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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2025-12-02 |
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01589-9
PMID:37563308
|
研究论文 | 本文通过小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据,识别并验证了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+ T细胞 | 首次将人类exTreg细胞定义为CD16+CD56+细胞毒性CD4+ T细胞,并利用跨物种转录组分析和功能实验验证其细胞毒性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证可能有限,且疾病背景聚焦于动脉粥样硬化 | 识别和表征在动脉粥样硬化中从调节性T细胞转化而来的exTreg细胞的分子特征和功能 | 小鼠和人类的T细胞、exTreg细胞,以及自然杀伤细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 流式细胞术, T细胞受体测序, 细胞杀伤和CD107a脱颗粒实验 | NA | RNA测序数据, 流式细胞数据, 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1242 | 2025-12-02 |
Multimodal single-cell datasets characterize antigen-specific CD8+ T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01608-9
PMID:37735591
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研究论文 | 本文使用多模态单细胞测序技术,对SARS-CoV-2疫苗接种和感染后的抗原特异性CD8+ T细胞进行了纵向分析 | 首次结合转录组、可及染色质景观和免疫表型,定义了疫苗诱导的CD8 T细胞亚群,并发现其与COVID-19患者临床结局相关 | 研究主要基于mRNA疫苗BNT162b2,可能不适用于其他疫苗类型;样本量有限,需进一步扩大验证 | 改善对T细胞反应的表征和量化,以补充基于抗体滴度的群体监测 | 人类循环白细胞,特别是CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 多模态测序技术,包括scRNA-seq | NA | 单细胞多模态数据(转录组、染色质可及性、免疫表型) | 纵向收集的疫苗接种前后人类白细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | NA |
| 1243 | 2025-12-02 |
Antigen-driven colonic inflammation is associated with development of dysplasia in primary sclerosing cholangitis
2023-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02372-x
PMID:37322120
|
研究论文 | 本研究通过分析原发性硬化性胆管炎(PSC)患者的结肠组织,发现了一种独特的适应性炎症转录特征,该特征与PSC患者发生异型增生的更高风险和更短时间相关 | 首次结合流式细胞术、批量与单细胞转录组学以及T和B细胞受体库分析,识别出PSC中与异型增生风险相关的特异性抗原驱动的炎症特征,揭示了PSC与IBD在异型增生机制上的差异 | 样本量相对有限(共221名参与者),且研究主要关注右结肠组织,可能未全面反映整个结肠的炎症状态 | 探究PSC患者结肠炎症与异型增生发展的关联机制,以指导结直肠癌预防 | 65名PSC患者、108名IBD患者和48名健康个体的右结肠组织 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 流式细胞术、批量转录组学、单细胞转录组学、T和B细胞受体库分析 | NA | 转录组数据、细胞表型数据 | 221名参与者(65名PSC患者、108名IBD患者、48名健康个体) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1244 | 2025-12-02 |
The tumor immune microenvironment of nasopharyngeal carcinoma after gemcitabine plus cisplatin treatment
2023-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02369-6
PMID:37280275
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,揭示了吉西他滨联合顺铂(GP)化疗后鼻咽癌肿瘤免疫微环境的变化,并发现了一种以先天样B细胞(ILB)为中心的抗肿瘤免疫反应机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘了GP化疗后鼻咽癌的免疫微环境图谱,并发现了化疗诱导的DNA片段通过STING通路和TLR9信号激活先天样B细胞(ILB)的新型抗肿瘤免疫机制 | 样本量相对有限(15对匹配样本),且为观察性研究,需要进一步的功能性实验验证机制 | 阐明GP化疗在鼻咽癌中发挥临床活性的免疫学机制 | 鼻咽癌患者 | 单细胞组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,T细胞和B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 | 15对匹配的初治与GP化疗后鼻咽癌样本(单细胞测序),一项III期试验中的139名患者(生存分析),以及380名接受GP联合免疫治疗的患者(验证队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1245 | 2025-12-02 |
Multimodal characterization of antigen-specific CD8 + T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.525203
PMID:36747786
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研究论文 | 本文利用多模态测序技术对BNT162b2疫苗接种前后的循环白细胞进行纵向分析,揭示了抗原特异性CD8+ T细胞的亚群特征及其与临床预后的关联 | 首次结合转录组、染色质可及性、免疫表型和T细胞受体测序等多模态数据,系统表征了疫苗诱导的SARS-CoV-2抗原特异性CD8+ T细胞,并发现其频率可预测COVID-19临床结局 | 研究主要基于疫苗接种后的时间点分析,对感染后长期动态的覆盖有限;样本量相对较小,且未涵盖不同人群的异质性 | 深入表征SARS-CoV-2感染或疫苗接种后T细胞免疫应答,特别是抗原特异性CD8+ T细胞的特征 | 人类循环白细胞,特别是CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | COVID-19 | 多模态测序技术,包括scRNA-seq、ATAC-seq、T细胞受体测序和DNA寡核苷酸标记的肽-MHC多聚体技术 | NA | 单细胞多组学数据 | 疫苗接种前后采集的纵向人类白细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1246 | 2025-12-01 |
A synthetic circular RNA targeting miR-340-5p promotes optic nerve regeneration and retinal ganglion cell survival following axotomy
2026-Feb, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115527
PMID:41138896
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向miR-340-5p的合成环状RNA,能够促进视神经切断后的轴突再生和视网膜神经节细胞存活 | 首次通过计算模型筛选出调控多个再生相关基因的miR-340-5p,并设计环状RNA海绵实现多基因转录重编程 | Circ-340-5p对神经元存活的促进作用在六周后未能持续维持 | 探索通过miRNA调控促进中枢神经系统轴突再生的新策略 | 小鼠视网膜神经节细胞和背根神经节神经元 | 神经再生 | 神经损伤 | 单细胞RNA测序,计算建模,环状RNA设计 | 计算模型 | 单细胞RNA测序数据 | 雄性和雌性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1247 | 2025-12-01 |
Low-density lipoprotein receptor interacts with clusterin to regulate A1/A2 astrocyte polarization and ameliorate hemorrhagic brain injury
2026-Feb, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115539
PMID:41175961
|
研究论文 | 本研究探讨低密度脂蛋白受体与clusterin相互作用调控星形胶质细胞A1/A2极化并改善出血性脑损伤的机制 | 首次揭示LDLR通过相互作用蛋白CLU调控星形胶质细胞极化状态,为出血性脑损伤提供新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探索LDLR对星形胶质细胞极化的影响及其分子机制 | C57BL/6J小鼠脑出血模型中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 脑出血 | 单细胞测序, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 小鼠脑出血模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1248 | 2025-12-01 |
De novo truncating variant in the FBRSL1 gene caused neurodevelopmental disorders, epilepsy, congenital heart disease, and facial dysmorphism
2026-Feb, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115549
PMID:41232796
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序和斑马鱼模型验证,发现FBRSL1基因新发截断变异导致神经发育障碍、癫痫、先天性心脏病和面部畸形的综合征 | 首次将FBRSL1确定为多系统发育障碍的致病基因,揭示了其与AUTS2旁系同源基因在神经发育中的关联机制 | 研究样本量有限,仅分析了5名患者,需要更大规模研究验证 | 探究FBRSL1基因在发育障碍中的致病作用 | 携带FBRSL1变异的患者和斑马鱼模型 | 遗传学 | 神经发育障碍 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 斑马鱼基因敲低 | 斑马鱼模型, 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 5名患者和斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 1249 | 2025-12-01 |
EED226 treatment targets key immune genes to suppress LPS response in Chinese tongue sole splenocytes
2026-Jan, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110927
PMID:41076212
|
研究论文 | 本研究探讨EED226通过表观遗传机制调控中国半滑舌鳎脾细胞对LPS免疫反应的机制 | 首次在硬骨鱼中揭示EED蛋白及其抑制剂EED226的免疫调节功能,发现跨物种保守的EED靶点 | 研究仅限于中国半滑舌鳎脾细胞,未在其他组织或物种中验证 | 探究表观遗传机制在硬骨鱼LPS免疫反应中的调控作用 | 中国半滑舌鳎脾细胞 | 表观遗传学 | 细菌感染 | 转录组分析,单细胞RNA测序,定量RT-PCR | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 1250 | 2025-12-01 |
Type I IFN drives neutrophil swarming, impeding lung T cell-macrophage interactions and TB control
2025-Dec-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250466
PMID:40986319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了I型干扰素在结核感染早期通过驱动中性粒细胞聚集而限制CD4+ T细胞-巨噬细胞相互作用的新机制 | 发现相对耐药小鼠早期肺内I型干扰素反应更强,并阐明其通过中性粒细胞群聚阻碍T细胞-巨噬细胞空间互作的独特免疫调控机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;观察时间限于感染初期数周 | 探究结核分枝杆菌感染早期决定感染结局的免疫机制 | C57BL/6和C3HeB/FeJ小鼠的肺部免疫细胞 | 免疫学 | 结核病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两种基因型小鼠在感染初数周内的肺部样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1251 | 2025-12-01 |
Inhibition of Cholesterol Transport from Lysosomes by Itraconazole Repolarizes Tumor-associated Macrophages to Anti-tumor M1 type
2025-Dec, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17866
PMID:41318128
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研究论文 | 本研究探讨伊曲康唑通过抑制溶酶体胆固醇转运将肿瘤相关巨噬细胞从促瘤M2表型重编程为抗瘤M1表型的机制 | 首次揭示伊曲康唑通过抑制溶酶体胆固醇释放实现巨噬细胞表型重编程的新机制 | 研究仅使用THP-1细胞来源的M2巨噬细胞,未在体内模型验证 | 探究伊曲康唑诱导肿瘤相关巨噬细胞表型重编程的分子机制 | THP-1细胞来源的M2巨噬细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,延时成像,Western blot | 细胞模型 | 基因表达数据,图像数据,蛋白质数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1252 | 2025-12-01 |
Potential Role of Tumor-derived MIF in B-Cell Antigen Presentation in Lung Adenocarcinoma: Single-cell and TCGA Analyses
2025-Dec, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17874
PMID:41318120
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研究论文 | 本研究通过单细胞和TCGA分析探讨了肿瘤源性MIF在肺腺癌B细胞抗原呈递中的潜在作用 | 首次在单细胞水平揭示MIF通过调控B细胞获得抗原呈递细胞样功能在肺腺癌中的双重作用 | 样本量较小(仅3个肿瘤样本),需要更大规模验证 | 研究肿瘤源性MIF在肺腺癌免疫调控和预后中的作用 | 肺腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞和恶性细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | Seurat,CellChat,GEPIA2 | 单细胞RNA测序数据,TCGA临床数据 | 3个肺腺癌肿瘤(29,936个细胞)和TCGA-LUAD队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1253 | 2025-12-01 |
Single-cell analysis reveals the diversity of human fetal membrane and adjacent placental cells with preterm premature rupture of membranes
2025-Nov-30, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf143
PMID:41319021
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早产胎膜早破患者胎膜及邻近胎盘细胞的多样性和细胞间相互作用差异 | 发现了一种新型滋养层细胞亚型FABP7+Tb,并识别了MMP11在EVT-1中的上调表达作为PPROM的潜在生物标志物 | 样本来源仅限于脐带周围约两厘米范围内的组织,可能无法完全代表整个胎膜和胎盘的情况 | 探索早产胎膜早破的细胞组成和分子机制 | 足月分娩、早产无胎膜早破和早产胎膜早破患者的胎膜及邻近胎盘组织 | 单细胞组学 | 产科疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 三种临床分组(FTIL、PPWROM、PPROM)的胎膜和胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1254 | 2025-12-01 |
Deep Transfer Learning Links Benign Glands to Prostate Cancer Progression via Transcriptomics
2025-Nov-29, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf119
PMID:41317378
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习分析前列腺癌空间转录组数据,揭示形态学良性腺体与癌症进展的关联 | 首次将DEGAS深度迁移学习框架应用于前列腺癌空间转录组学,发现形态学良性腺体中MSMB表达降低与癌症进展的关联 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;空间转录组技术分辨率限制可能影响细胞类型精确识别 | 探索前列腺癌进展中的场效应现象,识别与癌症进展相关的分子特征 | 前列腺癌患者的空间转录组数据、单细胞转录组数据和免疫组织化学样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 深度迁移学习, 免疫组织化学 | 深度迁移学习, 深度学习图像分析 | 转录组数据, 图像数据, 蛋白质表达数据 | 包含有和无5年远处转移患者的前列腺组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1255 | 2025-12-01 |
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell RNA Sequencing Data by Dual-Role Graph Contrastive Learning
2025-Nov-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518277
PMID:41317402
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研究论文 | 提出一种名为RegGAIN的双角色图对比学习模型,用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 采用自监督对比学习最大化基因嵌入在扰动图视图间的一致性,并利用双编码器同时学习基因的调控者和靶标双重角色表征 | 未明确说明模型对特定生物环境或数据类型的适用性限制 | 从单细胞转录组数据准确重建细胞类型特异性基因调控网络 | 基因调控网络和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1256 | 2025-12-01 |
Identification and validation of SUN modification-related anti-PD-1 immunotherapy-resistance signatures to predict prognosis and immune microenvironment status in glioblastoma
2025-Nov-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15345-9
PMID:41318472
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别了与SUN修饰和抗PD-1免疫治疗耐药相关的六基因标志物,并构建了胶质母细胞瘤预后预测模型 | 首次整合泛素化、SUMO化和neddylation(统称SUN修饰)与抗PD-1耐药性,建立了六基因预后风险模型,并利用单细胞RNA测序和空间转录组分析验证基因表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于细胞系水平,需要进一步临床样本验证 | 探讨SUN修饰在胶质母细胞瘤预后和抗PD-1免疫治疗耐药中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞系和生物信息学数据集 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 差异表达分析、WGCNA、机器学习算法、RT-qPCR、Western blotting、单细胞RNA测序、空间转录组分析 | 预后风险模型、机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 胶质母细胞瘤细胞系和公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 1257 | 2025-12-01 |
Single-cell transcriptome analysis defines novel molecular subtypes and reveals therapeutic implications of T/myeloid mixed-phenotype acute leukemia
2025-Nov-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01585-8
PMID:41318446
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析定义了T/髓系混合表型急性白血病的新型分子亚型并揭示其治疗意义 | 首次构建T/My MPAL的单细胞转录组图谱,识别出三种恶性细胞亚群并发现传统流式细胞术分类的局限性 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证亚型分类的普适性 | 解析T/髓系混合表型急性白血病的分子异质性并开发个性化治疗策略 | T/髓系混合表型急性白血病患者样本,包括AML、T-ALL和正常供体对照 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约275,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1258 | 2025-12-01 |
Epithelial pyroptosis-induced TREM1+ macrophages activate Th17 cells to accelerate oral mucosal inflammation
2025-Nov-29, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02853-7
PMID:41318555
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组等技术揭示了上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞通过激活Th17细胞加速口腔黏膜炎症的机制 | 首次发现上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞在口腔慢性炎症中的关键作用,并建立了ORGUAMIA在线数据库 | NA | 研究口腔慢性炎症的发病机制 | 口腔黏膜组织 | 单细胞生物学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序,空间转录组,多重免疫组化,细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量RNA测序数据 | 大型临床随访队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1259 | 2025-12-01 |
Single-cell transcriptomic datasets of the amphibious plant Water wisteria
2025-Nov-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-06341-6
PMID:41318588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了水蓑衣在陆生和水生环境下的叶片细胞基因表达模式 | 首次在异形叶性研究中使用水蓑衣作为模式植物,并应用单细胞转录组技术解析其环境适应性分子机制 | 未明确说明样本具体数量,且作为新兴模式植物其分子机制研究基础较为薄弱 | 探索异形叶性现象的分子机制和植物环境适应性 | 水蓑衣(Hygrophila difformis)的陆生和水生茎部原生质体 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1260 | 2025-12-01 |
CD74+CCL5+ effector CD8+ T cells drive mucosal inflammation and predict biologics response in inflammatory bowel disease
2025-Nov-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07509-9
PMID:41318676
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现CD74+CCL5+效应CD8+T细胞是驱动炎症性肠病黏膜炎症的关键细胞亚群,并开发了预测生物制剂治疗反应的六基因模型 | 首次系统识别CCL5+效应CD8+T细胞作为IBD关键致病细胞,建立基于六基因的诊断和治疗反应预测模型 | 样本量相对有限,需要更大规模队列验证,外周血变化不如组织明显 | 识别驱动IBD发病的免疫细胞亚群和分子程序,开发治疗反应预测生物标志物 | 炎症性肠病患者和健康对照的结肠组织及外周血样本 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 转录组反卷积, 孟德尔随机化, 肠道微生物组分析, 免疫组织化学, 流式细胞术 | 六基因预测模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 基因组数据, 微生物组数据, 组织图像, 流式细胞数据 | 12名IBD患者和10名健康对照的结肠组织,7名IBD患者和12名健康个体的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组分析 | NA | NA |