单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 12621 - 12640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12621 | 2024-08-05 |
The interleukin-1 receptor type-1 in disturbed flow-induced endothelial mesenchymal activation
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1190460
PMID:37539090
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研究论文 | 本研究探讨了干扰流动（d-flow）诱导的内皮间充质转化（EndMT）中白细胞介素-1受体类型1（IL-1R1）的角色 | 发现IL-1R1作为内皮细胞中新型的机械敏感受体，连接d-flow与EndMT信号通路 | 不同血管细胞类型的IL-1R1信号数据不一致，尚需进一步验证 | 揭示IL-1R1在内皮细胞对干扰流动反应中的作用 | 研究动脉粥样硬化中内皮细胞和EndMT相关转录因子SNAI1的相互作用 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | scRNA-seq | Cre-lox系统小鼠 | 基因表达数据 | 人类动脉粥样硬化样本和特定小鼠模型 |
| 12622 | 2024-08-05 |
Comprehensive characterization of tumor immune landscape following oncolytic virotherapy by single-cell RNA sequencing
2022-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-03084-2
PMID:34716463
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面描述了肿瘤免疫微环境在肿瘤溶瘤病毒治疗后的变化 | 首次全面分析了溶瘤病毒治疗引起的癌症中免疫变化 | 缺乏对长期治疗效果和不同类型肿瘤的研究 | 探究溶瘤病毒治疗如何改变肿瘤微环境中的免疫细胞组成 | 分析了使用HSV-2基础的溶瘤病毒处理的癌瘤中的免疫细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 处理过和未处理的肿瘤样本 |
| 12623 | 2024-08-05 |
Site-1 protease ablation in the osterix-lineage in mice results in bone marrow neutrophilia and hematopoietic stem cell alterations
2020-06-23, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.052993
PMID:32576566
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠中osterix谱系中Site-1蛋白酶的缺失对骨髓中中性粒细胞及造血干细胞的影响 | 本研究初步揭示了Site-1蛋白酶在维持骨髓造血微环境平衡中的重要作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果能否推广到人类需进一步验证 | 研究Site-1蛋白酶缺失对骨髓细胞组成及造血干细胞功能的影响 | 小鼠，尤其是osterix谱系中Site-1蛋白酶缺失的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质质谱 | NA | NA | 涉及多种骨髓来源的细胞，具体样本量未说明 |
| 12624 | 2024-08-04 |
Gene Expression Patterns in the Ctenophore Pleurobrachia bachei: In Situ Hybridization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_9
PMID:38668969
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研究论文 | 本研究提出了一种用于观察海洋无脊椎动物Pleurobrachia bachei的基因表达模式的原位杂交方法 | 提供了适用于高度脆弱的动物的原位杂交协议，并展示了细胞表型标记的表达模式 | 对脆弱动物的应用具有挑战性，可能限制了方法的通用性 | 研究Ctenophora类动物的基因表达模式 | 成年Pleurobrachia bachei | 数字病理学 | NA | 原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 成年Pleurobrachia bachei的样本 |
| 12625 | 2024-08-04 |
Analysis and Visualization of Single-Cell Sequencing Data with Scanpy and MetaCell: A Tutorial
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_17
PMID:38668977
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教程 | 本章节提供了对单细胞RNA测序数据分析流程的概述和实践指南 | 提出了使用Scanpy和MetaCell的实用指南，以及对主要分析步骤和数据可视化的最佳实践的比较 | 尚未充分代表用户在使用scRNA-seq分析中所需的实用指南 | 旨在为单细胞RNA测序的数据分析提供系统性的方法和实用指南 | 以单细胞RNA测序数据为研究对象，分析生物样本的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用了来自栅鳗鱼的scRNA-seq数据集，相应样本大小未具体说明 |
| 12626 | 2024-08-04 |
Unique challenges and best practices for single cell transcriptomic analysis in toxicology
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100475
PMID:38645720
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综述 | 本综述探讨了在毒理学中应用单细胞转录组分析面临的独特挑战及最佳实践 | 提出了针对毒理学中单细胞转录组分析的关键挑战和实用分析解决方案 | 该论文未提供具体的实验数据或样本分析 | 提高单细胞转录组学在毒理学中的应用 | 单细胞转录组数据在毒理学中的应用 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 转录组数据 | NA |
| 12627 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of CYBB as a prognostic marker and therapeutic target in glioma: A bioinformatics approach
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29549
PMID:38655339
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研究论文 | 本文综合分析了CYBB作为神经胶质瘤的预后标志物和治疗靶点 | 建立了基于CYBB和线粒体基因的预后模型，揭示其在神经胶质瘤患者预后中的潜在应用 | 未提及具体的样本数量和研究的局限性 | 识别新的标志基因并建立预后模型以改善神经胶质瘤的早期诊断和预后判断 | 研究对象为神经胶质瘤患者及其临床病理特征 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞测序，生物信息学分析 | 10基因预后模型 | 基因表达数据 | 7名神经胶质瘤患者的单细胞测序数据 |
| 12628 | 2024-08-04 |
Identifying MS4A6A+ macrophages as potential contributors to the pathogenesis of nonalcoholic fatty liver disease, periodontitis, and type 2 diabetes mellitus
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29340
PMID:38644829
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研究论文 | 本研究识别了MS4A6A+巨噬细胞作为非酒精性脂肪肝病、牙周炎和2型糖尿病发病机制的重要贡献者 | 首次确定了MS4A6A+巨噬细胞在多种疾病交互作用中的重要性 | 缺乏临床验证和更大样本量的支持 | 探讨非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病和牙周炎之间的共同机制 | 分析与NAFLD、T2DM和PD相关的数据集及其差异表达基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病、牙周炎 | 单细胞测序、免疫组织化学染色 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 三个疾病相关的数据集中识别了25个共享的差异表达基因 |
| 12629 | 2024-08-05 |
DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis
2024-Apr-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03720-5
PMID:38650025
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研究论文 | 本文研究了牙髓干细胞（DPSCs）如何调节口腔亚粘膜纤维化（OSF）中的上皮细胞-T细胞相互作用。 | 发现了一种独特的上皮细胞群体Epi1.2，具有促炎和促纤维化功能，揭示了它们与T细胞的相互作用在OSF中的重要机制。 | 本研究在探讨OSF的致病机制时仍存在一些不确定性，需要进一步验证和探索。 | 探索口腔亚粘膜纤维化(OSF)的致病机制，并基于此寻找新的治疗选择。 | 研究对象主要是口腔粘膜组织中的单细胞群体，尤其是Epi1.2上皮细胞及其与免疫细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 口腔亚粘膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 细胞数据 | 通过人类细胞图谱汇编的数据，以及在动物模型和临床病理切片中的验证 |
| 12630 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-Apr-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的分隔和缺血微环境中的明显免疫抑制。 | 利用空间转录组学技术，我们首次展示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间定位和分隔。 | 研究样本量较小，仅为三名胶质母细胞瘤患者，可能限制了结果的推广性。 | 旨在深入了解胶质母细胞瘤微环境中的肿瘤细胞状态及其空间分布。 | 研究对象为三名胶质母细胞瘤患者的肿瘤微环境和相关细胞状态。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 10x Chromium单细胞RNA测序（snRNA-seq）和空间转录组学数据 | NA | RNA数据 | 3名胶质母细胞瘤患者 |
| 12631 | 2024-08-05 |
Unravelling immune microenvironment features underlying tumor progression in the single-cell era
2024-Apr-22, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03335-z
PMID:38649887
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综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序(SC-RNA-seq)在肿瘤免疫微环境(TIME)特征解析中的重要性。 | 强调了SC-RNA-seq在肿瘤发生和进展中揭示TIME细胞和分子变化的新颖性。 | 未具体提及传统测序方法的局限性细节。 | 阐明免疫细胞与肿瘤发生和进展之间的关系。 | 肿瘤免疫微环境中细胞异质性的变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 12632 | 2024-08-04 |
Dysregulation of CD4+ and CD8+ resident memory T, myeloid, and stromal cells in steroid-experienced, checkpoint inhibitor colitis
2024-Apr-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008628
PMID:38642938
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研究论文 | 本研究揭示了使用检查点抑制剂引起的结肠炎中CD4+和CD8+记忆T细胞及内皮细胞的异常调节情况 | 本研究首次应用多重单细胞转录组学和蛋白质组学技术识别了特定的细胞群体，并探索了其在类固醇经历下的致病潜力 | 研究主要集中在类固醇经历的CPI结肠炎患者，可能不适用于类固醇未经历的患者群体 | 探索类固醇经历患者中检查点抑制剂结肠炎机制的细胞参与 | 类固醇经历的检查点抑制剂结肠炎患者的结肠活检和血液样本 | 数字病理学 | 结肠炎 | 多重单细胞转录组学和蛋白质组学 | NA | 活检样本和血液样本 | 主要来自类固醇经历的CPI结肠炎患者的样本 |
| 12633 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas in C57BL/6 mice encodes morphological phenotypes in the aging kidneys
2024-Apr-19, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03514-0
PMID:38641839
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研究论文 | 本研究提供了C57BL/6小鼠在不同发育阶段的肾脏形态和单细胞转录组图谱的综合数据。 | 提供了关于C57BL/6小鼠肾脏在整个发育阶段的详细形态学和单细胞转录组参考标准，有助于生物研究的进一步扩展。 | 缺乏对其他小鼠品系或其它管理条件下的肾脏形态及转录组的比较研究。 | 探究C57BL/6小鼠肾脏在不同发育阶段的形态变化及其单细胞转录组。 | C57BL/6小鼠的肾脏在胚胎到老化过程中的各个阶段。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 肾脏组织数据 | 8组，每组5-6只小鼠 |
| 12634 | 2024-08-05 |
Membrane to cortex attachment determines different mechanical phenotypes in LGR5+ and LGR5- colorectal cancer cells
2024-Apr-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47227-2
PMID:38637494
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研究论文 | 本文研究了LGR5+和LGR5-结直肠癌细胞在机械性状上的差异 | 揭示了LGR5+细胞与LGR5-细胞在机械属性上的显著差异及其对转移的潜在影响 | 对不同细胞群体在转移过程中的具体机制尚未深入探讨 | 探讨结直肠癌细胞群体的机械性状如何影响其转移能力 | 分析LGR5+和LGR5-结直肠癌细胞的机械性能和生物学特性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 来自患者队列的结直肠癌源性类器官样本 |
| 12635 | 2024-08-04 |
Identification of cells of leukemic stem cell origin with non-canonical regenerative properties
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101485
PMID:38582086
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研究论文 | 本研究揭示了一种来源于白血病干细胞但具有非典型再生特性的细胞群体 | 首次识别出具有促进或抑制白血病再生功能的 AML 再生富集细胞（RECs） | 尚不清楚 RECs 在白血病复发中的具体机制 | 研究化疗后的急性髓性白血病（AML）细胞群体的特征和功能 | 焦点集中在来源于白血病干细胞的 AML 再生富集细胞（RECs） | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞转录组测序和空间转录组学 | NA | 生物样本数据 | AML 患者的骨髓样本（具体样本数量未说明） |
| 12636 | 2024-08-05 |
Multicellular ecotypes shape progression of lung adenocarcinoma from ground-glass opacity toward advanced stages
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101489
PMID:38554705
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研究论文 | 本文分析了58例肺腺癌患者，以阐明不同临床影像表现之间的异质性 | 识别了六种肺多细胞生态型（LME），并揭示了其与放射学模式及癌细胞状态的关联 | 当前对这种异质性的理解仍然有限 | 探讨肺腺癌的临床放射学表现及其生物特征的异质性 | 58例肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，全外显子组测序，机器学习 | NA | 基因组数据 | 58例肺腺癌患者 |
| 12637 | 2024-08-05 |
Establishment of a cholangiocarcinoma risk evaluation model based on mucin expression levels
2024-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i4.1344
PMID:38660669
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研究论文 | 本研究建立了一个基于粘蛋白表达水平的胆管癌风险评估模型 | 首次系统性探讨了粘蛋白在胆管癌进展及预后中的作用，建立了风险评估公式 | 尚未完全理解粘蛋白家族如何影响胆管癌的进展和预后 | 研究粘蛋白在胆管癌进展中的作用并建立风险评估模型 | 14个胆管癌样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫组化 | LASSO回归 | RNA数据 | 14个胆管癌样本 |
| 12638 | 2024-08-05 |
Identification of receptors and factors associated with human coronaviruses in the oral cavity using single-cell RNA sequencing
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28280
PMID:38560173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了与人类冠状病毒在口腔中相关的受体和因素 | 本研究整合了多个口腔组织的单细胞RNA测序数据，识别了特定细胞簇及SARS-CoV-2和与冠状病毒相关的受体的表达模式 | SCARFs在其他口腔部位的表达模式相对复杂，可能仅与SARS-CoV-2感染特定相关 | 探究四种人类冠状病毒在口腔中的感染机制和靶细胞特征 | 本研究对象为七种人类口腔组织中的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 七种人类口腔组织的单细胞数据 |
| 12639 | 2024-08-04 |
Staphylococcus aureus induces drug resistance in cancer T cells in Sézary syndrome
2024-Apr-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021671
PMID:38170178
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研究论文 | 本研究报告了金黄色葡萄球菌及其肠毒素在Sézary综合症患者的恶性T细胞中诱导耐药性 | 首次揭示了金黄色葡萄球菌肠毒素诱导的抗药机制及其在Sézary综合症中的影响 | 本研究未涉及多种其他类型的细菌或影响因素 | 探索金黄色葡萄球菌诱导的药物耐受机制及其在SE综合症中的作用 | 对来自Sézary综合症患者的恶性T细胞进行研究 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 来自Sézary综合症患者的多个原代恶性T细胞样本 |
| 12640 | 2024-08-04 |
Spatial motifs reveal patterns in cellular architecture of complex tissues
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588586
PMID:38645046
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研究论文 | 空间组织对保证组织的生理功能和癌症等病理状态至关重要 | 提出了一种新方法，通过空间邻域图检测细胞类型的空间模式 | 未提及该方法在其他组织类型或更复杂条件下的适用性 | 旨在识别细胞类型之间的更高阶关联，以理解复杂组织的发育和功能 | 主要研究小鼠视网膜双极细胞和下丘脑前视区域的空间图谱 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 合成数据和空间图谱 | 使用合成数据进行验证，具体样本量未知 |