEC3B表达 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12738 | 2024-11-27 |
scRNA-Seq Analysis Revealed CAFs Regulating HCC Cells via PTN Signaling
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S493675
PMID:39582814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过PTN信号通路调控肝细胞癌（HCC）细胞 | 首次揭示了CAFs通过PTN/SDC2信号通路促进HCC进展的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和有限的临床样本，未来需更多实验验证 | 探讨CAFs在肝细胞癌微环境中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集（GSE158723和GSE112271）以及来自HCC患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 12739 | 2024-11-27 |
Single-cell data revealed the function of natural killer cells and macrophage cells in chemotherapy tolerance in acute myeloid leukemia
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18521
PMID:39583114
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析，揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的功能 | 首次通过单细胞RNA测序数据揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的潜在作用 | 研究主要基于单细胞转录组数据，缺乏体内实验验证 | 探讨免疫细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的调控机制 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞亚群及其标记基因 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 急性髓系白血病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 12740 | 2024-11-27 |
MUC1 and CREB3 are Hub Ferroptosis Suppressors for Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus Degeneration by Integrated Bioinformatics and Experimental Verification
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489052
PMID:39583856
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验验证，探讨了MUC1和CREB3作为核心铁死亡抑制因子在椎间盘退变中的作用 | 首次揭示了MUC1和CREB3作为椎间盘退变中的铁死亡抑制因子，并构建了药物和竞争性内源RNA网络 | 实验验证和单细胞RNA测序分析的样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探索铁死亡相关基因及其在椎间盘退变中的作用 | 椎间盘的髓核和纤维环 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 基因表达分析、GO和KEGG分析、LASSO和SVM-RFE算法、GSEA和GSVA分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 髓核和纤维环的基因表达数据来自Gene Expression Omnibus数据库，实验验证和单细胞RNA测序分析的具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |