单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1221	2025-04-21	Progesterone signaling in oviductal epithelial cells modulates the immune response to support preimplantation embryonic development 2025-Apr-18, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adt6113 PMID:40249812	研究论文	本研究探讨了孕酮信号在输卵管上皮细胞中对免疫反应的调节作用及其对胚胎植入前发育的影响	揭示了孕酮受体在输卵管上皮细胞中的表达对胚胎发育的重要性，并发现通过抑制炎症可以挽救胚胎发育延迟	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	理解孕酮信号在早期妊娠中的作用，特别是对胚胎植入前发育的影响	输卵管上皮细胞和小鼠胚胎	生殖生物学	妊娠失败	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	未明确提及具体样本数量，但涉及小鼠输卵管上皮细胞和胚胎
1222	2025-04-21	Single-cell RNA sequencing of human double-negative T cells reveals a favorable cellular signature for cancer therapy 2025-Apr-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010684 PMID:40246580	研究论文	通过单细胞RNA测序和功能分析，揭示了人类双阴性T细胞在癌症治疗中的独特细胞特征	首次通过单细胞RNA测序比较了双阴性T细胞（DNTs）与常规Vδ2 T细胞的转录组和功能差异，揭示了DNTs独特的细胞组成和功能特征	研究仅针对健康供体的细胞进行分析，未涉及患者样本	探究双阴性T细胞（DNTs）在癌症治疗中的生物学特性和潜在优势	健康供体来源的双阴性T细胞（DNTs）和Vδ2 T细胞	免疫治疗	白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术，异种移植模型	NA	RNA测序数据，流式细胞数据	健康供体来源的细胞样本
1223	2025-04-21	Hypoxia-induced Wnt5a-secreting fibroblasts promote colon cancer progression 2025-Apr-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-58748-9 PMID:40246836	研究论文	本研究揭示了Wnt5a在结肠癌进展中的作用机制，特别是其在低氧诱导的炎症性成纤维细胞中的表达及其对肿瘤微环境的影响	首次发现Wnt5a在低氧诱导的炎症性成纤维细胞中表达，并通过抑制血管生成维持低氧环境，进而促进结肠癌进展	研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA-seq数据，人类样本的直接验证有限	探究Wnt5a在结肠癌进展中的作用及其机制	结肠癌及其微环境中的成纤维细胞和内皮细胞	癌症生物学	结肠癌	单细胞RNA-seq	小鼠结肠癌模型	RNA-seq数据	人类和小鼠结肠成纤维细胞的单细胞RNA-seq数据
1224	2025-04-21	MIRO1 mutation leads to metabolic maladaptation resulting in Parkinson's disease-associated dopaminergic neuron loss 2025-Apr-17, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-025-00509-x PMID:40246848	研究论文	本文利用携带MIRO1 p.R272Q突变的患者特异性iPSC来源的中脑类器官，探讨了多巴胺能神经元退化的细胞和分子机制	揭示了MIRO1 p.R272Q突变通过影响多巴胺能神经元的发育路径和代谢缺陷，破坏神经元-星形胶质细胞代谢互作，从而导致其丢失的新机制	研究仅基于iPSC来源的类器官模型，未在动物模型或更多患者样本中验证	探究MIRO1突变导致帕金森病相关多巴胺能神经元丢失的分子机制	携带MIRO1 p.R272Q突变的iPSC来源中脑类器官	神经退行性疾病研究	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNAseq)和代谢建模	iPSC来源的中脑类器官模型	基因表达数据和代谢数据	NA
1225	2025-04-21	Single-cell sequencing systematically analyzed the mechanism of Emdogain on the restoration of delayed replantation periodontal membrane 2025-Apr-17, International journal of oral science IF:10.8Q1 DOI:10.1038/s41368-024-00345-5 PMID:40246878	研究论文	本研究通过单细胞测序技术系统分析了Emdogain（EMD）在延迟再植牙周膜修复中的作用机制	首次在单细胞分辨率下揭示了EMD促进牙周膜修复的细胞和分子机制，并发现了Vtn+成纤维细胞的关键作用	研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人体验证	探究EMD在延迟再植牙周膜修复中的作用机制	大鼠延迟再植牙模型	数字病理学	牙周疾病	单细胞测序、Micro-CT、HE染色、TRAP染色、免疫荧光染色	动物模型	单细胞转录组数据、影像数据	大鼠延迟再植牙模型（具体数量未说明）
1226	2025-04-21	PRC1 as an independent adverse prognostic factor in Wilms tumor via integrated bioinformatics and experimental validation 2025-Apr-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-98030-y PMID:40247060	研究论文	本研究通过综合生物信息学和实验验证方法，探讨了PRC1在Wilms肿瘤中的关键预后因素作用及其机制	首次将PRC1确定为Wilms肿瘤的独立不良预后因素，并通过多组学分析揭示了其在肿瘤进展中的多重作用机制	研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证	探索PRC1在Wilms肿瘤中的预后价值和分子机制	Wilms肿瘤患者样本和WIT-49细胞系	肿瘤生物学	Wilms肿瘤	RNA-seq、单细胞RNA-seq、功能富集分析(GO/KEGG/GSEA)、免疫分析、体外敲低实验	NA	基因表达数据、单细胞数据、基因组数据	来自TARGET数据库的批量RNA-seq数据和GSE200256单细胞数据集
1227	2025-04-21	Dynamic evolution and antitumor mechanisms of CXCR6+CD8+ T cells in small cell lung cancer treated with low-dose radiotherapy and immunotherapy 2025-Apr-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06450-1 PMID:40247265	research paper	本研究探讨了低剂量放疗联合免疫治疗对小细胞肺癌中CXCR6+CD8+ T细胞的动态演变及抗肿瘤机制的影响	揭示了干细胞样T细胞从肿瘤引流淋巴结迁移至肿瘤部位并分化为效应表型的过程，以及树突状细胞在T细胞分化中的关键作用	研究结果仍需通过更大规模的临床队列验证，且具体分子机制有待进一步阐明	阐明低剂量放疗联合免疫治疗促进CD8+ T细胞肿瘤内浸润及其细胞毒功能增强的机制	小细胞肺癌患者及Kaede荷瘤小鼠	肿瘤免疫学	小细胞肺癌	流式细胞术、单细胞RNA测序、免疫荧光	Kaede荷瘤小鼠模型	单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、临床队列数据	未明确说明患者数量，使用Kaede荷瘤小鼠模型
1228	2025-04-21	High-fat diet alters retinal lipid composition and gene expression networks in mice 2025-Apr-17, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-025-02212-z PMID:40247316	研究论文	本研究通过多组学方法揭示了高脂饮食（HFD）如何通过改变视网膜脂质组成和基因表达网络影响视网膜疾病的发展	首次在高脂饮食模型中，通过单细胞转录组测序在单细胞分辨率上研究了HFD对视网膜不同细胞类型的影响，并揭示了胆汁酸合成途径的异常激活在视网膜脂质代谢中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，结果是否适用于人类仍需进一步验证	探究高脂饮食对视网膜脂质代谢和基因表达网络的影响及其与视网膜疾病的关联	高脂饮食喂养的小鼠视网膜组织	生物医学	视网膜疾病（包括年龄相关性黄斑变性、青光眼和糖尿病视网膜病变）	单细胞转录组测序、脂质组学、蛋白质组学	小鼠高脂饮食模型	脂质组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据	高脂饮食喂养6个月的小鼠视网膜组织
1229	2025-04-21	Bulk RNA-seq conjoined with ScRNA-seq analysis reveals the molecular characteristics of nucleus pulposus cell ferroptosis in rat aging intervertebral discs 2025-Apr-17, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-025-03550-7 PMID:40247370	research paper	该研究通过批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，揭示了大鼠衰老椎间盘中髓核细胞铁死亡的分子特征	首次定义了铁死亡的关键驱动因素和铁死亡髓核细胞亚群的特征，并发现ATF3是铁死亡的关键驱动因子，Rps6 +/Cxcl1-是铁死亡髓核细胞亚群的共同分子特征	研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究髓核细胞铁死亡在椎间盘退变(IDD)中的分子特征和机制	大鼠尾椎间盘的髓核细胞	分子生物学	椎间盘退变	批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq (ScRNA-seq), Prussian blue染色, C11-BODIPY荧光探针, 4-HNE染色	NA	RNA-seq数据	10个月和20个月大的大鼠髓核组织
1230	2025-04-21	High-throughput drug screening identifies SMAC mimetics as enhancers of NK-cell cytotoxicity in chronic myeloid leukemia 2025-Apr-10, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025286 PMID:39792962	研究论文	通过高通量药物筛选发现SMAC模拟物能增强NK细胞在慢性髓性白血病中的细胞毒性	首次系统性评估了500多种小分子化合物对NK细胞功能的影响，并发现SMAC模拟物能显著增强NK细胞对CML细胞的杀伤作用	研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索增强NK细胞免疫疗法效果的药物	NK细胞和慢性髓性白血病细胞	免疫治疗	慢性髓性白血病	高通量药物筛选、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	细胞系和原代患者样本
1231	2025-04-21	Elevated Serum and Urinary Secreted Protein Acidic and Rich in Cysteine Levels are Novel Biomarkers of Kidney Fibrosis Severity 2025-Apr, Archives of medical research IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.arcmed.2024.103125 PMID:39612526	research paper	该研究探讨了血清和尿液中SPARC水平作为肾脏纤维化严重程度的新型生物标志物的诊断价值	首次发现血清和尿液中的SPARC水平与肾脏纤维化严重程度相关，并验证了其作为非侵入性诊断标志物的潜力	研究样本仅包括CKD患者，未在其他肾脏疾病中验证SPARC的诊断价值	探索SPARC在肾脏纤维化中的诊断价值	674名接受肾活检的CKD患者及肾脏纤维化的体内外模型	生物标志物研究	慢性肾病	单细胞转录组分析	NA	血清和尿液样本数据	674名CKD患者（训练队列322人，验证队列352人）
1232	2025-04-21	Immune pathogenic response landscape of acute posterior multifocal placoid pigment epitheliopathy revealed by scRNA sequencing 2025-Apr, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-024-00316-0 PMID:39774261	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示急性后部多灶性鳞状色素上皮病变（APMPPE）的免疫致病反应图谱	首次使用单细胞RNA测序技术对APMPPE患者的外周血单核细胞（PBMCs）进行综合分析，揭示了单核细胞的转录变化及其亚群，并识别出IFITM3在APMPPE发病机制中的关键作用	研究仅基于一名APMPPE患者的数据，样本量较小，可能影响结果的普遍性	探究APMPPE的免疫致病机制	APMPPE患者的外周血单核细胞（PBMCs）	生物医学研究	急性后部多灶性鳞状色素上皮病变（APMPPE）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	1名APMPPE患者
1233	2025-04-21	Asherman syndrome at single-cell resolution 2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.ajog.2024.12.023 PMID:40253078	综述	本文全面回顾了Asherman综合征的历史背景、临床表现、分类、产科挑战及当前治疗方法	探讨了单细胞RNA测序技术在揭示Asherman综合征分子机制中的潜力	现有治疗方法如宫腔镜粘连松解术仍面临粘连复发和产科并发症的挑战	深入了解Asherman综合征的病理机制并探索创新治疗策略	Asherman综合征患者及其相关治疗方法	生殖医学	Asherman综合征	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
1234	2025-04-21	Uterine fibroids at single-cell resolution: unveiling cellular heterogeneity to improve understanding of pathogenesis and guide future therapies 2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.037 PMID:40253076	综述	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了子宫肌瘤的细胞异质性，以增进对其发病机制的理解并指导未来治疗	利用单细胞RNA测序技术首次详细描述了子宫肌瘤中平滑肌细胞和成纤维细胞的异质性，并发现了MED12突变肌瘤可能非单克隆性质的新证据	主要基于MED12突变型肌瘤的研究，对其他遗传突变型肌瘤的细胞异质性研究较少	深入理解子宫肌瘤的细胞和分子机制，为开发更有效的非侵入性治疗方案提供依据	子宫肌瘤组织和平滑肌组织	数字病理学	子宫肌瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫染色、流式细胞术	NA	单细胞转录组数据	未明确说明具体样本数量，但涉及MED12突变型肌瘤和正常肌层组织的比较研究
1235	2025-04-21	"Thin endometrium" at single-cell resolution 2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.ajog.2024.10.002 PMID:40253077	综述	本文综述了薄型子宫内膜在单细胞分辨率下的研究进展，探讨了其细胞群、信号通路和细胞间通讯的关键变化	利用单细胞测序技术揭示了薄型子宫内膜在细胞水平上的加速衰老过程及其对子宫内膜容受性的影响	目前的研究仍处于基础研究阶段，尚未提出具体的临床治疗方案	探索薄型子宫内膜的潜在机制，为开发新的治疗方法提供理论基础	薄型子宫内膜与正常子宫内膜在晚增殖期的比较	生殖医学	不孕症	单细胞测序	NA	单细胞数据	NA
1236	2025-04-21	Single-cell omics technologies - Fundamentals on how to create single-cell looking glasses for reproductive health 2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.041 PMID:40253074	综述	本文综述了单细胞组学技术在生殖健康研究中的最新应用及其潜力	探讨了单细胞技术在生殖医学中的创新应用，包括空间转录组学和高维蛋白质组成像	讨论了单细胞技术在数据分析方面的统计限制和计算挑战	提高对女性健康和生殖障碍的基本理解，并改变临床实践和患者预后	生殖道组织、妊娠及妊娠障碍、妇科恶性肿瘤、子宫和卵巢生理及衰老	单细胞组学	妇科疾病	单细胞测序、蛋白质组学、空间转录组学、高维蛋白质组成像	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	NA
1237	2025-04-21	Single-cell technology: the key to an improved understanding of the human endometrium in health and disease 2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.042 PMID:40253082	综述	本文总结了利用单细胞RNA测序技术研究子宫内膜在月经周期中单细胞分辨率下的变化及其在健康和疾病中的作用	利用单细胞RNA测序技术揭示子宫内膜不同细胞类型在月经周期中的基因表达谱及细胞间复杂协作	NA	深入理解子宫内膜在月经周期中的细胞水平变化及其在病理条件下的差异	子宫内膜中的上皮细胞、基质细胞、内皮细胞和免疫细胞	单细胞测序	子宫内膜异位症、子宫内膜癌、Asherman综合征	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1238	2025-04-21	TrimNN: Characterizing cellular community motifs for studying multicellular topological organization in complex tissues 2025-Jan-17, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-5584635/v1 PMID:39877090	研究论文	介绍了一种名为TrimNN的图深度学习框架，用于识别和分析空间转录组学和蛋白质组学中的细胞群落基序	提出了一种自下而上的方法，通过可计数的拓扑块来区分细胞生态位，具有可解释性和普适性	NA	研究复杂组织中多细胞拓扑组织的协调规则	空间转录组学和蛋白质组学数据中的细胞群落基序	数字病理学	NA	空间转录组学、蛋白质组学	图深度学习框架	空间组学数据	NA
1239	2025-04-21	Interferon-γ Signaling in Eosinophilic Esophagitis Affects Epithelial Barrier Function and Programmed Cell Death 2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101466 PMID:39884574	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了嗜酸性食管炎(EoE)中干扰素信号对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响	首次在单细胞水平揭示了EoE患者上皮细胞中干扰素反应特征基因的差异表达，并明确了IFN-γ对上皮屏障功能的显著影响	研究主要基于体外器官模型，需要进一步在体实验验证	阐明干扰素信号在EoE发病机制中的作用	嗜酸性食管炎患者的上皮细胞和器官模型	单细胞组学	嗜酸性食管炎	scRNA-seq, bulk RNA-seq	器官模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量
1240	2025-04-20	Role of PRC2 in the stochastic expression of Aire target genes and development of mimetic cells in the thymus 2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20240817 PMID:40244172	研究论文	本文通过多组学单细胞方法和深度单细胞RNA测序，研究了Aire如何控制多种基因在少量Aire表达细胞中的转录，并揭示了PRC2在Aire介导的随机基因表达和模拟细胞发育中的关键作用	揭示了PRC2在Aire介导的随机基因表达和模拟细胞发育中的独立且关键的作用	研究主要基于单细胞测序技术，可能未涵盖所有相关细胞类型或基因	理解Aire在胸腺上皮细胞中的耐受性功能及其基因表达调控机制	胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和Aire靶基因	分子生物学	NA	多组学单细胞方法、深度单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但涉及少量Aire表达细胞