单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12381 - 12400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12381 | 2024-08-05 |
Generation of ventralized human thalamic organoids with thalamic reticular nucleus
2023-05-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.007
PMID:37019105
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研究论文 | 本研究报告了一种将人类胚胎干细胞转化为具有不同核身份的腹侧丘脑类器官的方法 | 实现了以前未能达到的丘脑模式，展现了丘脑网状核的特征 | 未影响整体丘脑谱系发育的神经功能变化可能限定了结果的适用性 | 探索人类丘脑中核特异性发育与病理的机制 | 使用腹侧丘脑类器官研究TRN特异性与病相关基因的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA |
| 12382 | 2024-08-05 |
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
DOI:10.1093/jncimonographs/lgad014
PMID:37139973
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研究论文 | 本研究探讨了肥胖如何影响人类B细胞急性淋巴细胞白血病的功能 | 使用多组学方法揭示了肥胖相关的B细胞特异性标志与生存结果之间的关联，提供了新的见解 | 研究未提及样本的多样性和肥胖机制的广泛性 | 理解脂肪细胞如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病中的代谢和耐药性 | 正常和恶性B细胞，特别是B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序，质谱 | NA | 血清和血浆样本 | 健康供体和B-ALL患者的样本 |
| 12383 | 2024-08-05 |
Categorization of lung mesenchymal cells in development and fibrosis
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102551
PMID:34151224
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研究论文 | 该文章探讨了肺间充质细胞在发育和纤维化过程中的分类及其转录组特征 | 本研究识别并描绘了一种新的细胞群体，并描述了细胞亚型特异性转录因子 | 未明确提出该研究的具体局限性 | 研究肺间充质细胞的异质性及其在发育和纤维化中的作用 | 小鼠和人类的肺间充质细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胚胎、出生后、成人及老年期的纤维化肺中间充质细胞 |
| 12384 | 2024-08-05 |
The derepression of transposable elements in lung cells is associated with the inflammatory response and gene activation in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-Jun-09, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-021-00241-3
PMID:34108012
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研究论文 | 本文探讨了转座元件在特发性肺纤维化中的去抑制与炎症反应和基因激活的关联 | 研究首次展示了转座元件在特发性肺纤维化患者肺细胞中的失调与基因表达和炎症反应的关联 | 研究中仅使用了24名样本，可能无法全面代表特发性肺纤维化患者的多样性 | 确定转座元件是否与特发性肺纤维化相关 | 健康供体与特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 24名受试者（16名健康供体和8名特发性肺纤维化患者） |
| 12385 | 2024-08-05 |
Uphyloplot2: visualizing phylogenetic trees from single-cell RNA-seq data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07739-3
PMID:34090344
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研究论文 | Uphyloplot2是一种可视化单细胞RNA测序数据的系统。 | 该工具能够直接从推断的RNA-seq数据或Newick格式的树状图文件生成系统发育图，简化了以往繁琐的手动分析。 | 目前没有提及该工具的具体限制。 | 本研究旨在提供一种简单的工具，以从单细胞RNA-seq数据及其他来源生成系统发育图，以展示肿瘤的克隆性。 | 研究对象是通过单细胞RNA测序获得的肿瘤细胞数据。 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 12386 | 2024-08-05 |
Naive stem cell blastocyst model captures human embryo lineage segregation
2021-06-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.031
PMID:33957081
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研究论文 | 本研究描述了一种通过自组织生成的人类胚胎模型（blastoids），模拟了自然的囊胚。 | 该文章创新地提出了一种灵活且可扩展的系统，为人类胚胎研究提供了稳定的实验模型。 | NA | 研究人类胚胎的发育过程及其细胞系分离机制。 | 人类天真多能细胞及其分化成囊胚的过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 12387 | 2024-08-05 |
Pro-cachectic factors link experimental and human chronic kidney disease to skeletal muscle wasting programs
2021-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135821
PMID:34060483
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研究论文 | 本文研究了慢性肾病与骨骼肌消耗之间的联系 | 研究揭示了激活素A在慢性肾病导致的肌肉消耗中的关键作用 | 未提及具体的临床试验数据或人类样本数量 | 探索慢性肾病与骨骼肌消耗之间的信号传递和相互作用 | 实验模型和人类慢性肾病患者的肌肉消耗机制 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞测序 | 小鼠实验模型 | 生物样本 | 不同的小鼠模型 |
| 12388 | 2024-08-05 |
Early precursors and molecular determinants of tissue-resident memory CD8+ T lymphocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2020-05-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz6894
PMID:32414833
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究CD8 T细胞在对病毒感染反应中的基因表达模式 | 揭示了在病毒感染早期，组织中特定CD8 T细胞前体的转录异质性 | 研究可能未涵盖所有组织环境下的CD8 T细胞特征 | 探讨CD8 T细胞在病毒感染中的分化过程 | CD8 T细胞在脾脏和小肠内的特定亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在病毒感染过程中对不同分化阶段的个体CD8 T细胞进行了分析 |
| 12389 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis characterizes common and cell-lineage-specific mutations in a muscle-invasive bladder cancer
2012-Aug-14, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1186/2047-217X-1-12
PMID:23587365
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研究论文 | 这篇文章分析了肌肉浸润性膀胱癌的单细胞突变特征 | 提出了一种在单细胞水平研究膀胱肿瘤遗传细节的新方法 | 该研究可能仅限于特定的肿瘤亚群，未涵盖所有膀胱癌的变异 | 探究肌肉浸润性膀胱癌的遗传演变过程 | 对66个单个肌肉浸润性膀胱同源细胞进行单细胞外显子组测序 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞外显子组测序 | NA | 基因组数据 | 66个肿瘤细胞和99个膀胱癌肿瘤 |
| 12390 | 2024-08-05 |
Modeling acute myocardial infarction and cardiac fibrosis using human induced pluripotent stem cell-derived multi-cellular heart organoids
2024-May-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06703-9
PMID:38693114
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的多细胞心脏类器官建模急性心肌梗死和心脏纤维化 | 该研究通过生成自组织的心脏类器官，首次将心肌细胞、成纤维细胞和内皮细胞的多细胞组成结合在一起，从而模仿人心脏的细胞组成 | 该研究可能在细胞模型的完全功能性和长期稳定性方面存在限制 | 研究旨在创建与临床相关的心脏疾病体外模型，以促进心脏疾病的研究和药物筛选 | 研究对象为使用人诱导多能干细胞生成的心脏类器官 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术、q-PCR | 多细胞模型 | 细胞和组织样本 | NA |
| 12391 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of IL4I1 in human tumors: a bulk omics research and single cell sequencing validation
2024-May-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01000-5
PMID:38691253
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研究论文 | 本研究探讨了IL4I1在多种肿瘤中的预后和免疫学角色 | IL4I1被发现与癌症的预后和免疫细胞浸润密切相关，且可能作为新的治疗靶点 | 研究主要依赖于现有数据库，可能存在数据偏差 | 探索IL4I1在肿瘤中的表达及其与预后和免疫的关系 | IL4I1在多种人类肿瘤中的表达和作用 | 数字病理学 | 肿瘤相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肿瘤样本 |
| 12392 | 2024-08-04 |
Molecular mechanisms underlying the therapeutic effects of Linggui Zhugan decoction in stroke: Insights from network pharmacology and single-cell transcriptomics analysis
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037482
PMID:38552092
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研究论文 | 本研究探讨了灵桂治肝汤在中风治疗中的作用机制 | 首次结合网络药理学和单细胞转录组分析揭示灵桂治肝汤的关键成分、靶点和通路 | 尚未完全阐明其疗效的具体分子机制 | 研究灵桂治肝汤在中风治疗中的分子机制 | 主要研究灵桂治肝汤的活性成分及其靶点 | 数字病理学 | 中风 | 网络药理学和单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据 | 144个潜在靶点与2035个中风相关基因的交集分析 |
| 12393 | 2024-08-04 |
Mechanistic insights into FEN1-mediated drug sensitivity and risk signature in colon cancer: An integrative bioinformatics study
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037517
PMID:38552056
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研究论文 | 本研究探讨了FEN1在结肠癌中的表达及其与临床病理和预后的关系 | 提出了一个由FEN1导出的多基因预后风险标志，并揭示了FEN1表达水平与结肠癌转移潜力及药物敏感性之间的相互作用 | FEN1表达与预后的明显相关性未能得到确认 | 深入探讨FEN1在结肠癌中的作用，尤其是在药物敏感性和预后方面 | 结肠癌患者的FEN1表达及其与转移的关系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序，基因集富集分析，Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus的多个数据集 |
| 12394 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals comprehensive microenvironment and highlights the dysfuntional state of NK cells in endometrioid carcinoma
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037555
PMID:38552055
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了子宫内膜样癌（EEC）中的肿瘤微环境，重点是自然杀伤（NK）细胞的功能异常状态 | 发现了一种CD56dim_DNAJB1 NK细胞亚群，其具有低细胞毒性和高压力水平，显示出NK细胞在肿瘤微环境中的功能失调 | NA | 更好地理解EEC中的肿瘤微环境的多样性 | 21个样本，包括16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织，特别关注肿瘤浸润的NK细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 21个样本（16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织） |
| 12395 | 2024-08-05 |
PD-1 Mediated Regulation of Unique Activated CD8 + T Cells by NK Cells in the Submandibular Gland
2023-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557930
PMID:37745414
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研究论文 | 本文研究了NK细胞如何通过PD-1/PD-L1轴在下颌下腺调控CD8 T细胞的稳态 | 发现PD-1缺乏小鼠的下颌下腺中存在独特的CD8 T细胞群，以及NK细胞在该部位的免疫调节作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏在人体中的验证 | 探讨NK细胞在下颌下腺对CD8 T细胞稳态的调控作用 | PD-1缺乏小鼠及NK细胞缺乏的小鼠模型 | 数字病理学 | 干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及PD-1缺乏和NK细胞缺乏的小鼠样本 |
| 12396 | 2024-08-05 |
Mapping disease regulatory circuits at cell-type resolution from single-cell multiomics data
2023-Jul, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00476-5
PMID:37974651
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法MAGICAL，用于从单细胞多组学数据中映射疾病相关的调控电路 | MAGICAL是一种分层贝叶斯方法，可以同时建模不同条件下的细胞信号变异，实现高准确度的电路推断 | 尽管差异表达分析未能显示预测价值，但MAGICAL仍需验证在不同疾病状态下的普适性 | 研究细胞类型分辨率下与疾病状态相关的基因表达变化 | 通过分析外周血单核细胞数据来研究脓毒症 | 数字病理 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序 | 层次贝叶斯模型 | 单细胞数据 | 生成的样本包括感染和未感染对照的外周血单核细胞数据 |
| 12397 | 2024-08-04 |
Delivery of mitochondria confers cardioprotection through mitochondria replenishment and metabolic compliance
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.02.016
PMID:36805084
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体移植在心力衰竭中的保护作用及其机制 | 研究揭示了线粒体移植通过恢复心脏功能和代谢适应性来保护心脏 | 未明确讨论线粒体移植的长期效果及其临床应用的挑战 | 旨在研究线粒体移植在心力衰竭中的效果及机制 | 研究对象为两种不同模型的心力衰竭，包括多柔比星诱导的心力衰竭模型和人诱导的多能干细胞衍生的心肌细胞模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 线粒体移植、单细胞RNA测序 | 人诱导的多能干细胞衍生心肌细胞模型 | RNA序列 | NA |
| 12398 | 2024-08-05 |
Tissue nanotransfection causes tumor regression by its effect on nanovesicle cargo that alters microenvironmental macrophage state
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.11.003
PMID:36380587
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研究论文 | 本研究首次报告了肿瘤来源的细胞外囊泡的纳米尺度荧光可视化，揭示了其对小鼠肿瘤相关巨噬细胞状态的影响 | 揭示了肿瘤源性囊泡携带的miR-126对肿瘤相关巨噬细胞状态改变的肿瘤发生机制 | 未提及具体的临床研究数据或在人类模型中的应用 | 研究肿瘤来源的细胞外囊泡如何影响肿瘤相关巨噬细胞并导致肿瘤退缩 | 主要研究对象是肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤来源的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肿瘤 | 纳米转染技术 | 小鼠肿瘤模型 | 分子和基因表达数据 | 涉及的样本数量未具体列出 |
| 12399 | 2024-08-05 |
Determination of the nanoparticle- and cell-specific toxicological mechanisms in 3D liver spheroids using scRNAseq analysis
2022-Dec, Nano today
IF:13.2Q1
DOI:10.1016/j.nantod.2022.101652
PMID:36911538
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研究论文 | 本研究探讨了纳米颗粒在3D肝脏类球体中对肝细胞的毒理学机制 | 使用单细胞RNA测序(scRNAseq)分析不同纳米材料对肝细胞和库普弗细胞的特异性毒性反应 | 未提及具体的局限性 | 研究纳米颗粒对肝细胞的影响及其毒理学机制 | 3D肝脏类球体中的肝细胞和库普弗细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 三种不同材料成分的体外3D肝脏类球体模型 |
| 12400 | 2024-08-05 |
Pooled CRISPR-activation screening coupled with single-cell RNA-seq in mouse embryonic stem cells
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100426
PMID:33899013
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研究论文 | 本文提出了一种在小鼠胚胎干细胞中进行归并CRISPR激活筛选和单细胞RNA测序的协议 | 创新性地将归并CRISPR/Cas9筛选与单细胞RNA测序结合，实现了在细胞水平上无偏见地评估基因功能和调控 | 本文未提及具体的限制因素 | 研究目的在于识别生物过程中关键调控因子 | 研究对象为小鼠胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |