单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12721 - 12740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12721 | 2024-08-04 |
Unraveling the mechanisms of NK cell dysfunction in aging and Alzheimer's disease: insights from GWAS and single-cell transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1360687
PMID:38464521
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研究论文 | 本研究探讨了衰老与阿尔茨海默病(NK细胞功能失常)之间的机制 | 通过GWAS和单细胞转录组学分析，揭示NK细胞在衰老与阿尔茨海默病中的作用 | 未提及具体的实验室验证或长期跟踪研究 | 研究衰老如何影响NK细胞的功能以及与阿尔茨海默病的关系 | 研究对象为不同年龄段的阿尔茨海默病患者的NK细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核转录组测序，基因组宽关联研究(GWAS) | NA | 基因表达数据 | 2,171名60岁以上的老年人 |
| 12722 | 2024-08-07 |
Precursor exhausted CD8+T cells in colorectal cancer tissues associated with patient's survival and immunotherapy responsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1362140
PMID:38510246
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研究论文 | 本研究利用多色免疫组织化学技术（mIHC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了结直肠癌（CRC）组织中肿瘤浸润T细胞的定位及其临床意义，并探讨了其在免疫治疗反应中的作用。 | 本研究首次通过mIHC技术和scRNA-seq分析，揭示了结直肠癌微环境中T细胞的转录和功能特性，并证实了其在患者生存和免疫治疗反应中的关键作用。 | NA | 探讨结直肠癌组织中T细胞的分布及其在患者生存和免疫治疗反应中的作用。 | 结直肠癌组织中的T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多色免疫组织化学（mIHC），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 人类结直肠癌组织及小鼠MC38肿瘤模型 |
| 12723 | 2024-08-07 |
Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372113
PMID:38529286
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研究论文 | 本文通过分析TCGA、CGGA和GEO数据库，鉴定了与胶质瘤免疫治疗抵抗相关的基因TBC1D1，并通过多种实验方法验证了其在免疫治疗中的作用。 | 首次发现TBC1D1作为胶质瘤免疫治疗抵抗的新型预后生物标志物，并探讨了其在免疫抑制微环境中的作用。 | NA | 研究胶质瘤免疫治疗抵抗的机制，并寻找新的预后生物标志物。 | 胶质瘤及其免疫治疗抵抗机制。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, GSEA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | 使用了来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组数据 |
| 12724 | 2024-08-07 |
A division-of-labor mode contributes to the cardioprotective potential of mesenchymal stem/stromal cells in heart failure post myocardial infarction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363517
PMID:38562923
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研究论文 | 本研究探讨了3D培养的间充质干细胞（MSCs）在心肌梗死后心力衰竭治疗中的保护作用及其机制 | 本研究首次揭示了3D MSCs在细胞层面的异质性和分工模式，并通过机器学习预测模型和网络服务器开发了预测MSCs分泌效能的配体模型 | NA | 提高MSCs的生产效率并寻找评估其治疗效能的新方法 | 3D培养的人脐带间充质干细胞（hUC-MSCs）及其在心肌梗死后心力衰竭治疗中的应用 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞和批量RNA测序 | 机器学习预测模型 | RNA测序数据 | 使用了125种组合算法进行筛选，并对CD142+和CD142- MSCs进行了差异表达分析 |
| 12725 | 2024-08-07 |
Comprehensive investigation into the influence of glycosylation on head and neck squamous cell carcinoma and development of a prognostic model for risk assessment and anticipating immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1364082
PMID:38562924
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研究论文 | 本文研究了糖基化在头颈鳞状细胞癌中的影响，并开发了一个预测模型用于风险评估和免疫治疗反应预测 | 首次详细阐明了糖基化与头颈鳞状细胞癌的关系，并开发了一个基于糖基化相关基因的风险预测模型 | NA | 研究糖基化在头颈鳞状细胞癌中的作用，并开发一个预测模型以评估患者风险和免疫治疗反应 | 头颈鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归和Lasso回归 | 基因数据 | 184个调控糖基化的基因 |
| 12726 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell analysis of LUAD: elucidating immune cell dynamics and prognostic modeling based on exhausted CD8+ T cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366096
PMID:38596689
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术，构建了肺腺癌（LUAD）的免疫微环境图谱，并基于耗竭的CD8+ T细胞标记基因建立了LUAD的预后模型 | 首次构建了LUAD的单细胞图谱，并基于耗竭的CD8+ T细胞标记基因建立了预后模型，识别了GALNT2作为潜在的治疗靶点 | NA | 旨在详细描绘LUAD及其相关微环境的特征，并建立基于耗竭CD8+ T细胞的预后模型 | LUAD的免疫细胞，包括CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 19名患者 |
| 12727 | 2024-08-04 |
Differential developmental blueprints of organ-intrinsic nervous systems
