单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 12621 - 12640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12621 | 2024-08-05 |
Cellular senescence and metabolic reprogramming model based on bulk/single-cell RNA sequencing reveals PTGER4 as a therapeutic target for ccRCC
2024-Apr-11, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12234-5
PMID:38605343
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研究论文 | 本研究建立了一个基于RNA测序的细胞衰老与代谢重编程模型，并提出了PTGER4作为治疗ccRCC的靶点。 | 首次系统性探讨了与衰老相关的代谢过程变更与ccRCC之间的关系，并开发了一个新模型SeMRM以预测患者的生存率。 | 本研究可能受限于数据集的偏差及其适用性，且缺乏长期跟踪数据验证。 | 研究细胞衰老和代谢重编程在ccRCC中的作用，探讨其潜在的治疗靶点。 | 以ccRCC患者为对象，研究其代谢活动、免疫微环境及治疗反应等。 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | 风险评分模型 (SeMRM) | 基因组数据，临床信息 | 使用了两个ccRCC数据集和一个单细胞数据集，具体样本量未明确说明 |
| 12622 | 2024-08-05 |
Immune Characteristic Genes and Neutrophil Immune Transformation Studies in Severe COVID-19
2024-Apr-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12040737
PMID:38674681
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研究论文 | 本研究识别了六个与 COVID-19 重症相关的免疫特征基因，并探讨了中性粒细胞在重症中的免疫转化。 | 本研究首次确定了 COVID-19 重症的免疫特征基因和关键免疫细胞，以及中性粒细胞的转变机制。 | 本研究的免疫特征基因和细胞机制尚需在更大规模的研究中验证。 | 探讨 COVID-19 重症的免疫病理特征及中性粒细胞的免疫转化过程。 | 研究对象为 COVID-19 重症患者外周血和支气管肺泡灌洗液中的细胞。 | 数字病理学 | COVID-19 | mRNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自 COVID-19 患者的外周血和支气管肺泡灌洗液样本 |
| 12623 | 2024-08-04 |
GTADC: A Graph-Based Method for Inferring Cell Spatial Distribution in Cancer Tissues
2024-Apr-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040436
PMID:38672453
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图的方法GTADC，旨在推断癌症组织中细胞的空间分布。 | GTADC通过利用轮廓得分来捕捉细胞类型内具有显著表达差异的基因，相较于传统方法增强了基因选择的准确性。 | 传统分析方法在处理癌细胞与正常细胞之间的基因表达差异时并不够准确，依赖于统计方法可能无法精确捕捉细胞类型的差异。 | 研究旨在更深入了解早期癌症，并为早期癌症诊断提供潜在支持。 | 研究对象为癌症组织中的细胞，特别是识别不同细胞类型的空间组合。 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学（ST）和单细胞测序（scRNA-seq） | 图神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 12624 | 2024-08-05 |
Tumor Cell-Derived Complement Component C1r Acts as a Prognostic Biomarker and Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024-Apr-02, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2904138
PMID:38682192
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研究论文 | 本研究探讨了C1r在食道鳞状细胞癌（ESCC）中的表达模式及其肿瘤促进作用 | C1r被发现不仅作为预后生物标志物，还促进了食道鳞状细胞癌的进展 | 本研究可能未全面揭示C1r其他潜在的肿瘤相关功能 | 旨在调查C1r在食道鳞状细胞癌中的作用及其相关机制 | 食道鳞状细胞癌组织、恶性上皮细胞以及培养的ESCC细胞 | 数字病理学 | 食道癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blotting | 无毛小鼠模型 | 组织样本、细胞培养样本 | 样本数量未具体提及，涉及ESCC组织、恶性上皮细胞和小鼠实验 |
| 12625 | 2024-08-05 |
Role of Tumor-Associated Macrophages in Cervical Cancer: Integrating Classical Perspectives with Recent Technological Advances
2024-Mar-27, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life14040443
PMID:38672714
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综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞在宫颈癌中的作用及其影响 | 提出结合最新研究技术深入研究宫颈癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤相关巨噬细胞在宫颈癌中的研究相对较少 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在宫颈癌进展中的作用 | 肿瘤相关巨噬细胞及其对宫颈癌的影响 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序和空间RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12626 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional landscapes of bovine peri-implantation development
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544813
PMID:37398069
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研究论文 | 该文章展示了牛的胚胎植入前发育过程中单细胞转录组的全景视图 | 发现了一种之前未被认识的原始滋养层细胞谱系，负责牛的妊娠维持 | 没有提供具体的样本量信息 | 全面理解牛的植入前发育中的细胞层次及其分子机制 | 牛的植入前胚胎在不同发育阶段的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 不同发育阶段（第12、14、16和18天）的单细胞样本 |
| 12627 | 2024-08-05 |
Inference of cell type-specific gene regulatory networks on cell lineages from single cell omic datasets
2023-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38637-9
PMID:37244909
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的方法，通过单细胞组学数据推断特定细胞类型的基因调控网络 | 开发了单细胞多任务网络推断(scMTNI)框架，可以整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，推断细胞谱系上的基因调控网络 | 当前方法在整合scRNA-seq和scATAC-seq测量及建模网络动态方面存在局限性 | 旨在提高细胞类型特异性基因调控网络的推断精度 | 特定细胞类型的基因调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞可转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | 多任务学习框架 | 模拟数据和真实数据 | NA |
| 12628 | 2024-08-05 |
Multimodal single-cell analysis reveals distinct radioresistant stem-like and progenitor cell populations in murine glioma
2020-12, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23866
PMID:32621641
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研究论文 | 这篇文章展示了小鼠胶质瘤中不同的耐辐射干样和祖细胞群体的多模态单细胞分析 | 首次结合侧群分析和单细胞RNA测序，揭示了胶质瘤对辐射的细胞反应时间过程 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表人类胶质瘤的复杂性 | 探讨胶质瘤中耐辐射细胞群体及其对辐射的反应 | 小鼠胶质瘤模型中的肿瘤细胞和免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，FACS | NA | 细胞 | NA |
| 12629 | 2024-08-05 |
RNA-seq analysis of galaninergic neurons from ventrolateral preoptic nucleus identifies expression changes between sleep and wake
2020-Sep-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07050-7
PMID:32928100
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研究论文 | 本文研究了在睡眠和觉醒状态下，腹外侧前视核的加拉宁能神经元的转录调控。 | 本研究揭示了加拉宁能神经元在睡眠和缺觉中的转录响应变化，扩展了对这一特定神经元群体的重要知识。 | 研究可能未能充分考虑其他神经元类型及其在睡眠/觉醒中的作用。 | 探讨腹外侧前视核加拉宁能神经元的转录调控机制，特别是在睡眠状态下的变化。 | 研究对象为腹外侧前视核的加拉宁能神经元，比较其在睡眠与觉醒状态下的表达变化。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从腹外侧前视核分离的eGFP(+)加拉宁神经元 |
| 12630 | 2024-08-05 |
Diversification of reprogramming trajectories revealed by parallel single-cell transcriptome and chromatin accessibility sequencing
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1190
PMID:32917699
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研究论文 | 本文探讨了细胞重编程过程中的异质性及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序揭示了重编程细胞的多样性和异步轨迹 | 未提及具体样本数量和实验限制 | 揭示重编程细胞的异质性及成功重编程的机制 | 重编程的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12631 | 2024-08-05 |
Targeting cellular senescence as a therapeutic vulnerability in gastric cancer
2024-Jun-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122631
PMID:38621585
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研究论文 | 本研究构建了一个胃癌的细胞衰老图谱，并探索了潜在的治疗方案 | 首次提出胃癌特异性细胞衰老评分（GSS）并发现其与临床结果有关联 | 本研究主要依赖于体外实验，临床验证尚需进一步研究 | 探讨细胞衰老在胃癌中的应用作为治疗脆弱性 | 胃癌患者中的细胞衰老相关调节因子 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq | NA | 基因数据 | 38个与衰老相关的调节因子 |
| 12632 | 2024-08-04 |
Prognostic gene landscapes and therapeutic insights in sepsis-induced coagulopathy
2024-May, Thrombosis research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.thromres.2024.03.011
PMID:38513536
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研究论文 | 本研究探讨了脓毒症诱导的凝血病的预后基因和治疗见解 | 本文首次识别了脓毒症患者生存的四个关键预后基因，并揭示了FYN基因在凝血功能中的重要作用 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类脓毒症的复杂性 | 本研究的目的是识别脓毒症诱导凝血病的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 研究对象为脓毒症患者及脓毒症小鼠模型 | 数字病理学 | 脓毒症 | 实时定量PCR，单细胞测序 | NA | 转录组数据，血液样本 | NA |
| 12633 | 2024-08-05 |
Genetic and Immunological Characterization of Brain Metastases from Solid Cancers
2024-May, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17001
PMID:38677762
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研究论文 | 本研究对来自实体癌症的脑转移瘤进行了遗传和免疫特征的分析 | 通过分析脑转移瘤的肿瘤突变负担和相关免疫基因，确定了新的预后标志物和治疗靶点 | 样本数量较小，仅基于九名癌症患者的肿瘤样本 | 调查脑转移瘤特异性的生物标志物和相关预后因素 | 来自静冈癌症中心九名癌症患者的原发癌和转移癌病变 | 数字病理学 | 脑转移癌症 | 下一代测序，单细胞RNA测序，定量PCR | NA | 基因数据 | 九名癌症患者的样本 |
| 12634 | 2024-08-05 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-Apr-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病性心肌病中细胞状态和分子变化的复杂性 | 整合了scRNA-seq和scATAC-seq数据，提供了对糖尿病性心肌病进展的单细胞水平理解 | 本研究主要集中在小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 深入了解糖尿病性心肌病(DCM)中的细胞状态和分子特征 | 从WT小鼠和DCM小鼠心脏中提取的单细胞RNA和ATAC数据 | 数字病理学 | 糖尿病性心肌病 | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞RNA和ATAC数据 | 从10个小鼠心脏提取的单细胞数据 |
| 12635 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-Apr, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞环境 | 首次确定了促进翼状胬肉的新的细胞亚群和细胞间相互作用 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行更广泛的临床验证 | 揭示翼状胬肉的病理机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者和正常对照的结膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 45605个细胞来自翼状胬肉患者和正常对照 |
| 12636 | 2024-08-04 |
Hypercapnia alters stroma-derived Wnt production to limit β-catenin signaling and proliferation in AT2 cells
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159331
PMID:36626234
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研究论文 | 这篇文章探讨了高二氧化碳血症如何通过限制β-连环蛋白信号传导和增殖能力，影响肺泡Ⅱ型细胞的功能 | 研究揭示了高二氧化碳血症对肺泡Ⅱ型细胞增殖能力的抑制及其机制，尤其是Wnt信号通路的改变 | 该研究主要基于小鼠模型，可能在人类中的适用性有限 | 了解高二氧化碳血症对肺损伤后肺修复过程的影响 | 小鼠模型中的肺泡Ⅱ型细胞及其周围的基质细胞 | 数字病理学 | 肺病 | 空间转录组学、细胞谱系追踪、3D培养 | NA | NA | 小鼠模型，样本数量未明确描述 |
| 12637 | 2024-08-05 |
Social reprogramming in ants induces longevity-associated glia remodeling
2020-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba9869
PMID:32875108
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研究论文 | 本文探讨了社会性昆虫中工蚁转变为类女王状态对神经胶质细胞重塑及寿命的影响 | 发现社交行为的重编程与神经保护胶质细胞的扩展相关，揭示了工蚁转变为gamergate对寿命延长的影响 | 研究主要集中在特定的社交转变上，可能无法广泛适用于所有社交昆虫 | 探索社会性昆虫中工作形式与寿命之间的关系及其机制 | 研究对象是社会性昆虫中的工蚁与gamergate状态的比较 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12638 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Cellular Hierarchies and Impaired Developmental Trajectories in Pediatric Ependymoma
2020-07-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.06.004
PMID:32663469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析小儿室管膜瘤的细胞层次和发育轨迹的影响 | 揭示了室管膜瘤的细胞层次和发育起源，以及其与生物学和临床行为相关的分子依赖性 | NA | 研究小儿室管膜瘤的肿瘤异质性及其发育起源 | 取自不同分子组和解剖位置的室管膜瘤样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12639 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals ectopic and aberrant lung-resident cell populations in idiopathic pulmonary fibrosis
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1983
PMID:32832599
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研究论文 | 我们提供了一幅特发性肺纤维化（IPF）单细胞图谱，揭示了该致命间质肺病中的细胞多样性 | 识别出一种先前未被发现的异常基底细胞群体，并展示了IPF肺中细胞群体的复杂性 | 研究仅涉及有限的样本种类，可能无法完全代表所有IPF患者中的细胞异质性 | 研究特发性肺纤维化中的细胞组成及其潜在功能 | 312,928个来自32个IPF患者和其他对照的单细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 312,928个细胞来自32个IPF患者、28个吸烟和不吸烟的对照以及18个COPD患者的肺 |
| 12640 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in choroidal neovascularization model
2024-May, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109877
PMID:38537669
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研究论文 | 本文通过单细胞测序探索了脉络膜新生血管化模型中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次详细描述了RPE/脉络膜复合体内的细胞多样性和特定细胞类型之间复杂的相互作用 | 研究可能需要更大样本量和长时间跟踪，以充分验证发现的细胞类型及其功能 | 探索与年龄相关性黄斑变性相关的脉络膜新生血管化中的细胞组成和相互作用 | 主要研究脉络膜/视网膜色素上皮复合体中的各种细胞类型，包括内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |