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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2026-03-19 |
Reconstructing Coherent Functional Landscape From Multi-Modal Multi-Slice Spatial Transcriptomics by a Variational Spatial Gaussian Process
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520423
PMID:41521465
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研究论文 | 本文提出了一种名为stVGP的变分空间高斯过程框架,用于从多模态、多切片空间转录组数据中对齐、整合和重建空间相干功能域 | stVGP通过将空间高斯过程与空间分层Transformer结合,支持虚拟组织切片生成,实现连续3D重建和未采样区域的基因表达插值,并能从组织学图像中跨模态生成基因表达 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个统一、可扩展的框架,用于从多模态、多切片空间转录组数据中建模复杂组织和发育系统的3D空间景观 | 多模态、多切片空间转录组数据集,包括人类乳腺癌样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 变分空间高斯过程框架,结合空间分层Transformer | 空间转录组数据,组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1222 | 2026-03-19 |
HMGB2-RAD21 Axis Promotes Fibro/Adipogenic Progenitor Proliferation and Regulates Fat Infiltration
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514363
PMID:41524172
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析猪胚胎肌肉,揭示了HMGB2-RAD21轴调控纤维/脂肪祖细胞增殖并影响肌肉间脂肪浸润的分子机制 | 首次构建了猪胚胎纤维/脂肪祖细胞的发育图谱,并鉴定出HMGB2亚群作为调控祖细胞池大小的关键决定因素 | 研究主要基于猪和小鼠模型,在人类疾病中的直接应用仍需进一步验证 | 探究肌肉间脂肪浸润的分子和细胞机制,以改善肉类品质并缓解病理性的脂肪浸润 | 猪胚胎肌肉组织和小鼠模型中的纤维/脂肪祖细胞 | 单细胞测序 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 猪胚胎肌肉样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1223 | 2026-03-19 |
Cross-scale causal inference integrated with single-cell profiling and molecular simulations reveals a macrophage CSF1R-CD68-LYZ axis linking benzo[a]pyrene to erectile dysfunction
2026-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2026.109169
PMID:41548764
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、网络毒理学、分子模拟和单细胞RNA测序,揭示了苯并[a]芘暴露通过巨噬细胞CSF1R-CD68-LYZ轴导致勃起功能障碍的分子机制 | 首次采用跨尺度因果推断方法,结合单细胞分析和分子模拟,系统阐明了环境污染物苯并[a]芘诱发勃起功能障碍的巨噬细胞特异性分子通路 | 研究结果主要基于计算分析和单细胞数据,未来需要通过实验验证靶点并探索针对巨噬细胞驱动炎症的治疗策略 | 探究环境污染物苯并[a]芘暴露与勃起功能障碍之间的因果关系及分子机制 | 巨噬细胞及相关基因(CSF1R、CD68、LYZ)在苯并[a]芘诱导勃起功能障碍中的作用 | 计算生物学 | 勃起功能障碍 | 孟德尔随机化、网络毒理学、分子模拟、单细胞RNA测序、虚拟基因敲除 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1224 | 2026-03-19 |
Immune Predictors of Radiotherapy Outcomes in Cervical Cancer
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509784
PMID:41560673
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习,揭示了宫颈癌放疗后免疫微环境的动态重塑,并开发了预测放疗预后的模型 | 首次结合单细胞转录组学与机器学习识别宫颈癌放疗的免疫预测因子,并发现C3/C3AR1轴介导的上皮-髓系细胞互作关键作用 | 研究主要基于单细胞数据和小鼠模型,临床验证样本有限,需进一步大规模队列验证 | 探索宫颈癌放疗疗效的免疫预测因子并开发预后预测模型 | 宫颈癌患者样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 多层感知机 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1225 | 2026-03-19 |
PARPi Combining Nanoparticle LIN28B siRNA for the Management of Malignant Ascites
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510547
PMID:41572432
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向递送LIN28B siRNA的纳米颗粒联合PARP抑制剂BMN673的协同治疗策略,用于治疗恶性腹水 | 首次将LIN28B表达上调与DNA修复通路失调确定为恶性浆液性积液的两个主要特征,并开发了siRNA纳米颗粒递送系统与PARP抑制剂的联合疗法 | 研究主要在临床前卵巢癌模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对恶性腹水的有效治疗策略 | 恶性浆液性积液(恶性胸水和恶性腹水) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1226 | 2026-03-19 |
