单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2025-05-06 |
TREM2+ macrophages accumulate in childhood IgA nephropathy and soluble TREM2 represents a reliable non-invasive biomarker
2025-May-05, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP092716
PMID:40321057
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和血液样本分析，揭示了儿童IgA肾病中TREM2+巨噬细胞的积累及其可溶性形式sTREM2作为非侵入性生物标志物的潜力 | 首次在儿童IgA肾病中发现TREM2+巨噬细胞亚群的积累，并证实血浆sTREM2水平与疾病严重程度相关 | 样本量较小（38例患者），且缺乏长期随访数据验证sTREM2的预后价值 | 探索儿童IgA肾病的发病机制并寻找有效的非侵入性生物标志物 | 儿童IgA肾病患者（38例）的肾脏组织和血液样本 | 数字病理学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、临床生化数据 | 38例儿童IgA肾病患者+健康对照组 |
| 1222 | 2025-05-06 |
MRAS: Master Regulator Analysis of Alternative Splicing
2025-May-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414493
PMID:40323145
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research paper | 介绍了一种名为MRAS的计算方法，用于识别在剪接调控网络中起核心作用的关键剪接因子 | 提出了MRAS方法，能够高效识别调控剪接异常的关键剪接因子，并揭示其在肿瘤发生和发展中的作用 | 未提及具体的样本量或实验验证细节 | 研究剪接调控网络中的关键剪接因子及其在肿瘤发生和发展中的作用 | 剪接因子和剪接调控网络 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 1223 | 2025-05-06 |
OLS4: A new Ontology Lookup Service for a growing interdisciplinary knowledge ecosystem
2025-May-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf279
PMID:40323307
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研究论文 | 介绍了一种新的本体查找服务OLS4，用于支持不断增长的跨学科知识生态系统 | 实现了完整的OWL2规范，支持多语言国际化，并提供了新的用户界面和用户体验增强功能 | 未提及具体的技术或性能限制 | 开发一个支持现代本体定义范围的搜索工具，以替代现有的OLS3 | 生物信息学和化学社区中用于注释生物和生物医学数据的本体 | 生物信息学 | NA | OWL2规范 | NA | 本体数据 | NA |
| 1224 | 2025-05-06 |
Single-cell transcriptomics of human skin reveals age-associated specificity of distinct cell populations
2025-May-05, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-025-04222-x
PMID:40323328
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类皮肤细胞在衰老过程中的特异性变化 | 首次在避光区域皮肤中详细描述了衰老对皮肤细胞功能和相互作用的影响 | 研究样本仅来自健康供体，未考虑疾病状态对皮肤衰老的影响 | 阐明皮肤细胞群体在衰老过程中的分子和功能变化 | 人类皮肤细胞（包括成纤维细胞、角质形成细胞和免疫细胞） | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞转录组数据 | 超过5,000个细胞 |
| 1225 | 2025-05-06 |
TREM2 Impedes Recovery After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Lysosomal Membrane Permeabilization-Mediated Autophagy
2025-May-04, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70047
PMID:40320759
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research paper | 该研究探讨了TREM2在脊髓损伤后通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬影响恢复过程的机制 | 首次揭示了TREM2通过Syk磷酸化-TFEB核转位通路调控溶酶体膜通透性介导的自噬过程，并提出了基于基因治疗的临床转化策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化效果仍需进一步验证 | 探究TREM2在脊髓损伤恢复中的具体作用机制 | 野生型和Trem2敲除小鼠的小胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序、免疫荧光、3D步态分析、运动诱发电位实验、H&E染色、Masson染色 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、行为学数据、电生理数据、组织学数据 | 野生型和Trem2敲除小鼠在脊髓损伤前后的样本 |
| 1226 | 2025-05-06 |
Exome and Transcriptome Analysis Links Calcium Channel Pathway Aberrations to Botox Resistance in Hailey-Hailey Disease
2025-May-03, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf112
PMID:40317184
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research paper | 该研究通过多组学方法探讨了钙通道通路异常与Hailey-Hailey病患者对Botox治疗反应差异的关联 | 首次发现ORAI1/SOCE通路上调可能与Botox治疗抵抗相关，并可作为预测患者治疗反应的生物标志物 | 样本量较小（仅12例患者），需要更大规模研究验证发现 | 阐明Hailey-Hailey病患者对Botox治疗反应差异的潜在机制 | Hailey-Hailey病患者 | 生物医学研究 | Hailey-Hailey病 | 全外显子测序(WES)、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组化(IHC) | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质表达数据 | 12例Hailey-Hailey病患者 |
| 1227 | 2025-05-06 |
Nuclear Profilin-1 for DNA Damage Repair Is Involved in Phagocytic Impairment of Senescent Microglia
2025-May-03, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70028
PMID:40317528
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研究论文 | 本研究探讨了profilin-1（PFN1）在DNA损伤修复中的作用及其与衰老小胶质细胞吞噬功能受损的关系 | 首次揭示了PFN1在DNA双链断裂修复中的核质转运机制及其在衰老小胶质细胞功能障碍中的作用 | 研究主要基于体外实验和公开数据，需要更多体内实验验证 | 阐明PFN1在DNA损伤修复中的作用及其与衰老小胶质细胞功能障碍的关联 | 小胶质细胞 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外培养的小胶质细胞和公开的小鼠脑部单细胞RNA测序数据 |
| 1228 | 2025-05-06 |
Single-cell transcriptomics reveal the effects of chemoimmunotherapy on hypopharyngeal cancer and its tumor microenvironment
2025-May-03, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析化疗免疫疗法对下咽癌及其肿瘤微环境的影响 | 揭示了肿瘤微环境异质性与治疗反应的关系，并识别了S100A2基因在肿瘤细胞中的高表达及其对ICIT疗效的影响 | 研究样本量有限，且仅针对下咽癌患者 | 探索化疗免疫疗法对下咽癌及其肿瘤微环境的影响，寻找预测治疗反应的分子标记 | 下咽癌患者的活检样本 | 数字病理学 | 下咽癌 | 单细胞转录组学，bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 下咽癌患者治疗前后的活检样本 |
| 1229 | 2025-05-06 |
Heterogeneous Responses to High-Dose Testosterone in Castration-Resistant Prostate Cancer Tumors with Mixed Rb-Proficient and Rb-Deficient Cells
2025-May-02, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0716
PMID:40116305
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研究论文 | 研究高剂量睾酮对混合Rb功能正常和缺失的去势抵抗性前列腺癌肿瘤的异质性反应 | 揭示了Rb家族蛋白在高剂量睾酮治疗反应中的作用，并提出通过抑制缺氧诱导因子-1α来恢复Rb缺失细胞对治疗的敏感性 | 研究基于患者来源的异种移植模型和细胞系，可能无法完全反映人类肿瘤的复杂性 | 探索高剂量睾酮治疗去势抵抗性前列腺癌的分子机制及提高治疗效果的新策略 | 去势抵抗性前列腺癌肿瘤细胞 | 肿瘤学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 患者来源的异种移植模型 | 基因表达数据 | 包含Rb功能正常和缺失细胞群的CRPC患者来源的异种移植模型 |
| 1230 | 2025-05-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals gut microbiota-immunotherapy synergy through modulating tumor microenvironment
2025-May-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02226-7
PMID:40312419
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了肠道微生物群与免疫疗法通过调节肿瘤微环境产生的协同作用 | 在单细胞分辨率下揭示了肠道微生物群与免疫检查点抑制剂（ICI）协同作用的机制，提出了γδ T细胞-APC-CD8 T细胞轴的概念 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探究肠道微生物群如何调节免疫检查点抑制剂的疗效 | 小鼠模型中的肿瘤微环境（TME）和免疫细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据 | NA |
| 1231 | 2025-05-06 |
Targeting HMGB2 acts as dual immunomodulator by bolstering CD8+ T cell function and inhibiting tumor growth in hepatocellular carcinoma
2025-May-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads8597
PMID:40315321
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研究论文 | 本文探讨了HMGB2在肝细胞癌中对CD8+ T细胞功能和肿瘤生长的双重调节作用 | 发现HMGB2作为免疫耗竭相关分子，通过单细胞RNA测序揭示了其在CD8 T细胞和肿瘤细胞中的新机制 | 研究未涉及HMGB2抑制剂在其他癌症类型中的适用性 | 探索HMGB2在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌中的CD8+ T细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1232 | 2025-05-06 |
Single-cell profiling unveils a geroprotective role of Procyanidin C1 in hematopoietic immune system via senolytic and senomorphic effects
2025-May-02, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-025-00222-3
PMID:40316527
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研究论文 | 研究发现原花青素C1（PCC1）通过其抗衰老和模拟衰老的特性，对造血免疫系统具有保护作用，能够改善衰老相关的变化 | 揭示了PCC1通过抑制衰老相关标志物和恢复正常免疫过程，对造血免疫系统具有广泛的抗衰老保护作用，特别是在B细胞和造血干细胞中 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探究PCC1对造血免疫系统衰老的影响及其潜在的治疗作用 | 小鼠的骨髓和脾脏组织 | 生物医学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、机器学习、基因集富集分析 | NA | RNA测序数据 | 小鼠骨髓和脾脏组织的单细胞数据 |
| 1233 | 2025-05-06 |
Identification of leukemia-enriched signature through the development of a comprehensive pediatric single-cell atlas
2025-May-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59362-5
PMID:40316535
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研究论文 | 该研究通过开发一个全面的儿科单细胞图谱，识别了白血病富集的基因特征 | 构建了包含超过54万个细胞的儿科白血病单细胞图谱，并识别出9个白血病富集的基因特征 | 研究主要基于单细胞转录组数据，可能未涵盖所有白血病亚型的分子特征 | 识别儿科白血病中的特异性基因特征并构建单细胞图谱 | 儿科急性白血病（髓系、淋巴系、混合表型）和健康骨髓样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 159个儿科白血病和健康骨髓样本，超过54万个细胞 |
| 1234 | 2025-05-06 |
Identification of PANoptosis related biomarkers to predict hepatic ischemia‒reperfusion injury after liver transplantation
2025-May-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99264-6
PMID:40316717
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示肝缺血再灌注损伤（HIRI）中PANoptosis相关分子机制，并构建预测模型 | 鉴定了6个与HIRI相关的PANoptosis基因生物标志物，揭示了巨噬细胞亚群在HIRI中的异质性和动态变化，以及MIF和VISFATIN信号通路在细胞间相互作用中的重要作用 | 未提及样本量的具体大小，可能影响模型的泛化能力 | 研究肝移植后肝缺血再灌注损伤（HIRI）的分子机制和预测生物标志物 | 人肝组织在HIRI前后的bulk和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肝缺血再灌注损伤 | bulk和单细胞RNA测序 | 机器学习方法构建的诊断预测模型 | RNA测序数据 | NA |
| 1235 | 2025-05-06 |
CD55 upregulation in T cells of COVID-19 patients suppresses type-I interferon responses
2025-May-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08066-z
PMID:40316776
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research paper | 研究发现COVID-19重症患者T细胞中CD55上调抑制了I型干扰素反应 | 首次揭示了CD55在COVID-19重症患者中对I型干扰素反应的新调控作用 | 研究主要针对重症和危重症患者，未涵盖轻症或无症状感染者 | 探究COVID-19患者中补体调节蛋白表达异常与疾病发病机制的关系 | COVID-19重症和危重症患者的PBMCs、T细胞和单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术(FACS) | NA | 基因表达数据 | COVID-19重症和危重症患者的PBMCs样本 |
| 1236 | 2025-05-06 |
Integrating analysis of multi-omics summary data identifies novel plasma protein biomarkers and drug targets for bladder cancer
2025-May-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02476-5
PMID:40316856
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研究论文 | 通过整合多组学摘要数据分析，识别出与膀胱癌风险相关的14种血浆蛋白生物标志物和药物靶点 | 使用孟德尔随机化方法和大样本多中心数据，首次系统地识别与膀胱癌发病机制有因果关系的血浆蛋白 | 研究结果需要进一步的实验验证，且样本来源可能影响结果的普适性 | 解决膀胱癌的诊断和治疗挑战，寻找潜在的血浆蛋白生物标志物和药物靶点 | 膀胱癌患者和血浆蛋白质组数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 孟德尔随机化(MR)、单细胞转录组分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 多组学数据(蛋白质组、基因组) | 来自6个研究的5538种血浆蛋白数据和3个膀胱癌数据集 |
| 1237 | 2025-05-06 |
Whole-body CT scanning radiation improves the immune microenvironment of tumor tissues to enhance the antitumor effect of ICI
2025-May-02, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14119-7
PMID:40316957
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研究论文 | 探讨全身CT扫描辐射对免疫检查点抑制剂（ICI）治疗患者抗肿瘤免疫的影响 | 首次研究CT扫描辐射对ICI治疗的影响，发现多次CT扫描可能延缓肿瘤进展 | 研究为回顾性临床研究和小鼠模型，需要更多临床数据验证 | 研究CT扫描频率与ICI治疗缓解持续时间（DOR）的相关性 | IV期非小细胞肺癌（NSCLC）患者和小鼠模型 | 肿瘤免疫治疗 | 非小细胞肺癌 | 全身CT扫描、单细胞测序 | 小鼠模型 | 临床数据、实验数据 | 未明确提及患者数量，使用小鼠模型进行实验 |
| 1238 | 2025-05-06 |
Exploring ribosome biogenesis in lung adenocarcinoma to advance prognostic methods and immunotherapy strategies
2025-May-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06489-0
PMID:40316986
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research paper | 本研究探讨了核糖体生物发生（RiboSis）与肺腺癌（LUAD）的关系，并开发了一种与核糖体生物发生相关的特征（RBS）作为预后生物标志物 | 首次利用单细胞RNA测序技术分析LUAD中T细胞亚群与RiboSis的关系，并构建了优于现有140个LUAD预后模型的RBS特征 | 研究主要基于生物信息学分析，虽然进行了体外实验验证，但仍需更多体内实验和临床样本验证 | 探索RiboSis在LUAD中的作用机制并开发新型预后预测方法 | 肺腺癌细胞和肿瘤微环境中的T细胞亚群 | digital pathology | lung cancer | scRNA-seq, 免疫组化, 体外实验 | machine learning algorithms, monocle2 | RNA-seq数据, 免疫组化图像, 体外实验数据 | 未明确说明样本数量，但比较了140个已发表的LUAD预后模型 |
| 1239 | 2025-05-06 |
Exploring secondary extramedullary myeloma disease: a five-predictor scoring system with spotlight on double-hit cytogenetics
2025-May-02, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04086-y
PMID:40316968
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研究论文 | 本研究探索了继发性髓外骨髓瘤疾病（sEMD），提出了一个包含五个预测因子的评分系统，并重点关注了双打击细胞遗传学的作用 | 提出了一个基于五个独立预测因子的评分系统，用于分层sEMD风险，并通过单细胞RNA测序揭示了双打击骨髓瘤中MAPK通路的激活和潜在治疗靶点 | 样本量相对较小（77例sEMD患者），且研究为回顾性设计 | 识别sEMD的预测标志物并探索其潜在机制，以改善临床管理 | 618例新诊断的多发性骨髓瘤患者中的77例sEMD患者 | 血液肿瘤学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 时间-事件模型 | 临床数据和RNA测序数据 | 618例新诊断的多发性骨髓瘤患者（其中77例发展为sEMD） |
| 1240 | 2025-05-06 |
Decoding per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) in hepatocellular carcinoma: a multi-omics and computational toxicology approach
2025-May-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06517-z
PMID:40317014
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研究论文 | 本研究采用多组学和计算毒理学方法，探索全氟和多氟烷基物质（PFAS）在肝细胞癌（HCC）中的作用机制 | 结合网络毒理学、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学等多种技术，首次构建了PFAS相关的HCC生存风险模型（PFASRHSig） | 研究主要基于公开的转录组数据，实验验证样本量有限 | 揭示PFAS暴露导致HCC的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC）及其与PFAS暴露的关联 | 计算毒理学 | 肝细胞癌 | 网络毒理学、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学、分子对接模拟 | PFASRHSig生存风险模型 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 多个公开HCC队列数据，实验验证样本未明确说明 |