单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28614 篇文献，本页显示第 12621 - 12640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12621 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Epstein-Barr Virus-Associated Hemophagocytic Lymphohistiocytosis
2024-Apr-20, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-024-01701-0
PMID:38642164
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序表征EBV-HLH的免疫特征并与EBV-IM进行比较 | 首次详细探讨了IFNγ及其他细胞因子在EBV-HLH中的作用 | 样本数量较少，仅包括三名EBV-HLH患者 | 研究EBV感染引发的EBV-HLH的免疫反应特点 | 三名背景不同的EBV-HLH儿童患者及两名EBV-IM患者 | 数字病理学 | EB病毒相关淋巴组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五名患者，包括三名EBV-HLH患者和两名EBV-IM患者 |
| 12622 | 2024-08-04 |
SCIMAP: A Python Toolkit for Integrated Spatial Analysis of Multiplexed Imaging Data
2024, Journal of open source software
DOI:10.21105/joss.06604
PMID:38873023
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研究论文 | 本文介绍了SCIMAP，一个用于多重成像数据的集成空间分析的Python工具包 | SCIMAP专门为多重成像数据的复杂性量身定制，提供了图像可视化与数据分析之间的无缝集成 | 目前尚未提及SCIMAP在特定研究领域的局限性 | 研究多重成像数据的空间关系及其统计显著性 | 主要研究不同细胞之间的空间关系 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 成像数据 | 涉及10个或更多细胞，测量多达100种生物分子 |
| 12623 | 2024-08-04 |
Absence of Slc39a14/Zip14 in mouse pancreatic beta cells results in hyperinsulinemia
2024-01-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00117.2023
PMID:38019082
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研究论文 | 本研究探讨了SLC39A14/ZIP14在小鼠胰腺β细胞中在胰岛素分泌中的作用 | 揭示了ZIP14在胰腺β细胞内的锌转运与葡萄糖刺激下的胰岛素分泌之间的关系，提供了对2型糖尿病治疗的新见解 | 尚未充分研究ZIP14在β细胞中的具体功能，以及其在磁共振成像中的应用 | 探索ZIP14介导的细胞内锌转运在葡萄糖刺激的胰岛素分泌及代谢反应中的作用 | 小鼠胰腺β细胞特定的ZIP14敲除模型 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | KO模型 | 体内，体外和外切除实验数据 | 使用了β-KO小鼠及分离的胰岛 |
| 12624 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis identifies a unique tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572266
PMID:38187574
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研究论文 | 本研究描述了在黑色素瘤脑膜下疾病中脑膜间质的肿瘤促进功能 | 首次揭示了脑膜间质在黑色素瘤LMD中的肿瘤促进作用及其机制 | 仅针对特定肿瘤微环境进行研究，结果可能不适用于其它类型的转移性肿瘤 | 研究黑色素瘤脑膜下疾病的肿瘤微环境与肿瘤细胞之间的相互作用 | 侧重于黑色素瘤LMD的脑膜组织及对应的外脑转移位点 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 12625 | 2024-08-04 |
Coordinated immune dysregulation in Juvenile Dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566033
PMID:37986917
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研究论文 | 该文章探讨了青少年皮肌炎的免疫失调特征 | 首次通过单细胞基因组学揭示了青少年皮肌炎中免疫系统的协调失调 | 对疾病机制的理解仍然不完全，治疗选择有限 | 旨在理解青少年皮肌炎的免疫失调及其与疾病活动的关系 | 研究对象为不同疾病活动阶段的青少年皮肌炎患者的外周血 | 数字病理学 | 青少年皮肌炎 | 单细胞转录组学 | NA | 外周血单核细胞的转录组数据 | NA |
| 12626 | 2024-08-04 |
GJA4 expressed on cancer associated fibroblasts (CAFs)-A 'promoter' of the mesenchymal phenotype
2024-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102009
PMID:38833783
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研究论文 | 研究发现癌相关成纤维细胞上的GJA4能够促进结直肠癌的间充质表型。 | 揭示了GJA4在肿瘤基质中的致恶机制和其与M2巨噬细胞的协同作用。 | 未详细探讨GJA4对肿瘤微环境中其他细胞类型的影响。 | 探讨GJA4在促进结直肠癌中的作用和机制。 | 结直肠癌（CRC）中的癌相关成纤维细胞（CAFs）。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞分析、空间转录组学、免疫荧光染色等 | NA | 组织样本 | 涉及的样本数量未指定 |
| 12627 | 2024-08-05 |
Multiomics Analyses Identify AKR1A1 as a Biomarker for Diabetic Kidney Disease
2024-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0540
PMID:38394643
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研究论文 | 本研究通过多组学分析确定了AKR1A1作为糖尿病肾病的生物标志物 | 研究首次揭示AKR1A1在糖尿病肾病细胞功能障碍中的潜在分子中心作用 | 研究可能受限于单细胞RNA测序和蛋白质组学数据的特定性和样本量 | 揭示糖尿病肾病的病理生理机制并寻找生物标志物 | 糖尿病肾病相关的功能基因及其蛋白产物 | 生物医学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和蛋白质组学 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | 包括糖尿病心脏研究样本的纵向代谢物分析 |
| 12628 | 2024-08-04 |
A Novel Macrophage Subpopulation Conveys Increased Genetic Risk of Coronary Artery Disease
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324172
PMID:38747151
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研究论文 | 该文章探讨了一种新的巨噬细胞亚群如何增加冠状动脉疾病的遗传风险 | 研究揭示了CD52-hi巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的关键作用，以及与冠状动脉疾病相关的特定遗传变异和候选致病基因 | 研究可能在样本规模和病例异质性方面存在局限性 | 探索冠状动脉疾病中巨噬细胞亚群的遗传贡献和致病机制 | 主要以人类单核细胞源的巨噬细胞为研究对象 | 数字病理学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞多组学 | NA | 基因组数据 | 来自38个动脉粥样硬化样本的5000多个巨噬细胞 |
| 12629 | 2024-08-05 |
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8501
PMID:38905342
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研究论文 | 本研究提供了一幅心脏纤维化的单细胞转录组整合图，揭示了多种病理状态下细胞纤维化的原理 | 创新性地整合了不同实验设计和分析流程的单细胞转录组数据，阐明心脏纤维化在心血管疾病中的病理生理学 | NA | 探讨心脏纤维化与各种心血管疾病的关系 | 心脏纤维细胞的单细胞转录组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12630 | 2024-08-04 |
Establishment and validation of a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature for predicting clinical outcomes and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01092-z
PMID:38900330
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研究论文 | 本文建立并验证了一个新的CD8+ T细胞相关预后标志，通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据来预测肝细胞癌的临床结果和免疫治疗反应 | 提出了基于CD8+ T细胞的预后标志，这为肝细胞癌患者临床结果和免疫治疗反应的预测提供了强有力的模型 | 尚未提及研究的具体局限性 | 探讨CD8+ T细胞相关基因在肝细胞癌中的预后意义 | 利用来自不同数据库的HCC的单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | Cox-Lasso回归模型 | RNA数据 | NA |
| 12631 | 2024-08-05 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
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research paper | 本文探讨了MYCT1在调节人类造血干细胞（HSCs）环境感知和内吞作用中的重要性 | 发现MYCT1是人类HSC的重要调控因子，其缺失使HSC在培养中失去干性 | 研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证结果 | 揭示MYCT1在保持人类造血干细胞干性中的作用 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
| 12632 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing of 3' RNA Transcripts
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_16
PMID:38907922
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research paper | 本研究描述了一种通过单细胞封闭和捕获mRNA转录本3'端聚腺苷酸尾巴的单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法 | 结合细胞和分子条形码的技术创新使得能对细胞中表达的基因进行更精确的识别 | NA | 探讨单细胞RNA测序在细胞状态和行为研究中的应用 | 单个细胞内的RNA表达 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | NA |
| 12633 | 2024-08-05 |
Sequencing: 10X Genomics 3' HT Assay for Gene Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_15
PMID:38907921
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研究论文 | 本文章介绍了10X Genomics 3' HT试剂盒用于基因表达的单细胞RNA测序方法 | 此试剂盒引入了新的专有芯片，支持更高数量的细胞条形码和更大样本容量 | 没有提到特定的局限性 | 研究单细胞RNA测序技术以提升基因表达研究的准确性 | 研究对象为单个细胞及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达序列 | 每次实验最多可处理16个样本 |
| 12634 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals dysregulated fibroblast subclusters in prurigo nodularis
2023-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.29.526050
PMID:36778229
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研究论文 | 单细胞RNA测序揭示了瘙痒结节病中失调的成纤维细胞亚群。 | 本研究首次识别了瘙痒结节病中的七个独特的成纤维细胞亚群，并揭示了成纤维细胞与神经元之间的相互作用。 | 研究仍未完全理解瘙痒结节病的发病机制，且样本主要集中在黑人患者。 | 本研究旨在揭示瘙痒结节病的致病机制及相关细胞组分。 | 研究对象为28,695个瘙痒结节病损及非病损皮肤细胞。 | 数字病理学 | 瘙痒结节病 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 28695个瘙痒结节病细胞 |
| 12635 | 2024-08-05 |
The spatial transcriptomic landscape of the healing mouse intestine following damage
2022-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28497-0
PMID:35149721
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学定义了小鼠肠道在稳态和愈合过程中的转录组景观 | 揭示了结肠在稳态条件下的分子区域化特征，及其在粘膜愈合过程中的显著变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全代表人类的相应机制 | 探讨小鼠肠道在愈合过程中转录组的空间组织 | 小鼠结肠的转录组及其在愈合过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本 |
| 12636 | 2024-08-04 |
Zinc ions regulate mitochondrial quality control in neurons under oxidative stress and reduce PANoptosis in spinal cord injury models via the Lgals3-Bax pathway
2024-Aug-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究探讨了锌离子如何通过Lgals3-Bax通路在脊髓损伤模型中调节线粒体质量控制并降低PANoptosis | 研究揭示了锌离子在氧化应激下通过靶向Lgals3-Bax通路保护线粒体的机制，为脊髓损伤的治疗提供了一种新的方法 | 研究对锌离子的作用机制进行了探讨，但可能需要更多的临床数据来进一步验证 | 本研究旨在探讨锌离子在脊髓损伤中的保护作用及其机制 | 研究对象为脊髓损伤模型中的神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 12637 | 2024-08-05 |
Comparison of genetic and epigenetic profiles of periodontitis according to the presence of type 2 diabetes
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.620
PMID:38903536
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研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病与牙周炎之间的遗传和表观遗传特征的比较 | 使用多组学方法揭示了与Fc-伽马受体介导的吞噬作用通路相关的特定遗传和表观遗传变化 | 暂无具体的限制说明 | 深入理解2型糖尿病与牙周炎之间的相互关系 | 2型糖尿病患者的牙周组织样本与健康参与者进行比较 | 数字病理学 | 牙周炎, 2型糖尿病 | 全基因组测序, 甲基化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 甲基化数据, RNA测序数据 | 涉及牙周炎患者（含糖尿病与不含糖尿病）及健康参与者的样本 |
| 12638 | 2024-08-04 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
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研究论文 | 该论文研究了肠道病毒基因型网络的结构和动态 | 使用单细胞测序方法揭示了病毒种群结构的复杂性，并将宿主细胞转录表型与病毒基因型结构联系起来 | NA | 理解病毒种群如何适应选择环境的变化 | 肠道病毒的基因型及其与宿主细胞转录组的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | mRNA | 来自数百个感染细胞的病毒单倍型 |
| 12639 | 2024-08-04 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
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研究论文 | 该文章探讨了跨种杂交引发的学习能力扩展，特别是关于鸟类的歌唱学习 | 研究揭示了杂交鸟类在学习能力上超越亲本的机制，特别是在神经元转录特征方面的独特性 | 缺乏对环境因素及其影响的具体研究 | 探索物种特定的歌唱学习的神经遗传机制 | F杂交鸟类的学习能力及其神经元特征 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | F杂交鸟类的多个个体 |
| 12640 | 2024-08-04 |
Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding
2024-Jun-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.05.001
PMID:38823396
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research paper | 本研究提出了一种新的深度学习方法SPACE，用于通过细胞相互作用意识的细胞嵌入分析单细胞分辨率的空间转录组数据 | SPACE能够识别具有特殊空间分布模式和不同邻近相互作用细胞类型的空间信息细胞亚型，并自动发现具有明显边界的细胞社区 | NA | 揭示个体细胞如何发挥组织特异性功能的空间组织原则 | 单细胞分辨率的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 空间转录组数据 | NA |