单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 12621 - 12640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12621 | 2024-08-05 |
Trem2 promotes foamy macrophage lipid uptake and survival in atherosclerosis
2023-Nov, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00354-3
PMID:38646596
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研究论文 | 本研究揭示了Trem2在动脉粥样硬化中对泡沫巨噬细胞分化和生存的调节作用 | 首次确定Trem2作为泡沫巨噬细胞特性的调节因子，并揭示其作为动脉粥样硬化潜在治疗靶点的可能性 | 本研究可能未能充分考虑动脉粥样硬化中其他潜在调节因子的影响 | 探讨Trem2在动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞的角色 | 泡沫巨噬细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因组范围的CRISPR筛选 | NA | NA | NA |
| 12622 | 2024-08-05 |
Cell-type specific molecular architecture for mu opioid receptor function in pain and addiction circuits
2023-11-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2023.109597
PMID:37271281
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研究论文 | 该文章描述了在疼痛和成瘾电路中，特定细胞类型的μ阿片受体功能的分子结构。 | 研究中使用单细胞RNA测序技术识别了整个神经系统中表达μ阿片受体的细胞类型，提供了将阿片类药物影响映射到新发现细胞类型的新机会。 | 该研究可能在细胞特征与阿片类药物作用之间的因果关系上存在探索的局限性 | 阐明与阿片类药物相关的细胞类型和神经电路，以促进安全的疼痛管理和阿片使用障碍的治疗。 | 研究对象为表达μ阿片受体的神经元细胞类型。 | 数字病理学 | 阿片类药物使用障碍 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 12623 | 2024-08-05 |
Illuminating the Terminal Nerve: Uncovering the Link between GnRH-1 and Olfactory Development
2023-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.31.555770
PMID:37693459
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研究论文 | 该研究揭示了GnRH-1神经元与嗅觉发育之间的联系 | 首次发现Prokr2在终末神经元中的表达与GnRH-1神经元形成及迁徙的关键时期相关 | 研究主要依赖于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨嗅觉系统与GnRH-1发育之间的机制联系 | 重点研究终末神经元及其在嗅觉发育中的作用 | 数字病理学 | Kallmann综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 12624 | 2024-08-05 |
CXCL9 influences the tumor immune microenvironment by stimulating JAK/STAT pathway in triple-negative breast cancer
2023-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03343-w
PMID:36472587
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研究论文 | 这项研究探讨了CXCL9在三阴性乳腺癌中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 发现CXCL9通过刺激JAK/STAT信号通路在三阴性乳腺癌中影响肿瘤免疫微环境，并可能作为临床预后和免疫治疗疗效的生物标志物 | 研究未提及样本规模和临床数据的全面性 | 探讨CXCL9在三阴性乳腺癌中对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究对象为三阴性乳腺癌中的M1和M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 在研究中包含了三阴性乳腺癌样本，但具体样本数量未提及 |
| 12625 | 2024-08-05 |
Immunosuppressive TREM2(+) macrophages are associated with undesirable prognosis and responses to anti-PD-1 immunotherapy in non-small cell lung cancer
2022-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03173-w
PMID:35278107
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研究论文 | 这项研究探讨了TREM2阳性巨噬细胞在非小细胞肺癌中的免疫抑制作用及其与免疫治疗反应的关系 | 首次识别出TREM2阳性巨噬细胞亚型与免疫疗法反应相关，并揭示其在肿瘤进展中的作用 | 未在外周血中发现TREM2+ TAMs，可能限制了其作为通用生物标志物的适用性 | 研究TAM亚型与非小细胞肺癌免疫治疗反应之间的关系 | 涉及341个手术样本和40个接受免疫治疗的NSCLC患者的组织样本 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 341个手术样本和40个免疫治疗组织样本 |
| 12626 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on B cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2022-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03143-2
PMID:35152302
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研究论文 | 研究分析了B细胞标记基因的表达谱，并基于这些基因构建了肺腺癌的预后标记。 | 提出了一种基于B细胞标记基因的新型预后标记，能够有效预测肺腺癌患者的生存率和免疫治疗反应。 | 研究可能存在样本来源的限制，尽管已在多个独立队列中进行验证。 | 探索B细胞标记基因在肺腺癌中的表达特征，并构建预后标记。 | 研究对象为1268名不同队列的肺腺癌患者。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1268名肺腺癌患者 |
| 12627 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals intra-tumoral heterogeneity in human chordomas
2022-Sep, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03152-1
PMID:35084549
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研究论文 | 这项研究探讨了人类软骨瘤中的肿瘤异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了软骨瘤的转录组特征及其异质性 | 仅涉及6个软骨瘤样本，样本量较小 | 评估软骨瘤的肿瘤异质性并识别潜在的治疗靶点 | 六个软骨瘤样本和分析的33,737个细胞 | 数字病理 | 软骨瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 6个软骨瘤样本，分析了33,737个细胞 |
| 12628 | 2024-08-05 |
MAIT cells accumulate in ovarian cancer-elicited ascites where they retain their capacity to respond to MR1 ligands and cytokine cues
2022-May, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-03118-9
PMID:34854949
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研究论文 | 本研究探讨了卵巢癌引起的腹水中MAIT细胞的特征及其免疫功能 | 揭示了MAIT细胞在卵巢癌腹水中的功能，及其在肿瘤进展中的作用 | 样本量相对较小，且仅展示了功能标志而未进行深入机制研究 | 研究MAIT细胞在卵巢癌中的积累及其免疫反应能力 | 主要研究了卵巢癌患者及小鼠模型中的MAIT细胞 | 免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本 | 23名卵巢癌患者的腹水样本 |
| 12629 | 2024-08-05 |
Construction of TME and Identification of crosstalk between malignant cells and macrophages by SPP1 in hepatocellular carcinoma
2022-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02967-8
PMID:34028567
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了肝细胞癌中的肿瘤微环境及SPP1在恶性细胞与巨噬细胞之间的交互作用 | 提出了一种新的表观遗传免疫评分系统(EIRS)，并揭示SPP1作为HCC患者预后差的免疫相关预测因子 | 研究主要依赖于已有的数据库，可能限制了对内在机制的更深入理解 | 探讨肝细胞癌的免疫微环境及其对疾病进展的影响 | 以肝细胞癌(HCC)患者为研究对象，分析肿瘤微环境的特征及与巨噬细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 12630 | 2024-08-05 |
CD74+ macrophages are associated with favorable prognosis and immune contexture in hepatocellular carcinoma
2022-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02962-z
PMID:34009409
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研究论文 | 本研究探讨了CD74+巨噬细胞在肝细胞癌中的作用及其与预后和免疫环境的关系 | 本研究首次展示了CD74在肝细胞癌肿瘤微环境中的重要作用，并揭示了其与CD8细胞毒性T淋巴细胞浸润之间的关联 | 研究主要依赖于来自单一医院和TCGA的数据，可能存在样本代表性问题 | 探讨CD74在肝细胞癌中的功能及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本和相关的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 免疫组化, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本, 单细胞数据 | 来自中山医院的肝细胞癌组织样本和TCGA数据 |
| 12631 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular immune profile in a Pembrolizumab-responsive PD-L1-negative lung cancer patient
2021-Aug, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02848-0
PMID:33506299
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了一例Pembrolizumab反应的PD-L1阴性肺癌患者的细胞和分子免疫特征 | 首次在PD-L1阴性患者中识别与PD-1阻断相关的新细胞特征和潜在的预测标记 | 样本量有限，可能不足以广泛推广发现的应用 | 探索PD-L1阴性肺癌患者在Pembrolizumab治疗中的细胞及分子特征 | PD-L1阴性肺癌患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 16个细胞簇中的3423个细胞 |
| 12632 | 2024-08-05 |
Cryopreservation of microglia enables single-cell RNA sequencing with minimal effects on disease-related gene expression patterns
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102357
PMID:33870145
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研究论文 | 本文研究了冷冻保存小胶质细胞对单细胞RNA测序的影响 | 探索了冷冻保存小胶质细胞的使用，证明其在单细胞RNA测序中具有良好的适用性 | 未明确指出冷冻保存对其他细胞类型的影响 | 研究冷冻保存小胶质细胞对疾病相关基因表达模式的影响 | 冷冻保存的小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了配对的新鲜和冷冻保存的小胶质细胞样本 |
| 12633 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels tumour heterogeneity plus M2-like tumour-associated macrophage infiltration and aggressiveness in TNBC
2021-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02669-7
PMID:32681241
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研究论文 | 本研究分析了三阴性乳腺癌中的肿瘤异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润及其侵袭性 | 结合单细胞和整体组织转录组分析揭示了肿瘤异质性和免疫微环境与临床结果之间的关联 | 研究的局限性未在摘要中明确提及 | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤异质性及M2型肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤细胞和肿瘤浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | 随机森林和支持向量机（SVM），深度学习神经网络 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 12634 | 2024-08-05 |
Dynamics of peripheral T cell clones during PD-1 blockade in non-small cell lung cancer
2020-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02642-4
PMID:32591861
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研究论文 | 本文探讨了在非小细胞肺癌中PD-1阻断期间外周T细胞克隆的动态变化 | 通过Smart-seq2单细胞RNA测序分析，首次对T细胞克隆在免疫治疗中的动态进行了全面监测 | 研究样本仅限于非小细胞肺癌患者，可能影响结果的普遍适用性 | 研究PD-1阻断患者外周T细胞克隆的功能状态和动态变化 | 分析了3,110个非小细胞肺癌患者的外周T细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | Smart-seq2单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3,110个外周T细胞 |
| 12635 | 2024-08-05 |
Tumor-infiltrating CD39+CD8+ T cells determine poor prognosis and immune evasion in clear cell renal cell carcinoma patients
2020-Aug, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02563-2
PMID:32306075
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研究论文 | 该研究评估了肾透明细胞癌患者中肿瘤浸润CD39+CD8+ T细胞的临床价值 | 首次展示了CD39+CD8+ T细胞积累与肾透明细胞癌差预后的相关性 | 研究基于回顾性队列，缺乏前瞻性验证 | 探究CD39+CD8+ T细胞在肾透明细胞癌中的预后价值及其作为潜在治疗靶点 | 243例肾透明细胞癌患者的肿瘤微环境及其免疫细胞功能 | 数字病理学 | 肾癌 | 免疫组化分析，流式细胞术，生物信息学分析 | Kaplan-Meier分析，COX回归模型 | 样本 | 243例肾透明细胞癌患者，48个新鲜肿瘤样本 |
| 12636 | 2024-08-05 |
Interpretable factor models of single-cell RNA-seq via variational autoencoders
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa169
PMID:32176273
|
研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器的可解释单细胞RNA-seq因子模型 | 提出了一种修改过的变分自编码器框架，为大规模数据集中的基因程序识别提供可解释性 | 由于论文中未详细描述具体的限制，故此处为NA | 探索单细胞RNA-seq中基因表达变异和细胞类型依赖的统计推断方法 | 通过对大规模数据集的分析，识别基因程序 | 数字病理学 | NA | 变分自编码器 | 因子模型 | 基因表达数据 | NA |
| 12637 | 2024-08-05 |
Linking single-cell measurements of mass, growth rate, and gene expression
2018-11-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1576-0
PMID:30482222
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研究论文 | 本文介绍了一种微流体平台，可直接测量单细胞质量和生长速率。 | 创新之处在于将单细胞质量和生长速率的测量与高倍单细胞分析技术结合起来 | 未提及特定的局限性 | 研究单细胞生理特征与转录特征之间的关系 | 研究L1210和FL5.12细胞系及激活的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 微流体平台 | NA | NA | 涉及的细胞系包括L1210、FL5.12和患者来源的胶质母细胞瘤细胞系 |
| 12638 | 2024-08-04 |
NIFK, a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Pan-- Cancer Analysis, Significantly Regulates Proliferation and Metastasis of Colorectal Cancer
2024-Apr-24, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 该研究系统分析了NIFK在全癌种中的表达及其在结直肠癌中的作用 | 揭示了NIFK在大多数肿瘤中过表达，并显示出显著的预后效能和与免疫特征的相关性 | 目前缺乏对NIFK在其他癌种的系统分析，如在非结直肠癌中的具体作用 | 探讨NIFK作为潜在预后和免疫生物标志物在癌症中的作用 | 研究NIFK在多种癌症中表达、突变及其在结直肠腺癌中的免疫特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 通过TCGA进行的大规模分析，具体样本数量未提供 |
| 12639 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human lung innate lymphoid cells in the vascular and tissue niche reveals molecular features of tissue adaptation
2023, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyad007
PMID:38650756
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研究论文 | 本研究利用人源化小鼠模型，通过单细胞RNA测序技术，揭示了人体肺部血管和组织微环境中先天淋巴细胞（ILCs）的基因特征及其组织适应性的分子机制 | 首次在人源化小鼠模型中定义了肺部血管和组织微环境中人体ILCs的基因特征，并揭示了微环境信号对ILCs分子程序的塑造作用 | NA | 研究人体肺部不同解剖微环境中先天淋巴细胞（ILCs）的分子特征及其组织适应性 | 人体肺部的先天淋巴细胞（ILCs）及其在血管和组织微环境中的适应性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源化MISTRG小鼠模型中的肺部ILCs和NK细胞 |
| 12640 | 2024-08-04 |
Co-expression of immune checkpoints in glioblastoma revealed by single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.014
PMID:38633388
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中的免疫检查点的共表达及其分子特征 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组分析，首次揭示了胶质母细胞瘤中免疫检查点表达模式及其潜在的免疫逃逸机制 | 本研究基于未治疗的胶质母细胞瘤样本，可能无法完全反映治疗后的情况 | 为了更好地理解胶质母细胞瘤的肿瘤微环境及其免疫逃逸机制 | 未治疗的胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组 | NA | RNA数据 | 180名胶质瘤患者用于预后验证 |