单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 12481 - 12500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12481 | 2024-08-05 |
Preparation of single cell suspensions enriched in mouse brain vascular cells for single-cell RNA sequencing
2021-09-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100715
PMID:34401781
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研究论文 | 本文建立了用于小鼠大脑血管细胞的单细胞RNA测序的细胞分离程序 | 创新性在于提供了一种高效的细胞分离方法以获取高质量的脑血管细胞 | 未提及具体的实验条件和样本来源的限制 | 研究目标是改善脑血管细胞的分离与表征以进行转录组分析 | 研究对象为小鼠脑血管细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12482 | 2024-08-05 |
Lentiviral vectors transduce lung stem cells without disrupting plasticity
2021-Sep-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.06.010
PMID:34458011
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研究论文 | 本研究探讨了逆转录病毒载体在不影响气道干细胞功能的情况下转导肺干细胞。 | 该研究首次证明了逆转录病毒载体转导不会改变气道干细胞的可塑性与功能。 | 研究主要针对人类囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的细胞，可能不适用于其他类型的肺病。 | 探讨病毒载体转导或治疗转基因的异位表达是否会影响气道干细胞的功能。 | 研究对象为来自人类囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的初级气道基底细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 逆转录病毒载体 | NA | 细胞文化 | 来自囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的初级气道基底细胞 |
| 12483 | 2024-08-05 |
Intratumoral injection of caerin 1.1 and 1.9 peptides increases the efficacy of vaccinated TC-1 tumor-bearing mice with PD-1 blockade by modulating macrophage heterogeneity and the activation of CD8+ T cells in the tumor microenvironment
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1335
PMID:34429969
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研究论文 | 本文展示了结合E7抗原特异性免疫疗法及IL-10和PD-1阻断剂，局部注射caerin 1.1/1.9肽能增强TC-1肿瘤微环境的免疫活性 | 首次展示了caerin 1.1/1.9肽在结合抗PD-1治疗下对肿瘤免疫细胞类型的影响 | 该研究未详细探讨不同剂量的caerin肽对免疫反应的影响 | 改善临床免疫疗法对肿瘤的响应 | 接种E7抗原的TC-1肿瘤小鼠 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术、单细胞转录组学与蛋白质组学 | NA | 细胞, 蛋白质 | 受试者为接种E7抗原的TC-1肿瘤小鼠 |
| 12484 | 2024-08-05 |
Deciphering Müller cell heterogeneity signatures in diabetic retinopathy across species: an integrative single-cell analysis
2024-May-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01847-y
PMID:38698486
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析阐明了糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的复杂特征 | 首次揭示了不同物种中穆勒细胞的异质性及其在糖尿病视网膜病变中的作用 | 未明确提到该研究的局限性 | 深入理解糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的细胞机制 | 糖尿病视网膜病变中的穆勒细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了斯普拉吉-道利大鼠模型和人类患者的样本 |
| 12485 | 2024-08-04 |
A cuproptosis-related signature predicts prognosis and indicates cross-talk with immunocyte in ovarian cancer
2024-May-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00981-7
PMID:38696071
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研究论文 | 本文构建了一个新的与铜死亡相关的基因特征，具有良好的预后能力，以评估卵巢癌患者的结果 | 建立了与铜死亡相关的预后模型，并发现了其与免疫细胞的交互作用和化疗反应的关系 | 本研究主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在数据偏差问题 | 研究铜死亡与卵巢癌进展之间的关系 | 卵巢癌患者的基因组数据和细胞实验 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因组数据 | TCGA中583名卵巢癌患者和GEO中260名卵巢癌患者 |
| 12486 | 2024-08-05 |
Development of an Automated Morphometric Approach to Assess Vascular Outcomes following Exposure to Environmental Chemicals in Zebrafish
2024-May, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP13214
PMID:38701112
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研究论文 | 本文开发了一种自动化形态度量方法来评估环境化学物质对血管的影响 | 提出了一个基于深度学习的定量框架ECA-ResXUnet，用于自动分割血管网和提取特征 | 对环境化学物质对血管的影响研究还不够全面 | 研究环境化学物质对血管形态的影响并开发评估方法 | Tg(fli1a:eGFP)斑马鱼胚胎作为实验对象 | 数字病理学 | NA | 高含量成像平台和单细胞RNA测序 | ECA-ResXUnet | 图像 | 对150种环境化学物质处理的斑马鱼幼体进行了评估 |
| 12487 | 2024-08-04 |
AI identifies potent inducers of breast cancer stem cell differentiation based on adversarial learning from gene expression data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae207
PMID:38701411
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研究论文 | 本文利用基于转录组数据的人工智能方法识别强效的诱导乳腺癌干细胞分化的小分子。 | 创新之处在于采用对抗学习方法解决不同数据域的适应性问题，从而有效识别和消除域特定偏差。 | 实验验证仅在MDA-MB-231和MCF7细胞中进行，样本可能存在局限性。 | 研究旨在寻找能够诱导乳腺癌干细胞分化的小分子。 | 研究对象为乳腺癌干细胞及其分化过程中的小分子。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-Seq | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 六个小分子在MDA-MB-231和MCF7细胞中进行检验 |
| 12488 | 2024-08-05 |
scEWE: high-order element-wise weighted ensemble clustering for heterogeneity analysis of single-cell RNA-sequencing data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae203
PMID:38701413
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研究论文 | 提出了一种高阶元素加权集成聚类方法scEWE，以分析单细胞RNA测序数据中的异质性 | 开发了一个基于高阶元素加权策略的自我代表性集成学习框架，优化了对个体细胞的聚类权重分配 | 针对特定数据集的性能验证，可能不适用于所有类型的单细胞RNA-seq数据 | 提高单细胞RNA测序数据的异质性分析性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 计算机视觉 | NA | RNA-seq | 集成学习 | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 12489 | 2024-08-04 |
ProtoCell4P: an explainable prototype-based neural network for patient classification using single-cell RNA-seq
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad493
PMID:37540223
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研究论文 | 本文提出了一种名为ProtoCell4P的原型基础神经网络，用于基于单细胞RNA测序进行患者分类并提供可解释性 | 该模型通过利用细胞知识和细胞的代表（称为原型）来缓解样本稀缺和细胞数量多样性的问题，具备良好的可解释性 | 样本数量通常较小，单细胞表达轮廓较嘈杂，并且高维性可能限制了一些分析 | 旨在设计深度学习模型对患者表型进行精准分类 | 研究对象为通过单细胞RNA测序数据获得的患者样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 原型基础神经网络 | 单细胞表达数据 | 样本数量通常较小，具体数字未给出 |
| 12490 | 2024-08-05 |
Generation of ventralized human thalamic organoids with thalamic reticular nucleus
2023-05-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.007
PMID:37019105
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研究论文 | 本研究报告了一种将人类胚胎干细胞转化为具有不同核身份的腹侧丘脑类器官的方法 | 实现了以前未能达到的丘脑模式，展现了丘脑网状核的特征 | 未影响整体丘脑谱系发育的神经功能变化可能限定了结果的适用性 | 探索人类丘脑中核特异性发育与病理的机制 | 使用腹侧丘脑类器官研究TRN特异性与病相关基因的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA |
| 12491 | 2024-08-05 |
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
DOI:10.1093/jncimonographs/lgad014
PMID:37139973
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研究论文 | 本研究探讨了肥胖如何影响人类B细胞急性淋巴细胞白血病的功能 | 使用多组学方法揭示了肥胖相关的B细胞特异性标志与生存结果之间的关联，提供了新的见解 | 研究未提及样本的多样性和肥胖机制的广泛性 | 理解脂肪细胞如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病中的代谢和耐药性 | 正常和恶性B细胞，特别是B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序，质谱 | NA | 血清和血浆样本 | 健康供体和B-ALL患者的样本 |
| 12492 | 2024-08-05 |
Categorization of lung mesenchymal cells in development and fibrosis
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102551
PMID:34151224
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研究论文 | 该文章探讨了肺间充质细胞在发育和纤维化过程中的分类及其转录组特征 | 本研究识别并描绘了一种新的细胞群体，并描述了细胞亚型特异性转录因子 | 未明确提出该研究的具体局限性 | 研究肺间充质细胞的异质性及其在发育和纤维化中的作用 | 小鼠和人类的肺间充质细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胚胎、出生后、成人及老年期的纤维化肺中间充质细胞 |
| 12493 | 2024-08-05 |
The derepression of transposable elements in lung cells is associated with the inflammatory response and gene activation in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-Jun-09, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-021-00241-3
PMID:34108012
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研究论文 | 本文探讨了转座元件在特发性肺纤维化中的去抑制与炎症反应和基因激活的关联 | 研究首次展示了转座元件在特发性肺纤维化患者肺细胞中的失调与基因表达和炎症反应的关联 | 研究中仅使用了24名样本，可能无法全面代表特发性肺纤维化患者的多样性 | 确定转座元件是否与特发性肺纤维化相关 | 健康供体与特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 24名受试者（16名健康供体和8名特发性肺纤维化患者） |
| 12494 | 2024-08-05 |
Uphyloplot2: visualizing phylogenetic trees from single-cell RNA-seq data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07739-3
PMID:34090344
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研究论文 | Uphyloplot2是一种可视化单细胞RNA测序数据的系统。 | 该工具能够直接从推断的RNA-seq数据或Newick格式的树状图文件生成系统发育图，简化了以往繁琐的手动分析。 | 目前没有提及该工具的具体限制。 | 本研究旨在提供一种简单的工具，以从单细胞RNA-seq数据及其他来源生成系统发育图，以展示肿瘤的克隆性。 | 研究对象是通过单细胞RNA测序获得的肿瘤细胞数据。 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 12495 | 2024-08-05 |
Naive stem cell blastocyst model captures human embryo lineage segregation
2021-06-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.031
PMID:33957081
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研究论文 | 本研究描述了一种通过自组织生成的人类胚胎模型（blastoids），模拟了自然的囊胚。 | 该文章创新地提出了一种灵活且可扩展的系统，为人类胚胎研究提供了稳定的实验模型。 | NA | 研究人类胚胎的发育过程及其细胞系分离机制。 | 人类天真多能细胞及其分化成囊胚的过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 12496 | 2024-08-05 |
Pro-cachectic factors link experimental and human chronic kidney disease to skeletal muscle wasting programs
2021-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135821
PMID:34060483
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研究论文 | 本文研究了慢性肾病与骨骼肌消耗之间的联系 | 研究揭示了激活素A在慢性肾病导致的肌肉消耗中的关键作用 | 未提及具体的临床试验数据或人类样本数量 | 探索慢性肾病与骨骼肌消耗之间的信号传递和相互作用 | 实验模型和人类慢性肾病患者的肌肉消耗机制 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞测序 | 小鼠实验模型 | 生物样本 | 不同的小鼠模型 |
| 12497 | 2024-08-05 |
Early precursors and molecular determinants of tissue-resident memory CD8+ T lymphocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2020-05-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz6894
PMID:32414833
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究CD8 T细胞在对病毒感染反应中的基因表达模式 | 揭示了在病毒感染早期，组织中特定CD8 T细胞前体的转录异质性 | 研究可能未涵盖所有组织环境下的CD8 T细胞特征 | 探讨CD8 T细胞在病毒感染中的分化过程 | CD8 T细胞在脾脏和小肠内的特定亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在病毒感染过程中对不同分化阶段的个体CD8 T细胞进行了分析 |
| 12498 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis characterizes common and cell-lineage-specific mutations in a muscle-invasive bladder cancer
2012-Aug-14, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1186/2047-217X-1-12
PMID:23587365
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研究论文 | 这篇文章分析了肌肉浸润性膀胱癌的单细胞突变特征 | 提出了一种在单细胞水平研究膀胱肿瘤遗传细节的新方法 | 该研究可能仅限于特定的肿瘤亚群，未涵盖所有膀胱癌的变异 | 探究肌肉浸润性膀胱癌的遗传演变过程 | 对66个单个肌肉浸润性膀胱同源细胞进行单细胞外显子组测序 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞外显子组测序 | NA | 基因组数据 | 66个肿瘤细胞和99个膀胱癌肿瘤 |
| 12499 | 2024-08-05 |
Modeling acute myocardial infarction and cardiac fibrosis using human induced pluripotent stem cell-derived multi-cellular heart organoids
2024-May-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06703-9
PMID:38693114
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的多细胞心脏类器官建模急性心肌梗死和心脏纤维化 | 该研究通过生成自组织的心脏类器官，首次将心肌细胞、成纤维细胞和内皮细胞的多细胞组成结合在一起，从而模仿人心脏的细胞组成 | 该研究可能在细胞模型的完全功能性和长期稳定性方面存在限制 | 研究旨在创建与临床相关的心脏疾病体外模型，以促进心脏疾病的研究和药物筛选 | 研究对象为使用人诱导多能干细胞生成的心脏类器官 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术、q-PCR | 多细胞模型 | 细胞和组织样本 | NA |
| 12500 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of IL4I1 in human tumors: a bulk omics research and single cell sequencing validation
2024-May-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01000-5
PMID:38691253
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研究论文 | 本研究探讨了IL4I1在多种肿瘤中的预后和免疫学角色 | IL4I1被发现与癌症的预后和免疫细胞浸润密切相关，且可能作为新的治疗靶点 | 研究主要依赖于现有数据库，可能存在数据偏差 | 探索IL4I1在肿瘤中的表达及其与预后和免疫的关系 | IL4I1在多种人类肿瘤中的表达和作用 | 数字病理学 | 肿瘤相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肿瘤样本 |