单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2025-10-05 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2025-Jul-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100447
PMID:40329537
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，增强阿尔茨海默病相关表型的差异基因表达分析能力 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序数据整合，实现了皮层层次和细胞类型特异性的差异基因表达分析 | 空间转录组学数据样本量较小，分析仅限于背外侧前额叶皮层组织 | 增强阿尔茨海默病相关表型的空间信息差异基因表达分析能力 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织中的约150万个细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 线性混合模型 | 基因表达数据 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1222 | 2025-10-05 |
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae189
PMID:39212489
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研究论文 | 本文详细介绍通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的实验方案 | 提供了从肺组织和气道分离单细胞并进行全面染色的详细步骤方案 | NA | 探索中性粒细胞在肺部生理和病理条件下的复杂功能 | 小鼠肺部中性粒细胞 | NA | 肺部炎症 | 流式细胞术 | NA | 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1223 | 2025-10-05 |
YBX1/CD36 positive feedback loop-mediated lipid accumulation drives metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.105798
PMID:40083711
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研究论文 | 本研究揭示了YBX1/CD36正反馈环路通过促进肝脏脂质积累驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝病的新机制 | 首次发现YBX1与CD36之间形成正反馈环路，该环路通过增强CD36表达和膜定位促进肝脏脂质积累 | 研究主要基于小鼠模型和原代肝细胞，需要进一步在人类临床试验中验证 | 探究MASLD的发病机制及YBX1在该疾病中的作用 | 小鼠模型、原代肝细胞、人类肝脏样本 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞测序、透射电子显微镜、生物学和组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像、电子显微镜图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1224 | 2025-10-05 |
Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596916
PMID:40936897
|
研究论文 | 通过分析头颈癌单细胞RNA测序数据，发现PRDM6通过调节免疫基因表达促进肿瘤进展 | 首次发现PRDM6在促进肿瘤细胞增殖中的新作用，并揭示HPV病毒癌蛋白通过上调PRDM6表达与HPV阳性头颈癌相关 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌中转录因子-免疫应答基因网络对肿瘤进展的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | IRIS3 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1225 | 2025-10-05 |
MAIT Cells with High PFN1 Expression Mediate Immune Activation and Metabolic Reprogramming in Psoriasis
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S535795
PMID:40948612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传分析揭示了MAIT细胞及其高表达基因PFN1在银屑病免疫激活和代谢重编程中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析，发现PFN1高表达的MAIT细胞在银屑病中介导免疫激活和代谢重编程 | 样本量较小（3例银屑病患者和2例对照），且PFN1表达与银屑病风险缺乏显著的遗传共定位证据 | 探索银屑病的细胞和分子机制，特别关注MAIT细胞的作用 | 银屑病患者和健康对照的皮肤组织样本 | 单细胞基因组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 基因表达谱分析, 孟德尔随机化分析, 富集分析 | 细胞分化轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 遗传数据 | 5例样本（3例银屑病，2例对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1226 | 2025-10-05 |
Enhancing natural killer cell anti-tumour activity through macrophage manipulation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1656925
PMID:40948757
|
综述 | 本文探讨通过调控肿瘤相关巨噬细胞来增强自然杀伤细胞抗肿瘤活性的策略 | 系统阐述巨噬细胞与NK细胞相互作用的双重调控机制及其在肿瘤免疫治疗中的转化潜力 | NA | 探索通过巨噬细胞干预增强NK细胞抗肿瘤功能的治疗策略 | 肿瘤微环境中的巨噬细胞和自然杀伤细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1227 | 2025-10-05 |
Multi-omics approach to personalised treatment: insights into thrombus-derived exosome regulation in cardiomyocyte ferritinophagy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1607355
PMID:40948766
|
研究论文 | 本研究首次揭示血栓来源外泌体通过FENDRR-m6A-NCOA4调控轴介导心肌细胞铁蛋白自噬在1型心肌梗死中的关键作用 | 首次发现血栓来源外泌体通过lncRNA FENDRR与P53协同调控m6A修饰，揭示铁蛋白自噬与免疫炎症反应的关联机制 | 铁蛋白自噬在T1MI中的具体作用机制仍需进一步阐明 | 系统分析铁蛋白自噬在1型心肌梗死中的作用机制及其与免疫炎症反应的潜在联系 | 1型心肌梗死患者冠状动脉血栓来源外泌体及心肌细胞 | 多组学分析 | 心血管疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,RIP,FISH,ChIP,m6A甲基化实验,生物信息学分析 | 心肌细胞模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 1型心肌梗死患者冠状动脉血栓样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1228 | 2025-10-05 |
Dissecting the immune evasion and therapeutic resistance mechanisms in EGFR/TP53 co-mutated non-small cell lung cancer: implications for targeted and immunotherapy strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652213
PMID:40948762
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌的免疫逃逸和治疗抵抗机制 | 首次在单细胞层面发现EGFR/TP53共突变NSCLC中两种恶性上皮细胞亚群的协同作用机制，并揭示STAT1/ETS1转录调控网络的核心作用 | 样本量较小（仅4例进行单细胞测序），需要在更大患者队列和功能研究中进一步验证 | 探究EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌的分子机制及治疗策略 | 40例住院NSCLC患者的福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 下一代测序 | NA | 基因表达数据, 突变数据 | 40例NSCLC患者，其中4例EGFR/TP53共突变样本进行单细胞测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | 10x Genomics单细胞转录组测序平台 |
| 1229 | 2025-10-05 |
Integrative transcriptomic and machine learning analyses identify HDAC9 as a key regulator of mitochondrial dysfunction and senescence-associated inflammation in diabetic nephropathy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1627173
PMID:40948769
|
研究论文 | 通过整合转录组学和机器学习分析，鉴定HDAC9作为糖尿病肾病中线粒体功能障碍和衰老相关炎症的关键调控因子 | 首次通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，结合多种机器学习方法系统鉴定糖尿病肾病中线粒体功能障碍和衰老相关的关键基因 | 研究主要基于体外细胞模型验证，缺乏体内动物实验验证；样本来源和数量可能有限 | 探索糖尿病肾病中线粒体功能障碍和衰老相关炎症的分子机制，并寻找潜在治疗靶点 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本和高糖诱导的HK-2肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | RNA-seq, scRNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 机器学习, siRNA基因敲低 | 支持向量机(SVM), 多种机器学习方法 | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | 糖尿病肾病和正常肾脏组织的bulk RNA-seq数据，包含2,176个差异表达基因 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1230 | 2025-10-05 |
Research trends and hotspots in the tumor microenvironment of ovarian cancer: a bibliometrics and visualization study from 2005 to 2024
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1605695
PMID:40948776
|
文献计量学研究 | 对2005-2024年卵巢癌肿瘤微环境研究趋势和热点进行文献计量学与可视化分析 | 首次系统分析卵巢癌肿瘤微环境研究领域的演进历程和热点方向 | 仅基于Web of Science数据库的1720篇文献，可能存在收录偏差 | 探索卵巢癌肿瘤微环境研究的发展趋势和重点领域 | 卵巢癌肿瘤微环境相关研究文献 | 文献计量学 | 卵巢癌 | 文献计量分析、可视化分析 | NA | 文献数据 | 1720篇相关文章 | NA | NA | NA | NA |
| 1231 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling delineates the tumor microenvironment and immunological networks in patient-derived uterine leiomyosarcoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653096
PMID:40948800
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序描绘了子宫平滑肌肉瘤的肿瘤微环境和免疫网络特征 | 首次构建了子宫平滑肌肉瘤的单细胞图谱，识别了转移易感细胞亚群(U11-EDARADD)和以耗竭CD8+T细胞、M2巨噬细胞和N2中性粒细胞为主的免疫抑制微环境 | 样本量较小，仅分析了初治患者的转移病灶，需要更大规模验证 | 解析子宫平滑肌肉瘤的肿瘤微环境特征和免疫抑制机制 | 子宫平滑肌肉瘤患者的转移病灶(盆腔、直肠、腹膜、膀胱)和正常子宫肌层组织 | 数字病理学 | 子宫癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 拷贝数变异分析 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像数据 | 1例初治ULSA患者的多个转移病灶和5例正常对照 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1232 | 2025-10-05 |
Deciphering the role of myofibroblasts in microvascular invasion of hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1596181
PMID:40949143
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示肌成纤维细胞在肝细胞癌微血管侵袭中的作用机制 | 首次在单细胞水平系统解析肌成纤维细胞在肝细胞癌微血管侵袭中的关键作用，发现MF2细胞亚群与血管生成密切相关 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分仅限于细胞系水平 | 探究肝细胞癌微血管侵袭的细胞群体和分子网络机制 | 肝细胞癌患者样本和细胞系 | 单细胞分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,细胞功能实验 | Seurat,DAVID,CellChat,Monocle 2 | 单细胞RNA测序数据,RNA测序数据 | 来自公共数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1233 | 2025-10-05 |
Integrating microarray data and single-cell RNA-seq reveals correlation between kit and nmyc in mouse spermatogonia stem cell population
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1634347
PMID:40950403
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研究论文 | 本研究通过整合微阵列数据和单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠精原干细胞中Kit基因与Nmyc之间的相关性及其在精子发生中的关键作用 | 首次结合微阵列数据和单细胞RNA测序技术系统分析小鼠精原干细胞中Kit基因与Nmyc的共表达关系及其在分化过程中的动态表达模式 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；需要进一步整合基因编辑技术进行功能验证 | 阐明精原干细胞中Kit基因的调控机制及其在精子发生过程中的作用 | 小鼠精原干细胞 | 单细胞测序分析 | 男性不育症 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 免疫细胞化学, 基因本体富集分析, WGCNA, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 小鼠睾丸样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1234 | 2025-10-05 |
Comprehensive analysis of the papillary thyroid carcinoma identifies CSGALNACT1 as a proliferation driver and prognostic biomarker
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1638348
PMID:40950406
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据构建甲状腺乳头状癌高分辨率细胞图谱，鉴定CSGALNACT1作为增殖驱动因子和预后生物标志物 | 首次整合多个单细胞RNA测序数据集构建PTC高分辨率细胞图谱，发现29个细胞亚群并鉴定CSGALNACT1作为关键预后基因 | 研究样本量相对有限（20个人类甲状腺样本），需要更大规模验证 | 解析甲状腺乳头状癌的细胞异质性并确定预后决定因素 | 人类甲状腺组织样本，包括健康和肿瘤组织 | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归模型，Cox风险比例模型 | 单细胞RNA测序数据 | 20个人类甲状腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1235 | 2025-10-05 |
Identification of Novel Biomarkers Associated with Corticosteroid Resistance in Asthma by Bioinformatics Analysis and Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S527640
PMID:40951447
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证识别与哮喘皮质类固醇抵抗相关的新型生物标志物 | 首次发现TNS1、ABCC4和TNFRSF21三个关键基因与香烟烟雾诱导的哮喘皮质类固醇抵抗相关，并揭示TNS1通过促进巨噬细胞M2极化参与该过程 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步深入验证 | 探索与香烟烟雾诱导的哮喘皮质类固醇抵抗相关的潜在生物标志物和治疗靶点 | 哮喘患者、哮喘小鼠模型、Raw264.7细胞系 | 生物信息学 | 哮喘 | 差异基因表达分析、WGCNA、GO/KEGG富集分析、ROC分析、CIBERSORT免疫细胞浸润分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个GEO数据集(GSE230048和GSE13896)、哮喘患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1236 | 2025-10-05 |
Vispro improves imaging analysis for Visium spatial transcriptomics
2024-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617088
PMID:39416029
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研究论文 | 开发了专为10x Visium数据设计的端到端自动化图像处理工具Vispro，用于提升空间转录组学图像分析质量 | 首个针对Visium数据的全自动图像处理工具，集成了基准标记检测与去除、图像修复、组织区域检测和分割四个关键模块 | 目前仅针对10x Visium平台数据，未验证在其他空间转录组技术上的适用性 | 解决空间转录组学图像中基准标记和背景区域对分析造成的干扰问题 | 空间转录组学组织图像数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 1237 | 2025-10-05 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
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综述 | 本文探讨单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用现状及其与传统方法的权衡 | 首次系统评述scRNA-seq在斑马鱼生殖毒理学领域的创新应用潜力，强调其在识别稀有细胞亚型和细胞特异性表达谱方面的独特优势 | 该技术在当前领域仍属未充分开发利用状态，且与传统方法存在技术权衡需要考量 | 探索单细胞RNA测序技术在生殖毒理学研究中的应用前景与方法学比较 | 斑马鱼性腺组织及其在毒物暴露下的细胞反应 | 单细胞组学 | 生殖毒理学 | 单细胞RNA测序, 下一代测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1238 | 2025-10-05 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.10.588953
PMID:38645099
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研究论文 | 本研究通过基因组编辑技术揭示了人类特异性增强子HAR对大脑皮层发育的调控机制 | 首次证明人类特异性增强子HAR通过调控WNT信号通路精细调节神经前体细胞的增殖和神经发生能力 | 研究主要依赖动物模型和类器官，与真实人类大脑发育环境存在差异 | 探索人类特异性基因组区域HAR在皮层发育中的功能作用 | 基因组编辑小鼠、灵长类模型、人类和黑猩猩神经前体细胞及皮层类器官 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑、单细胞RNA测序、活体成像、谱系分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、成像数据 | 多种基因编辑动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1239 | 2025-10-05 |
Intestinal epithelial adaptations to vertical sleeve gastrectomy defined at single-cell resolution
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110805
PMID:38309446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了垂直袖状胃切除术对小鼠小肠上皮细胞的特异性影响 | 首次在单细胞分辨率下系统定义VSG对肠道上皮不同细胞谱系的特异性分子适应机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 阐明垂直袖状胃切除术诱导肠道适应性的细胞分子机制 | 小鼠小肠上皮细胞 | 单细胞组学 | 肥胖和糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 验证的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1240 | 2025-10-05 |
Hypoxia activates SREBP2 through Golgi disassembly in bone marrow-derived monocytes for enhanced tumor growth
2023-11-15, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114032
PMID:37781951
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧通过诱导高尔基体解体和内质网融合激活SREBP2，促进骨髓来源单核细胞胆固醇合成，从而增强肿瘤生长的机制 | 首次发现缺氧通过高尔基体-内质网融合以SCAP非依赖方式激活SREBP2，并在骨髓来源细胞特定谱系中调控胆固醇生物合成 | 研究主要聚焦于骨髓来源单核细胞，其他免疫细胞类型的作用尚未完全阐明 | 探索缺氧环境下骨髓来源细胞中SREBP2激活的分子机制及其在肿瘤进展中的作用 | 骨髓来源细胞（BMDCs）、造血干细胞（HSCs）、单核细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |