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当前共找到 41493 篇文献,本页显示第 1241 - 1260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1241 2026-06-29
LDRT combined with anti-PD-1 promotes tumor regression in head and neck squamous cell carcinoma through tumor metaprogram evolution and immune cell reprogramming
2026-Feb-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本文研究低剂量放疗联合抗PD-1治疗在头颈部鳞状细胞癌中通过肿瘤元程序演化和免疫细胞重编程促进肿瘤消退 首次通过单细胞RNA测序和TCR测序揭示低剂量放疗联合抗PD-1治疗如何协同重塑肿瘤微环境,特别是发现Isg15high巨噬细胞状态与CD4⁺ Treg-Ctla4的频率正相关,并识别出CXCL14-CXCR4趋化因子轴在联合治疗中受到抑制 研究基于小鼠模型,需在人类患者中进一步验证;单细胞分析样本量有限,可能未涵盖所有细胞异质性 探索低剂量放疗增强抗PD-1免疫疗法在头颈部鳞状细胞癌中疗效的机制 小鼠头颈部鳞状细胞癌模型 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,空间转录组学,多重免疫荧光 NA 单细胞基因表达数据,TCR序列数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 小鼠HNSCC肿瘤样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium用于单细胞RNA和TCR测序,10x Visium用于空间转录组学
1242 2026-06-29
Mitochondrial DNA methylation predicts immunotherapy response and prognosis in lung adenocarcinoma: evidence from scRNA-Seq and machine learning
2026-Feb-10, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和机器学习方法,研究了线粒体DNA甲基化在肺腺癌免疫治疗反应和预后预测中的作用 首次将线粒体DNA甲基化与机器学习结合,构建了一个六基因预后模型,并通过单细胞RNA测序揭示了这些基因在肿瘤上皮细胞中的特异性表达模式 研究结果基于公开数据集和体外实验验证,尚需大规模临床队列和体内实验进一步验证 探索线粒体DNA甲基化在肺腺癌发病机制中的作用,并建立预测免疫治疗反应和预后的生物标志物 肺腺癌患者的肿瘤组织样本、单细胞RNA测序数据及细胞系 机器学习, 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序, qRT-PCR 机器学习风险模型 基因表达数据, 单细胞转录组数据 来自公共数据库的肺腺癌患者样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1243 2026-06-29
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to identify hub pathways and diagnostic biomarkers in active pulmonary tuberculosis
2026-Feb-10, BMC infectious diseases IF:3.4Q2
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序,识别活动性肺结核的关键通路和诊断生物标志物 首次整合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据,系统揭示活动性肺结核单核细胞重编程和Wnt通路失调,并鉴定出四个高效诊断生物标志物 样本量较小,仅包含8例单细胞样本和274例批量测序样本;临床实用性需进一步验证 识别区分活动性肺结核和潜伏感染的诊断生物标志物,阐明结核病进展的免疫机制 活动性肺结核、潜伏感染和健康对照的外周血单个核细胞 数字病理学 肺结核 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA 基因表达数据 单细胞RNA-seq: 8例 (3 ATB, 3 LTBI, 2 HC);批量RNA-seq发现队列: 84例,验证队列: 82例,测试队列: 108例 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
1244 2026-06-29
Machine learning, whole-transcriptome and integrative omics analysis reveals key regulatory networks governing human spermatogonial stem cells
2026-Feb-10, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 通过机器学习和整合组学分析揭示调控人类精原干细胞的关键调控网络 首次综合应用机器学习和多组学整合方法(转录组、蛋白质组和相互作用组)系统鉴定精原干细胞身份和功能的调控网络及枢纽基因 研究主要依赖于公共数据库数据和有限的培养条件验证,缺乏体内功能验证和临床样本的大规模验证 解析精原干细胞身份的调控网络和枢纽基因,探索其在生殖医学中的潜在应用 人类精原干细胞与睾丸细胞 机器学习 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质相互作用网络分析, 配体-受体相互作用分析 随机森林, 支持向量机, 加权基因共表达网络分析 RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 蛋白质组数据库, 相互作用组数据库 多组培养条件和生物学重复样本 Illumina 转录组测序, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 标准生物信息学流程(STAR, DESeq2)处理原始测序数据
1245 2026-06-29
The BCAA metabolism-related gene BCAT1 promotes the progression of bladder urothelial carcinoma through the PI3K/AKT/mTOR signalling pathway
2026-Feb-09, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨了BCAA代谢相关基因BCAT1通过PI3K/AKT/mTOR信号通路促进膀胱尿路上皮癌进展的机制 首次系统揭示BCAT1在膀胱尿路上皮癌中通过激活PI3K/AKT/mTOR通路促进肿瘤进展和上皮-间质转化,并发现叶酸可作为潜在抑制剂 研究主要基于TCGA数据库和体外实验,缺乏体内模型验证,且叶酸结合效果需进一步实验确认 阐明BCAA代谢在膀胱尿路上皮癌中的分子机制,寻找新的治疗靶点 膀胱尿路上皮癌及相关基因BCAT1 机器学习 膀胱尿路上皮癌 RNA-seq,单细胞RNA-seq Cox回归,LASSO回归,加权基因共表达网络分析 基因表达数据,单细胞转录组数据 TCGA-BLCA数据集样本 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
1246 2026-06-29
Integrative single-cell and machine learning framework reveals prognostic fibroblast subtypes and constructs a fibroblast-related risk signature in lung adenocarcinoma
2026-Feb-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和机器学习框架,揭示肺腺癌中成纤维细胞的异质性并构建预后相关风险特征 首次结合单细胞转录组分析与十种机器学习算法的101种组合,开发成纤维细胞相关风险特征用于肺腺癌预后评估,并验证核心基因TIMP1的促癌功能 本文未明确讨论局限性 阐明肺腺癌中成纤维细胞的表型多样性及其临床意义,并构建成纤维细胞相关预后签名 肺腺癌肿瘤微环境中的癌相关成纤维细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 CNN 基因表达数据 两个单细胞RNA测序数据集(GSE171145和GSE189357)及多个GEO数据集和TCGA-LUAD队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1247 2026-06-29
Single-cell transcriptomics identifies fibroblast associated immune heterogeneity and prognostic signatures in bladder cancer
2026-Feb-03, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用单细胞转录组学分析膀胱癌中成纤维细胞相关的免疫异质性和预后标志物 首次通过单细胞RNA-seq数据构建膀胱癌成纤维细胞相关基因表达图谱,并鉴定出MAF、TWIST1和TCF21等关键成纤维细胞特异性转录因子 基于三个副癌单细胞样本的分析,样本量有限,需要更多数据验证 建立预测性预后指标并研究免疫微环境以改善膀胱癌临床治疗策略 膀胱癌患者样本中的成纤维细胞及其相关免疫异质性 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 三个副癌单细胞样本,包含3603个成纤维细胞和500个成纤维细胞相关标记基因 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1248 2026-06-29
Integrative analysis of transcriptome and single-cell sequencing combined with experimental validation identifies biomarkers associated with T cell and senescence in sepsis
2026-Feb-03, Scientific reports IF:3.8Q1
research paper 通过整合转录组和单细胞测序分析并结合实验验证,鉴定了败血症中与T细胞和衰老相关的生物标志物 首次利用单细胞测序数据鉴定T细胞相关基因,并通过机器学习、人工神经网络等综合方法筛选败血症中与T细胞和衰老相关的生物标志物,并进行了药物预测 MTHFD2在临床样本验证中无显著差异,可能影响其作为生物标志物的可靠性 鉴定败血症中与T细胞和衰老相关的生物标志物,以阐明机制、辅助诊断和靶向治疗 败血症患者及临床样本 machine learning 败血症 单细胞测序、RNA-seq 人工神经网络 转录组数据、单细胞测序数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
1249 2026-06-29
Tumor microenvironment dynamics in gastric cancer pathogenesis and therapeutic resistance
2026-Feb-02, Molecular cancer IF:27.7Q1
综述 综述胃癌肿瘤微环境的细胞和分子组成、在发病机制和治疗抵抗中的作用,以及针对肿瘤微环境的潜在治疗策略 系统总结了胃癌肿瘤微环境的细胞和空间异质性,以及单细胞测序和空间转录组学技术在理解该异质性中的最新应用 未提供具体的数据或实验验证,仅为文献综述 总结胃癌肿瘤微环境的组成及其在发病机制和治疗抵抗中的作用,并探讨靶向肿瘤微环境的治疗策略 胃癌及其肿瘤微环境 数字病理学 胃癌 NA NA NA NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1250 2026-06-29
Single-cell sequencing analysis and machine learning model reveal aberrant TIM-3 expression in microglia during Alzheimer's disease progression
2026-Jan-24, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞测序和机器学习模型揭示了阿尔茨海默病进展中小胶质细胞TIM-3的异常表达 首次发现TIM-3阳性小胶质细胞亚群通过双重机制驱动阿尔茨海默病致病过程,并利用机器学习将患者分为两种分子亚型 研究主要基于公开数据集,缺乏患者样本的体内验证;药物预测尚需实验验证 探究免疫检查点分子TIM-3在小胶质细胞中的具体功能及其在阿尔茨海默病中的作用机制 阿尔茨海默病患者的小胶质细胞 machine learning 阿尔茨海默病 RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 机器学习分类模型 转录组数据 纳入了多个bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集,具体样本数未在摘要中明确 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1251 2026-06-29
A pro-inflammatory neutrophil subpopulation drives intestinal ischemia-reperfusion injury via the ATF4-mediated endoplasmic reticulum stress pathway
2026-Jan-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和功能实验,发现一个促炎中性粒细胞亚群通过ATF4介导的内质网应激通路加剧小鼠肠道缺血再灌注损伤 首次通过单细胞RNA测序鉴定出肠道缺血再灌注损伤中一种特殊的促炎中性粒细胞亚群(C5),并揭示其通过内质网应激/ATF4通路驱动损伤的新机制 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且未完全阐明中性粒细胞亚群招募和激活的上游调控机制 探究中性粒细胞在肠道缺血再灌注损伤中的具体作用及分子机制 小鼠肠道缺血再灌注损伤模型中的中性粒细胞及其亚群 NA 肠道缺血再灌注损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠肠道组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1252 2026-06-29
Single-cell transcriptome analysis reveals mechanisms by which hippocampal deep brain stimulation promotes neurorepair and microglial subpopulation remodeling in ischemic stroke
2026-Jan-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示海马深部脑刺激促进缺血性卒中神经修复与小胶质细胞亚群重塑的机制 首次利用单细胞转录组测序技术系统揭示海马深部脑刺激对缺血性卒中后神经元、胶质细胞及小胶质细胞亚群的具体调控机制,特别发现小胶质细胞亚群5的免疫炎症与血管生成相关标记物变化 研究仅基于小鼠模型,且未明确海马深部脑刺激的最佳参数,临床转化仍需进一步验证 探究海马深部脑刺激对缺血性卒中脑损伤修复的作用及其潜在机制 缺血性卒中模型小鼠 数字病理学 缺血性卒中 单细胞转录组测序, RNA-seq, 多通道电极阵列记录 NA 单细胞转录组数据, RNA测序数据, 电生理记录数据 缺血性卒中小鼠(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
1253 2026-06-29
‌PPIA regulates fatty acid and glutamine metabolism in lung adenocarcinoma based on multiomics prognostic model and experiment validation
2026-Jan-05, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究PPIA通过c-Myc介导的脂肪酸-谷氨酰胺代谢轴促进肺腺癌恶性进展,并构建基于脂肪酸代谢的预后模型 首次利用多组学数据结合scRNA-seq构建脂肪酸代谢相关预后模型,并揭示PPIA通过c-Myc调控脂肪酸和谷氨酰胺代谢重编程的新机制 部分数据集临床信息不完整,未能进行全面的亚组分析 探究PPIA在肺腺癌代谢重编程及免疫微环境中的作用,并建立脂肪酸代谢相关预后模型 肺腺癌细胞系A549和H1975,TCGA和GEO多组学数据 数字病理学 肺腺癌 多组学分析、单细胞RNA测序、WGCNA、qRT-PCR、Western blotting、代谢检测 预后风险模型(多基因) 基因表达数据、代谢数据 TCGA和GEO多个数据集,具体样本数文中未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1254 2026-06-29
Integrated single-cell and machine learning analysis identifies PMAIP1 as a novel biomarker for predicting prognosis and immunotherapy response in colorectal cancer
2025-Dec-23, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序与机器学习分析,鉴定PMAIP1作为结直肠癌预后和免疫治疗反应的新型生物标志物 首次揭示凋亡相关基因PMAIP1作为连接细胞凋亡与免疫微环境重塑的关键调控节点,并发现其具有招募免疫细胞与上调免疫检查点分子的双重矛盾功能 未提及具体局限性 利用多维计算生物学方法识别结直肠癌中调控凋亡与免疫互作的核心基因,并探索其作为预后标志物和潜在治疗靶点的临床价值 结直肠癌原发性肿瘤和肝转移组织 机器学习, 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 实时定量PCR(RT-qPCR) LASSO, 随机森林, XGBoost 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 来自TCGA数据库的批量转录组数据和临床样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1255 2026-06-29
Overexpression of Meis factors in late-stage retinal progenitors yields complex effects on temporal patterning and neurogenesis
2025-Dec-03, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究Meis1和Meis2在晚期视网膜祖细胞中的过表达对时间模式形成和神经发生的复杂影响 首次系统探讨Meis1和Meis2在出生后小鼠视网膜祖细胞中过表达对时间身份和早期细胞类型诱导的作用,并揭示二者调控时间身份和神经发生能力的非重叠方面 Meis过表达不足以完全重编程晚期视网膜祖细胞;未涉及体内功能性评估或长期追踪 探究Meis1和Meis2过表达是否改变晚期视网膜祖细胞的时间身份并诱导早期细胞类型 出生后小鼠视网膜祖细胞 自然语言处理 NA 电穿孔, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1256 2026-06-29
Multi-omics analysis reveals the role of tumor-infiltrating CD4+CCR7+ T cells in EGFR antibody resistance and prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Nov-29, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 通过多组学分析揭示CD4+CCR7+肿瘤浸润T细胞在肝细胞癌EGFR抗体耐药与预后中的作用 首次在肝细胞癌中通过PDX模型联合单细胞RNA测序和全外显子测序,发现CD4+CCR7+ T细胞富集与EGFR抗体耐药及免疫抑制微环境相关,并构建了基于九基因特征的预后风险模型 PDX模型样本量有限(14例),且耐药机制验证主要基于关联分析,缺乏直接的因果实验证据 探究肝细胞癌中肿瘤浸润T细胞特征与EGFR抗体(尼妥珠单抗)治疗反应及预后的关联 14例肝细胞癌患者的患者源性异种移植(PDX)模型及其肿瘤组织和肿瘤浸润淋巴细胞 数字病理 肝细胞癌 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、流式细胞术、LASSO回归分析 LASSO回归模型 基因表达数据、测序数据、免疫荧光图像 14例PDX模型,外加2个外部验证数据集(ICGC-JP和GSE141202) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1257 2026-06-29
The co-location of MARCO + macrophages and SPOCK1 + fibroblasts contributes to the poor prognosis and undesirable immunotherapy response in colorectal cancer
2025-Nov-28, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合bulk、单细胞和空间转录组学数据,揭示了MARCO+巨噬细胞与SPOCK1+成纤维细胞在结直肠癌中的共定位与不良预后及免疫治疗反应的关系 首次发现MARCO+巨噬细胞和SPOCK1+成纤维细胞的共定位现象,并阐明其通过SPP1/EGF和C3-C3AR1信号通路相互促进的机制 NA 探究结直肠癌中巨噬细胞表型异质性、空间分布和细胞互作对预后的影响 结直肠癌组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 数字病理学 结直肠癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像 NA 10x Genomics, NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学
1258 2026-06-29
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学揭示基底细胞癌中TNC阳性癌症相关成纤维细胞介导免疫抑制并促进肿瘤进展 首次鉴定出C01_TNC成纤维细胞簇作为癌症相关成纤维细胞亚群,揭示其通过上调胶原蛋白与整合素相互作用促进肿瘤侵袭,并通过与调节性T细胞的空间关联增强免疫抑制 样本量较小,仅6名患者的9个手术标本;需要进一步在更大队列中验证发现 研究基底细胞癌中成纤维细胞亚群及其与肿瘤微环境其他组分的相互作用 基底细胞癌肿瘤组织和相邻正常组织 数字病理学 基底细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组织化学 NA 基因表达数据, 图像 6名患者的9个手术标本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
1259 2026-06-29
Uncovering the role of RNA binding proteins in colorectal cancer through single-cell transcriptomic analysis
2025-Nov-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示RNA结合蛋白在结直肠癌中的作用 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据,系统鉴定结直肠癌中与预后相关的RNA结合蛋白,并揭示其在特定细胞亚型中的表达模式和临床意义 样本量较小(仅4例患者和15对配对样本),缺乏大型独立队列的验证,机制研究不够深入 探索RNA结合蛋白在结直肠癌进展中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 结直肠癌相关的RNA结合蛋白及其在正常、腺瘤和癌组织中的细胞类型特异性表达模式 自然语言处理 结直肠癌 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 批量转录组分析 NA 转录组数据 4例患者(正常、腺瘤和结直肠癌组织),15对肿瘤与癌旁组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1260 2026-06-29
Polymer-based chemo-immunotherapy: Combining immunogenic cell death induction and PD-L1 blockade enhances antitumor immunity in melanoma
2025-11-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 提出了一种基于聚合物的化学免疫疗法,结合免疫原性细胞死亡诱导和PD-L1阻断,增强黑色素瘤的抗肿瘤免疫 首次将可降解HPMA共聚物-表柔比星偶联物(KT-1)与多价HPMA共聚物-PD-L1肽拮抗剂(MPPA)联合用于化学免疫治疗,并证明联合治疗优于单药或序贯给药 MPPA在没有诱导NOD小鼠自身免疫性糖尿病方面显示出安全性,但长期毒性和临床转化潜力需进一步验证 开发一种更安全有效的聚合物基化学免疫疗法,替代传统免疫检查点抑制剂治疗免疫排斥性肿瘤 B16F10黑色素瘤小鼠模型 机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 B16F10黑色素瘤小鼠模型,但未明确具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
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