SiCmiR Atlas: Single-Cell miRNA Landscape Reveals Hub-miRNA and Network Signatures in Human Cancers
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514446
PMID:41691474
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研究论文 | 本文介绍了SiCmiR,一种基于双层神经网络的工具,用于从单细胞RNA测序数据预测miRNA表达,并构建了首个单细胞成熟miRNA表达图谱数据库SiCmiR-Atlas | 开发了首个能够从少量基因预测单细胞miRNA表达的双层神经网络,并创建了包含数百万细胞和多种细胞类型的首个单细胞miRNA表达专用数据库 | 依赖于TCGA数据训练,可能对未见癌症类型或药物扰动的泛化能力有限,且预测基于基因表达而非直接测量miRNA | 揭示单细胞水平miRNA在人类癌症中的调控网络和生物标志物 | 人类癌症中的miRNA表达谱,包括肝癌、胰腺导管癌、垂体腺瘤和胶质母细胞瘤等 | 机器学习 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序,miRNA-mRNA配对分析 | 双层神经网络 | 基因表达数据,miRNA表达数据 | 6,462个TCGA配对miRNA-mRNA样本,362个公共数据集,936万细胞,726种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1227 | 2026-03-19 |
Dual-Target ROS-Driven Spatiotemporal Senolysis for Vascular Repair and Immune Microenvironment Reprogramming in the Treatment of Ocular Fundus Neovascularization
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523495
PMID:41698122
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研究论文 | 本研究开发了一种可注射的ROS响应性衰老细胞清除水凝胶(PCC1/PHCF-Gel),用于治疗眼底部新生血管,通过选择性清除衰老内皮细胞和小胶质细胞,重塑血管免疫微环境 | 开发了一种新型的ROS响应性、病灶激活的衰老细胞清除水凝胶,实现了PCC1的持续眼内释放,并首次通过单细胞RNA测序揭示了其对CXCR4+内皮细胞和IFITM3+小胶质细胞两种致病性衰老细胞亚群的选择性清除作用 | 研究主要在氧诱导视网膜病变和脉络膜新生血管动物模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发一种针对眼底部新生血管的精准治疗策略,通过清除衰老细胞和重塑微环境来促进血管修复 | 眼底部新生血管(OFN),包括氧诱导视网膜病变和脉络膜新生血管模型 | 生物医学工程 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1228 | 2026-03-19 |
Ventricular assist device unloading reverses microvascular senescence in single ventricle disease
2026-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00790-x
PMID:41781666
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,探讨了左心发育不全综合征(HLHS)右心室微环境在出生、手术后心力衰竭及心室辅助装置(VAD)卸载后的变化,揭示了心肌细胞内在衰老及微血管衰老生态位的特征 | 首次在HLHS中结合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了心肌细胞内在衰老及微血管衰老生态位,并发现VAD卸载可逆转这一衰老过程,为心力衰竭的细胞状态逆转提供了新见解 | 研究样本可能有限,且主要聚焦于HLHS,未广泛比较其他心脏疾病,长期VAD效果和机制需进一步验证 | 探究HLHS右心室微环境在心力衰竭发展及VAD干预下的细胞状态变化,以理解衰老机制和潜在治疗策略 | 左心发育不全综合征(HLHS)患者的心脏组织,包括出生时、手术后心力衰竭及VAD卸载后的样本,以及诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1229 | 2026-03-19 |
PBRM1 Deficiency Reshapes an Immune Suppressive Microenvironment Through Epigenetic Tuning of PBRM1-KDM5C-IL6 Axis in ccRCC
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512627
PMID:41514194
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研究论文 | 本研究揭示了PBRM1基因缺失通过调控PBRM1-KDM5C-IL6轴重塑肾透明细胞癌免疫抑制微环境的机制 | 首次构建PBRM1敲除小鼠模型进行单细胞RNA测序,揭示了PBRM1通过招募KDM5C调控IL-6表达从而促进M2型肿瘤相关巨噬细胞极化的新机制,并证明阻断IL-6可增强抗PD-1疗法的抗肿瘤效果 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析,缺乏大规模临床试验验证;机制研究尚未完全阐明下游信号通路的具体细节 | 探究PBRM1基因缺失在肾透明细胞癌免疫逃逸中的作用机制 | 肾透明细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | PBRM1敲除小鼠模型(自发性和原位肾肿瘤模型)及临床患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1230 | 2026-03-19 |
CRISPLD2 Attenuates Intervertebral Disc Degeneration by Suppressing Oxidative Stress-Induced Ferroptosis through the miR-548I-IL17A Axis
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516477
PMID:41514293
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研究论文 | 本文揭示了CRISPLD2通过调控miR-548I-IL17A轴抑制氧化应激诱导的铁死亡,从而延缓椎间盘退变的新机制 | 首次发现CRISPLD2在椎间盘退变中通过miR-548I-IL17A轴调控铁死亡的关键作用,并提出了靶向该轴作为治疗新策略 | 未明确说明样本量及具体实验模型的局限性 | 探究椎间盘退变的分子机制及潜在治疗靶点 | 髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1231 | 2026-03-19 |
Hepatocyte BPGM Induces RET Lactylation and Macrophage Reprogramming to Promote Tumorigenesis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518180
PMID:41514495
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞中的糖酵解关键酶BPGM通过促进RET蛋白的乳酸化修饰和重编程巨噬细胞,从而驱动肝细胞癌的肿瘤发生 | 首次发现BPGM通过促进RET蛋白K549位点的乳酸化修饰,竞争性抑制其泛素化降解,从而稳定RET蛋白并驱动HCC进展;同时阐明了BPGM通过分泌乳酸诱导巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究主要在临床样本和小鼠模型中进行,其结论在人类患者中的普适性及临床转化潜力仍需进一步验证;BPGM作为治疗靶点的具体干预策略(如抑制剂开发)尚未探索 | 探究糖酵解关键酶BPGM在肝细胞癌进展中的作用机制 | 肝细胞癌组织、小鼠DEN诱导的HCC模型、HCC细胞系、肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱 | 基因敲除小鼠模型、细胞过表达模型 | 基因表达数据、蛋白质修饰数据、细胞表型数据 | 临床HCC组织样本、DEN诱导的肝细胞特异性Bpgm敲除小鼠 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1232 | 2026-03-19 |
Correction to 'Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration'
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71061
PMID:41845558
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1233 | 2026-03-19 |
Mapping kinase-dependent tumor immune adaptation with multiplexed single-cell CRISPR screens
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698516
PMID:41542636
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研究论文 | 本文介绍了一种集成的高通量单细胞CRISPR筛选框架,用于绘制胶质母细胞瘤中T细胞驱动免疫压力的肿瘤内在调控机制 | 结合了CRISPR干扰与激活技术、免疫匹配的肿瘤-T细胞共培养以及大规模单细胞转录组学,系统量化遗传扰动对肿瘤状态和适应性反应的影响 | 研究主要针对胶质母细胞瘤,可能不适用于其他癌症类型;且依赖于体外共培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 绘制肿瘤免疫适应的激酶依赖性调控网络,并识别潜在的免疫逃逸靶点 | 胶质母细胞瘤细胞与T细胞的相互作用 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞CRISPR筛选、单细胞转录组学、CRISPR干扰与激活 | 深度生成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1234 | 2026-03-19 |
Inhibition of CDC25C attenuates IL-17A-driven keratinocyte hyperproliferation and psoriasis progression
2026-02-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153342
PMID:41587503
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研究论文 | 本研究探讨了CDC25C在IL-17A驱动的角质形成细胞过度增殖和银屑病进展中的作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次将CDC25C鉴定为非经典IL-17信号通路中的关键效应因子,并证明其选择性抑制可减轻角质形成细胞过度增殖而不影响经典炎症因子表达 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证CDC25C抑制剂的疗效和安全性 | 探索银屑病治疗的新靶点,以克服现有抗IL-17生物制剂疗效不完全和疾病复发的问题 | 银屑病患者皮肤样本、角质形成细胞、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织病理学图像 | 银屑病患者单细胞RNA-seq数据集、体外培养的角质形成细胞、IMQ诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1235 | 2026-03-19 |
A non-canonical role of Myc in programming basal cells as sentinels of upper airway immunity during influenza infection
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696065
PMID:41509430
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研究论文 | 本研究探讨了流感感染期间,Myc在编程基底细胞作为上呼吸道免疫哨兵中的非经典作用 | 揭示了基底细胞作为上皮哨兵,通过MYC依赖的CXCL10-CXCR3轴协调急性修复并招募细胞毒性效应细胞的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类上呼吸道感染后的区域特异性机制仍需进一步验证 | 阐明流感病毒感染后上呼吸道的损伤与修复机制,特别是基底细胞在免疫协调中的作用 | 小鼠上呼吸道(声门下和气管)的假复层上皮细胞,包括纤毛细胞、分泌细胞、神经内分泌细胞和基底细胞 | 数字病理学 | 流感感染 | 单细胞转录组学、成像技术 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1236 | 2026-03-19 |
MANTIS: Analytics toolkit for spatial metabolomics with matching spatial transcriptomics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.20.700581
PMID:41648596
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研究论文 | 介绍MANTIS,一个用于分析空间代谢组学与空间转录组学数据的统计框架工具包 | 首个统一空间代谢组学、空间转录组学、细胞类型信息和空间域的工具包,强调空间统计、假设检验和混杂因素校正 | NA | 开发一个统计框架,用于分析共注册的空间代谢组学和空间转录组学数据,以发现代谢物空间模式和基因-代谢物关系 | 空间代谢组学和空间转录组学数据,涵盖不同空间技术、组织和物种 | 空间组学 | NA | 空间代谢组学,空间转录组学 | 统计框架 | 空间代谢组学和空间转录组学数据 | NA | NA | 空间代谢组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 1237 | 2026-03-19 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2026-02-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69797-z
PMID:41723121
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研究论文 | 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序技术,揭示了肝癌中肿瘤细胞“村庄”与微环境之间的分子共依赖性及其对患者预后的影响 | 开发了基于深度学习的策略来空间映射肿瘤细胞状态及其周围环境结构,首次提出肿瘤细胞“村庄”概念,并揭示了村庄特异性分子共依赖性 | 研究主要聚焦于肝癌,结论在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 | 肝癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像, 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像, 转录组数据 | 50个肿瘤生物样本(超过200万个细胞),740名肝癌患者的验证数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1238 | 2026-02-21 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover SPP1⁺ and HLA-DRB5⁺ macrophages as key modulators of the immune microenvironment in colorectal cancer liver metastasis
2026-Feb-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07853-4
PMID:41715121
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1239 | 2026-03-19 |
High-resolution spatial multi-omics enables prognostic scoring in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-18, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.02.029
PMID:41709577
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学技术,开发了一种用于肝内胆管癌预后评分的新型空间多模态评分系统 | 首次结合图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序等技术,实现了肿瘤微环境的高分辨率空间多组学映射,并开发了基于毫米级分辨率的预后评分系统 | 研究样本量相对有限(训练队列155例,验证队列214例),且未在更广泛的多中心队列中进行外部验证 | 开发肝内胆管癌的预后工具,以进行精确风险分层和治疗优化 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学、多重免疫荧光 | 空间多模态评分系统 | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | 训练队列155例患者,独立验证队列214例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, 批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 1240 | 2026-03-19 |
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.700850
PMID:41756925
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研究论文 | 本研究通过体外和体内模型探讨了维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了维生素D缺乏在前列腺发育和癌症进展中的关键作用,并验证了其作为激素的生物学功能 | 研究主要基于小鼠模型和特定人类癌细胞系,可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探究维生素D缺乏作为前列腺癌侵袭性风险因素的作用机制 | 小鼠前列腺类器官、MDA-PCa-2b人类前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |