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当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 1221 - 1240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1221 2026-06-03
Single-cell RNA sequencing unveils macrophage heterogeneity and cell-cell interactions in hepatocellular carcinoma progression
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示肝细胞癌进展中巨噬细胞异质性和细胞间相互作用 首次在肝细胞癌微环境中识别出六个转录上不同的巨噬细胞亚群(M1-M6),并发现SPP1-CD44/ITGAV信号轴是介导巨噬细胞与肝细胞及成纤维细胞相互作用的主要通路,同时揭示了APOA2沉默通过代谢-免疫-表观遗传级联反应促进肿瘤纤维化和进展 主要基于公开数据库进行生物信息学分析,实验验证仅在两个肝癌细胞系中进行,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证;APOA2的诊断性能有限(AUC=0.552) 阐明肝细胞癌进展的分子机制,重点关注肿瘤微环境中巨噬细胞异质性和细胞间通讯网络 肝细胞癌微环境中的巨噬细胞亚群、肝细胞和成纤维细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析(WGCNA) 单细胞转录组数据、基因表达谱、DNA甲基化数据 GSE149614数据集(具体样本数量未明确),两种肝癌细胞系(HepG2和Huh7) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1222 2026-06-02
Alveolar macrophage subtypes express cholesterol and inflammation genes in cystic fibrosis
2026-07, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析囊性纤维化患者与健康对照者的肺泡巨噬细胞亚型,发现表达胆固醇和炎症相关基因的巨噬细胞亚型 首次在囊性纤维化肺中通过单细胞RNA测序无偏聚类识别出12种肺泡巨噬细胞亚型,并发现CDKN1A和LDLR表达上调与胆固醇代谢及炎症相关的联系 巨噬细胞与其他免疫细胞在囊性纤维化中的相互作用机制尚不完全清楚 识别和比较囊性纤维化与健康人群气腔巨噬细胞和单核细胞的细胞组成 囊性纤维化患者和健康对照者的肺泡巨噬细胞和单核细胞 单细胞转录组学 囊性纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 囊性纤维化患者和健康对照者的支气管肺泡灌洗液样本 NA 单细胞RNA测序 NA 通过支气管镜获取支气管肺泡灌洗液进行单细胞RNA测序
1223 2026-06-02
Integration of single-cell regulon atlas and bulk RNA-seq for individualized prognostic prediction in stomach adenocarcinoma
2026-Jun-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 利用单细胞调控子图谱和批量RNA-seq数据,开发基于23个调控子的胃腺癌预后签名,用于个性化预后预测 首次整合单细胞RNA-seq数据与批量RNA-seq,从恶性上皮细胞中识别出23个调控子并构建机器学习预后签名,该签名在多个独立数据集中优于现有预后模型 研究主要基于公共数据集,缺乏临床样本验证;调控子签名的生物学机制需进一步实验验证 开发基于转录调控子的胃腺癌预后签名,提高风险分层和预后预测准确性 胃腺癌患者的肿瘤组织和正常组织样本 机器学习 胃腺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 机器学习模型(具体类型未说明,可能包含集成学习等) 基因表达数据 多阶段单细胞RNA-seq数据及多个独立批量RNA-seq数据集,样本数量未具体说明 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
1224 2026-06-02
SiteCELL enables on-site PBMCs purification and cryopreservation for immune single-cell profiling of underrepresented ancestries
2026-Jun-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 SiteCELL方法能够在采集现场从全血中纯化和冷冻保存外周血单核细胞,适用于偏远地区,实现免疫功能单细胞分析,覆盖代表性不足的祖先群体 开发了一种无需电力、仅需最少实验室设备即可在现场进行PBMCs纯化和冷冻保存的方法,解决了在偏远和农村环境中难以实施单细胞测序的问题 NA 开发一种便于在偏远地区采集和处理外周血单核细胞的方法,以纳入全球南方代表性不足的社区 外周血单核细胞(PBMCs) 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 配对的纯化PBMCs样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1225 2026-06-02
Comprehensive assessment of alternative splicing analysis methods for single-cell RNA-seq
2026-Jun-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 系统评估六种代表性可变剪接分析方法在多个全长短读长单细胞RNA-seq数据集上的表现,重点分析它们在细胞聚类和差异剪接检测等生物学相关任务中的性能 首次对单细胞RNA-seq可变剪接分析方法进行系统基准测试,并识别出scQuint方法在不同数据集和任务中表现稳健,具有生物学意义 未提及具体局限性,可能包括依赖特定数据集类型或无法覆盖所有分析方法 评估单细胞RNA-seq可变剪接分析方法的性能,为方法选择提供指导 六种单细胞RNA-seq可变剪接分析方法(包括scQuint)以及多个全长短读长单细胞RNA-seq数据集 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 多个全长短读长单细胞RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1226 2026-06-02
Efferocytosis-related biomarkers and immune infiltration in pancreatic ductal adenocarcinoma based on single-cell sequencing and machine learning: a comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation
2026-06-11, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 结合单细胞测序和机器学习,筛选并验证胰腺导管腺癌中与胞葬作用相关的生物标志物及免疫浸润特征 首次通过单细胞转录组学揭示巨噬细胞胞葬作用在PDAC微环境中的异质性,并构建六基因预后模型(CD36、ITGAV、PANX1、PPARG、S100A4、THBS1),通过实验验证了THBS1的功能 未提及具体局限性 探究胰腺导管腺癌中胞葬作用相关基因的表达模式、功能及其在肿瘤微环境中的预测意义 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本及细胞系 机器学习, 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, RNA-seq, 实时定量PCR, 蛋白质印迹法 Cox回归, LASSO回归, 机器学习 单细胞转录组数据, 基因表达数据 TCGA-PDAC、GTEx和GEO数据集中的多个队列,具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq NA NA
1227 2026-06-02
In silico virtual knockout identifies PXDNL as a fibroblast-specific driver of sarcopenia and GABA as a potential modulator
2026-06-11, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 整合虚拟基因敲除、多组学分析和单细胞RNA测序,确定PXDNL为肌少症的成纤维细胞特异性驱动因子,并验证GABA作为一种潜在的可再利用治疗药物 首次通过计算机虚拟基因敲除结合多组学数据(238个活检样本、5个GEO队列)鉴定出成纤维细胞特异性驱动因子PXDNL,并建立从计算到体外验证的完整框架 研究缺乏体内动物模型验证,且虚拟基因敲除和药物的潜在临床应用仍需进一步临床试验确认 揭示肌少症的因果机制并识别可转化的治疗靶点 肌少症患者和对照的肌肉组织活检样本以及CC或HMC细胞系 计算生物学 肌少症 虚拟基因敲除、多组学分析(WGCNA、差异表达分析)、单细胞RNA测序、分子对接、酶活性测定 scTenifoldKnk、PLS-RGLM 基因表达数据(bulk及单细胞RNA测序)、分子结构数据 238个活检样本(多组学)、12,847个细胞(单细胞RNA测序),共5个GEO队列 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
1228 2026-06-02
Tumor-stromal crosstalk and macrophage enrichment are associated with chemotherapy response in bladder cancer
2026-Jun, FEBS open bio IF:2.8Q3
研究论文 本研究利用功能性离体膀胱癌组织切片模型,结合空间转录组学分析,揭示了肿瘤-基质交互和巨噬细胞富集与膀胱癌化疗反应的相关性 首次使用功能性离体膀胱癌组织切片模型结合空间转录组学,揭示肿瘤-基质交互和巨噬细胞招募在膀胱癌化疗耐药中的新机制,并发现SPP1作为潜在的预测生物标志物 未提及具体局限性 探究肿瘤-基质交互和巨噬细胞招募在膀胱癌化疗耐药中的机制 肌层浸润性膀胱癌患者的肿瘤组织 数字病理学 膀胱癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 64个样本的空间转录组数据 NA 空间转录组学 NA NA
1229 2026-06-02
Microglial dynamics and ferroptosis induction in human iPSC-derived neuron-astrocyte-microglia tri-cultures
2026-Jun, FEBS open bio IF:2.8Q3
研究论文 利用人诱导多能干细胞来源的神经元-星形胶质细胞-小胶质细胞三元共培养模型,研究小胶质细胞的动态变化及铁死亡诱导 首次在人类iPSC来源的三元共培养系统中系统刻画小胶质细胞与神经元及星形胶质细胞的互作,并发现补体C3可作为评估胶质细胞互作影响的生物标志物;同时在该模型中验证了小胶质细胞铁死亡机制 未提及具体局限性 探究神经元-星形胶质细胞-小胶质细胞三元共培养系统中小胶质细胞的转录状态、细胞互作及铁死亡诱导机制 人诱导多能干细胞来源的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 三元共培养模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1230 2026-06-02
A Tumor-Promoting Inflammatory SPP1+ Macrophage-IL6-CRP Axis Drives Immune Dysfunction in Bladder Cancer
2026-Jun-01, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 揭示SPP1+巨噬细胞-IL6-CRP炎症轴在膀胱癌中驱动免疫功能障碍的机制 首次通过大规模单细胞RNA测序整合分析,明确系统性炎症(IL6/CRP)与肿瘤微环境中SPP1+巨噬细胞富集的关联,并验证该轴通过IL6信号抑制T细胞活性 NA 探究膀胱癌中系统性炎症标志物CRP/IL6与肿瘤微环境免疫抑制的关系及机制 尿路上皮膀胱癌患者的血浆及肿瘤组织样本 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 基因表达数据, 血浆蛋白数据 多个免疫检查点阻断治疗队列的血浆样本及迄今最大规模膀胱癌单细胞图谱数据 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq批量RNA测序
1231 2026-06-02
A Single-Cell Analysis Reveals Macrophage Heterogeneity Driving Plaque Vulnerability in Coronary and Carotid Arteries
2026-Jun-01, Journal of atherosclerosis and thrombosis IF:3.0Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示冠状动脉和颈动脉斑块中巨噬细胞异质性驱动易损性的机制 首次整合多个RNA速率推断方法(原始RNA速率、动态RNA速率、TFvelo和CellRank),发现冠状动脉和颈动脉斑块中共享的向IL1B+炎症巨噬细胞的分化轨迹,并揭示不同血管床中糖酵解途径的差异激活模式 研究基于已有数据集(GSE184073和GSE253903),样本量和数据集来源可能限制结果的普适性 比较急性冠脉综合征和慢性冠脉综合征,以及症状性和无症状性颈动脉疾病的巨噬细胞异质性,寻找疾病特异性治疗策略 冠状动脉粥样硬化斑块和颈动脉粥样硬化斑块中的髓系细胞(巨噬细胞) 计算机视觉 心血管疾病 单细胞RNA测序 RNA速率模型(原始、动态、TFvelo、CellRank) 基因表达数据 两个公共数据集:GSE184073(冠状动脉疾病)和GSE253903(颈动脉疾病) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1232 2026-06-02
Spermidine Mitigates Immune Cell Senescence and Boosts Vaccine Responses in Healthy Older Adults-A Pilot Study
