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当前共找到 39398 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2026-05-02 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable features from high-resolution spatial omics data
2025-Feb-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.02.636138
PMID:39974940
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研究论文 | scBSP是一个快速准确的开源工具，用于从高分辨率空间组学数据中识别空间可变特征 | 利用稀疏矩阵运算显著提升计算效率和内存使用，能在桌面电脑上10秒内处理超过18万个点的高清空间转录组数据，是当前处理此类数据最快的工具 | 未在文中明确说明局限性 | 开发一种高效计算工具，用于识别高分辨率空间组学数据中的空间可变生物学特征 | 空间组学数据中的空间可变基因和空间可变峰 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 空间转录组学，10x Xenium | NA | 空间组学数据（二维和三维） | 高分辨率空间转录组数据包含19950个基因和181367个点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium空间原位分析平台 |
| 1222 | 2026-05-02 |
Sleeve gastrectomy reveals the plasticity of the human gastric epithelium
2025-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56135-y
PMID:39833151
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研究论文 | 通过组织学和单细胞RNA测序，发现袖状胃切除术导致人类胃上皮细胞重塑，包括产酸壁细胞和肠嗜铬样细胞亚群的变化 | 首次在单细胞水平揭示袖状胃切除术后人类胃上皮的重塑机制，并建立胃泌素调控胃酸稳态的数学模型 | 本文未明确提及局限性 | 探究袖状胃切除术后胃上皮细胞的适应性重塑机制 | 12名接受袖状胃切除术的女性患者的胃上皮细胞 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 非线性比例积分控制模型 | 转录组数据 | 12名女性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1223 | 2026-05-02 |
Detecting gene expression in Caenorhabditis elegans
2025-01-08, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae167
PMID:39693264
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综述 | 介绍秀丽隐杆线虫中检测基因表达的多种方法，包括原位检测、批量RNA测序、单细胞RNA测序和高通量蛋白质组学 | 系统总结了近年来线虫基因表达检测技术的新进展，并提供了选择方法和公开资源的实用指导 | 未深入比较各技术的具体性能指标或局限性，可能缺乏对最新前沿技术（如空间转录组学）的覆盖 | 为线虫基因表达检测方法提供综述和选择指南 | 秀丽隐杆线虫 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 原位杂交 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1224 | 2026-05-02 |
Epigenetic control of antigen presentation failure in osteosarcoma: from single-cell chromatin maps to therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728091
PMID:41383594
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迷你综述 | 本文综述了骨肉瘤中抗原呈递失败的表观遗传调控机制，并阐述了单细胞染色质图谱如何指导恢复肿瘤抗原可见性的治疗策略 | 通过整合单细胞ATAC-seq与单细胞和空间转录组学，解析了HLA、NLRC5及抗原加工基因的启动子-增强子可及性，区分可逆性抑制与固定病变，并将微环境应激与干扰素能力联系起来 | 尽管有令人鼓舞的临床前证据，但疗效将取决于克隆选择、保持干扰素信号传导的治疗安排以及与先天激动剂和免疫检查点阻断剂的合理组合 | 阐明骨肉瘤中抗原呈递失败的表观遗传机制，并概述单细胞染色质分析如何指导恢复肿瘤抗原可见性的策略 | 骨肉瘤肿瘤免疫生态系统中的恶性克隆、分化状态、髓系细胞和T细胞微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 染色质可及性数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1225 | 2026-05-02 |
Development of a Multilayered Prognostic Model for Wilms' Tumor Based on Characteristic Lymphocyte Genes
2025, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/1964582
PMID:41438620
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研究论文 | 基于特征淋巴细胞基因构建Wilms肿瘤多层预后模型 | 首次整合淋巴细胞基因表达与临床因素建立Wilms肿瘤预后列线图，利用单细胞RNA测序数据识别关键基因 | 未提及 | 开发整合遗传和临床因素的Wilms肿瘤预后列线图，提高评估准确性和临床效用 | Wilms肿瘤患者 | 机器学习 | 肾母细胞瘤 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型，列线图 | 基因表达数据 | 125名患者（RNA-seq），2437个样本（scRNA-seq） | 未提及 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 1226 | 2026-05-02 |
Somatic epigenetic drift during shoot branching: a cell lineage-based model
2024-08-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae091
PMID:38809088
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研究论文 | 提出了一个基于细胞谱系的模型，模拟侧枝形成过程中体细胞表观遗传漂变对分生组织表观遗传多样性的影响 | 首次将体细胞表观遗传漂变与侧枝形成的脱离子叶模型结合，预测了茎尖分生组织DNA甲基化异质性在发育过程中收敛于非零状态 | 模型假设自由细胞独立性最大化，可能简化了不同物种或环境条件下的实际分支过程复杂性 | 探索侧枝形成过程中体细胞表观遗传漂变的动态及其对分生组织表观遗传变异的影响 | 植物茎尖分生组织和腋芽前体细胞 | 机器学习 | NA | NA | 细胞谱系模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1227 | 2026-05-02 |
scRNA-seq reveals that origin recognition complex subunit 6 regulates mouse spermatogonial cell proliferation and apoptosis via activation of Wnt/β-catenin signaling
2024-01-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202330
PMID:37788012
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现ORC6通过激活Wnt/β-catenin信号调控小鼠精原细胞增殖与凋亡 | 首次揭示ORC6在精原细胞中上调并通过Wnt/β-catenin信号通路调控精原细胞增殖与凋亡 | 研究仅限于小鼠C18-4细胞系，需在体内实验进一步验证 | 探究ORC6基因在精原细胞增殖和凋亡中的作用机制 | 小鼠睾丸精原细胞及C18-4细胞系 | 单细胞转录组学 | 生殖相关疾病 | scRNA-seq, 西方印迹, 免疫荧光, EdU, TUNEL, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 细胞系实验数据 | 小鼠睾丸组织样本及C18-4细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1228 | 2026-05-02 |
Identification and Validation of Cytotoxicity-Related Features to Predict Prognostic and Immunotherapy Response in Patients with Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/3468209
PMID:39247556
|
研究论文 | 基于细胞毒性相关特征构建并验证透明细胞肾细胞癌患者预后及免疫治疗反应预测模型 | 首次利用单细胞RNA测序数据鉴定细胞毒性相关T细胞簇，并基于此构建预后风险模型，结合免疫浸润分析评估免疫治疗反应 | 仅依赖公共数据集GSE224630，缺乏独立外部验证队列；模型临床转化需进一步前瞻性研究验证 | 开发基于细胞毒性相关特征的预后模型，指导ccRCC患者免疫治疗决策 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者 | 机器学习和数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因共表达网络分析（WGCNA）、免疫浸润分析（CIBERSORT、MCP-counter、TIMER） | Cox比例风险模型、列线图 | 单细胞转录组数据和批量转录组数据 | GSE224630数据集中的ccRCC样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1229 | 2026-05-02 |
Vimentin promotes glioma progression and maintains glioma cell resistance to oxidative phosphorylation inhibition
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00844-3
PMID:37646965
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研究论文 | 本研究揭示了波形蛋白在胶质瘤进展中的作用及其维持肿瘤细胞对氧化磷酸化抑制耐药性的机制 | 首次系统阐明VIM在胶质瘤中通过调节氧化磷酸化抑制敏感性影响肿瘤进展和免疫浸润，并提出联合靶向VIM的免疫治疗新策略 | 未提及临床样本验证及具体分子机制的深入探讨 | 探究VIM在胶质瘤进展及氧化磷酸化抑制敏感性中的作用，为胶质瘤治疗提供潜在靶点 | 胶质瘤细胞及公共数据库中的胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 甲基化数据 | 基于TCGA、HPA、CGGA等多个公共数据库的胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1230 | 2026-05-02 |
TGF-β-p-STAT1-LAIR2 axis has a "self-rescue" role for exhausted CD8+ T cells in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00830-9
PMID:37223874
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研究论文 | 本研究揭示了TGF-β在肝细胞癌中通过TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴对耗竭CD8+ T细胞产生“自我救援”作用 | 首次发现TGF-β在诱导CD8+ T细胞耗竭的同时，通过TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴启动细胞内在的抗耗竭机制，即“自我救援” | “自我救援”行为对TGF-β刺激具有时间和剂量限制，易被更强的抑制信号掩盖 | 研究TGF-β对肝细胞癌浸润CD8+ T细胞功能的调控效应及分子机制 | 肝细胞癌中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术, 质谱流式细胞术, 免疫组织化学, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因实验 | NA | 图像, 文本, 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1231 | 2026-05-02 |
MTHFD2 ablation in T cells protects against heart transplant rejection by perturbing IRF4/PD-1 pathway through the metabolic-epigenetic nexus
2023-11, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.07.009
PMID:37495036
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研究论文 | 揭示MTHFD2在T细胞中通过代谢-表观遗传学影响IRF4/PD-1通路从而保护心脏移植免受排斥的机制 | 首次发现一碳代谢酶MTHFD2作为同种反应T细胞的代谢检查点，通过H3K4me3介导的代谢-表观遗传学机制影响IRF4/PD-1通路，并提出其作为心脏移植排斥治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，且未深入探讨MTHFD2在其他免疫细胞中的作用或其长期治疗效果 | 研究一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥中的作用及其机制，评估其作为治疗靶点的可能性 | 人类和鼠类心脏移植受体的心脏组织、T细胞特异性Mthfd2基因敲除小鼠、人源化皮肤移植模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、酶联免疫斑点法、切割靶点与标记法 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | 人类和鼠类心脏移植受体心脏组织，小鼠T细胞特异性Mthfd2基因敲除模型，人源化皮肤移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1232 | 2026-05-02 |
Dissecting the single-cell transcriptome network of macrophage and identifies a signature to predict prognosis in lung adenocarcinoma
2023-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00816-7
PMID:37079186
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌中不同来源巨噬细胞的功能差异并构建预后预测模型 | 首次根据来源将巨噬细胞分为肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞，并阐明其在肿瘤微环境中的不同功能及预后价值 | 未提及具体局限性 | 探索不同来源巨噬细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的功能及作为预后和治疗预测标志物的潜力 | 肺腺癌患者的肿瘤组织、正常肺组织和外周血样本中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | 21例肺腺癌、12例正常和4例外周血样本用于单细胞分析；502例TCGA患者用于构建模型；544例GEO数据集患者用于验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1233 | 2026-05-02 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1118024
PMID:36968839
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研究论文 | 利用数字空间转录组学技术分析SARS-CoV-2心肌炎患者冠状动脉内皮细胞的转录特征 | 首次在保留组织原位结构的情况下，通过空间转录组学分析SARS-CoV-2感染对心肌和冠状动脉血管内皮细胞的差异表达影响 | 样本量较小（4例对照，8例COVID-19患者）；未在大血管内皮观察到类似变化，限制了内皮炎作为COVID-19心血管事件关键驱动因素的结论 | 探讨重症COVID-19患者冠状动脉内皮和心肌的转录编程变化 | COVID-19患者和对照尸检心脏组织中的心肌及冠状动脉血管组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 12例尸检心脏组织样本（4例对照，8例COVID-19患者） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1234 | 2026-05-02 |
Colorectal cancer organoid models uncover oxaliplatin-resistant mechanisms at single cell resolution
2022-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-022-00705-5
PMID:36136268
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研究论文 | 利用结直肠癌类器官模型通过单细胞RNA测序揭示奥沙利铂耐药机制 | 建立了来自奥沙利铂耐药和初治患者的患者源性类器官模型，并通过单细胞RNA测序解析耐药细胞群体及相关信号通路和驱动基因 | 未提及具体局限性 | 研究结直肠癌对奥沙利铂化疗耐药的分子机制 | 来自奥沙利铂耐药和初治结直肠癌患者的患者源性类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两株患者源性类器官（来自耐药和初治患者各一株） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1235 | 2026-05-02 |
Molecular signaling in pancreatic ductal metaplasia: emerging biomarkers for detection and intervention of early pancreatic cancer
2022-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-022-00664-x
PMID:35290607
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综述 | 总结了胰腺导管化生的分子机制及其作为早期胰腺癌检测和干预生物标志物的潜力 | 通过整合基因工程小鼠模型、细胞谱系追踪和单细胞测序等最新技术，揭示了PDM形成和演化的新型细胞和分子机制，并探讨其作为早期胰腺癌生物标志物的临床应用前景 | 基于综述性分析，可能缺乏原始实验数据支持，且PDM标志物向临床转化的有效性需进一步验证 | 阐释胰腺导管化生的细胞和分子机制，并探讨其作为早期胰腺癌筛查和干预生物标志物的潜在价值 | 胰腺导管化生细胞及其基因调控网络 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序，细胞谱系追踪 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 可能使用10x Chromium平台进行单细胞转录组分析 |
| 1236 | 2026-05-02 |
A comprehensive prognostic signature for glioblastoma patients based on transcriptomics and single cell sequencing
2021-Aug, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-021-00612-1
PMID:34142341
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研究论文 | 基于转录组学和单细胞测序构建胶质母细胞瘤综合预后标志物 | 结合TCGA和CGGA数据库筛选出七种差异表达基因作为预后标志物，并利用单细胞测序分析这些基因在肿瘤细胞增殖和进展中的功能，最终构建了综合临床特征和基因谱的预后模型 | 模型主要基于公共数据集，可能在外部验证数据中表现待进一步确认，且老年患者亚组的特异性表现需更多研究支持 | 揭示胶质母细胞瘤的潜在预后标志基因并构建有效的预后模型 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞测序, 实时定量PCR | 预后风险评分模型 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和CGGA数据库中的胶质母细胞瘤患者样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1237 | 2026-05-02 |
1p/19q co-deletion status is associated with distinct tumor-associated macrophage infiltration in IDH mutated lower-grade gliomas
2021-Feb, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-020-00561-1
PMID:32915415
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研究论文 | 本研究探讨1p/19q共缺失状态对IDH突变低级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞浸润的影响 | 首次揭示1p/19q共缺失状态与IDH突变低级别胶质瘤中TAM表型及浸润程度的关联，并发现M-CSF和TGFβ1信号通路可能介导这一过程 | 研究主要依赖TCGA转录组数据和有限样本的免疫染色，小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 确定1p/19q共缺失状态是否影响IDH突变低级别胶质瘤中TAM的表型或浸润程度 | IDH突变低级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 脑胶质瘤 | RNA-seq、单细胞RNA测序、免疫染色、小分子抑制剂 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、组织样本图像 | 230个TCGA样本及IDH突变LGG原代样本 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1238 | 2026-05-01 |
HOX code-based stratification reveals RUNX1T1-HDAC reprogramming as a targetable driver of lineage plasticity across cancers
2026-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218465
PMID:41912135
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研究论文 | 通过分析80,000多个RNA-seq样本的HOX基因表达，发现HOX代码能够跨癌种区分谱系受限和谱系可塑性状态，并揭示RUNX1T1-HDAC轴作为可治疗靶点 | 首次建立基于HOX代码的跨癌种谱系可塑性分类框架，发现RUNX1T1作为跨谱系可塑性调节因子，并验证HDAC3抑制可作为治疗策略 | 未明确提及，但可能包括机制验证主要基于前列腺癌模型，以及临床验证样本范围的潜在限制 | 探索HOX代码作为跨癌种谱系可塑性生物标志物的可行性，并鉴定潜在治疗靶点 | 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病的谱系可塑性亚型及相关细胞模型 | 机器学习 | 前列腺癌、肺癌、急性髓系白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&RUN, 共免疫沉淀, 脂质纳米颗粒 | 人工智能结构建模 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 染色质图谱数据 | 超过80,000个RNA-seq样本，涵盖23种癌症类型的114个亚型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1239 | 2026-05-01 |
AMPK-p38 axis converts human pluripotent stem cells to naive state
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115569
PMID:42058906
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研究论文 | 本研究发现AMPK-p38轴可单独诱导人类多能干细胞（hPSCs）从始发态向原始态转化，并揭示了中间状态细胞的特征 | 首次发现AMPK/p38通路单因子即可驱动始发态hPSC向原始态转变，无需多种外源因子；通过scRNA-seq与RNA速率分析揭示了始发态与原始态之间的中间细胞状态 | 未提及具体局限性，可能需要进一步验证AMPK-p38通路的长期稳定性和安全性 | 探索将人类多能干细胞从始发态高效转化为原始态的新机制与简化方法 | 人类多能干细胞（hPSCs）在始发态与原始态之间的转化过程及中间状态细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，研究基于细胞系实验及单细胞分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 使用10x Chromium平台进行单细胞RNA测序，结合RNA速率分析和Totem轨迹映射分析中间状态 |
| 1240 | 2026-05-01 |
Single-Cell Profiling Reveals Divergent Mechanisms of Fibrosis in Localized Scleroderma and Systemic Sclerosis
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70039
PMID:41451447
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化的不同机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较两种纤维化疾病的机制差异，发现局限性硬皮病中三级淋巴结构驱动的局部免疫激活，而系统性硬化症中CREB3L1高表达成纤维细胞的系统性活化 | 样本量较小（每组仅3例患者），且未进行大规模队列验证 | 阐明局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化差异的分子机制 | 皮肤活检样本（3例健康对照、3例局限性硬皮病患者、3例系统性硬化症患者）及小鼠模型 | 数字病理学 | 纤维化疾病（局限性硬皮病、系统性硬化症） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9例皮肤活检样本（3例健康对照、3例局限性硬皮病、3例系统性硬化症） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |