单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 12581 - 12600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12581 | 2024-08-05 |
An autophagy program that promotes T cell egress from the lymph node controls responses to immune checkpoint blockade
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114020
PMID:38554280
|
研究论文 | 本文研究了淋巴结中淋巴内皮细胞如何通过自噬程序促进T细胞从淋巴结的离开。 | 首次系统阐明了淋巴内皮细胞如何调控T细胞动态及其在肿瘤免疫检查点治疗中的作用 | 缺乏在不同免疫监视环境下的系统比较分析 | 探讨淋巴内皮细胞自噬在调控T细胞动态和免疫治疗反应中的角色 | 主要研究淋巴结中的淋巴内皮细胞及其对T细胞行为的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和活体成像 | NA | 生物学数据, RNA测序数据 | 肿瘤引流淋巴结的样本 |
| 12582 | 2024-08-05 |
Stem cell-derived vessels-on-chip for cardiovascular disease modeling
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114008
PMID:38536819
|
研究论文 | 本文构建了一个基于人类干细胞衍生内皮细胞的微流控血管芯片平台，以模拟心血管疾病 | 该研究首次实现了干细胞衍生内皮细胞的成熟，包括屏障形成、动脉调节和在重力驱动流动下的高水平一氧化氮合成 | 在流动条件下的研究中涉及的样本体积和细胞数量较低 | 研究旨在更好地理解血管功能障碍并指导临床治疗 | 研究对象为人类多能干细胞衍生的内皮细胞，主要用于模拟动脉粥样硬化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、质谱蛋白组学、高分辨率成像 | 微流控芯片 | 细胞、蛋白质组 | 低样本体积和细胞数量的样本 |
| 12583 | 2024-08-05 |
scGAL: unmask tumor clonal substructure by jointly analyzing independent single-cell copy number and scRNA-seq data
2024-Apr-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10319-w
PMID:38649804
|
研究论文 | 该文章介绍了一种新型混合模型scGAL，用于推断肿瘤克隆拷贝数亚结构 | scGAL结合了自编码器和生成对抗网络，能够联合分析单细胞拷贝数和基因表达数据，克服拷贝数数据中的噪声影响 | 可能仍受到个别数据集特征和技术限制的影响 | 准确解码肿瘤克隆拷贝数亚结构以提供癌症的演化机制见解 | 真实癌症数据集中的单细胞拷贝数和基因表达数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | scDNA-seq | 生成对抗网络 | 拷贝数数据和基因表达数据 | 三个真实癌症数据集 |
| 12584 | 2024-08-05 |
Discrete-state models identify pathway specific B cell states across diseases and infections at single-cell resolution
2024-04-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2024.111769
PMID:38423206
|
研究论文 | 该文章研究了在健康和疾病状况下B细胞的特定状态。 | 开发了基于状态的离散模型，利用单细胞RNA测序数据来识别与氧调控通路相关的B细胞状态。 | 研究仅限于已发布的单细胞RNA测序数据，可能忽略其他重要因素。 | 理解B细胞在感染、疫苗接种和其他疾病中的状态及其调节方式。 | 研究不同疾病和感染中的B细胞状态及其转变。 | 数字病理学 | 乳腺癌, HIV | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 离散状态模型 | 基因表达数据 | NA |
| 12585 | 2024-08-05 |
YTE-17 inhibits colonic carcinogenesis by resetting antitumor immune response via Wnt5a/JNK mediated metabolic signaling
2024-Apr, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.11.008
PMID:38665223
|
研究论文 | 本研究探讨了YTE-17通过Wnt5a/JNK介导的代谢信号通路抑制结肠癌发生的机制 | 本研究首次揭示YTE-17通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞平衡来预防结直肠癌 | 关于YTE-17在预防结直肠癌的机制了解仍有限 | 探索YTE-17在结直肠癌预防中的潜在作用 | 研究对象包括暴露于YTE-17的肠上皮细胞及其在结肠癌模型中的免疫微环境 | 数字病理学 | 结肠癌 | iTRAQ分析、单细胞RNA测序 | 参与性癌症模型 | 组织样本 | 不同阶段的结肠癌模型样本 |
| 12586 | 2024-08-05 |
Sodium glucose co-transporter 2 inhibition increases epidermal growth factor expression and improves outcomes in patients with type 2 diabetes
2023-10, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.07.007
PMID:37543256
|
研究论文 | 本研究探讨了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂在2型糖尿病患者中对表皮生长因子表达的影响及其对肾脏结果的改善 | 本研究首次揭示了SGLT2抑制剂能agliflozin对EGF表达的影响及其在肾脏疾病进展中的潜在机制 | 本文的局限性在于使用的样本量及单细胞RNA测序的具体实验条件可能影响结果的普遍性 | 本研究的目的是探讨SGLT2抑制剂对2型糖尿病患者肾脏保护机制中的EGF表达的影响 | 研究对象包括3521名参与CANVAS研究的2型糖尿病患者及10名年轻的2型糖尿病患者的肾组织样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 生物样本 | 3521名参与者和20个肾组织样本 |
| 12587 | 2024-08-05 |
Improved Protocol for Reproducible Human Cortical Organoids Reveals Early Alterations in Metabolism with MAPT Mutations
2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.11.548571
PMID:37503195
|
研究论文 | 本研究报告了一种96孔方法，用于高效、可扩展和可重复的人类皮层类器官的生产 | 采用可控释放的FGF2和适当浓度的SB431542显著提高了类器官的皮层模式化和重复性 | 不同hPSC供体线和实验重复之间的高变异性仍然存在 | 研究人类皮层类器官的建立及分析与前额叶痴呆相关的突变对代谢的早期影响 | 来源于人类多能干细胞（hPSCs）的皮层类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | NA |
| 12588 | 2024-08-05 |
Lactate from glycolysis regulates inflammatory macrophage polarization in breast cancer
2023-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03382-x
PMID:36729212
|
研究论文 | 乳腺癌中，来自糖酵解的乳酸调节炎症性巨噬细胞的极化 | 本文揭示了糖酵解产生的乳酸如何影响乳腺癌中巨噬细胞的极化模式 | 该研究主要基于细胞水平的数据，临床验证仍需进一步研究 | 探讨乳腺癌中乳酸的来源及其对炎症巨噬细胞极化的影响 | 主要研究乳腺癌细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学数据分析、单细胞转录组分析、临床数据分析、体外实验 | NA | RNA、细胞 | 22种免疫细胞与临床数据分析 |
| 12589 | 2024-08-04 |
YAP1 and WWTR1 expression inversely correlates with neuroendocrine markers in Merkel cell carcinoma
2023-03-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157171
PMID:36719743
|
研究论文 | 本文探讨了Merkel细胞癌（MCC）中YAP1和WWTR1的表达与神经内分泌标志物之间的反向关系 | 研究揭示了MCC中NE基因表达的异质性，并发现YAP1/WWTR1沉默对MCPyV阳性MCC的发展至关重要 | 目前的临床诊断标志物无法区分MCPyV阳性和阴性亚型，且MCC肿瘤的表达谱尚未探索 | 研究MCC的转录环境及其与YAP1和WWTR1的关系 | 针对来自患者的肿瘤活检和细胞系进行的RNA-Seq分析 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤活检样本和细胞系 |
| 12590 | 2024-08-05 |
The interleukin-1 receptor type-1 in disturbed flow-induced endothelial mesenchymal activation
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1190460
PMID:37539090
|
研究论文 | 本研究探讨了干扰流动（d-flow）诱导的内皮间充质转化（EndMT）中白细胞介素-1受体类型1（IL-1R1）的角色 | 发现IL-1R1作为内皮细胞中新型的机械敏感受体，连接d-flow与EndMT信号通路 | 不同血管细胞类型的IL-1R1信号数据不一致，尚需进一步验证 | 揭示IL-1R1在内皮细胞对干扰流动反应中的作用 | 研究动脉粥样硬化中内皮细胞和EndMT相关转录因子SNAI1的相互作用 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | scRNA-seq | Cre-lox系统小鼠 | 基因表达数据 | 人类动脉粥样硬化样本和特定小鼠模型 |
| 12591 | 2024-08-05 |
Comprehensive characterization of tumor immune landscape following oncolytic virotherapy by single-cell RNA sequencing
2022-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-03084-2
PMID:34716463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面描述了肿瘤免疫微环境在肿瘤溶瘤病毒治疗后的变化 | 首次全面分析了溶瘤病毒治疗引起的癌症中免疫变化 | 缺乏对长期治疗效果和不同类型肿瘤的研究 | 探究溶瘤病毒治疗如何改变肿瘤微环境中的免疫细胞组成 | 分析了使用HSV-2基础的溶瘤病毒处理的癌瘤中的免疫细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 处理过和未处理的肿瘤样本 |
| 12592 | 2024-08-05 |
Site-1 protease ablation in the osterix-lineage in mice results in bone marrow neutrophilia and hematopoietic stem cell alterations
2020-06-23, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.052993
PMID:32576566
|
研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠中osterix谱系中Site-1蛋白酶的缺失对骨髓中中性粒细胞及造血干细胞的影响 | 本研究初步揭示了Site-1蛋白酶在维持骨髓造血微环境平衡中的重要作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果能否推广到人类需进一步验证 | 研究Site-1蛋白酶缺失对骨髓细胞组成及造血干细胞功能的影响 | 小鼠，尤其是osterix谱系中Site-1蛋白酶缺失的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质质谱 | NA | NA | 涉及多种骨髓来源的细胞，具体样本量未说明 |
| 12593 | 2024-08-04 |
Gene Expression Patterns in the Ctenophore Pleurobrachia bachei: In Situ Hybridization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_9
PMID:38668969
|
研究论文 | 本研究提出了一种用于观察海洋无脊椎动物Pleurobrachia bachei的基因表达模式的原位杂交方法 | 提供了适用于高度脆弱的动物的原位杂交协议，并展示了细胞表型标记的表达模式 | 对脆弱动物的应用具有挑战性，可能限制了方法的通用性 | 研究Ctenophora类动物的基因表达模式 | 成年Pleurobrachia bachei | 数字病理学 | NA | 原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 成年Pleurobrachia bachei的样本 |
| 12594 | 2024-08-04 |
Analysis and Visualization of Single-Cell Sequencing Data with Scanpy and MetaCell: A Tutorial
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_17
PMID:38668977
|
教程 | 本章节提供了对单细胞RNA测序数据分析流程的概述和实践指南 | 提出了使用Scanpy和MetaCell的实用指南，以及对主要分析步骤和数据可视化的最佳实践的比较 | 尚未充分代表用户在使用scRNA-seq分析中所需的实用指南 | 旨在为单细胞RNA测序的数据分析提供系统性的方法和实用指南 | 以单细胞RNA测序数据为研究对象，分析生物样本的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用了来自栅鳗鱼的scRNA-seq数据集，相应样本大小未具体说明 |
| 12595 | 2024-08-04 |
Unique challenges and best practices for single cell transcriptomic analysis in toxicology
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100475
PMID:38645720
|
综述 | 本综述探讨了在毒理学中应用单细胞转录组分析面临的独特挑战及最佳实践 | 提出了针对毒理学中单细胞转录组分析的关键挑战和实用分析解决方案 | 该论文未提供具体的实验数据或样本分析 | 提高单细胞转录组学在毒理学中的应用 | 单细胞转录组数据在毒理学中的应用 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 转录组数据 | NA |
| 12596 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of CYBB as a prognostic marker and therapeutic target in glioma: A bioinformatics approach
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29549
PMID:38655339
|
研究论文 | 本文综合分析了CYBB作为神经胶质瘤的预后标志物和治疗靶点 | 建立了基于CYBB和线粒体基因的预后模型，揭示其在神经胶质瘤患者预后中的潜在应用 | 未提及具体的样本数量和研究的局限性 | 识别新的标志基因并建立预后模型以改善神经胶质瘤的早期诊断和预后判断 | 研究对象为神经胶质瘤患者及其临床病理特征 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞测序，生物信息学分析 | 10基因预后模型 | 基因表达数据 | 7名神经胶质瘤患者的单细胞测序数据 |
| 12597 | 2024-08-04 |
Identifying MS4A6A+ macrophages as potential contributors to the pathogenesis of nonalcoholic fatty liver disease, periodontitis, and type 2 diabetes mellitus
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29340
PMID:38644829
|
研究论文 | 本研究识别了MS4A6A+巨噬细胞作为非酒精性脂肪肝病、牙周炎和2型糖尿病发病机制的重要贡献者 | 首次确定了MS4A6A+巨噬细胞在多种疾病交互作用中的重要性 | 缺乏临床验证和更大样本量的支持 | 探讨非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病和牙周炎之间的共同机制 | 分析与NAFLD、T2DM和PD相关的数据集及其差异表达基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病、牙周炎 | 单细胞测序、免疫组织化学染色 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 三个疾病相关的数据集中识别了25个共享的差异表达基因 |
| 12598 | 2024-08-05 |
DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis
2024-Apr-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03720-5
PMID:38650025
|
研究论文 | 本文研究了牙髓干细胞（DPSCs）如何调节口腔亚粘膜纤维化（OSF）中的上皮细胞-T细胞相互作用。 | 发现了一种独特的上皮细胞群体Epi1.2，具有促炎和促纤维化功能，揭示了它们与T细胞的相互作用在OSF中的重要机制。 | 本研究在探讨OSF的致病机制时仍存在一些不确定性，需要进一步验证和探索。 | 探索口腔亚粘膜纤维化(OSF)的致病机制，并基于此寻找新的治疗选择。 | 研究对象主要是口腔粘膜组织中的单细胞群体，尤其是Epi1.2上皮细胞及其与免疫细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 口腔亚粘膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 细胞数据 | 通过人类细胞图谱汇编的数据，以及在动物模型和临床病理切片中的验证 |
| 12599 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-Apr-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
|
研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的分隔和缺血微环境中的明显免疫抑制。 | 利用空间转录组学技术，我们首次展示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间定位和分隔。 | 研究样本量较小，仅为三名胶质母细胞瘤患者，可能限制了结果的推广性。 | 旨在深入了解胶质母细胞瘤微环境中的肿瘤细胞状态及其空间分布。 | 研究对象为三名胶质母细胞瘤患者的肿瘤微环境和相关细胞状态。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 10x Chromium单细胞RNA测序（snRNA-seq）和空间转录组学数据 | NA | RNA数据 | 3名胶质母细胞瘤患者 |
| 12600 | 2024-08-05 |
Unravelling immune microenvironment features underlying tumor progression in the single-cell era
2024-Apr-22, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03335-z
PMID:38649887
|
综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序(SC-RNA-seq)在肿瘤免疫微环境(TIME)特征解析中的重要性。 | 强调了SC-RNA-seq在肿瘤发生和进展中揭示TIME细胞和分子变化的新颖性。 | 未具体提及传统测序方法的局限性细节。 | 阐明免疫细胞与肿瘤发生和进展之间的关系。 | 肿瘤免疫微环境中细胞异质性的变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |