单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12461 - 12480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12461 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell dysfunction in the peripheral blood of patients with highly aggressive gastric cancer
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13591
PMID:38319150
|
研究论文 | 本研究采用单细胞RNA测序揭示了高度侵袭性胃癌患者外周血中免疫细胞的功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序展示了HAGC患者外周血单核细胞的显著变化，特别是嗜中性粒细胞的成熟度及其对T细胞的抑制作用 | 研究样本量较小，仅包括18名患者，可能限制了结果的普遍适用性 | 这个研究旨在揭示高度侵袭性胃癌患者的免疫反应 | 研究对象包括七名HAGC患者、六名正常晚期胃癌患者及五名健康个体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 共18个样本，其中包括7名HAGC患者、6名正常晚期胃癌患者和5名健康个体 |
| 12462 | 2024-08-05 |
Comprehensive profiling of endocrine metabolism identifies a novel signature with robust predictive value in ovarian cancer
2024-May, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3686
PMID:38689382
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研究论文 | 本研究通过综合剖析内分泌代谢，识别出一种在卵巢癌中具有强大预测价值的新特征 | 提出了一种基于分泌信号通路的卵巢癌预后标志物，显示出良好的预后性能 | 未明确提及研究的局限性 | 探讨卵巢癌中内分泌代谢特征与预后的关系 | 卵巢癌患者的基因和免疫细胞的数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 基因数据 | 从TCGA和GEO数据集中提取的卵巢癌数据 |
| 12463 | 2024-08-05 |
T-Cell-Based Platform for Functional Screening of T-Cell Receptors Identified in Single-Cell RNA Sequencing Data Sets of Tumor-Infiltrating T-Cells
2024-Apr-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4972
PMID:38686347
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研究论文 | 本研究展示了一种结合全转录组和T细胞受体测序的有效方法，用以识别肿瘤反应性TCR克隆类型 | 创新点在于建立了一种高效的体外功能检测平台，以筛选大量通过单细胞RNA测序识别的TCR克隆类型 | 最初开发的检测主要针对人源TCR，虽然也成功应用于小鼠源的TCR，但适用性仍需进一步验证 | 研究旨在开发和验证一种高效的TCR功能筛选方法 | 研究对象为从肿瘤浸润的T细胞中隔离出的TCR克隆 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），全转录组测序 | NA | mRNA | 肿瘤样本和同系小鼠肿瘤模型中衍生的CD8和CD4 T细胞 |
| 12464 | 2024-08-04 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2024-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.15.589676
PMID:38659941
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研究论文 | 本研究发现小分子抑制剂RMC-113可以有效抑制多种RNA病毒的复制，包括SARS-CoV-2 | 揭示了PIP4K2C在SARS-CoV-2感染过程中的作用，并提出双重抑制PIP4K2C和PIKfyve作为对抗新兴病毒的候选策略 | 研究中未提及样本规模及人类体内的进一步验证 | 探索新型广谱抗病毒药物的潜力 | 人类肺类器官中对SARS-CoV-2及其他RNA病毒的研究 | 数字病理学 | 肺癌 | 脂质组学 | NA | RNA病毒样本 | 人类肺类器官样本 |
| 12465 | 2024-08-05 |
Tumor-associated macrophage subtypes on cancer immunity along with prognostic analysis and SPP1-mediated interactions between tumor cells and macrophages
2024-Apr, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011235
PMID:38648200
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAM）亚型对癌症免疫和预后的影响 | 研究揭示了TAM的异质性，识别了十一种亚型及其对预后的影响，并发现SPP1通路在TAM亚型之间及与肿瘤细胞之间的关键通信作用 | 对不同癌症类型中TAM的分子特征和临床相关性的系统性研究仍然缺乏 | 系统探索不同癌症类型中TAM的分子特征及其对癌症预后的影响 | 三种不同肿瘤类型的单细胞RNA测序数据，分析巨噬细胞的克隆和分类 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 三种不同肿瘤类型的单细胞样本 |
| 12466 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12467 | 2024-08-04 |
Galectin-3 aggravates microglial activation and tau transmission in tauopathy
2024-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165523
PMID:37988169
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研究论文 | 本文研究了Galectin-3在tau病中的作用，发现其加剧了小胶质细胞的活化和tau的传递 | 这篇文章揭示了Galectin-3在tau病中的新作用及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 研究主要集中在小鼠模型和人类细胞，可能存在模型的局限性 | 探讨Galectin-3在tau病中的角色及其机制 | 小胶质细胞、超磷酸化tau和tau病小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | THY-Tau22小鼠模型 | 细胞和分子数据 | 纳入人类和小鼠的小胶质细胞样本 |
| 12468 | 2024-08-04 |
scRNA-seq characterizing the heterogeneity of fibroblasts in breast cancer reveals a novel subtype SFRP4+ CAF that inhibits migration and predicts prognosis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1348299
PMID:38686196
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研究论文 | 本文研究了乳腺癌中癌相关成纤维细胞的异质性，并首次发现了一种新的SFRP4+ CAF亚型，抑制迁移并预测预后 | 首次鉴定了SFRP4+ CAF亚型，主要存在于正常组织中，并发现其对乳腺癌细胞迁移具有抑制作用 | 尽管发现了新的CAF亚型，但其功能机制和临床应用仍需进一步研究 | 旨在全面了解乳腺癌中癌相关成纤维细胞的特征和作用 | 研究对象为14个乳腺癌正常-肿瘤配对样本中的CAF | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 样本 | 14个乳腺癌正常-肿瘤配对样本 |
| 12469 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing and ATAC sequencing identify novel biomarkers for bicuspid aortic valve-associated thoracic aortic aneurysm
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1265378
PMID:38685981
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序和ATAC测序识别与二尖瓣主动脉和胸主动脉瘤相关的新生物标志物 | 首次系统性评估了二尖瓣主动脉与胸主动脉瘤相关组织的细胞组成，并识别了不同表达基因 | 样本量较小，仅来自两名BAV患者和两名心脏移植供体 | 提高对二尖瓣主动脉病因学的理解 | 二尖瓣主动脉和胸主动脉瘤相关的组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，ATAC测序 | NA | 组织样本 | 4个样本（2名BAV患者和2名心脏移植供体） |
| 12470 | 2024-08-05 |
Tissue-specific Cre driver mice to study vascular diseases
2023-12, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2023.107241
PMID:37923099
|
研究论文 | 本文探讨了组织特异性Cre驱动小鼠在血管疾病研究中的应用 | 介绍了革命性的单细胞RNA测序和双重重组酶系统对于组织特异性Cre驱动小鼠的未来发展 | 未提及具体实验局限性 | 扩展对血管疾病的理解 | 主要研究血管壁的主要细胞类型及相关的Cre驱动小鼠 | 数字病理学 | NA | Cre-loxP系统 | 条件性基因敲除小鼠 | NA | NA |
| 12471 | 2024-08-05 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107937
PMID:37810214
|
研究论文 | 本研究探讨了在膀胱癌小鼠模型中，内皮细胞如何响应联合PD-1/CTLA-4免疫检查点抑制治疗 | 揭示了内皮细胞中IFN-g信号传导在免疫检查点抑制诱导的抗肿瘤活性中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能限制了对人类疾病的直接应用 | 探索不同细胞类型对联合PD-1/CTLA-4免疫检查点抑制治疗的响应机制 | 侵袭性尿路上皮癌小鼠模型中的肿瘤细胞及内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq | NA | 表格数据 | 三种条件下的细胞样本：未治疗肿瘤、治疗肿瘤、CD4 T细胞耗竭后治疗的肿瘤 |
| 12472 | 2024-08-04 |
CCR7+ CD4 T Cell Immunosurveillance Disrupted in Chronic SIV-Induced Neuroinflammation in Rhesus Brain
2023-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.28.555037
PMID:37693567
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研究论文 | 这篇文章探讨了CCR7+ CD4 T细胞在恒河猴脑中慢性SIV诱导的神经炎症中的免疫监视功能的破坏 | 首次揭示了CCR7+ CD4 T细胞在中枢神经系统中的特定亚群及其功能特点 | 样本主要来自恒河猴，可能限制了结果对人类的直接适用性 | 研究CCR7+ CD4 T细胞在慢性SIV诱导的神经炎症中的角色 | 恒河猴的CCR7+ CD4 T细胞及其在神经炎症中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析、ATAC-seq、空间转录组学、流式细胞术 | NA | NA | 慢性SIV感染的恒河猴 |
| 12473 | 2024-08-05 |
Lactate-dependent transcriptional regulation controls mammalian eye morphogenesis
2023-07-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39672-2
PMID:37452018
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研究论文 | 这篇文章研究了乳酸在哺乳动物眼形态发生中的转录调控作用 | 揭示了乳酸作为信号分子在哺乳动物眼形态发生中扮演的重要角色 | 未详细探讨其他代谢途径对 retinal morphogenesis 的潜在影响 | 探讨乳酸在视网膜发育早期阶段的重要性和机制 | 研究了小鼠胚胎中的视网膜祖细胞及其代谢活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA | NA |
| 12474 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies response of renal lymphatic endothelial cells to acute kidney injury
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.09.544380
PMID:37333313
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序鉴定了肾脏淋巴内皮细胞对急性肾损伤的反应 | 首次对小鼠肾脏淋巴内皮细胞亚群进行了特征描述，并揭示了它们在急性肾损伤中的基因变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表人类情况 | 研究肾脏淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的响应 | 小鼠肾脏淋巴内皮细胞亚群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠模型的不同急性肾损伤类型的淋巴内皮细胞 |
| 12475 | 2024-08-04 |
Insulin-like growth factor 1 reduces coronary atherosclerosis in pigs with familial hypercholesterolemia
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165713
PMID:36602878
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研究论文 | 这项研究探讨了类胰岛素生长因子1在家族性高胆固醇血症猪中的动脉粥样硬化作用 | 首次在家族性高胆固醇血症猪模型中证实IGF-1能减少冠状动脉粥样硬化并促进稳定斑块特征 | 本研究的结果可能仅限于猪模型，需在临床试验中进一步验证 | 研究IGF-1对冠状动脉粥样硬化的影响及其机制 | 家族性高胆固醇血症（FH）猪 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 使用家族性高胆固醇血症猪进行6个月的实验 |
| 12476 | 2024-08-05 |
Detecting retinal neural and stromal cell classes and ganglion cell subtypes based on transcriptome data with deep transfer learning
2022-09-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac514
PMID:35876552
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研究论文 | 本研究开发并评估了深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据识别不同类型的视网膜细胞和视网膜神经节细胞亚型 | 使用深度域自适应模型，结合多种损失函数，以提高不同数据集间的准确性 | 研究中仅基于小鼠的视网膜细胞，可能无法推广到其他物种 | 旨在提高识别不同视网膜细胞类型及其亚型的准确性 | 采用不同小鼠来源的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | RNA数据 | 44,808个视网膜细胞和6,225个及35,699个视网膜神经节细胞 |
| 12477 | 2024-08-05 |
Slow-Cycling Cells in Glioblastoma: A Specific Population in the Cellular Mosaic of Cancer Stem Cells
2022-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051126
PMID:35267434
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研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤中慢周期细胞的特性和功能异质性 | 首次揭示了慢周期细胞与表型定义的癌症干细胞之间的显著异质性和独特性 | 研究中未深入探讨细胞间的交互作用及其对肿瘤微环境的影响 | 研究胶质母细胞瘤中癌症干细胞群体的异质性 | 重点比较胶质母细胞瘤中的慢周期细胞与通常富集癌症干细胞的细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 流式细胞术、RNA测序、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 研究中解析了22个细胞组成的多个癌症干细胞组 |
| 12478 | 2024-08-05 |
Semiochemical responsive olfactory sensory neurons are sexually dimorphic and plastic
2020-11-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54501
PMID:33231170
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研究论文 | 本研究探讨了基因和经验如何共同作用生成表型变异性，特别是在小鼠的主要嗅觉上皮中 | 识别出了一群性别特异性的嗅觉感知神经元，并发现其在不同性别小鼠中的表现出性别差异，同时揭示了活动依赖基因表达的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种 | 研究基因和经验在表现性状变异中的作用 | 主要嗅觉上皮中的嗅觉感知神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | 性别分离的小鼠和性别结合的小鼠的嗅觉神经元亚群 |
| 12479 | 2024-08-05 |
Identification of Repurposable Drugs and Adverse Drug Reactions for Various Courses of COVID-19 Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-May-16, ArXiv
PMID:33299905
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据筛选出可重新利用的抗COVID-19药物和不良药物反应 | 首次使用系统生物学方法结合FDA批准的药物和小分子化合物的数据来发现防治COVID-19的新药物 | 未详细探讨所有候选药物的临床适应性和潜在不良反应 | 寻找可重新利用的药物以治疗COVID-19 | 美国FDA批准的药物和前临床小分子化合物 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含轻症和重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 |
| 12480 | 2024-08-05 |
Agouti-Related Protein 2 Is a New Player in the Teleost Stress Response System
2019-06-17, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2019.05.021
PMID:31178320
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研究论文 | 本文探讨了Agouti相关蛋白2在鱼类应激反应系统中的新作用 | 本文首次揭示了AgRP2作为神经内分泌因子在斑马鱼应激反应中的调节角色 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能不适用于其他物种 | 研究AgRP2在斑马鱼应激反应系统中的功能 | 斑马鱼中的AgRP1和AgRP2基因及其表达细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本数量未具体说明 |