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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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12441 | 2024-12-12 |
Pan-cancer dissection of vasculogenic mimicry characteristic to provide potential therapeutic targets
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1346719
PMID:38694917
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研究论文 | 本研究基于多组学数据分析了不同癌症类型中血管拟态(VM)的特征,并提供了潜在的治疗靶点和策略 | 首次全面解析了跨癌症类型的血管拟态特征,揭示了其与肿瘤侵袭性、转移潜力、恶性程度和预后的相关性,并发现了与免疫抑制微环境的关系 | 研究主要基于现有数据库数据,缺乏实验验证,且样本量和数据类型可能限制了结果的普适性 | 阐明不同癌症类型中血管拟态的特征及其调控机制,并提供潜在的治疗靶点 | 跨癌症类型的血管拟态特征及其与肿瘤侵袭性、免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 多组学数据分析、单细胞转录组数据分析 | NA | 多组学数据、转录组数据、药物反应数据 | 来自The Cancer Genome Atlas的多组学数据和Genomics of Drug Sensitivity in Cancer数据库的转录组及药物反应数据 | NA | NA | NA | NA |
12442 | 2024-12-12 |
Identification of early Alzheimer's disease subclass and signature genes based on PANoptosis genes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462003
PMID:39650656
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研究论文 | 本研究基于PANoptosis基因识别阿尔茨海默病(AD)的早期亚类和特征基因 | 本研究首次基于PANoptosis基因识别了AD的两个亚类,并预测了针对早期AD的治疗候选药物 | 本研究的样本量较小,且仅基于GEO数据库的数据进行分析,可能存在数据偏倚 | 识别阿尔茨海默病的不同分子亚型并探索潜在的治疗药物 | 阿尔茨海默病及其相关PANoptosis基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的三个数据集(GSE48350, GSE5281, GSE122063) | NA | NA | NA | NA |
12443 | 2024-12-11 |
Comprehensive Analysis of circRNA-Related mRNAs as Prognostic Factors in Non-Smoking Women with Lung Adenocarcinoma
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S490478
PMID:39650787
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研究论文 | 本文研究了circRNA相关的mRNA作为非吸烟女性肺腺癌的预后标志物 | 构建了circRNA-miRNA-mRNA网络,并基于相关mRNA创建了预后风险评分模型 | 样本量较小,仅16对肿瘤和癌旁组织样本 | 探讨circRNA相关的mRNA在非吸烟女性肺腺癌中的预后价值 | 非吸烟女性肺腺癌患者的肿瘤和癌旁组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 高通量测序、免疫组织化学 | NA | RNA | 16对肺腺癌组织及其对应的癌旁组织 | NA | NA | NA | NA |
12444 | 2024-12-12 |
Integrating multi-omics techniques and in vitro experiments reveals that GLRX3 regulates the immune microenvironment and promotes hepatocellular carcinoma cell proliferation and invasion through iron metabolism pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1496886
PMID:39654899
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研究论文 | 本研究通过整合多组学技术和体外实验,揭示了GLRX3通过铁代谢途径调控免疫微环境并促进肝细胞癌细胞增殖和侵袭 | 首次系统分析了肝细胞癌肿瘤微环境中铁代谢的变化,并揭示了GLRX3在铁代谢调控中的关键作用及其对肿瘤细胞增殖和免疫逃逸的机制 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内实验验证 | 系统分析肝细胞癌肿瘤微环境中铁代谢的变化,并探讨铁代谢调控对肝癌患者生存的影响 | 肝细胞癌患者的单细胞测序数据以及GLRX3基因的表达和功能 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | 来自GEO数据库的肝细胞癌患者单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
12445 | 2024-12-12 |
scMIC: A Deep Multi-Level Information Fusion Framework for Clustering Single-Cell Multi-Omics Data
2023-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3317272
PMID:37725723
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研究论文 | 提出了一种名为scMIC的深度多层次信息融合框架,用于聚类单细胞多组学数据 | 该框架能够整合细胞的属性信息和潜在的结构关系,减少不同组学之间的冗余信息,并通过多重协同监督聚类策略提高聚类精度 | NA | 提高单细胞多组学数据聚类的准确性 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 深度学习框架 | 多组学数据 | 七个单细胞多组学数据集 | NA | NA | NA | NA |
12446 | 2024-12-12 |
scGCC: Graph Contrastive Clustering With Neighborhood Augmentations for scRNA-Seq Data Analysis
2023-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3319551
PMID:37751336
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGCC的图对比聚类模型,用于单细胞RNA测序数据分析,旨在解决高维度、稀疏性和批次效应等问题 | 引入图注意力网络(GAT)进行细胞表示学习,并提出了五种数据增强方法以提高聚类性能和鲁棒性 | 未提及具体局限性 | 开发一种新的图自监督对比学习模型,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图对比学习模型 | 数据 | 14个真实世界数据集 | NA | NA | NA | NA |
12447 | 2024-12-12 |
Single-cell transcriptomics suggest distinct upstream drivers of IL-17A/F in hidradenitis versus psoriasis
2023-09, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.05.012
PMID:37271319
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研究论文 | 研究比较了化脓性汗腺炎(HS)和银屑病中T17细胞的转录组及其与邻近免疫细胞亚群的配体-受体相互作用 | 首次揭示了HS和银屑病中T17细胞的不同上游驱动因素,特别是IL-1β在HS中的主导作用 | 研究仅限于皮肤样本,未涵盖全身免疫反应 | 探讨化脓性汗腺炎和银屑病中T17细胞的转录组特征及其驱动机制 | 化脓性汗腺炎和银屑病中的T17细胞及其与邻近免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 12,300个来自8个化脓性汗腺炎皮肤样本的免疫细胞,19,525个来自11个银屑病皮肤样本的细胞,以及11,920个来自10个对照皮肤样本的细胞 | NA | NA | NA | NA |
12448 | 2024-12-12 |
Maternal respiratory SARS-CoV-2 infection in pregnancy is associated with a robust inflammatory response at the maternal-fetal interface
2021-05-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.016
PMID:33969332
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研究论文 | 研究了孕妇在妊娠晚期感染SARS-CoV-2后,母胎界面发生的炎症反应 | 首次揭示了妊娠晚期SARS-CoV-2感染在母胎界面引起的免疫激活,即使在没有检测到局部病毒入侵的情况下 | 研究样本量较小,且仅限于妊娠晚期的孕妇 | 探讨孕妇感染SARS-CoV-2后母胎界面的病理生理机制及其对胎儿的潜在影响 | 妊娠晚期感染SARS-CoV-2的孕妇及其胎盘组织 | NA | COVID-19 | 免疫组织化学、单细胞转录组学 | NA | 组织、细胞 | 15例妊娠晚期孕妇的胎盘组织 | NA | NA | NA | NA |
12449 | 2024-12-12 |
Single-cell RNA sequencing reveals microglia-like cells in cerebrospinal fluid during virologically suppressed HIV
2018-09-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.121718
PMID:30232286
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了HIV感染者脑脊液和血液中的细胞,发现了与神经退行性疾病相关的微胶质样细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术在脑脊液中识别出与神经退行性疾病相关的微胶质样细胞亚群,揭示了其在HIV感染中的潜在作用 | 研究样本量较小,且仅限于HIV感染者,未来需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨HIV感染期间中枢神经系统免疫激活与神经元损伤的细胞机制 | HIV感染者和非感染者的脑脊液和血液中的细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成人的脑脊液和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
12450 | 2024-12-11 |
Identification of cancer-associated fibrolast subtypes and distinctive role of MFAP5 in CT-detected extramural venous invasion in gastric cancer
2025-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102188
PMID:39531783
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研究论文 | 研究报告了MFAP5+癌症相关成纤维细胞(CAFs)在胃癌(GC)中通过调节乳酸化修饰促进CT检测到的壁外静脉侵犯(EMVI)的形成 | 首次揭示了MFAP5+ CAFs在胃癌中通过调节乳酸化修饰促进EMVI形成的作用,为胃癌的诊断和治疗提供了新的参考 | 研究样本量较小,仅涉及13名胃癌患者,可能影响结果的普适性 | 探讨癌症相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其对壁外静脉侵犯的影响 | 胃癌患者的病理样本和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、免疫组化、慢病毒敲低 | NA | 基因表达数据、图像 | 13名胃癌患者的病理样本 | NA | NA | NA | NA |
12451 | 2024-12-11 |
Machine learning-derived natural killer cell signature predicts prognosis and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102180
PMID:39536695
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研究论文 | 本文通过整合多种机器学习算法,建立了一个与自然杀伤细胞相关的风险模型,用于预测透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗反应 | 本文创新性地整合了十种不同的机器学习算法,建立了包含18个基因的风险模型,能够准确预测透明细胞肾细胞癌患者的预后,并揭示了自然杀伤细胞与其他细胞亚群之间的复杂信号相互作用 | 本文主要基于TCGA和GEO数据库的数据进行分析,未涉及大规模的临床验证 | 研究自然杀伤细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用,并建立预测患者预后和治疗反应的风险模型 | 透明细胞肾细胞癌患者的转录组数据、临床数据以及自然杀伤细胞的功能和表达模式 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序、qRT-PCR、IHC、CCK8检测、流式细胞术 | Coxboost plus plsRcox | 转录组数据 | TCGA数据库中的透明细胞肾细胞癌转录组数据和临床数据,以及GEO数据库中的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
12452 | 2024-12-11 |
Cordycepin enhances the Anticancer efficacy of PD-L1 blockade by modulating the tumor microenvironment of colon cancer
2024-Dec-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.177089
PMID:39489279
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研究论文 | 研究评估了抗PD-L1抗体与虫草素联合治疗结肠癌的效果及其机制 | 首次探讨了虫草素通过调节肿瘤微环境增强PD-L1阻断的抗肿瘤效果 | NA | 评估抗PD-L1抗体与虫草素联合治疗结肠癌的疗效 | 结肠癌及其肿瘤微环境 | NA | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
12453 | 2024-12-11 |
Leukemia inhibitory factor receptor inhibition by EC359 reduces atherosclerotic stenosis grade in Ldlr-/- mice
2024-Dec-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.177121
PMID:39528103
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研究论文 | 本研究探讨了白血病抑制因子(LIF)受体在动脉粥样硬化发展中的作用,并通过实验验证了LIF受体抑制剂EC359在减少动脉粥样硬化狭窄程度方面的潜力 | 首次深入研究了LIF及其受体在动脉粥样硬化中的作用,并证明了LIF受体抑制剂EC359在减少动脉粥样硬化斑块大小和降低胆固醇水平方面的效果 | 研究仅在Ldlr-/-小鼠模型中进行,结果的普遍性和在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探讨LIF受体信号在动脉粥样硬化发展中的作用,并评估LIF受体抑制剂EC359的疗效 | LIF受体在动脉粥样硬化中的作用及EC359对动脉粥样硬化的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 实验涉及30只Ldlr-/-小鼠,分为两组,每组15只 | NA | NA | NA | NA |
12454 | 2024-12-11 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear-cell renal-cell carcinoma tumor microenvironment
2024-Dec-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03435-z
PMID:39639369
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研究论文 | 本文通过空间转录组学研究了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中整合素和胶原蛋白IV的空间耦合,以更好地理解免疫治疗耐药性 | 本文首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术,分析了免疫治疗前后ccRCC肿瘤微环境中的分子变化,并发现免疫治疗后肿瘤中胶原蛋白IV和整合素αV的表达显著增加 | 本文仅分析了21个肿瘤样本,样本量较小,且未探讨潜在的治疗策略 | 研究透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中免疫治疗耐药性的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤及其微环境 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学 | NA | 空间分子图像 | 21个ccRCC肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
12455 | 2024-12-11 |
Nonepithelial Gene Expression Correlates With Symptom Severity in Adults With Eosinophilic Esophagitis
2024-Dec, The journal of allergy and clinical immunology. In practice
DOI:10.1016/j.jaip.2024.05.015
PMID:38768900
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研究论文 | 本文研究了非上皮基因表达与嗜酸性食管炎(EoE)症状严重程度之间的相关性 | 首次揭示了非上皮细胞(如成纤维细胞)在EoE症状严重程度中的潜在作用 | 样本量有限,且仅限于成人患者 | 探讨EoE症状严重程度与食管基因表达之间的关系 | 嗜酸性食管炎患者的食管基因表达与症状严重程度 | NA | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 146名成人EoE患者 | NA | NA | NA | NA |
12456 | 2024-12-11 |
Single-cell transcriptome analysis of the mouse lungs during the injury and recovery periods after lipopolysaccharide administration
2024-Dec, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01951-z
PMID:39377802
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了小鼠肺部在脂多糖处理后损伤和恢复期的细胞和分子变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脂多糖诱导的急性肺损伤(ALI)期间细胞间相互作用及Dpp4在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨急性肺损伤(ALI)期间细胞和分子变化,并寻找有效的治疗靶点 | 小鼠肺部在脂多糖处理后损伤和恢复期的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自损伤(第3天)和恢复(第6天)小鼠的肺泡组织样本 | NA | NA | NA | NA |
12457 | 2024-12-11 |
Doxorubicin resistance involves modulation of interferon signaling, transcriptional bursting, and gene co-expression patterns of U-ISGF3-related genes
2024-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101071
PMID:39405604
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研究论文 | 研究了多柔比星(DOX)在人结肠癌细胞中诱导的转录组变化,揭示了与U-ISGF3相关基因的表达变化及其在化疗耐药中的潜在作用 | 首次揭示了U-ISGF3相关基因在多柔比星耐药中的作用,并发现HSH2D作为不良预后标志物在耐药细胞中的高表达 | 研究仅限于人结肠癌细胞,未探讨其他癌症类型中的适用性 | 探讨多柔比星诱导的化疗耐药机制及其潜在治疗靶点 | 人结肠癌细胞在亚毒性多柔比星处理后的转录组变化 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 转录组数据 | 人结肠癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
12458 | 2024-12-11 |
Systematic analysis of human colorectal cancer scRNA-seq revealed limited pro-tumoral IL-17 production potential in gamma delta T cells
2024-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101072
PMID:39454432
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研究论文 | 本研究重新分析了九个已发表的人类结直肠癌全组织单细胞RNA测序数据集,揭示了γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的潜力有限 | 首次系统分析了人类结直肠癌中单细胞RNA测序数据,发现γδ T细胞在肿瘤微环境中主要表现为细胞毒性效应细胞,而非IL-17产生细胞 | 研究仅基于已发表的数据集,未进行新的实验验证 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的作用 | γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 165名结直肠癌患者的肿瘤和邻近正常组织中的951,785个细胞,其中18,483个为γδ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
12459 | 2024-12-11 |
Elucidating tobacco smoke-induced craniofacial deformities: Biomarker and MAPK signaling dysregulation unraveled by cross-species multi-omics analysis
2024-Dec, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117343
PMID:39549573
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研究论文 | 本研究使用斑马鱼幼体模型,通过多组学分析揭示了烟草烟雾引起的颅面畸形与MAPK信号通路失调之间的关系 | 首次通过跨物种多组学分析揭示了烟草烟雾引起的颅面畸形相关的新型生物标志物和MAPK信号通路的失调 | 研究主要基于斑马鱼模型和人类胚胎腭间充质细胞,可能需要进一步的人体临床研究验证 | 揭示烟草烟雾引起的颅面畸形的发生机制,并寻找相关的生物标志物和信号通路 | 斑马鱼幼体和人类胚胎腭间充质细胞 | NA | NA | 多组学分析(mRNA-miRNA分析、单细胞转录组学、定量实时PCR) | NA | 基因、蛋白质、代谢物 | 斑马鱼幼体和人类胚胎腭间充质细胞 | NA | NA | NA | NA |
12460 | 2024-12-11 |
Key Regulatory Elements of the TGFβ-LRRC15 Axis Predict Disease Progression and Immunotherapy Resistance Across Cancer Types
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.22.624939
PMID:39651139
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研究论文 | 本文研究了TGFβ-LRRC15轴的关键调控元件,揭示其在不同癌症类型中预测疾病进展和免疫治疗抵抗的潜力 | 本文通过结合功能性化合物筛选和单细胞RNA测序,揭示了调控TGFβ增加LRRC15表达的关键基因特征,并验证了这些基因在预测免疫治疗反应中的潜力 | 本文主要基于细胞模型进行验证,尚未在临床试验中验证其效果 | 揭示TGFβ-LRRC15轴的关键调控元件,并探索其在个性化免疫治疗中的应用 | TGFβ-LRRC15轴的关键调控基因及其在癌症进展和免疫治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因表达数据 | 细胞模型 | NA | NA | NA | NA |