单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27458 篇文献，本页显示第 12381 - 12400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12381 | 2024-08-04 |
ALDH2 as an immunological and prognostic biomarker: Insights from pan-cancer analysis
2024-Apr-19, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037820
PMID:38640328
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研究论文 | 本研究全面评估了ALDH2在全癌症中的重要性 | 首次揭示了ALDH2与多种癌症类型及其免疫微环境的关联 | 尚未深入探讨ALDH2在各癌症类型中的具体机制 | 研究ALDH2在全癌症中的免疫学和预后生物标志物作用 | 分析ALDH2在不同癌症类型中的表达与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 跨16种不同癌症类型的肿瘤及正常组织样本 |
| 12382 | 2024-08-04 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究探讨了在乙酰氨基酚诱导的肝损伤中，髓系Mas信号通路对细胞间病理性交互的调节作用 | 首次揭示了髓系Mas在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用，提供了细胞间相互作用的新视角 | 未明确Mas在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制和细分功能 | 研究髓系Mas信号通路在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用 | MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和动态观测成像 | NA | 生物样本 | 来自急性肝衰竭患者的样本 |
| 12383 | 2024-08-05 |
Identification of a distinct cluster of GDF15high macrophages induced by in vitro differentiation exhibiting anti-inflammatory activities
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1309739
PMID:38655264
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研究论文 | 本文研究了在体外分化中诱导的GDF15high巨噬细胞的特征及其抗炎活性 | 本研究首次识别出一种GDF15high巨噬细胞亚群，并揭示其独特的分子特征和抗炎功能 | 无法排除体外诱导协议对GDF15high巨噬细胞抗炎表型的影响 | 探讨GDF15high巨噬细胞的身份及其在炎症反应中的角色 | 来源于人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞的GDF15high巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA | 约1%的人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞中带有GDF15high表型的细胞 |
| 12384 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1418495
PMID:38711509
|
更正 | 这篇文章是对先前发表文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12385 | 2024-08-05 |
Alteration of Thyroid Hormones in Mouse Models of Alzheimer's Disease and Aging
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000536089
PMID:38228117
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病和衰老小鼠模型中甲状腺激素的变化 | 本研究首次揭示了免疫细胞浸润与甲状腺激素变化之间的潜在机制 | 研究仅限于小鼠模型，临床应用需要进一步验证 | 探讨甲状腺激素与阿尔茨海默病及衰老之间的关系 | FAD4T小鼠模型和自然衰老小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | FAD4T小鼠和自然衰老小鼠的甲状腺样本 |
| 12386 | 2024-08-05 |
Impaired Reorganization of Centrosome Structure Underlies Human Infantile Dilated Cardiomyopathy
2023-04-25, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了中心粒缺陷导致的人类婴儿扩张型心肌病的机制 | 首次将中心粒缺陷与非综合征型扩张型心肌病相关联，并发现RTTN在心脏发育中的新角色 | 该研究仅基于一名患者，可能无法广泛适用 | 探讨中心粒结构重组的障碍如何影响心肌细胞生物学及其与人类心脏疾病的关系 | 一名罕见的婴儿扩张型心肌病(I-DCM)患者 | 心血管疾病 | 扩张型心肌病 | CRISPR/Cas9基因敲除和校正、单细胞RNA测序 | 斑马鱼和果蝇 | 基因组数据、细胞数据 | 单个患者样本及其父母的全外显子组 |
| 12387 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181697
PMID:37180171
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研究论文 | 本文旨在识别与脓毒症免疫功能障碍相关的差异表达脂质代谢基因。 | 通过机器学习算法筛选出关键的脂质代谢相关中心基因，揭示了脓毒症中的免疫抑制微环境。 | 未提及具体的样本来源和大小，可能限制结果的普遍适用性。 | 探讨脓毒症中脂质代谢失衡与免疫反应的关系。 | 脓毒症患者与健康对照者的脂质代谢相关基因及相关免疫功能。 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE) | 基因数据 | 508个差异表达脂质代谢相关基因 |
| 12388 | 2024-08-05 |
Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions
2023, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20153.1
PMID:38707493
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研究论文 | 该研究调查了在神经性疼痛和非神经性疼痛情况下，脑脊液中的免疫细胞是否相似 | 结果表明，无论疼痛的病因如何，免疫细胞的数量和表型并没有明显差异，挑战了脑脊液作为微胶质细胞活化的生物标志物的有效性 | 该研究未能确定脑脊液中蛋白质的确切来源，是否直接来自于循环脑脊液单核细胞或源于脊髓微胶质细胞 | 本研究旨在探讨脑脊液是否可以用作人类微胶质细胞活化的代理测量 | 分析来自遭受神经性特征疼痛的个体的脑脊液免疫细胞群体 | 数字病理学 | 神经性疼痛 | RNA测序，CITE测序 | NA | 生物样本（脑脊液免疫细胞） | 分析了忍受神经性疼痛的个体的免疫细胞群体，样本大小未具体说明 |
| 12389 | 2024-08-05 |
Single-cell deletion analyses show control of pro-T cell developmental speed and pathways by Tcf7, Spi1, Gata3, Bcl11a, Erg, and Bcl11b
2022-05-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abm1920
PMID:35594339
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研究论文 | 该文章研究了个别转录因子在早期T细胞发育中的控制作用。 | 揭示了在T细胞承诺前期，不同转录因子之间的动态平衡和意外指导性作用。 | 该研究主要集中在单细胞分析，可能无法全面反映在整体细胞群体中的复杂交互。 | 探讨转录因子如何在早期T细胞发育过程中控制发育速度和选择路径。 | 研究对象为早期T细胞前体及其转录因子的功能。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR基因破坏 | NA | 基因表达数据 | 使用多个单细胞样本进行分析 |
| 12390 | 2024-08-05 |
Comprehensive RNA analysis of CSF reveals a role for CEACAM6 in lung cancer leptomeningeal metastases
2021-Oct-08, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00228-6
PMID:34625644
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研究论文 | 本研究综合使用单细胞RNA测序和游离RNA分析，揭示了CEACAM6在肺癌脑膜转移中的作用。 | 将单细胞RNA-seq与cfRNA分析结合，为NSCLC脑膜转移的诊断和机制提供了新的视角。 | 由于CSF中的癌细胞数量稀少，样本量有限，难以全面代表所有患者情况。 | 研究CEACAM6在肺癌脑膜转移中的作用及其基因表达特征。 | 怀疑有脑膜转移的非小细胞肺癌患者的脑脊液样本。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq，qPCR | NA | 细胞学，RNA数据 | 总共21个样本（14个脑膜转移患者，7个非肿瘤对照） |
| 12391 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into the hematopoietic generation of T-lymphocyte precursors in mouse and human
2021-03, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.12.005
PMID:33454362
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评论 | 该文章综述了小鼠和人类早期T细胞祖细胞的单细胞转录组研究 | 文章揭示了小鼠和人类之间在T细胞发育中的核心程序和物种间的变异 | 研究主要集中于胎儿和严格纯化的后天样本，可能缺乏其他发育阶段的全面性 | 旨在探讨T细胞潜能的分子要求及其早期发展 | 研究对象为小鼠和人类的早期T细胞祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胎儿及后天严格纯化的样本 |
| 12392 | 2024-08-05 |
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00941-x
PMID:33472616
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研究论文 | 这篇文章探讨在标准样本制备条件下，混合来自无关供体的外周血单核细胞是否会引起可检测的异体反应。 | 首次评估在标准scRNA-seq样本制备条件下，混合外周血单核细胞是否导致显著的基因表达变化。 | 未考虑在其他样本制备条件下的潜在异体反应。 | 确定在单细胞RNA测序中的样本混合是否引起异体反应。 | 外周血单核细胞（PBMCs）来自无关供体。 | 数字病理学 | NA | 10x Genomics scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 一个供体的PBMCs，与无关供体的PBMCs混合 |
| 12393 | 2024-08-05 |
ZipSeq: barcoding for real-time mapping of single cell transcriptomes
2020-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0880-2
PMID:32632238
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研究论文 | 本文提出了一种名为‘ZipSeq’的方法，用于在活组织中实时映射单细胞转录组。 | 创新点在于使用图案照明和光封闭的寡核苷酸即时为活细胞打印条形码，解决了细胞位置与转录组关联的局限性。 | 目前方法在实时定位细胞转录组方面存在不同的局限性。 | 本研究旨在提高细胞转录组数据与细胞在三维空间中位置的整合能力。 | 研究对象包括体外创伤愈合、活淋巴结切片和活肿瘤微环境中的细胞。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 光照和光封闭的寡核苷酸 | NA | 基因表达数据 | 在各种设置中发现新的基因表达模式，具体样本数量未提及 |
| 12394 | 2024-08-05 |
Building a Human Thymus: A Pointillist View
2019-11-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.10.003
PMID:31747579
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序分析稀有样本，探讨人类胎儿早期的胸腺基质细胞类型及其相关的T淋巴细胞发展 | 阐明了早期人类胎儿中胸腺基质细胞类型和T淋巴细胞的发育过程 | 样本稀有，可能限制结果的普遍适用性 | 研究胸腺基质细胞的来源及早期T淋巴细胞的形成 | 早期人类胎儿的胸腺相关细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 稀有样本 |
| 12395 | 2024-08-04 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-Feb-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1
PMID:38463959
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研究论文 | 本研究探讨了TPOm如何刺激骨髓血管和基质生态位，以减轻急性辐射综合症（ARS） | 揭示了TPOm对促进骨髓内造血干细胞（HSPCs）再生的作用，及其影响骨髓血管和基质生态位的机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在临床应用中的有效性尚需进一步验证 | 研究TPOm在急性辐射综合症（ARS）中的疗效和机制 | 以小鼠作为模型研究对象 | 数字病理 | 急性辐射综合症 | RNA-seq | NA | 组织学、流式细胞术、单细胞RNA测序 | C57BL/6J小鼠（9-14周龄），样本数量未明确说明 |
| 12396 | 2024-08-05 |
Intrahepatic IgA complex induces polarization of cancer-associated fibroblasts to matrix phenotypes in the tumor microenvironment of HCC
2024-Feb-15, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000772
PMID:38466639
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研究论文 | 本研究揭示了IgA复合物对肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中癌相关成纤维细胞（CAFs）的影响 | 首次阐明了肝内IgA如何诱导HCC-CAFs朝向更恶性基质表型极化 | 本研究的样本量相对较小，仅分析了50个HCC样本 | 探讨IgA复合物在HCC肿瘤微环境中对CAFs的作用 | 从HCC样本中分离的癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 50个HCC样本 |
| 12397 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of the retina shows that LDHA regulates pathogenesis of autoimmune uveitis
2024-02, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103160
PMID:38160538
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研究论文 | 本文研究了LDHA在自身免疫性葡萄膜炎中对病理发生的调节作用 | 研究发现LDHA的抑制可以恢复炎症下T效应细胞和T调节细胞的不平衡，并揭示了其在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 未提及具体的临床数据或者长期观察结果 | 旨在揭示自身免疫性葡萄膜炎中视网膜损伤的细胞动态和致病机制 | 实验自身免疫性葡萄膜炎小鼠及葡萄膜炎患者外周血单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 实验中使用了自身免疫性葡萄膜炎小鼠和人类患者的样本 |
| 12398 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals a pathogenic role of cytotoxic CD4+ T cells in giant cell arteritis
2024-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103124
PMID:37952293
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研究论文 | 本研究揭示了细胞毒性CD4+ T细胞在巨细胞动脉炎中的致病作用 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析深入探讨了CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的作用 | 研究可能受到样本大小限制，仅包括八名巨细胞动脉炎患者和八名健康对照 | 进一步阐明CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的角色 | 114,799个循环CD4 T细胞来源于活动性和缓解期的巨细胞动脉炎患者与健康对照 | 数字病理学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析 | NA | 细胞数据 | 114,799个CD4 T细胞，来自8名巨细胞动脉炎患者和8名健康对照 |
| 12399 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics uncovers a non-autonomous Tbx1-dependent genetic program controlling cardiac neural crest cell development
2023-03-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37015-9
PMID:36941249
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研究论文 | 这篇文章揭示了一个非自主的Tbx1依赖的基因程序，该程序控制心脏神经嵴细胞的发展 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了心脏神经嵴细胞的动态转变及其在Tbx1缺失下的非自主变化 | 未提及研究的限制 | 探讨心脏神经嵴细胞在发育过程中的命运动态 | 对照小鼠胚胎和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自对照小鼠和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞 |
| 12400 | 2024-08-05 |
BOMA, a machine-learning framework for comparative gene expression analysis across brains and organoids
2023-02-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100409
PMID:36936070
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研究论文 | 本研究提出了一种机器学习框架BOMA，用于比较大脑和类器官之间的基因表达分析 | 开发了一种全球对齐和局部细化的机器学习框架，能够揭示大脑和类器官间保护的和特定的发育轨迹 | 没有提到具体的局限性 | 旨在比较和分析大脑与类器官之间的基因表达差异 | 研究对象为人类大脑和人类类器官，以及非人灵长类动物的大脑 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用多个人类大脑和类器官的样本，具体数量未说明 |