2026-Jun, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 一项试点研究评估亚精胺对健康老年人免疫细胞衰老和疫苗应答的影响 首次在人体随机对照试验中证明亚精胺能逆转免疫衰老标志物并增强疫苗特异性B细胞和抗体反应 样本量较小(40人),且为试点研究,需更大规模试验验证 评估亚精胺对老年人疫苗诱导免疫应答的安全性和效果 65岁以上健康老年人,接种新冠疫苗第三剂后 机器学习 老年病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 40名65岁以上老年人 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
1233 2026-06-02
The transcriptional atlas, intercellular communication, and metabolic reprogramming of the cartilage and synovium in osteoarthritis patients with diabetes mellitus : a multiomics study
2026-Jun-01, Bone & joint research IF:4.7Q1
研究论文 通过多组学分析揭示糖尿病如何加剧骨关节炎的细胞和分子机制 首次通过单细胞RNA测序、批量RNA测序和代谢组学联合分析,构建了2型糖尿病骨关节炎患者软骨与滑膜的转录组图谱、细胞间通讯网络及代谢重编程特征 未提及具体局限性 阐明糖尿病加剧骨关节炎的细胞与分子机制 21例骨关节炎或2型糖尿病骨关节炎患者的膝关节软骨和滑膜组织 机器学习和数字病理学 骨关节炎,糖尿病 单细胞RNA测序,批量RNA测序,代谢组学分析 NA 转录组数据,代谢组数据 21例患者样本 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序,代谢组学 NA NA
1234 2026-06-02
Peroxisomal DBP deficiency causes male infertility through disruption of lipid homeostasis in Drosophila
2026-Jun-01, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 该论文利用果蝇模型结合单细胞RNA测序分析,研究了过氧化物酶体DBP缺乏导致男性不育的致病机制,发现Mfe2(人类HSD17B4的果蝇同源物)缺失破坏脂质稳态,导致精子发生缺陷 首次利用果蝇DBP缺乏模型结合单细胞RNA测序分析,揭示了Mfe2缺失通过干扰脂质稳态(尤其是磷脂酰肌醇衍生物)导致精子发生障碍的分子机制,并通过补充多不饱和磷脂部分挽救细胞分裂缺陷 未明确说明研究局限性,但可能包括:果蝇模型与人类之间的物种差异、饮食补充部分挽救而非完全恢复表型、未深入探讨其他脂质代谢途径的潜在贡献 阐明过氧化物酶体DBP缺乏导致男性不育的致病机制 果蝇Mfe2突变体的精子发生过程,包括精原细胞、精母细胞及细胞分裂行为 数字病理学 男性不育 单细胞RNA测序、脂质组学分析 果蝇突变模型(Mfe2敲除) 单细胞转录组数据、脂质组学数据 果蝇睾丸组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1235 2026-06-02
CCDC6, a ferroptosis-related gene, modulates stemness features of pancreatic cancer cells in vitro
2026-Jun-01, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,鉴定铁死亡相关基因CCDC6在胰腺癌中调控干细胞特性的作用 首次将铁死亡相关基因CCDC6与胰腺癌干细胞特性调控联系起来,并构建了基于铁死亡相关基因的预后模型 仅进行了体外实验验证,缺乏体内实验数据支持 鉴定铁死亡相关基因作为胰腺癌预后标志物,构建风险预测模型,并探索其生物学机制 胰腺癌细胞及其干细胞特性 机器学习 胰腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 风险预测模型 转录组数据, 单细胞测序数据 独立数据集用于验证 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1236 2026-06-02
Hybrid untargeted short-read and targeted long-read RNA sequencing facilitates genotype-phenotype associations at single-cell resolution
2026-Jun-01, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出一种结合非靶向短读长和靶向长读长RNA测序的混合策略,以在单细胞分辨率下实现基因型-表型关联分析 首次系统比较短读长全转录组扩增、长读长全转录组扩增和长读长靶向测序,并开发基于Snakemake管道的混合策略,结合两者的优势 长读长全转录组扩增的限制在于低读段覆盖度,限制了单细胞分辨率的基因型-表型分析 在单细胞分辨率下实现基因型-表型关联分析 短读长全转录组扩增、长读长全转录组扩增和长读长靶向测序数据 自然语言处理 不适用 RNA测序 不适用 RNA序列数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
1237 2026-06-02
Single-Cell Annotation and Localization via Integrating Spatial Transcriptomics Maps the Mouse Ocular Atlas and RAO Dynamics
2026-Jun-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过整合空间转录组学技术开发ASCAL流程,构建小鼠全眼单细胞空间图谱并揭示视网膜动脉闭塞的细胞时空动态变化 提出了ASCAL流程,结合单核分辨率SeekSpace和均匀覆盖Stereo-seq两种空间转录组技术,实现大规模单细胞RNA测序数据的自动注释和定位,无需大量空间切片即可构建全眼单细胞空间图谱 标题和摘要未提及具体局限性 开发单细胞注释与定位方法并绘制小鼠眼部细胞图谱,解析视网膜动脉闭塞的病理机制 小鼠全眼组织及视网膜动脉闭塞模型 单细胞组学与空间转录组学 视网膜动脉闭塞 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光染色、RNAscope分析 NA 空间转录组数据、单细胞转录组数据 小鼠全眼组织样本(具体数量未提及)及视网膜动脉闭塞模型样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 SeekSpace、Stereo-seq 单核分辨率SeekSpace用于细胞注释参考,均匀覆盖Stereo-seq用于注释细胞定位
1238 2026-06-02
The role of MXRA7 in bone marrow senescence involves macrophage polarization and microenvironment remodeling
2026-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
研究论文 研究MXRA7在骨髓衰老中的作用,涉及巨噬细胞极化和微环境重塑 首次揭示MXRA7通过调控巨噬细胞极化和微环境信号通路影响骨髓衰老 未在人类样本中验证,且机制仅基于小鼠模型,可能不直接适用于人类 探究MXRA7在骨髓衰老中的作用机制 年轻和老年野生型及MXRA7基因敲除小鼠的骨髓细胞 单细胞转录组学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 2月龄和2年龄小鼠的骨髓细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
1239 2026-06-02
Oncogenic PIK3CA mutations shape an immunoregulatory microenvironment in mosaic overgrowth disorders
2026-Jun, PNAS nexus IF:2.2Q1
研究论文 该研究表明致癌性PIK3CA突变通过代谢重编程和免疫微环境重塑驱动过度生长疾病中的组织过度生长和免疫抑制 首次揭示PIK3CA突变在非肿瘤性过度生长疾病中通过Warburg样效应和TREM2+巨噬细胞浸润重塑免疫微环境,与肿瘤微环境相似 过度生长障碍的罕见性限制了人类样本的可及性;结论主要基于小鼠模型,人类验证样本量可能有限 探究PIK3CA突变在PIK3CA相关过度生长谱系障碍中如何塑造组织微环境 PIK3CA相关过度生长谱系障碍患者和小鼠模型 数字病理学 过度生长障碍 单细胞转录组测序、流式细胞术、多重免疫荧光 NA 基因表达数据、细胞群数据、组织图像 小鼠模型(Adipo-Cre驱动的PIK3CA激活突变)及PIK3CA相关过度生长谱系障碍患者组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
1240 2026-06-02
Organ-Specific Cancer-Associated Fibroblast Subtypes Across the Digestive System Linked to Cancer Hallmarks
2026-Jun-01, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 综合单细胞RNA测序数据定义消化系统器官特异性癌相关成纤维细胞亚型及其与癌症标志的关联 首次整合多个数据集全面定义消化系统腺癌中八种CAF亚型,并揭示其器官特异性分布及与预后的关联 NA 阐明消化系统癌症中CAF的异质性、组织特异性及临床意义 239例消化道腺癌样本及3396例患者的批量转录组数据 生物信息学、计算生物学 消化系统癌症(包括胃肠道腺癌) 单细胞RNA测序、批量转录组测序、空间转录组学 机器学习解卷积模型 基因表达数据 239例单细胞测序样本及3396例批量转录组样本 多个平台 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 多个平台 NA
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