单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 12521 - 12540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12521 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106164
PMID:36915697
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序研究饮食诱导肥胖下海马微胶质细胞的失调 | 利用小鼠高脂饮食模型揭示饮食诱导肥胖对海马微胶质细胞活化的深刻影响 | 关于肥胖期间微胶质细胞活化的确切机制尚未完全理解 | 探讨肥胖对海马微胶质细胞的影响及其与认知障碍之间的关系 | 肥胖小鼠模型中的海马微胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 研究了饮食诱导肥胖下的海马微胶质细胞，在高脂饮食下观察了不同时间点的变化 |
| 12522 | 2024-08-05 |
Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy
2023-03-10, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00315-1
PMID:36895061
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研究论文 | 本研究调查了静息及失用萎缩后骨骼肌中的细胞外囊泡分布和定位 | 本文首次揭示了α-鞘糖蛋白和miR-1在血清细胞外囊泡中不可检测，并且细胞外囊泡生物发生因子在多种骨骼肌细胞类型中表达 | 在大鼠的尾部悬置实验中，未发现血清细胞外囊泡浓度的变化 | 调查骨骼肌中细胞外囊泡的生物发生因子、标记物表达及其在细胞类型中的定位 | 研究对象为大鼠和人类模型中的骨骼肌细胞外囊泡 | 数字病理 | NA | qPCR、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光相关光谱测量、免疫组化 | NA | 血清样本 | 在大鼠和人类模型中均涉及样本 |
| 12523 | 2024-08-04 |
Conserved Transcriptome Features Define Prepubertal Primate Spermatogonial Stem Cells as Adark Spermatogonia and Identify Unique Regulators
2023-Mar-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054755
PMID:36902187
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞，探讨了人类前青春期生精干细胞的分子特征及调控因子 | 确定了前青春期人类生精干细胞的分子特征，并发现了新的调控通路，这可能有助于其体外选择和传播 | 尚未确定专门的生物标志物来明确识别前青春期生精干细胞 | 明确前青春期生精干细胞的分子身份 | 猕猴、狒狒与人类的生精干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞 |
| 12524 | 2024-08-05 |
Cholesterol homeostasis regulated by ABCA1 is critical for retinal ganglion cell survival
2023-02, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2126-2
PMID:35829808
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研究论文 | 本文探讨了ABCA1在视网膜神经节细胞存活中的重要性以及其与原发性开角型青光眼的关联 | 研究表明ABCA1表达降低和HDL水平下降是POAG的风险因素，并提出使用他汀类药物作为预防治疗 | 研究主要集中在小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探明ABCA1与视网膜神经节细胞存活之间的关系及其在原发性开角型青光眼中的作用 | 主要研究对象为小鼠模型以及POAG患者的白细胞样本 | 数字病理 | 原发性开角型青光眼 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞样本和基因表达数据 | 小鼠模型和POAG患者的血液样本 |
| 12525 | 2024-08-04 |
A Cdh3-β-catenin-laminin signaling axis in a subset of breast tumor leader cells control leader cell polarization and directional collective migration
2023-01-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.005
PMID:36626870
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研究论文 | 本文探讨了一组乳腺肿瘤领袖细胞如何通过Cdh3-β-catenin-laminin信号轴控制细胞极化和方向性集体迁移 | 提出了领袖细胞需要生成高推力并克服细胞外基质阻力以引导集体迁移的新机制 | 研究主要基于体外模型，尚未在体内模型中验证 | 了解肿瘤细胞如何通过集体迁移进行扩散 | 乳腺肿瘤细胞及其微环境的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 3D计算模型 | 视频，细胞序列数据 | 包括多个小鼠和人类乳腺肿瘤类器官的样本 |
| 12526 | 2024-08-07 |
Author Correction: Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-Oct-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01440-x
PMID:36266696
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12527 | 2024-08-05 |
Plasma IL-6 levels following corticosteroid therapy as an indicator of ICU length of stay in critically ill COVID-19 patients
2021-Mar-15, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00429-9
PMID:33723251
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研究论文 | 该研究探讨了在重症COVID-19患者中，皮质类固醇治疗后IL-6水平与ICU住院时长之间的关系 | 首次提出了皮质类固醇后IL-6水平可能与COVID-19严重程度相关的假设 | 样本量较小，仅涉及16名患者 | 探究皮质类固醇治疗后IL-6水平在重症COVID-19患者中的作用 | 重症COVID-19患者，特别是接受类固醇治疗的患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本（平行组织扫描的细胞数据） | 16名重症患者接受治疗，41名未接受治疗的患者 |
| 12528 | 2024-08-05 |
Transcriptional heterogeneity and tightly regulated changes in gene expression during Plasmodium berghei sporozoite development
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023438118
PMID:33653959
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研究论文 | 这篇文章研究了疟原虫孢子虫发育过程中的转录异质性和基因表达变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示孢子虫发育中的基因表达调控及其异质性 | 尚未深入研究环境因素对孢子虫发育的具体影响 | 探讨疟原虫孢子虫在蚊子中的发育机制 | 研究了从中肠包囊到唾液腺发育过程中的16038个孢子虫的基因表达谱 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 16038个孢子虫样本 |
| 12529 | 2024-08-05 |
Investigation of Drosophila fruitless neurons that express Dpr/DIP cell adhesion molecules
2021-02-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63101
PMID:33616528
|
研究论文 | 研究表达Dpr/DIP细胞粘附分子的果蝇fruitless神经元的功能和特征 | 通过对基因组研究的重新分析，发现对性别特异性行为的神经元形态和细胞数量存在性别二态性 | 未详细介绍实验样本和研究方法的局限性 | 探讨fruitless神经元在果蝇交配行为中的作用 | Drosophila的fruitless神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12530 | 2024-08-05 |
Integration of single-nucleus and exosome RNA sequencing dissected inter-cellular communication and biomarkers in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.021
PMID:38689717
|
研究论文 | 本研究通过snRNA-seq和外泌体小RNA测序构建了胰腺癌的细胞间通讯网络 | 结合miRNA追踪与配体-受体分析，提供了一种新方法来揭示胰腺癌微环境中的细胞间复杂互动 | 虽然使用了多种技术，但可能未能捕捉到所有类型的细胞间通讯 | 研究胰腺导管腺癌中的细胞间通讯及潜在生物标志物 | 胰腺导管腺癌（PDAC）组织及其外泌体 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（snRNA-seq）、小RNA测序 | NA | RNA序列 | 胰腺导管腺癌组织样本 |
| 12531 | 2024-08-05 |
Galectin-3 inhibition ameliorates alveolar epithelial cell pyroptosis in phosgene-induced acute lung injury
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111965
PMID:38583242
|
研究论文 | 本研究探讨了Galectin-3抑制对磷酸酯引发的急性肺损伤中的肺泡上皮细胞焦亡的改善作用 | 首次提出Galectin-3通过抑制Gal3/caspase-8/GSDMD信号通路来改善肺泡上皮细胞焦亡的机制 | 该研究主要在小鼠模型中进行，临床应用的转化需要进一步验证 | 探究Galectin-3在磷酸酯引发的急性肺损伤中的作用及其机制 | 磷酸酯引发的急性肺损伤模型中的肺泡上皮细胞和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 小鼠模型，未具体说明样本数量 |
| 12532 | 2024-08-05 |
Establishment and validation of a tumor-infiltrating γδT cell related prognostic gene signature in head and neck squamous cell carcinoma
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112054
PMID:38608477
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研究论文 | 本文建立并验证了与肿瘤浸润γδT细胞相关的预后基因特征在头颈部鳞状细胞癌中的应用 | 首次提出γδT细胞基因特征作为头颈部鳞状细胞癌患者的独立预后指标 | 本研究仅使用了TCGA HNSCC数据库及100个肿瘤样本，样本数量可能限制了结果的广泛适用性 | 评估γδT细胞在头颈部鳞状细胞癌中的浸润及其与临床病理因素的关联 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本和相应的基因特征 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因组数据 | 100个头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 |
| 12533 | 2024-08-05 |
CXCR6 defines therapeutic subtypes of CD4+ cytotoxic T cell lineage for adoptive cell transfer therapy in pediatric B cell acute lymphoblastic leukemia
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111972
PMID:38569429
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研究论文 | 本研究探讨CXCR6作为新生儿B细胞急性淋巴细胞白血病中细胞毒性CD4 T细胞的治疗亚型的作用 | 提出CXCR6可以作为小儿B-ALL患者骨髓中细胞毒性CD4 Trm细胞的标志 | 需要更多的临床数据验证CXCR6在其他患者群体中的作用 | 研究CXCR6在小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者中细胞毒性CD4 T细胞的影响 | 小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者及健康供体的骨髓和外周血样本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 流式细胞术 (FCM), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 集成机器学习算法 | 血液样本 | 包括小儿B-ALL患者和健康供体的样本，具体数量未说明 |
| 12534 | 2024-08-05 |
The skin circadian clock gene F3 as a potential marker for psoriasis severity and its bidirectional relationship with IL-17 signaling in keratinocytes
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111993
PMID:38565044
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研究论文 | 本研究探讨了皮肤生物钟基因F3与牛皮癣严重程度及其与IL-17信号传导之间的双向关系 | 揭示了皮肤生物钟基因F3与IL-17信号通路之间的双向联系，指出F3可能通过激活JAK-STAT信号在角质形成细胞中引发异常细胞内炎症 | 关于F3和IL-17信号通路关系的机制需要进一步研究 | 研究皮肤生物钟基因F3与牛皮癣病理机制之间的关系 | 牛皮癣病灶与健康对照组 | 数字病理 | 牛皮癣 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 生物信息学数据 | GSE121212的牛皮癣病灶和健康对照样本，以及多个数据集进行验证 |
| 12535 | 2024-08-05 |
Living in Syn: T Cell Antigen Identification Based on Synapse Sequencing
2024-May-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0239
PMID:38557780
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于突触测序的T细胞抗原识别新平台Tsyn-seq | 提出了一种新的抗原发现平台Tsyn-seq，利用TCR-肽-HLA诱导的突触进行全基因组表位筛选 | 文章没有提及具体的局限性 | 研究T细胞抗原的识别机制 | 聚焦于通过突触测序识别T细胞表位 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12536 | 2024-08-04 |
TENET: Triple-enhancement based graph neural network for cell-cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2024-May-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168543
PMID:38508302
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研究论文 | 本文提出了一种新的图神经网络方法TENET，用于从空间转录组数据重构细胞-细胞相互作用网络 | TENET采用三重增强机制来改善细胞-细胞相互作用网络的重构精度，尤其在稀疏连接和噪声数据的情况下表现出色 | 可能在特定类型的噪声数据或极端稀疏的连接情况下依然存在准确性挑战 | 旨在提升细胞-细胞相互作用网络的重构准确性 | 重构细胞-细胞相互作用网络 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 真实和合成空间转录组数据 | NA |
| 12537 | 2024-08-05 |
High-Frequency Spinal Stimulation Suppresses Microglial Kaiso-P2X7 Receptor Axis-Induced Inflammation to Alleviate Neuropathic Pain in Rats
2024-May, Annals of neurology
IF:8.1Q1
DOI:10.1002/ana.26898
PMID:38450773
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研究论文 | 本研究探讨了高频脊髓刺激对神经病理性疼痛的减轻效果及其机制 | 揭示了HF10 SCS通过抑制小胶质细胞的Kaiso-P2X7受体病理轴来减少免疫反应，从而提供持久的疼痛缓解 | 仅在动物模型中进行试验，尚需在人类临床研究中验证结果 | 探讨10kHz HF SCS在疼痛缓解中的作用机制 | 以神经病理性疼痛大鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用大鼠模型进行测试，具体样本数量未提及 |
| 12538 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic landscape of peripheral blood cells provides insights into adaptation of red-eared sliders (Trachemys scripta elegans)
2024-May, Integrative zoology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/1749-4877.12725
PMID:37226359
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研究论文 | 本研究描绘了红耳龟外周血细胞的单细胞转录组图谱，探讨了其环境适应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术对红耳龟外周血细胞进行转录组分析，发现新的免疫信号类型 | 目前的研究主要集中在外周血细胞的转录组分析，未深入探讨其功能和机制 | 研究红耳龟在环境压力下的适应机制，主要通过血液学角度进行探索 | 红耳龟外周血细胞的多种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12539 | 2024-08-05 |
Novel Phosphate Transporter-B PvPTB1;1/1;2 Contribute to Efficient Phosphate Uptake and Arsenic Accumulation in As-Hyperaccumulator Pteris vittata
2024-Apr-30, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c09335
PMID:38624169
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研究论文 | 本研究揭示了低亲和力磷转运体-B 1家族介导的新型磷/砷运输系统在As-超积累植物中的作用 | 首次在维管植物中识别出两种膜蛋白基因，并确认其在磷摄取和砷积累中的作用 | 未提供关于其他植物转运体的对比分析数据 | 研究磷和砷在As-超积累植物中的摄取机制 | As-超积累植物Pteris vittata及其低亲和力磷转运体-B 1家族 | 植物生理学 | NA | 功能补偿实验和转基因分析 | NA | 基因表达数据和细胞转录组数据 | NA |
| 12540 | 2024-08-05 |
Cauchy hyper-graph Laplacian nonnegative matrix factorization for single-cell RNA-sequencing data analysis
2024-Apr-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05797-4
PMID:38684942
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研究论文 | 本文提出了一种Cauchy超图拉普拉斯非负矩阵分解方法用于单细胞RNA测序数据分析 | 使用Cauchy损失函数替代传统非负矩阵分解中的欧几里得距离，大大降低噪声影响，并结合超图约束。 | 至于模型的训练和优化过程的复杂性，具体应用于更大规模数据时的表现尚未讨论 | 探讨和改善单细胞数据分析中的聚类准确性 | 七个单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解 | Cauchy超图拉普拉斯非负矩阵分解 | RNA测序数据 | 七个数据集 |