单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 12381 - 12400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12381 | 2024-08-05 |
Cardiopulmonary progenitors facilitate cardiac repair via exosomal transfer of miR-27b-3p targeting the SIK1-CREB1 axis
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13593
PMID:38185757
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研究论文 | 这篇文章探讨了心肺前体细胞在心脏修复中的作用，特别是通过外泌体转移miR-27b-3p靶向SIK1-CREB1轴来促进心脏修复 | 该研究首次揭示心肺前体细胞通过外泌体转移miR-27b-3p促进心脏修复的机制 | 研究只在小鼠模型中进行，临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证 | 研究心肺前体细胞在缺血性心脏疾病中修复受损心脏的机制 | 本研究对象为小鼠胚胎衍生的心肺前体细胞 | 数字病理学 | 缺血性心脏病 | scRNA-seq, miRNA-seq, RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 细胞, RNA | 使用E9.5小鼠胚胎获取心肺前体细胞，具体样本数量未提及 |
| 12382 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a lactate metabolism-related six-gene prognostic signature in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-16, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05723-4
PMID:38627278
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研究论文 | 本文揭示了乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用，并构建了一个可靠的乳酸代谢相关预后标志。 | 文章首次系统性地识别和验证了与乳酸代谢相关的六个基因的预后标志，提供了新思路用于肝内胆管癌的预后评估和治疗。 | 研究对乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学功能的探索仍然有限，需要更多的临床数据来验证。 | 研究目的是明确乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用，开发预后工具。 | 研究对象为肝内胆管癌患者及其相关细胞系。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 高和低乳酸代谢相关基因得分组中的患者样本 |
| 12383 | 2024-08-04 |
Casp11 Deficiency Alters Subgingival Microbiota and Attenuates Periodontitis
2024-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231221712
PMID:38197150
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研究论文 | 本研究探讨了Caspase-11介导的非经典焦亡、亚龈微生物群变化与巨噬细胞极化之间的相互作用 | 揭示了Caspase-11在牙周炎病理生理过程中的关键作用，并强调其对亚龈微生物群和巨噬细胞M1极化的影响 | 具体机制尚不清楚，需进一步研究以验证这些发现 | 探讨Caspase-11缺失对亚龈微生物群及牙周炎的影响 | 牙周炎患者的临床样本以及实验性牙周炎小鼠模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 临床样本 | 牙周炎患者的临床样本及实验性小鼠模型 |
| 12384 | 2024-08-05 |
Identification of CFH and FHL2 as biomarkers for idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1363643
PMID:38784225
|
研究论文 | 本研究识别了CFH和FHL2作为特发性肺纤维化的生物标志物 | 本研究首次确认CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的诊断价值 | 该研究缺乏长期临床验证，临床适用性尚需进一步评估 | 研究CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的作用及其与免疫细胞的关系 | 特发性肺纤维化相关的关键基因及其在免疫细胞中的表达 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 基因微阵列分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 两组数据共涉及647个差异表达基因 |
| 12385 | 2024-08-05 |
CONSTRUCTION OF SEPSIS DIAGNOSTIC MODELS AND IDENTIFICATION OF MACROPHAGE SUBPOPULATIONS BASED ON PYROPTOSIS-RELATED GENES
2023-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002137
PMID:37179249
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研究论文 | 本文构建了基于炎性细胞死亡相关基因的败血症诊断模型，并识别了巨噬细胞亚群 | 创新点在于基于10种关键炎性细胞死亡相关基因构建败血症风险评分，并确定了一种与预后相关的巨噬细胞亚群 | 研究局限性在于样本来源仅依赖公共数据库，可能忽略了临床样本的多样性 | 研究炎性细胞死亡在败血症患者中的预后和诊断价值 | 研究对象包括败血症患者的单细胞和总体RNA序列数据 | 数字病理 | 败血症 | RNA-seq | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 根据公共数据库进行分析，样本数量未明确 |
| 12386 | 2024-08-04 |
Concerted epithelial and stromal changes during progression of Barrett's Esophagus to invasive adenocarcinoma exposed by multi-scale, multi-omics analysis
2023-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.544265
PMID:37333362
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研究论文 | 本研究通过多规模、多组学分析揭示了巴雷特食管进展为侵袭性腺癌过程中的上皮和基质的变化 | 整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白组学等多个组学的分析，揭示了肿瘤进程的共享特征和患者特异特征 | 该研究样本数量相对较少，且仅限于特定患者的病理进程 | 探讨巴雷特食管向侵袭性腺癌进展中的生物学变化 | 分析来自12名患者的64个样本，研究其从鳞状上皮到腺癌的发展路径 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞转录组学，细胞外基质蛋白组学，组织力学，空间蛋白组学 | NA | 样本 | 64个样本来自12名患者 |
| 12387 | 2024-08-04 |
Single-Cell and Spatial Transcriptome Analysis of Dermal Fibroblast Development in Perinatal Mouse Skin: Dynamic Lineage Differentiation and Key Driver Genes
2024-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.11.008
PMID:38072389
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和空间转录组学研究了胎儿鼠皮肤中真皮成纤维细胞的发展 | 首次系统分析了不同发育阶段的单细胞RNA测序数据，并识别了多个重要驱动基因 | 主要集中在小鼠的发育阶段，可能不适用于其他物种或更广泛的生物学过程 | 探讨皮肤发育过程中真皮成纤维细胞的动态谱系分化及其关键驱动基因 | 聚焦于不同发育阶段小鼠皮肤的真皮成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA数据 | 多个阶段的小鼠样本（胚胎13.5天，14.5天，16.5天和出生后0天，2天，4天） |
| 12388 | 2024-08-05 |
Hepatic organoids move from adolescence to maturity
2024-Jun, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15893
PMID:38451053
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研究论文 | 这篇文章探讨了肝脏类器官在肝脏研究中的贡献和未来发展 | 指出肝脏类器官在基本研究、药物发现和疾病病理生物学理解方面的四种先进应用 | 没有具体提及研究的局限性 | 旨在评估肝脏类器官在肝脏疾病研究中的应用 | 肝脏类器官及其在不同领域的应用 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序和CRISPR技术 | 类器官模型 | 细胞和组织 | NA |
| 12389 | 2024-08-04 |
Multiregional transcriptomics identifies congruent consensus subtypes with prognostic value beyond tumor heterogeneity of colorectal cancer
2024-May-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48706-2
PMID:38773143
|
研究论文 | 研究多区域转录组学在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤异质性的影响 | 首次通过多区域转录组学探究了结直肠癌中的凝聚共识分型及其预后能力 | 该研究仅基于单个医院的样本，可能限制了结果的广泛适用性 | 评估转录组异质性对结直肠癌预后的影响及其分类能力 | 对来自692名患者的1093个肿瘤样本进行研究，包括98个原发肿瘤和35对原发-转移样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 1093个肿瘤样本，来自692名患者 |
| 12390 | 2024-08-04 |
A comparative study on the dose-effect of low-dose radiation based on microdosimetric analysis and single-cell sequencing technology
2024-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62501-5
PMID:38773212
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研究论文 | 本研究探讨了低剂量辐射对BEAS-2B细胞系的潜在机制 | 使用微剂量分析和单细胞测序技术，提供了选择对低剂量辐射反应敏感生物标志物的新视角 | 研究中的数值不确定性可能影响微剂量与基因表达的相关性 | 深入探索低剂量辐射诱发的生物机制 | BEAS-2B细胞系及其对低剂量辐射的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 蒙特卡罗模型 | 细胞能量分布和基因表达数据 | NA |
| 12391 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of KLF family reveals KLF6 as a promising prognostic and immune biomarker in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-May-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03369-3
PMID:38773440
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研究论文 | 本研究全面分析了KLF家族，并揭示KLF6作为胰腺导管腺癌中有前景的预后和免疫生物标志物 | 本研究提出KLF6是胰腺导管腺癌中一个新的诊断生物标志物，并作为潜在治疗靶点 | 未在临床上验证KLF6的作用及其作为生物标志物的应用效果 | 探讨KLF家族基因在胰腺导管腺癌中的生物学功能及其临床意义 | 研究胰腺导管腺癌中的KLF家族基因及其表达模式 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox回归模型 | 转录组数据 | 包含了大量胰腺癌患者的转录组样本 |
| 12392 | 2024-08-05 |
Dynamic changes in B cell subpopulations in response to triple-negative breast cancer development
2024-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60243-y
PMID:38773133
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研究论文 | 本文探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）发展过程中B细胞亚群的动态变化 | 本研究揭示了LAG-3 + B细胞在三阴性乳腺癌中的潜在良好预后意义，并提出其可能成为靶向治疗的新方向 | 需要更多研究来揭示这些细胞的机制路径，并在更大、更多样化的患者群体中验证其预后价值 | 研究B细胞在三阴性乳腺癌发展过程中的响应变化及其预后关联 | 使用小鼠模型探讨B细胞在肿瘤相关淋巴结中的反应 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 研究涉及TNBC患者的转录组数据 |
| 12393 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals a myeloid cell-related regulon predicting neoadjuvant immunotherapy response across cancers
2024-May-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05123-9
PMID:38773508
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研究论文 | 本文分析了肿瘤免疫治疗响应相关的髓系细胞调控系统 | 识别了与免疫检查点抑制剂响应相关的PPARG调控单元，并构建了髓系细胞图谱 | 研究主要集中在特定癌症种类上，可能不适用于所有癌症类型 | 探索肿瘤患者对免疫治疗的反应机制 | 从肺腺癌患者中提取的单细胞RNA测序数据和大规模的全癌种数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 1名肺腺癌患者的预处理和后处理样本，以及多个癌症类型的大规模数据集 |
| 12394 | 2024-08-05 |
Tenascin C as a novel zinc finger protein 750 target regulating the immunogenicity via DNA damage in lung squamous cell carcinoma
2024-May-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12285-8
PMID:38711034
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研究论文 | 本研究揭示了锌指蛋白750（ZNF750）通过调节tenascin C（TNC）在肺鳞状细胞癌中的免疫原性和DNA损伤修复机制 | 首次提出ZNF750-TNC轴在肺鳞状细胞癌中的作用，以及其对免疫原性和DNA损伤修复的影响 | 尚未在临床环境中验证研究结果 | 探讨ZNF750-TNC轴在肺鳞状细胞癌中对DNA损伤修复和免疫原性的调节作用 | 研究对象为肺鳞状细胞癌中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 肺鳞状细胞癌样本的单细胞测序数据 |
| 12395 | 2024-08-04 |
scmFormer Integrates Large-Scale Single-Cell Proteomics and Transcriptomics Data by Multi-Task Transformer
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307835
PMID:38483032
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研究论文 | 提出了一种新的单细胞多模态/多任务变换器 scmFormer，以整合单细胞蛋白组学与其他组学数据 | scmFormer 通过系统基准测试展示了在整合大规模单细胞多模态数据和异质多批次配对多组学数据方面的优势 | NA | 研究旨在填补整合单细胞蛋白组学和其他组学数据的现有空白 | 主要研究对象为大规模单细胞多组学数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞 RNA 测序 | 变换器 | 细胞数据 | 超过 148 万个细胞 |
| 12396 | 2024-08-05 |
Specific lineage transition of tumor-associated macrophages elicits immune evasion of ascitic tumor cells in gastric cancer with peritoneal metastasis
2024-05, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-024-01486-6
PMID:38460015
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研究论文 | 本研究系统评估了腹水中与肿瘤相关的巨噬细胞的特定谱系转变以及其对胃癌伴腹膜转移的免疫逃逸的影响 | 首次识别了来自PM-GC患者腹水中的CTShigh到C1Qhigh巨噬细胞的免疫抑制转变 | 本研究的局限性在于样本数量和来源的多样性可能影响结果的普遍性 | 旨在探讨腹水中肿瘤微环境在胃癌伴腹膜转移中的免疫抑制作用及其导致治疗失败的机制 | 研究对象为51名PM-GC患者的63个腹水样本和43个外周血样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 生物样本 | 51名PM-GC患者的63个腹水样本和43个外周血样本 |
| 12397 | 2024-08-05 |
Tumor-infiltrating monocytic myeloid-derived suppressor cells contribute to the development of an immunosuppressive tumor microenvironment in gastric cancer
2024-03, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-023-01456-4
PMID:38217732
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研究论文 | 本研究探讨了不同免疫抑制细胞在胃癌免疫微环境发展中的作用 | 识别了肿瘤浸润的单核细胞来源抑制性细胞在胃癌免疫抑制微环境中的关键作用，尤其是IER3+ M-MDSCs | 研究主要集中于未治疗或对免疫检查点抑制剂(Ici)有抵抗性的胃癌患者的样本 | 探讨不同免疫抑制细胞类型在胃癌免疫微环境中的作用 | 未治疗或对免疫检查点抑制剂抵抗的胃癌患者的样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和多重免疫染色 | NA | 基因表达数据 | 未处理或免疫检查点抑制剂抵抗的胃癌患者样本 |
| 12398 | 2024-08-04 |
Network Analysis of Osteoarthritis Progression Using a Steiner Minimal Tree Algorithm
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S438407
PMID:38779430
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研究论文 | 本文提供了与骨关节炎相关基因的综合分析 | 采用Steiner最小树算法分析骨关节炎进展及发现新的生物分子 | 未提及研究的局限性 | 分析与骨关节炎相关的基因及其生物通路 | 与骨关节炎相关的177个基因 | 数字病理学 | 骨关节炎 | Steiner最小树算法 | NA | 基因数据 | 从187项研究中收集了177个与骨关节炎显著相关的基因 |
| 12399 | 2024-08-04 |
Overactivated MX1 Positive Natural Killer Cells Promote the Progression of Sepsis-Induced Acute Respiratory Distress Syndrome
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S460259
PMID:38779429
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研究论文 | 本研究探讨了在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中MX1阳性自然杀伤(NK)细胞的特征及其对疾病进展的影响 | 本研究首次识别出在脓毒症诱导的ARDS中独特的MX1+NK细胞群体，并揭示其在疾病进展中的作用 | 由于样本数量有限，需要更大规模的样本进行进一步探索 | 探讨脓毒症诱导的ARDS中NK细胞的特征及其在疾病中的作用 | 本研究以115名脓毒症患者为对象，其中包括63名发展为ARDS的患者 | 数字病理 | 急性呼吸窘迫综合征 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 转录组数据，细胞群体数据 | 总共分析了115名脓毒症患者，其中63名发展为ARDS，52名未发展为ARDS |
| 12400 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics: A Powerful Tool in Disease Understanding and Drug Discovery
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.95908
PMID:38773973
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研究论文 | 本文章介绍了空间转录组学在疾病理解和药物发现中的应用 | 空间转录组学作为一种新兴技术，提供了基因表达的空间信息，有助于药物靶点发现 | 当前在空间转录组学研究中仍存在许多挑战和问题需要解决 | 探讨空间转录组学在药物发现中的潜力和应用 | 空间转录组学的分析策略及其在新的靶点发现和药物机制解析中的应用 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |