单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28721 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2025-05-28 |
Super-resolution imaging informed scRNA sequencing analysis reveals the critical role of GDF15 in rejuvenating aged hematopoietic stem cells
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000236
PMID:40416726
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研究论文 | 本文通过超分辨率成像和单细胞RNA测序分析，揭示了GDF15在衰老造血干细胞再生中的关键作用 | 结合超分辨率显微镜和单细胞RNA测序技术，首次揭示了GDF15在调节线粒体信号和形态以影响造血干细胞命运中的新作用 | 研究样本量相对较小，仅涉及约200个年轻和年老小鼠的造血干细胞 | 探索造血干细胞衰老过程中线粒体形态变化的分子和细胞机制 | 年轻和年老小鼠的造血干细胞 | 数字病理学 | 老年病 | 超分辨率显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA序列数据 | 约200个年轻和年老小鼠的造血干细胞 |
| 1222 | 2025-05-28 |
Cellular hierarchies of embryonal tumors with multilayered rosettes are shaped by oncogenic microRNAs and receptor-ligand interactions
2025-May-26, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00964-9
PMID:40419763
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和多重空间成像技术，分析了11例ETMR患者的样本，揭示了ETMR的细胞层次结构和致癌机制 | 揭示了C19MC在干细胞样细胞中的主要表达及其对干细胞性和谱系承诺的转录网络的控制，同时发现了成纤维细胞生长因子受体和Notch信号作为致癌通路的新靶点 | 样本量较小（11例ETMR患者样本），可能影响结果的普遍性 | 研究ETMR的细胞层次结构和致癌机制，为更有效的靶向治疗提供理论基础 | ETMR（多层玫瑰花结胚胎性肿瘤）患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 儿科脑肿瘤 | 单细胞转录组学、多重空间成像 | NA | 转录组数据、图像数据 | 11例ETMR患者样本 |
| 1223 | 2025-05-28 |
Exploiting the endothelial-immune axis to improve radiotherapy efficacy
2025-May-26, The British journal of radiology
DOI:10.1093/bjr/tqaf114
PMID:40419861
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review | 本文探讨了内皮细胞在放疗中对免疫细胞招募的调控作用及其对治疗效果的影响 | 提出通过靶向内皮细胞来调节免疫反应，以提高放疗的治疗增益 | 需要更多体内实验数据来验证内皮细胞在放疗中的具体作用机制 | 研究内皮细胞在放疗中对免疫细胞招募的调控作用及其对治疗效果的影响 | 内皮细胞、免疫细胞、肿瘤组织和正常组织 | 肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 动物模型和人类患者样本 |
| 1224 | 2025-05-28 |
An inducible mouse model of osteogenesis imperfecta type V reveals aberrant osteogenesis caused by Ifitm5 c.-14C>T mutation
2025-May-24, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf022
PMID:39908237
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research paper | 该研究开发了一种可诱导的小鼠模型，用于探索由IFITM5基因c.-14C>T突变引起的V型成骨不全症的致病机制 | 开发了一种可诱导的小鼠模型，克服了以往模型胚胎致死的问题，并利用单细胞RNA测序技术揭示了SOX9异常表达和骨生成、软骨生成及脂肪生成平衡失调的致病机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证 | 探究V型成骨不全症的分子机制 | 携带Ifitm5 c.-14C>T突变的小鼠模型 | 遗传疾病研究 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序 | 可诱导小鼠模型(Ifitm5flox c.-14C>T) | 基因表达数据 | 多种Cre重组酶诱导的突变小鼠模型(Prx1-Cre, Col1a1-Cre, Ocn-Cre) |
| 1225 | 2025-05-28 |
Analyses of single-cell RNA sequencing uncover the role of intratumoral Helicobacter pylori in shaping tumor progression and immunity in gastric cancer
2025-May-24, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04048-6
PMID:40411560
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤内幽门螺杆菌在胃癌进展和免疫中的作用 | 使用SAHMI流程系统性地恢复和去噪人类临床组织中的微生物信号，并在单细胞转录组水平上研究肿瘤-微生物相互作用 | NA | 探究肿瘤内微生物群在胃癌发生和进展中的作用 | 胃癌组织中的细胞群和幽门螺杆菌 | digital pathology | gastric cancer | single-cell RNA sequencing, fluorescence in situ hybridization, immunohistochemistry | NA | RNA sequencing data, image data | 一个大型胃癌队列中的多个肿瘤和正常样本 |
| 1226 | 2025-05-28 |
Unraveling the significance of cuproptosis in hepatocellular carcinoma heterogeneity and tumor microenvironment through integrated single-cell sequencing and machine learning approaches
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02696-9
PMID:40411678
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和机器学习方法，揭示铜死亡在肝细胞癌异质性和肿瘤微环境中的重要性 | 首次将铜死亡与肝细胞癌的异质性和肿瘤微环境联系起来，并构建了基于铜死亡相关基因的风险评分模型和预后列线图 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，缺乏实验验证 | 提高肝细胞癌的预后预测和个性化治疗策略 | 肝细胞癌（HCC）细胞亚群 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | LASSO回归，多变量Cox回归 | RNA测序数据 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的数据 |
| 1227 | 2025-05-28 |
Prognostic model identification of ribosome biogenesis-related genes in pancreatic cancer based on multiple machine learning analyses
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02733-7
PMID:40411705
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研究论文 | 本研究通过多机器学习分析识别了胰腺癌中与核糖体生物合成相关的基因，构建了一个预后风险模型 | 首次结合机器学习算法和单细胞RNA测序分析，筛选出9个关键生物标志物，揭示了核糖体生物合成在胰腺癌进展和治疗抵抗中的关键作用 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索胰腺癌中核糖体生物合成的分子机制，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 胰腺癌患者和相关的基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习算法 | Cox回归和多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胰腺癌样本，以及GSE155698单细胞RNA测序数据集 |
| 1228 | 2025-05-28 |
Dissecting PTPN7-driven aggressiveness in IDH-wildtype astrocytomas: multi-omics, clinical validation, and spatial transcriptomics for prognostic insights
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02662-5
PMID:40413344
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研究论文 | 本研究探讨了PTPN7在IDH野生型星形细胞瘤中的预后意义、空间分布及免疫相关功能，旨在阐明其作为胶质瘤治疗预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次全面评估PTPN7在胶质瘤中的预后价值和免疫调节作用，并利用空间转录组学技术揭示其空间分布特征 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证PTPN7的具体作用机制 | 探索PTPN7作为胶质瘤预后生物标志物和免疫调节因子的潜力 | IDH野生型星形细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫组化 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本，70例免疫组化验证病例 |
| 1229 | 2025-05-28 |
Compromised efferocytosis during aging is related to COVID-19 severity in mice
2025-May-24, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.05.008
PMID:40419113
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研究论文 | 本研究通过建立老年小鼠COVID-19模型，揭示了老年个体中SARS-CoV-2感染后免疫细胞景观的变化及炎症反应过度激活的机制 | 首次在老年小鼠模型中揭示了efferocytosis（凋亡细胞清除）功能受损与COVID-19严重程度的关系 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 探究老年个体COVID-19病情加重的免疫学机制 | 老年小鼠的肺组织免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | 老年小鼠COVID-19模型 | 基因表达数据 | 未明确说明小鼠数量 |
| 1230 | 2025-05-28 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2025-May-22, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173
PMID:40401371
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research paper | 该研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4/5在肺动脉高压（PAH）中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用 | 首次发现FABP4/5在肺动脉高压中的关键作用，并阐明其通过调控内皮细胞糖酵解和动脉编程促进血管重塑的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床转化仍需进一步验证 | 探究FABP4/5在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉内皮细胞、肺动脉高压患者样本和PH大鼠模型 | digital pathology | pulmonary hypertension | single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomic analysis, bulk RNA-seq | Egln1Tie2Cre (CKO) mice, Egln1Tie2Cre/Fabp4/5-/- (TKO) mice | RNA-seq data, histology images | 患者样本和PH大鼠模型（具体数量未明确说明） |
| 1231 | 2025-05-28 |
Cell simulation as cell segmentation
2025-May-22, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02697-0
PMID:40404994
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research paper | 该论文提出了一种名为Proseg的概率分割方法，通过细胞模拟技术改进单细胞空间转录组学中的细胞分割准确性 | 采用ab initio细胞模拟方法，提出Proseg算法，显著提高了细胞分割的形态学合理性和计算效率 | 仅在三种商业平台生成的数据集上进行了基准测试，未涵盖所有可能的实验条件 | 提高单细胞空间转录组学中细胞分割的准确性 | 单细胞空间转录组数据中的细胞边界 | digital pathology | renal cell carcinoma | spatial transcriptomics | probabilistic segmentation model (Proseg) | spatial transcriptomics data | 来自肾细胞癌患者的样本数据 |
| 1232 | 2025-05-28 |
Regulatory network analysis of Dclk1 gene expression reveals a tuft cell-ILC2 axis that inhibits pancreatic tumor progression
2025-May-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115734
PMID:40408246
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研究论文 | 本研究通过Dclk1报告小鼠模型和单细胞RNA测序技术，揭示了Dclk1基因表达的调控网络及其在胰腺肿瘤进展中的作用 | 发现了Dclk1表达的两种细胞群在胰腺肿瘤进展中的对立作用，并揭示了一种保护性的tuft细胞-ILC2轴机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类胰腺肿瘤中的相关性需要进一步验证 | 阐明Dclk1基因表达的调控网络及其在胰腺肿瘤进展中的作用机制 | Dclk1表达的细胞群及其在胰腺肿瘤微环境中的功能 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Dclk1报告小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1233 | 2025-05-28 |
Embryonic mast cells arise from the Cpa3-expressing precursors but not granulocyte-monocyte progenitors
2025-May-22, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2891-1
PMID:40419842
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和新的遗传命运图谱模型，揭示了胚胎期皮肤肥大细胞的起源和发育路径 | 发现了表达Cpa3的前体细胞群在卵黄囊、胎儿肝脏和外周组织中的顺序出现，并证实它们是皮肤肥大细胞的来源，而非粒细胞-单核细胞前体 | 研究主要聚焦于胚胎期的发育过程，对成年期肥大细胞的维持和功能未做深入探讨 | 阐明胚胎期肥大细胞的起源和发育路径 | 胚胎期肥大细胞及其前体细胞 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、遗传命运图谱模型 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎期组织（卵黄囊、胎儿肝脏等）及人类早期卵黄囊和胎儿肝脏样本 |
| 1234 | 2025-05-28 |
Controlling Human Stem Cell-Derived Islet Composition Using Magnetic Sorting
2025-May-21, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.29030
PMID:40400171
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研究论文 | 本研究开发了一种磁性激活细胞分选方法，用于富集干细胞来源的胰岛中的CD49a标记细胞，以改善其治疗1型糖尿病的潜力 | 利用磁性激活细胞分选技术控制干细胞来源胰岛的细胞组成，显著提高了β细胞比例和功能 | 研究仅针对CD49a标记进行富集，未探索其他可能的细胞表面标记 | 改善干细胞来源胰岛的细胞组成和功能，以增强其治疗1型糖尿病的效果 | 人类多能干细胞来源的胰岛细胞 | 干细胞治疗 | 1型糖尿病 | 磁性激活细胞分选、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、免疫染色图像 | 未明确说明具体数量，使用了人类多能干细胞来源的胰岛细胞 |
| 1235 | 2025-05-28 |
Bi-allelic variants in POPDC2 cause an autosomal recessive syndrome presenting with cardiac conduction defects and hypertrophic cardiomyopathy
2025-May-20, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.04.016
PMID:40409267
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研究论文 | 研究发现POPDC2基因的双等位基因变异导致一种表现为心脏传导缺陷和肥厚型心肌病的常染色体隐性综合征 | 首次发现POPDC2基因的双等位基因变异与人类心脏传导缺陷和肥厚型心肌病的直接关联，并通过实验证实这些变异会削弱POPDC2结合cAMP的能力 | 肌肉活检未显示明显的肌病，且样本量相对较小（四个家族） | 探究POPDC2基因变异与心脏传导缺陷和肥厚型心肌病之间的关系 | 四个携带POPDC2双等位基因变异的家族 | 遗传学 | 心血管疾病 | 同源建模、体外电生理研究、单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、电生理数据、RNA测序数据 | 四个家族，超过100万人的群体遗传数据 |
| 1236 | 2025-05-28 |
AI-Driven Multiscale Study on the Mechanism of Polygonati Rhizoma in Regulating Immune Function in STAD
2025-May-20, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c00981
PMID:40415801
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研究论文 | 本研究利用AI驱动的网络药理学、生物信息学和单细胞RNA测序技术，揭示了黄精在调节胃腺癌(STAD)肿瘤免疫微环境中的多靶点机制 | 首次结合AI技术、网络药理学和单细胞RNA测序，系统揭示黄精在STAD中的免疫调节和抗肿瘤机制 | 研究主要基于计算预测和体外实验，需要进一步的体内实验和临床研究验证 | 探索黄精在胃腺癌中的免疫调节机制 | 黄精的活性成分及其在胃腺癌中的作用靶点 | 生物信息学 | 胃腺癌 | AI驱动的网络药理学、生物信息学分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 5,569个免疫相关基因(来自GeneCards)，18个重叠差异表达基因 |
| 1237 | 2025-05-28 |
Single-Cell RNA Sequencing in Incontinentia Pigmenti With Neonatal Encephalopathy Reveals Broad Immune Activation Moderated by Steroids
2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200358
PMID:40020213
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究色素失禁症伴新生儿脑病患者的免疫激活状态及类固醇治疗的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了色素失禁症患者的广泛免疫激活状态及类固醇治疗的调节作用 | 样本量较小（n=1），研究结果可能需要更大样本验证 | 探究色素失禁症伴新生儿脑病患者的细胞特异性基因表达及类固醇治疗的影响 | 色素失禁症伴新生儿脑病患者 | 单细胞测序 | 色素失禁症 | scRNAseq | NA | RNA测序数据 | 1例患者（治疗前后）和1例健康对照 |
| 1238 | 2025-05-28 |
Spatially resolved transcriptomic profiling for glomerular and tubulointerstitial gene expression in C3 glomerulopathy
2025-May, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfaf139
PMID:40416397
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究了C3肾小球病的肾小球和肾小管间质基因表达特征 | 首次在C3肾小球病中应用空间转录组学技术进行亚结构特异性基因表达分析 | 样本量较小（3例C3G病例），且仅使用体外实验进行验证 | 揭示C3肾小球病的转录组特征及其病理机制 | C3肾小球病患者的肾脏活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学（GeoMx Digital Spatial Profiler） | NA | 转录组数据 | 3例C3G病例、7例对照样本和41例其他肾小球肾炎样本 |
| 1239 | 2025-05-28 |
Data standards for single-cell RNA-sequencing of paediatric cancer
2025-May, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70033
PMID:40416408
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研究论文 | 本文系统评估了公开可用的儿科癌症单细胞RNA测序数据集，提出了改进数据存储实践的建议框架 | 首次系统评估儿科癌症scRNA-seq数据的存储现状，并提出标准化建议框架 | 仅关注儿科癌症领域，未涉及其他疾病类型的scRNA-seq数据 | 改善儿科癌症研究中单细胞RNA测序数据的存储标准和使用效率 | 公开可用的儿科癌症单细胞RNA测序数据集 | 基因组学 | 儿科癌症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 488个临床样本，超过130万个细胞 |
| 1240 | 2025-05-28 |
Revolutionizing cancer treatment: Navigating the intricate landscape of cellular signaling networks
2025-May, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/205024
PMID:40418208
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research paper | 探讨癌症治疗中细胞信号网络的动态重编程及其对治疗抵抗的影响 | 利用单细胞多组学、空间转录组学和AI驱动的网络建模等创新技术解析癌症的适应性机制 | 未提及具体研究样本大小或数据类型的限制 | 通过整合系统生物学与计算和实验方法，设计能够克服癌症进化抵抗力的适应性疗法 | 肿瘤细胞、非编码基因组和微环境之间的动态交互作用 | systems biology | cancer | single-cell multi-omics, spatial transcriptomics, AI-powered network modeling | AI-powered network modeling | multi-omics data, spatial transcriptomics data | NA |