单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 12581 - 12600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12581 | 2024-08-04 |
CCR7+ CD4 T Cell Immunosurveillance Disrupted in Chronic SIV-Induced Neuroinflammation in Rhesus Brain
2023-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.28.555037
PMID:37693567
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研究论文 | 这篇文章探讨了CCR7+ CD4 T细胞在恒河猴脑中慢性SIV诱导的神经炎症中的免疫监视功能的破坏 | 首次揭示了CCR7+ CD4 T细胞在中枢神经系统中的特定亚群及其功能特点 | 样本主要来自恒河猴，可能限制了结果对人类的直接适用性 | 研究CCR7+ CD4 T细胞在慢性SIV诱导的神经炎症中的角色 | 恒河猴的CCR7+ CD4 T细胞及其在神经炎症中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析、ATAC-seq、空间转录组学、流式细胞术 | NA | NA | 慢性SIV感染的恒河猴 |
| 12582 | 2024-08-05 |
Lactate-dependent transcriptional regulation controls mammalian eye morphogenesis
2023-07-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39672-2
PMID:37452018
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研究论文 | 这篇文章研究了乳酸在哺乳动物眼形态发生中的转录调控作用 | 揭示了乳酸作为信号分子在哺乳动物眼形态发生中扮演的重要角色 | 未详细探讨其他代谢途径对 retinal morphogenesis 的潜在影响 | 探讨乳酸在视网膜发育早期阶段的重要性和机制 | 研究了小鼠胚胎中的视网膜祖细胞及其代谢活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA | NA |
| 12583 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies response of renal lymphatic endothelial cells to acute kidney injury
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.09.544380
PMID:37333313
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序鉴定了肾脏淋巴内皮细胞对急性肾损伤的反应 | 首次对小鼠肾脏淋巴内皮细胞亚群进行了特征描述，并揭示了它们在急性肾损伤中的基因变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表人类情况 | 研究肾脏淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的响应 | 小鼠肾脏淋巴内皮细胞亚群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠模型的不同急性肾损伤类型的淋巴内皮细胞 |
| 12584 | 2024-08-04 |
Insulin-like growth factor 1 reduces coronary atherosclerosis in pigs with familial hypercholesterolemia
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165713
PMID:36602878
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研究论文 | 这项研究探讨了类胰岛素生长因子1在家族性高胆固醇血症猪中的动脉粥样硬化作用 | 首次在家族性高胆固醇血症猪模型中证实IGF-1能减少冠状动脉粥样硬化并促进稳定斑块特征 | 本研究的结果可能仅限于猪模型，需在临床试验中进一步验证 | 研究IGF-1对冠状动脉粥样硬化的影响及其机制 | 家族性高胆固醇血症（FH）猪 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 使用家族性高胆固醇血症猪进行6个月的实验 |
| 12585 | 2024-08-05 |
Detecting retinal neural and stromal cell classes and ganglion cell subtypes based on transcriptome data with deep transfer learning
2022-09-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac514
PMID:35876552
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研究论文 | 本研究开发并评估了深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据识别不同类型的视网膜细胞和视网膜神经节细胞亚型 | 使用深度域自适应模型，结合多种损失函数，以提高不同数据集间的准确性 | 研究中仅基于小鼠的视网膜细胞，可能无法推广到其他物种 | 旨在提高识别不同视网膜细胞类型及其亚型的准确性 | 采用不同小鼠来源的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | RNA数据 | 44,808个视网膜细胞和6,225个及35,699个视网膜神经节细胞 |
| 12586 | 2024-08-05 |
Slow-Cycling Cells in Glioblastoma: A Specific Population in the Cellular Mosaic of Cancer Stem Cells
2022-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051126
PMID:35267434
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研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤中慢周期细胞的特性和功能异质性 | 首次揭示了慢周期细胞与表型定义的癌症干细胞之间的显著异质性和独特性 | 研究中未深入探讨细胞间的交互作用及其对肿瘤微环境的影响 | 研究胶质母细胞瘤中癌症干细胞群体的异质性 | 重点比较胶质母细胞瘤中的慢周期细胞与通常富集癌症干细胞的细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 流式细胞术、RNA测序、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 研究中解析了22个细胞组成的多个癌症干细胞组 |
| 12587 | 2024-08-05 |
Semiochemical responsive olfactory sensory neurons are sexually dimorphic and plastic
2020-11-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54501
PMID:33231170
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研究论文 | 本研究探讨了基因和经验如何共同作用生成表型变异性，特别是在小鼠的主要嗅觉上皮中 | 识别出了一群性别特异性的嗅觉感知神经元，并发现其在不同性别小鼠中的表现出性别差异，同时揭示了活动依赖基因表达的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种 | 研究基因和经验在表现性状变异中的作用 | 主要嗅觉上皮中的嗅觉感知神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | 性别分离的小鼠和性别结合的小鼠的嗅觉神经元亚群 |
| 12588 | 2024-08-05 |
Identification of Repurposable Drugs and Adverse Drug Reactions for Various Courses of COVID-19 Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-May-16, ArXiv
PMID:33299905
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据筛选出可重新利用的抗COVID-19药物和不良药物反应 | 首次使用系统生物学方法结合FDA批准的药物和小分子化合物的数据来发现防治COVID-19的新药物 | 未详细探讨所有候选药物的临床适应性和潜在不良反应 | 寻找可重新利用的药物以治疗COVID-19 | 美国FDA批准的药物和前临床小分子化合物 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含轻症和重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 |
| 12589 | 2024-08-05 |
Agouti-Related Protein 2 Is a New Player in the Teleost Stress Response System
2019-06-17, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2019.05.021
PMID:31178320
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研究论文 | 本文探讨了Agouti相关蛋白2在鱼类应激反应系统中的新作用 | 本文首次揭示了AgRP2作为神经内分泌因子在斑马鱼应激反应中的调节角色 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能不适用于其他物种 | 研究AgRP2在斑马鱼应激反应系统中的功能 | 斑马鱼中的AgRP1和AgRP2基因及其表达细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本数量未具体说明 |
| 12590 | 2024-08-05 |
Narrow band imaging-based radiogenomics for predicting radiosensitivity in nasopharyngeal carcinoma
2024-Jun, European journal of radiology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1016/j.ejro.2024.100563
PMID:38681663
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研究论文 | 本研究评估了窄带成像内镜在利用放射组学预测鼻咽癌放射敏感性的有效性，并探讨相关的分子机制 | 基于窄带成像的放射组学模型为预测鼻咽癌放射敏感性提供了一种新颖有效的方法 | 论文中未提及研究的局限性 | 研究的目的是评估窄带成像内镜在鼻咽癌放射敏感性预测中的有效性 | 参与研究的对象是57名经过病理诊断的鼻咽癌患者 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | RNA测序 | 随机森林算法 | 图像 | 57名鼻咽癌患者 |
| 12591 | 2024-08-04 |
Identification of eight genes associated with recurrent patellar dislocation
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109697
PMID:38680665
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研究论文 | 本研究首次通过全外显子测序识别与反复髌骨脱臼相关的八个基因 | 识别出CPD基因与反复髌骨脱臼的相关性，提供了全新的视角来理解该疾病 | 研究可能缺乏大样本验证，样本的多样性有待提升 | 识别反复髌骨脱臼的易感基因并探讨其潜在发病机制 | 关注反复髌骨脱臼患者的基因组特征 | NA | NA | 全外显子测序 (WES) | NA | 基因组数据 | NA |
| 12592 | 2024-08-04 |
Stratification and prognostic evaluation of breast cancer subtypes defined by obesity-associated genes
2024-Apr-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00988-0
PMID:38676834
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研究论文 | 研究探讨与肥胖相关基因定义的乳腺癌亚型的分层与预后评估 | 识别了七个中心基因作为乳腺癌的分子诊断生物标志物，并提出了通过神经网络模型进行有效的诊断 | 七个中心基因作为预后分子标志物表现不佳，生存预测AUC值大多数低于0.5 | 研究肥胖作为乳腺癌风险因素对其机制的影响 | 1226名乳腺癌患者，其被分为BRCA亚型1和亚型2 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qRT-PCR，RNA转录组数据分析 | 神经网络模型 | 基因表达数据 | 1226名乳腺癌患者 |
| 12593 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of metabolomics and transcriptomics to uncover biomarkers in sepsis
2024-04-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59400-0
PMID:38678059
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研究论文 | 利用代谢组学结合RNA测序识别脓毒症患者血液中的生物标志物并发现新的诊断和治疗靶点 | 首次联合应用代谢组学和转录组学，鉴定脓毒症特异性生物标志物和靶基因 | 样本量较小，仅包含16个脓毒症患者和11个系统性炎症反应综合症患者 | 识别脓毒症的生物标志物和潜在靶点 | 脓毒症患者和系统性炎症反应综合症患者的血液样本 | 数字病理学 | 脓毒症 | 液相色谱-质谱联用技术（LC-MS/MS）和RNA测序 | NA | 代谢物和基因数据 | 16个脓毒症患者和11个SIRS患者的血液样本 |
| 12594 | 2024-08-04 |
Ptch1 is essential for cochlear marginal cell differentiation and stria vascularis formation
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114083
PMID:38602877
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研究论文 | 本文探讨了Ptch1在耳蜗边缘细胞分化和血管条形成中的重要性 | 发现Ptch1对边缘细胞分化和SV形成至关重要，并揭示了Ptch1-Gli2轴在耳蜗发展中的关键作用 | 未明确提及具体的实验限制或样本限制 | 研究耳蜗非感官上皮细胞的早期特化及其在听力中的作用 | 研究耳蜗边缘细胞及其分化过程 | 数字病理学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | Shh信号突变体 | 基因表达数据 | 涉及的样本数量和类型未明确说明 |
| 12595 | 2024-08-05 |
Regulation of muscle hypertrophy through granulin: Relayed communication among mesenchymal progenitors, macrophages, and satellite cells
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114052
PMID:38573860
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研究论文 | 该文章探讨了通过granulin调节肌肉肥大，并分析了间充质祖细胞、巨噬细胞和卫星细胞之间的通讯 | 该研究揭示了granulin在间充质祖细胞、巨噬细胞和MuSC之间的中介通讯在肌肉肥大中的关键作用 | 该研究的局限性在于对肌肉适应的细胞网络理解不足，相较于肌肉再生的研究较少 | 研究肌肉在过载和再生过程中细胞网络的变化及其在肌肉肥大中的调节作用 | 研究对象是过载肌肉和再生肌肉中的细胞组成及其基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 4天过载肌肉和10天再生肌肉 |
| 12596 | 2024-08-05 |
MAFB in macrophages regulates cold-induced neuronal density in brown adipose tissue
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113978
PMID:38522069
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子MAFB在冷诱导的棕色脂肪组织中调节巨噬细胞功能的作用 | 揭示了MAFB缺乏与棕色脂肪组织热生热能力下降和神经元密度减少之间的关系 | 缺乏针对其他环境因素的综合分析 | 研究MAFB在巨噬细胞中对棕色脂肪组织中的热生热和神经密度的影响 | 使用巨噬细胞特异性MAFB缺陷小鼠来观察冷环境中的生理变化 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用巨噬细胞特异性MAFB缺陷小鼠，样本数未具体说明 |
| 12597 | 2024-08-05 |
Synergistic induction of tertiary lymphoid structures by chemoimmunotherapy in bladder cancer
2024-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02598-7
PMID:38332180
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研究论文 | 本文研究了在膀胱癌中，通过化疗和免疫疗法的联合使用促进三级淋巴结构的形成 | 首次系统评估了化疗和免疫疗法对膀胱癌患者免疫反应和淋巴结构成熟的联合效应 | 未提供对其他类型癌症的验证或比较研究 | 探讨其他治疗方式与免疫疗法联合使用以提高膀胱癌患者免疫反应的可能性 | 膀胱癌患者，特别是接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括接受免疫检查点抑制剂和化疗的膀胱癌患者相关样本 |
| 12598 | 2024-08-04 |
CPPLS-MLP: a method for constructing cell-cell communication networks and identifying related highly variable genes based on single-cell sequencing and spatial transcriptomics data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae198
PMID:38678387
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研究论文 | 提出了一种基于单细胞测序和空间转录组数据的新方法CPPLS-MLP，用于构建细胞间通信网络并识别相关的高度变异基因 | 该方法通过更准确地识别与细胞通信密切相关的高度变异基因，提供了一种新的视角来构建细胞间通信网络 | 目前尚未提及该方法在特定情境下的局限性或潜在问题 | 探索细胞间通信与高度变异基因之间的关系 | 重点研究细胞间通信网络及其相关的高度变异基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 (scRNA-seq), 空间转录组 | CPPLS-MLP | 基因表达数据 | NA |
| 12599 | 2024-08-04 |
scBOL: a universal cell type identification framework for single-cell and spatial transcriptomics data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae188
PMID:38678389
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研究论文 | 提出了一种名为scBOL的通用细胞类型识别框架，用于单细胞和空间转录组数据 | 首次提出了普遍细胞类型识别这一新任务，并设计了从双边原型对齐角度出发的端到端算法 | 该研究的限制未在摘要中具体说明 | 开发一种能够有效标注单细胞转录组数据的通用方法，适应于空间和非空间维度 | 单细胞转录组和空间转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 自动编码器神经网络和图卷积网络 | 原型学习 | 转录组数据 | NA |
| 12600 | 2024-08-05 |
scINRB: single-cell gene expression imputation with network regularization and bulk RNA-seq data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae148
PMID:38600665
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研究论文 | 提出了一种基于网络正则化和批量RNA-seq数据的单细胞基因表达填充方法scINRB | scINRB通过网络正则化非负矩阵分解保持细胞间和基因间的相似性，并结合批量RNA-seq数据的信息 | 尽管scINRB表现出色，但研究的适用性和数据类型可能仍受限于特定的实验条件 | 开发一种准确且稳健的单细胞基因表达数据填充方法 | 主要研究单细胞RNA测序数据中的基因表达缺失（dropout事件） | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 非负矩阵分解 | 数据集 | 在模拟和实验数据集上进行测试 |