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.12.571306
PMID:38168446
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研究论文 | 本文描述了肠道神经系统与心脏内在神经系统之间实现器官特异性组织的不同策略 | 揭示了内脏器官特异性神经元分化路径受其宿主器官影响的基本原则 | 对心脏内在神经系统的了解仍然较少，可能影响研究深入性 | 探讨内在神经系统的发展蓝图及其器官特异性 | 研究对象包括肠道神经系统和心脏内在神经系统的前体细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 高分辨率全胚胎成像、单细胞基因组学、空间转录组学、蛋白质组学和生物信息学 | NA | NA | NA |
| 12728 | 2024-08-07 |
CXCR4 expression is associated with proneural-to-mesenchymal transition in glioblastoma
2023-02-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34329
PMID:36250346
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研究论文 | 研究探讨了CXCR4表达与胶质母细胞瘤中从proneural型向mesenchymal型转变的关系 | 首次揭示了CXCR4信号在胶质母细胞瘤中促进proneural型向mesenchymal型转变的作用，并提出了抑制CXCR4作为潜在治疗策略 | 研究主要基于RNA测序数据和遗传小鼠模型，需要进一步的临床试验验证 | 探究CXCR4表达与胶质母细胞瘤分子亚型转变及患者生存期的关系 | 胶质母细胞瘤的分子亚型转变及CXCR4表达的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 包括TCGA数据库中的proneural型胶质母细胞瘤样本和内部高级别胶质瘤样本，以及单细胞RNA测序数据和小鼠模型 |
| 12729 | 2024-08-07 |
Epithelial Endoplasmic Reticulum Stress Enhances the Risk of Muc5b-associated Lung Fibrosis
2023-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0252OC
PMID:36108173
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研究论文 | 本文研究了Muc5b过度表达与内质网应激在肺纤维化中的关联，并探讨了使用ISRIB恢复正常翻译以促进肺修复的可能性 | 首次报道了内质网应激途径成员ATF4和ATF6在IPF中的表达，并发现ISRIB能减少Muc5b的翻译，缓解肺纤维化 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探讨Muc5b过度表达与内质网应激在肺纤维化中的关系及治疗策略 | Muc5b过度表达的小鼠模型及IPF患者 | NA | 肺纤维化 | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型及IPF患者样本 |
| 12730 | 2024-08-07 |
Live, die, or regenerate? New insights from multi-omic analyses
2022-08-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.07.026
PMID:35981522
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了视网膜神经保护和视神经再生的新策略 | 通过多组学筛选和单细胞RNA测序技术，发现了轴突损伤信号转导和再生过程中的关键转录调控因子 | NA | 探索视网膜神经保护和视神经再生的分子机制 | 视网膜神经保护和视神经再生中的关键分子 | 数字病理学 | NA | 多组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12731 | 2024-08-07 |
Deep Imputation Bi-stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-cell RNA-sequencing Data
2024-Apr-12, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
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research paper | 本文提出了一种新的方法DSINMF，通过深度矩阵分解对单细胞RNA测序数据进行聚类 | DSINMF方法包括特征选择、缺失值插补、降维和深度矩阵分解与双随机图正则化四个步骤，以提高聚类效果 | NA | 探索细胞异质性和功能，辅助识别疾病机制和生物标志物 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | CNN | 基因转录组数据 | 九个数据集 |
| 12732 | 2024-08-07 |
A specific enterotype derived from gut microbiome of older individuals enables favorable responses to immune checkpoint blockade therapy
2024-Apr-10, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.03.002
PMID:38513657
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研究论文 | 本研究探讨了老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法的增强敏感性现象，并通过元分析和单细胞RNA测序数据揭示了其潜在机制，特别是与肠道微生物群相关的特定肠型。 | 识别了一种与老年患者免疫疗法效果改善相关的特定肠型，并通过小鼠实验证实了其治疗潜力。 | NA | 探索老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法增强敏感性的机制，并寻找个性化癌症免疫疗法的新途径。 | 老年癌症患者的肠道微生物群及其对免疫疗法的影响。 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 25个中小型试验 |
| 12733 | 2024-08-05 |
scRNAseq and High-Throughput Spatial Analysis of Tumor and Normal Microenvironment in Solid Tumors Reveal a Possible Origin of Circulating Tumor Hybrid Cells
2024-Apr-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16071444
PMID:38611120
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研究论文 | 利用高通量单细胞和空间转录组学分析肿瘤混合细胞的来源. | 首次识别共表达上皮和巨噬细胞标记的肿瘤混合细胞，并提供了其特征转录组的信息. | 关于循环混合细胞在组织中的来源的研究较少，且基于一两种标记的研究方法有限. | 探讨循环混合细胞的组织来源及其在不同类型癌症中的表现. | 肿瘤混合细胞(THCs)和正常组织中的细胞(NHCs)的转录组特征. | 数字病理学 | 乳腺癌和结肠癌 | 高通量单细胞转录组和空间转录组学 | NA | NA | 涉及乳腺癌和结肠癌的稀有样本 |
| 12734 | 2024-08-04 |
Defining T cell receptor repertoires using nanovial-based binding and functional screening
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320442121
PMID:38536748
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研究论文 | 本文利用纳米瓶进行T细胞受体多样性的定义和筛选 | 提出了一种新颖的纳米瓶技术，可以有效地捕获和激活特定的T细胞，从而链接TCR序列与其靶标 | 对特定抗原的识别和效率可能受到pMHC的选择和设计限制 | 开发一种新的方法来识别和筛选抗原反应性T细胞，以应用于免疫疗法 | 通过纳米瓶捕获并排序反应特定病毒和癌症抗原的T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA |
| 12735 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-Apr, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350660
PMID:38304946
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析新鲜和冷冻组织中的细胞，揭示了冷冻标志，表现为应激和激活的基因上调 | 首次揭示了冷冻处理对人类组织T细胞、ILCs和NK细胞的单细胞RNA测序结果的影响，特别是应激和激活相关基因的上调 | NA | 研究冷冻处理对人类组织中细胞的单细胞RNA测序结果的影响 | 人类组织中的T细胞、ILCs和NK细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 12736 | 2024-08-07 |
Identification and validation of an immunotherapeutic signature for colon cancer based on the regulatory patterns of ferroptosis and their association with the tumor microenvironment
2024-Apr, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119698
PMID:38387508
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研究论文 | 本研究全面评估了1623份结肠癌样本，识别基于铁死亡相关基因的铁死亡调控模式，并系统地将其与肿瘤微环境（TME）细胞浸润特征相关联 | 构建了铁死亡调控基因评分（FRG-score）以量化个体肿瘤中铁死亡改变的模式，并通过免疫治疗队列验证了低FRG-score患者的显著治疗和临床益处 | NA | 旨在识别和验证基于铁死亡调控模式的结肠癌免疫治疗特征 | 结肠癌样本及其铁死亡调控模式与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 结肠癌 | scRNA-seq | NA | 基因数据 | 1623份结肠癌样本 |
| 12737 | 2024-08-07 |
High lymphocyte signature genes expression in parathyroid endocrine cells and its downregulation linked to tumorigenesis
2024-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105053
PMID:38471398
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了甲状旁腺内分泌细胞中淋巴细胞标志物的高表达及其与肿瘤发生的关系 | 首次发现甲状旁腺内分泌细胞中CD4和CD226的高表达，并揭示了其在甲状旁腺腺瘤发病机制中的作用 | 由于正常甲状旁腺样本获取困难，研究样本数量有限 | 深入理解甲状旁腺内分泌细胞的功能及其在肿瘤发生中的作用 | 甲状旁腺内分泌细胞及其在甲状旁腺腺瘤中的变化 | 数字病理学 | 甲状旁腺疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 6个正常甲状旁腺样本和8个甲状旁腺腺瘤样本 |
| 12738 | 2024-08-05 |
Machine Learning-Based Characterization and Identification of Tertiary Lymphoid Structures Using Spatial Transcriptomics Data
2024-Mar-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25073887
PMID:38612697
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研究论文 | 该研究利用空间转录组数据对三级淋巴结构进行表征和识别 | 首次应用机器学习技术识别三级淋巴结构的标记，并建立预测模型 | 目前对TLS标记的一致性仍有待进一步验证 | 旨在通过机器学习方法识别和预测三级淋巴结构 | 三级淋巴结构及其标记基因 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 支持向量分类器 | 基因表达数据 | NA |
| 12739 | 2024-08-07 |
Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods with and without Sample Multiplexing
2024-Mar-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25073828
PMID:38612639
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研究论文 | 本研究对比分析了有无样本多重化的单细胞RNA测序方法 | 首次对比了使用样本多重化的Parse Biosciences平台和未使用样本多重化的10x Genomics平台的单细胞RNA测序方法 | 研究仅使用了来自两名健康个体的PBMCs样本，可能限制了结果的普遍性 | 评估不同单细胞RNA测序方法在样本多重化与非多重化条件下的性能 | 来自两名健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两名健康个体的PBMCs样本 |
| 12740 | 2024-08-04 |
A comprehensive multi-omics analysis identifies a robust scoring system for cancer-associated fibroblasts and intervention targets in colorectal cancer
2024-Mar-13, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05548-7
PMID:38478111
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研究论文 | 本研究建立了一个癌症相关成纤维细胞的评分系统，并识别了结直肠癌的干预靶点 | 创新性地开发了一个基于CAF基因评分的系统，用于评估结直肠癌患者的免疫微环境和预后 | 研究的局限性在于样本量和真实性的验证需要进一步的临床试验支持 | 研究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌中的临床应用和生物学机制 | 癌症相关成纤维细胞及其在结直肠癌中的不同亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 机器学习分析 | NA | 基因组数据 | 多个结直肠癌队列的样本 |