单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2025-10-05 |
Revealing the Heterogeneity of the Tumor Ecosystem of Cholangiocarcinoma through Single-Cell Transcriptomics
2023-03-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12060862
PMID:36980203
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综述 | 通过单细胞转录组学揭示胆管癌肿瘤生态系统的异质性 | 利用单细胞RNA测序技术首次系统解析胆管癌肿瘤生态系统中各类细胞的表型和功能多样性 | 当前研究存在样本量有限和技术方法标准化不足等局限性 | 探讨胆管癌肿瘤生态系统的细胞异质性和细胞间相互作用 | 胆管癌肿瘤生态系统中的基质细胞和恶性细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1242 | 2025-10-05 |
Endocrine disruptors and male infertility: multi-omics identification of key genes in non-obstructive azoospermia
2025-Sep-16, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03664-6
PMID:40956397
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研究论文 | 通过多组学方法识别环境内分泌干扰物与男性非梗阻性无精子症相关的关键基因 | 首次整合转录组学、孟德尔随机化和单细胞RNA测序方法，系统识别EDC相关基因在NOA中的因果作用 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；EDC暴露数据主要来自数据库，缺乏直接测量 | 探索环境内分泌干扰物导致男性非梗阻性无精子症的基因机制 | 非梗阻性无精子症患者睾丸组织和相关基因 | 生物信息学 | 男性不育症 | 转录组分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 全表型关联研究 | NA | 基因表达数据, 基因组数据 | GEO数据集中的NOA患者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | NA |
| 1243 | 2025-10-05 |
ESR1 Expression Negatively Correlates with Immune Cell Infiltration and Response to Immune Checkpoint Inhibitors in Estrogen Receptor-Positive/HER2-Negative Breast Cancer
2025-Sep-16, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18260-2
PMID:40956534
|
研究论文 | 本研究探讨ESR1表达与ER+/HER2-乳腺癌免疫细胞浸润及免疫检查点抑制剂反应的关系 | 发现ESR1高表达与免疫抑制性肿瘤微环境相关，且其预测ICI反应的能力优于PDL1 | 研究基于回顾性队列分析，需要前瞻性研究验证 | 评估ESR1作为ER+/HER2-乳腺癌免疫检查点抑制剂反应预测生物标志物的价值 | 雌激素受体阳性/HER2阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个乳腺癌队列（具体样本数未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1244 | 2025-10-05 |
Multi-condition and multi-modal temporal profile inference during mouse embryonic development
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.03.583179
PMID:38496477
|
研究论文 | 提出Sunbear联合建模框架，用于整合多条件和多模态的单细胞时间序列数据 | 开发能够整合多条件和多模态单细胞时间序列数据的联合建模框架，实现单细胞时间谱变化插补、多数据集多模态谱对齐以及缺失模态的外推预测 | 基于破坏性单细胞测量技术，无法捕获特定细胞的完整时间轨迹 | 开发单细胞多条件多模态时间序列数据的整合分析方法 | 小鼠胚胎发育过程中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 联合建模框架 | 单细胞时间序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1245 | 2025-10-05 |
Cellular and transcriptional profiles of peripheral blood mononuclear cells pre-vaccination predict immune response to preventative MUC1 vaccine
2024-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598031
PMID:38948837
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析疫苗接种前外周血单核细胞，预测MUC1预防性疫苗的免疫反应 | 首次在癌前病变人群中研究非病毒癌症疫苗，并通过单细胞分析发现免疫应答者的特定细胞类型和基因特征 | 样本量较小（16名应答者和16名无应答者），需要在更大规模研究中验证 | 评估MUC1肿瘤抗原疫苗的安全性和免疫原性，并寻找预测疫苗反应的生物标志物 | 有晚期结肠腺瘤病史的个体 | 单细胞测序分析 | 结肠腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯网络分析，差异基因表达分析 | 单细胞转录组数据 | 32名参与者（16名免疫应答者和16名无应答者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1246 | 2025-10-05 |
Dysregulation of cell state dynamics during early stages of serous endometrial carcinogenesis
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585274
PMID:38562813
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了浆液性子宫内膜癌发生早期阶段的细胞状态动态失调机制 | 首次在SEC小鼠模型中系统描绘了正常、前异型增生和异型增生子宫内膜的细胞类型和状态变化，并鉴定出44个潜在早期诊断标志物 | 研究基于小鼠模型，在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 探索浆液性子宫内膜癌发生早期的分子和细胞动力学机制 | 小鼠子宫内膜组织（正常、前异型增生和异型增生阶段） | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1247 | 2025-10-05 |
A human stomach cell type transcriptome atlas
2024-02-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01812-5
PMID:38355543
|
研究论文 | 通过整合相关性分析方法构建人类胃部细胞类型转录组图谱 | 首次利用未分级的胃部RNAseq数据预测胃部细胞类型转录组特征，填补了主要单细胞测序图谱中胃部细胞类型基因富集谱的空白 | 基于相关性分析的预测方法而非直接单细胞测序，可能无法完全捕获细胞异质性 | 建立人类胃部细胞类型特异性基因表达图谱 | 人类胃部细胞（壁细胞、主细胞、胃黏液细胞、胃肠内分泌细胞等11种细胞类型） | 单细胞生物学 | 胃癌 | RNA-seq，整合相关性分析 | 相关性分析模型 | RNA测序数据 | 359名个体的未分级胃部RNAseq数据 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1248 | 2025-10-05 |
Cephalopod-omics: Emerging Fields and Technologies in Cephalopod Biology
2023-12-29, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad087
PMID:37370232
|
综述 | 总结了头足类动物生物学中新兴研究领域和技术的现状、挑战与前景 | 整合了头足类分子生物学多个新兴领域的最新进展，包括比较基因组学、基因操纵和单细胞技术等 | NA | 探讨头足类分子生物学和进化研究的关键挑战与未来方向 | 头足类动物 | 比较基因组学，基因编辑，单细胞技术 | NA | 测序技术，成像技术，基因操纵技术，单细胞转录组学，宏基因组学 | NA | 基因组数据，转录组数据，微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，宏基因组学 | NA | NA |
| 1249 | 2025-10-05 |
Marine Invertebrates One Cell at A Time: Insights from Single-Cell Analysis
2023-12-12, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad034
PMID:37188638
|
综述 | 本文综述了海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的现状与进展 | 系统整合了海洋无脊椎动物单细胞分析领域的最新研究成果，并提出了跨实验和跨物种数据比较的重要考量 | 海洋无脊椎动物细胞类型的完整多样性仍未知晓，存在数据整合和比较的技术挑战 | 探讨单细胞分析技术在海洋无脊椎动物研究中的应用与前景 | 海洋无脊椎动物 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1250 | 2025-10-05 |
Acetylcholine From Solitary Chemosensory Cell, Not Neuron, Regulates Basal Cell Fate Driving Eosinophilic Chronic Rhinosinusitis With Nasal Polyps
2025-Sep-15, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70048
PMID:40951952
|
研究论文 | 本研究揭示了在嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉中，孤立的化学感应细胞而非神经元释放的乙酰胆碱通过调节基底细胞命运驱动疾病发展 | 首次发现孤立的化学感应细胞来源的乙酰胆碱（而非副交感神经）通过毒蕈碱型乙酰胆碱受体调控基底细胞增殖分化 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步深入 | 探究SCC来源的乙酰胆碱在决定基底细胞命运中的作用 | 健康个体、eCRSwNP患者和neCRSwNP患者的组织样本，以及体外细胞培养和小鼠模型 | 单细胞测序 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞测序，细胞培养（浸没式培养和气液界面培养），小鼠模型 | NA | 单细胞测序数据，组织样本数据 | 健康个体、eCRSwNP患者和neCRSwNP患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1251 | 2025-10-05 |
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72-ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2025-Sep-15, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70084
PMID:40952044
|
研究论文 | 本研究利用C9ORF72基因突变ALS患者来源的iPSC构建运动神经元与小胶质细胞共培养模型，揭示神经炎症特征改变 | 首次建立C9ORF72-ALS iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型，发现LPS刺激下炎症反应减弱的新型机制 | 研究仅针对C9ORF72基因突变型ALS，未涵盖其他ALS亚型 | 探究小胶质细胞在ALS神经炎症中的具体作用机制 | C9ORF72基因突变ALS患者来源的iPSC分化的运动神经元和小胶质细胞 | 神经退行性疾病研究 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序，iPSC分化技术 | 共培养模型 | 基因表达数据，细胞因子分泌数据 | 多个C9ORF72 HRE和C9ORF72 KO iPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1252 | 2025-10-05 |
Staphylococcus aureus transcriptomics and single-cell sequencing approaches
2025-Sep-15, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00411-25
PMID:40952388
|
综述 | 本文综述了用于研究金黄色葡萄球菌的基因组学和转录组学方法，特别关注转录组学和单细胞测序技术的应用与发展 | 特别强调转录组学和单细胞测序技术在金黄色葡萄球菌研究中的最新应用和未来发展前景 | NA | 回顾用于研究金黄色葡萄球菌的基因组学和转录组学方法，特别关注转录组学和单细胞测序技术 | 金黄色葡萄球菌 | NA | 细菌感染 | 基因组学, 转录组学, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1253 | 2025-10-05 |
A single-cell and spatial RNA-seq database for Alzheimer's disease (ssREAD)
2024-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49133-z
PMID:38844475
|
研究论文 | 介绍了一个专门用于阿尔茨海默病的单细胞和空间RNA-seq数据库ssREAD | 提供了更广泛的AD相关数据集、优化的分析流程和改善的可用性，整合了大量单细胞和空间转录组数据 | NA | 解决阿尔茨海默病研究中单细胞和空间转录组数据缺乏综合性用户友好存储库的问题 | 阿尔茨海默病患者和模型动物的脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | 1,053个样本（277个整合数据集）包含7,332,202个细胞，以及381个空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1254 | 2025-10-05 |
Dimension-agnostic and granularity-based spatially variable gene identification using BSP
2023-11-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43256-5
PMID:37963892
|
研究论文 | 提出了一种名为BSP的空间可变基因识别方法，能够处理二维和三维空间转录组数据 | 开发了非参数模型BSP，通过比较两个空间粒度的基因表达模式来识别空间可变基因，支持三维数据分析 | NA | 开发能够有效识别空间可变基因的计算方法 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | 癌症, 神经科学, 类风湿关节炎, 肾脏疾病 | 空间转录组技术 | 非参数模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1255 | 2025-10-05 |
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011300
PMID:37428794
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研究论文 | 开发了LRT计算框架，整合分析scRNA-seq和scTCR-seq数据以研究T细胞克隆分化异质性 | 首次提出整合scRNA-seq和scTCR-seq数据的计算方法，能够识别具有不同分化偏倚的克隆型簇 | NA | 探索T细胞克隆分化轨迹异质性 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq | NA | NA |
| 1256 | 2025-10-05 |
Melatonin modulates the hypothalamic-pituitary neuroendocrine axis to regulate physiological color change in teleost fish
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.81055
PMID:37324950
|
研究论文 | 本研究揭示褪黑素通过激活多种受体调控下丘脑-垂体神经内分泌轴，介导硬骨鱼生理性体色变化的分子机制 | 首次在海洋硬骨鱼中系统解析褪黑素信号系统的多重细胞内信号通路，并发现MT/MCH和MT/(TAC1+CRH)/MSH两条新型调控通路 | 研究仅聚焦于大黄鱼这一特定物种，其发现是否适用于其他硬骨鱼类仍需验证 | 探究褪黑素信号系统在硬骨鱼生理性体色变化中的调控机制 | 大黄鱼（海洋硬骨鱼）及其褪黑素受体信号通路 | 神经内分泌学 | NA | 单细胞RNA测序，药理学实验，配体-受体相互作用分析 | NA | 基因表达数据，空间表达模式数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1257 | 2025-10-05 |
Structural and temporal dynamics analysis of PD-1/PD-L1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma: History, research hotspots, and emerging trends
2025-Dec, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2025.2540143
PMID:40820303
|
研究论文 | 通过文献计量学方法分析肝细胞癌PD-1/PD-L1免疫治疗领域的历史演变、研究热点和新兴趋势 | 首次系统性地对肝细胞癌PD-1/PD-L1免疫治疗领域进行结构性和时间动态分析，识别出五个新兴子领域 | 仅基于Web of Science数据库文献，可能存在发表偏倚 | 探索肝细胞癌PD-1/PD-L1免疫治疗的历史发展、研究热点和新兴趋势 | 肝细胞癌PD-1/PD-L1免疫治疗相关研究文献 | 文献计量学 | 肝细胞癌 | 文献计量分析，聚类分析 | CiteSpace，HistCite | 文献数据 | 2804篇论文，涉及13796位作者和2659个机构 | NA | NA | NA | NA |
| 1258 | 2025-10-05 |
Biomaterial-mediated Cell Atlas: an insight from single-cell and spatial transcriptomics
2025-Dec, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.07.047
PMID:40821937
|
综述 | 介绍'生物材料介导的细胞图谱'概念并总结单细胞和空间转录组学在生物材料研究中的最新进展 | 提出'生物材料介导的细胞图谱'新概念，将人类细胞图谱框架扩展到生物材料介导的细胞响应研究 | 当前方法学存在固有挑战，生物体内细胞-材料相互作用的复杂机制尚未完全解析 | 探索生物材料与细胞相互作用的分子机制并指导材料设计 | 生物材料介导的细胞响应和细胞-材料相互作用 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1259 | 2025-10-05 |
CRCs-CAFs crosstalk-targeted nano-delivery system reprograms tumor microenvironment for oxaliplatin resistance reversing and liver metastasis inhibition in colorectal cancer
2025-Dec, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.08.002
PMID:40837498
|
研究论文 | 开发了一种靶向CRCs-CAFs串扰的纳米递送系统，通过重编程肿瘤微环境逆转奥沙利铂耐药并抑制结直肠癌肝转移 | 创新构建了透明质酸修饰的MIL-100纳米颗粒共载OXA和EGCG，首次通过靶向CRCs-CAFs串扰实现代谢和微环境双重重编程 | NA | 开发突破结直肠癌肝转移治疗瓶颈的新策略，同时实现原发灶药物增敏和肝转移抑制 | 结直肠癌细胞(CRCs)、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、肝星状细胞(HSCs) | 纳米医学 | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞测序、纳米技术 | NA | 测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1260 | 2025-10-05 |
Tanshinone IIA suppresses fibro-adipogenic progenitor differentiation and attenuates fat infiltration in rotator cuff injury via Wnt/β-catenin pathway
2025-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.08.004
PMID:40837862
|
研究论文 | 本研究探讨丹参酮IIA通过Wnt/β-catenin通路抑制纤维脂肪祖细胞分化并减轻肩袖损伤中脂肪浸润的作用 | 首次揭示丹参酮IIA通过激活Wnt/β-catenin通路特异性抑制纤维脂肪祖细胞的脂肪生成分化 | 研究主要基于细胞和动物模型，尚未进行人体临床试验验证 | 探究丹参酮IIA对肩袖损伤后脂肪浸润的治疗作用及机制 | 人类纤维脂肪祖细胞和肩袖撕裂动物模型 | 分子生物学 | 肩袖损伤 | 流式细胞分选, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 油红O染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 人类FAPs细胞和肩袖撕裂动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |