单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
12401 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing of mouse islets exposed to proinflammatory cytokines
2021-06, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 这篇文章探讨了小鼠胰岛在炎性细胞因子影响下的单细胞RNA测序结果 首次揭示了不同类型的胰岛内分泌细胞对炎性细胞因子的响应及其基因表达变化的异质性 主要只研究了IL-1β和IFN-γ的影响,未考虑其他可能的细胞因子 理解炎性细胞因子如何影响胰岛细胞的基因表达 小鼠胰岛的内分泌细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠胰岛样本,具体样本数未提供
12402 2024-08-05
XIAP Knockdown in Alcohol-Associated Liver Disease Models Exhibits Divergent in vitro and in vivo Phenotypes Owing to a Potential Zonal Inhibitory Role of SMAC
2021, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
研究论文 研究了XIAP在酒精相关肝病模型中的功能及其相应表型差异 提出了SMAC在不同区域的抑制作用可能解释了XIAP缺失小鼠未出现疾病加重表型的机制 缺乏对XIAP缺失导致炎症反应机制的全面理解 探讨XIAP在酒精相关肝病发生中的作用 小鼠模型中XIAP基因缺失对肝脏细胞的影响 数字病理学 肝病 scRNA-seq NA 转录组数据 使用了多种小鼠模型
12403 2024-08-04
Exhaled volatolomics profiling facilitates personalized screening for gastric cancer
2024-May-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究建立了一种非侵入性方法,通过呼气挥发物组学和集成学习来检测胃癌 该研究开发了一种基于质谱的程序,筛选出用于区分胃癌与对照组的 biomarkers 面板,并表现出高准确性 未提及具体的局限性 旨在开发一种有效的非侵入性筛查工具用于胃癌的早期检测 研究对象为314个呼吸样本 数字病理学 胃癌 质谱 集成学习 呼吸样本 314个呼吸样本
12404 2024-08-04
BMP signaling maintains auricular chondrocyte identity and prevents microtia development by inhibiting protein kinase A
2024-May-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文研究BMP信号在维持耳廓软骨细胞身份及防止微小耳畸形发展中的作用 发现BMP-Smad1/5/9信号激活与耳廓软骨细胞再生活性降低相关,提供了微小耳发病机理的新见解 目前对于微小耳发病机制的理解仍不完全,研究可能未能涵盖所有相关基因和路径 探讨BMP信号如何维持耳廓软骨细胞身份以及防止微小耳的发病 研究对象为成人小鼠耳廓软骨细胞以及人类微小耳样本 数字病理学 微小耳畸形 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 成人小鼠耳廓软骨细胞和人类微小耳样本
12405 2024-08-05
Acute Lymphoblastic Leukemia with Myeloid Mutations Is a High-Risk Disease Associated with Clonal Hematopoiesis
2024-May-01, Blood cancer discovery IF:11.5Q1
研究论文 本研究探讨了急性淋巴细胞白血病(ALL)中与骨髓突变相关的克隆性造血的影响 该研究首次揭示了急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的存在及其对预后的影响 本研究的样本量可能不足以全面反映该疾病的所有临床特征 研究急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的作用及其病理机制 成年人急性淋巴细胞白血病患者 数字病理学 急性淋巴细胞白血病 单细胞蛋白基因组分析,单细胞RNA测序 NA 基因组数据 研究涉及的成年ALL案例中,包括TP53突变和骨髓克隆突变的患者
12406 2024-08-05
Characterization of macrophages in head and neck squamous cell carcinoma and development of MRG-based risk signature
2024-04-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌中的巨噬细胞特征,并开发了基于MRG的风险标志。 首次识别了8个具有预后潜力的巨噬细胞相关基因,并构建了预测模型,探讨了它们在HNSCC中的作用。 研究可能未考虑到所有可能影响HNSCC预后的因素,样本量和分类可能存在局限性。 研究巨噬细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其与疾病预后的关系。 头颈部鳞状细胞癌的患者样本及其巨噬细胞特征。 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 scRNA-seq,bulk RNA-seq Cox回归模型 临床数据,基因表达数据 包含特定的HNSCC患者数据,样本量在文中未具体说明
12407 2024-08-05
Functional specialization of hippocampal somatostatin-expressing interneurons
2024-Apr-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该文章探讨了海马体中表达生长抑素的GABA能抑制神经元的功能特化。 该研究为功能性不同的海马CA1抑制神经元亚群提供了一种新的识别和访问方法,揭示了它们在功能上的多样性。 该研究未完全解决神经元的具体功能与其转录组特征之间的联系。 研究海马抑制神经元的亚群特征及其功能特化。 研究对象为海马CA1区的抑制神经元亚群。 神经科学 NA 单细胞转录组分析 小鼠模型 转录组数据 四种小鼠模型
12408 2024-08-04
Spatiotemporal transcriptomic changes of human ovarian aging and the regulatory role of FOXP1
2024-Apr, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 该研究系统性地表征人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法,首次揭示了八种卵巢细胞在衰老过程中的时空分子特征 本文对衰老机制的理解仍有限,可能需要更多的实验进行验证 旨在全面理解人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 研究对象为人类卵巢细胞的岁月变化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 NA
12409 2024-08-05
BAP1 is required prenatally for differentiation and maintenance of postnatal murine enteric nervous system
2024-Mar-12, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本文发现BAP1在胎儿期对小鼠肠道神经系统的分化和维持至关重要 首次阐明BAP1缺失对肠道神经元分化和早期存活的影响 未能探讨其他可能的表观遗传调节因子对ENS发育的影响 研究BAP1在胎儿期对肠道神经系统发展的重要性 Tyr-Cre Bap1fl/fl小鼠的肠道神经系统 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 小鼠模型 RNA序列数据 Tyrosinase-Cre Bap1fl/fl小鼠的肠道神经元样本
12410 2024-08-05
Predicting mitophagy-related genes and unveiling liver endothelial cell heterogeneity in hepatic ischemia-reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的作用 该研究识别了8个关键基因并建立了基于这些基因的诊断模型,揭示了内皮细胞的异质性 研究仅基于有限的样本和单细胞数据分析,可能需要更广泛的验证 探究线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的重要性 研究对象包括44个肝脏缺血再灌注损伤样本及44个正常对照样本 数字病理学 肝脏疾病 单细胞RNA测序 逻辑回归模型 基因表达数据 44个肝脏缺血再灌注损伤样本和44个正常对照样本
12411 2024-08-05
The bone marrow of mouse-rat chimeras contains progenitors of multiple pulmonary cell lineages
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究使用小鼠-大鼠嵌合体以增强骨髓中的呼吸道前体细胞,以研究其在放射性肺损伤后的贡献 使用小鼠-大鼠嵌合体创造了一个独特的骨髓细胞移植模型,能够提供多种呼吸道细胞类型的前体 研究主要集中在小鼠模型中,尚未在临床转化中验证其有效性 探讨小鼠-大鼠嵌合体中骨髓细胞对放射性肺损伤的修复作用 小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞及其对放射性肺损伤小鼠的贡献 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 造模用小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞和致死性放射照射小鼠
12412 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序研究饮食诱导肥胖下海马微胶质细胞的失调 利用小鼠高脂饮食模型揭示饮食诱导肥胖对海马微胶质细胞活化的深刻影响 关于肥胖期间微胶质细胞活化的确切机制尚未完全理解 探讨肥胖对海马微胶质细胞的影响及其与认知障碍之间的关系 肥胖小鼠模型中的海马微胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA NA 研究了饮食诱导肥胖下的海马微胶质细胞,在高脂饮食下观察了不同时间点的变化
12413 2024-08-05
Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy
2023-03-10, Skeletal muscle IF:5.3Q2
研究论文 本研究调查了静息及失用萎缩后骨骼肌中的细胞外囊泡分布和定位 本文首次揭示了α-鞘糖蛋白和miR-1在血清细胞外囊泡中不可检测,并且细胞外囊泡生物发生因子在多种骨骼肌细胞类型中表达 在大鼠的尾部悬置实验中,未发现血清细胞外囊泡浓度的变化 调查骨骼肌中细胞外囊泡的生物发生因子、标记物表达及其在细胞类型中的定位 研究对象为大鼠和人类模型中的骨骼肌细胞外囊泡 数字病理 NA qPCR、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光相关光谱测量、免疫组化 NA 血清样本 在大鼠和人类模型中均涉及样本
12414 2024-08-04
Conserved Transcriptome Features Define Prepubertal Primate Spermatogonial Stem Cells as Adark Spermatogonia and Identify Unique Regulators
2023-Mar-01, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞,探讨了人类前青春期生精干细胞的分子特征及调控因子 确定了前青春期人类生精干细胞的分子特征,并发现了新的调控通路,这可能有助于其体外选择和传播 尚未确定专门的生物标志物来明确识别前青春期生精干细胞 明确前青春期生精干细胞的分子身份 猕猴、狒狒与人类的生精干细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞
12415 2024-08-05
Cholesterol homeostasis regulated by ABCA1 is critical for retinal ganglion cell survival
2023-02, Science China. Life sciences
研究论文 本文探讨了ABCA1在视网膜神经节细胞存活中的重要性以及其与原发性开角型青光眼的关联 研究表明ABCA1表达降低和HDL水平下降是POAG的风险因素,并提出使用他汀类药物作为预防治疗 研究主要集中在小鼠模型,临床转化需要进一步验证 探明ABCA1与视网膜神经节细胞存活之间的关系及其在原发性开角型青光眼中的作用 主要研究对象为小鼠模型以及POAG患者的白细胞样本 数字病理 原发性开角型青光眼 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞样本和基因表达数据 小鼠模型和POAG患者的血液样本
12416 2024-08-04
A Cdh3-β-catenin-laminin signaling axis in a subset of breast tumor leader cells control leader cell polarization and directional collective migration
2023-01-09, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文探讨了一组乳腺肿瘤领袖细胞如何通过Cdh3-β-catenin-laminin信号轴控制细胞极化和方向性集体迁移 提出了领袖细胞需要生成高推力并克服细胞外基质阻力以引导集体迁移的新机制 研究主要基于体外模型,尚未在体内模型中验证 了解肿瘤细胞如何通过集体迁移进行扩散 乳腺肿瘤细胞及其微环境的相互作用 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序 3D计算模型 视频,细胞序列数据 包括多个小鼠和人类乳腺肿瘤类器官的样本
12417 2024-08-07
Author Correction: Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-Oct-20, BMC biology IF:4.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12418 2024-08-05
Plasma IL-6 levels following corticosteroid therapy as an indicator of ICU length of stay in critically ill COVID-19 patients
2021-Mar-15, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 该研究探讨了在重症COVID-19患者中,皮质类固醇治疗后IL-6水平与ICU住院时长之间的关系 首次提出了皮质类固醇后IL-6水平可能与COVID-19严重程度相关的假设 样本量较小,仅涉及16名患者 探究皮质类固醇治疗后IL-6水平在重症COVID-19患者中的作用 重症COVID-19患者,特别是接受类固醇治疗的患者 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 生物样本(平行组织扫描的细胞数据) 16名重症患者接受治疗,41名未接受治疗的患者
12419 2024-08-05
Transcriptional heterogeneity and tightly regulated changes in gene expression during Plasmodium berghei sporozoite development
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 这篇文章研究了疟原虫孢子虫发育过程中的转录异质性和基因表达变化 首次使用单细胞RNA测序技术揭示孢子虫发育中的基因表达调控及其异质性 尚未深入研究环境因素对孢子虫发育的具体影响 探讨疟原虫孢子虫在蚊子中的发育机制 研究了从中肠包囊到唾液腺发育过程中的16038个孢子虫的基因表达谱 数字病理 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 16038个孢子虫样本
12420 2024-08-05
Investigation of Drosophila fruitless neurons that express Dpr/DIP cell adhesion molecules
2021-02-22, eLife IF:6.4Q1
研究论文 研究表达Dpr/DIP细胞粘附分子的果蝇fruitless神经元的功能和特征 通过对基因组研究的重新分析,发现对性别特异性行为的神经元形态和细胞数量存在性别二态性 未详细介绍实验样本和研究方法的局限性 探讨fruitless神经元在果蝇交配行为中的作用 Drosophila的fruitless神经元 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 NA
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