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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1221 | 2025-10-05 |
Thyroid differentiation score-related genes and prognostic model for thyroid cancer
2025-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-460
PMID:40950686
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研究论文 | 本研究构建了甲状腺分化评分相关的四基因风险模型用于甲状腺癌预后预测 | 首次将甲状腺分化评分与基因表达特征结合构建甲状腺癌预后模型,并发现UST基因通过p53信号通路调控CD4+记忆细胞的新机制 | 研究基于TCGA单一数据库,缺乏外部验证队列 | 构建甲状腺分化评分相关的预后风险模型并探索潜在生物标志物 | 甲状腺癌患者 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, LASSO回归, Cox回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | TCGA-THCA数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
1222 | 2025-10-05 |
Identification of mechanosensitive ion channel-related molecular subtypes and key genes for ovarian cancer
2025-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1219
PMID:40950697
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研究论文 | 本研究从机械敏感性离子通道角度识别卵巢癌的分子亚型和关键基因 | 首次从机械敏感性离子通道角度对卵巢癌进行分子分型并识别关键基因 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 阐明机械敏感性离子通道在卵巢癌中的功能 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | LASSO,Cox回归 | RNA测序数据,临床数据 | TCGA数据库中的卵巢癌样本 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
1223 | 2025-10-05 |
BIRC5 expression correlates with immunosuppressive phenotype and predicts inferior response to immunotherapy in lung adenocarcinoma
2025-Aug-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-216
PMID:40950902
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研究论文 | 本研究探讨BIRC5表达与肺腺癌免疫抑制表型及免疫治疗疗效的关系 | 首次系统揭示BIRC5表达与肺腺癌免疫微环境特征及免疫检查点抑制剂疗效的关联 | 样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 研究BIRC5对肺腺癌临床特征、肿瘤微环境及预后的影响 | 肺腺癌患者组织样本和接受免疫检查点抑制剂治疗的非小细胞肺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 转录组测序,单细胞测序,免疫浸润分析 | Cox回归分析,log-rank检验 | 转录组数据,临床数据 | 535例肺腺癌样本,59例正常肺组织,54例接受免疫治疗的NSCLC患者 | NA | 转录组测序,单细胞测序 | NA | NA |
1224 | 2025-10-05 |
Cross-platform transcriptomic data integration identifies an overactive neuro-immune signature in human osteoarthritis synovium
2025-Aug-30, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.013
PMID:40889615
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研究论文 | 通过跨平台转录组数据整合分析,鉴定出人类骨关节炎滑膜中过度活跃的神经免疫特征 | 首次通过整合多个公共基因表达数据集,系统识别骨关节炎滑膜中的神经免疫相互作用特征,并构建了滑膜-背根神经节相互作用网络 | 研究主要基于公开数据集,样本量相对有限(139例),且主要关注终末期骨关节炎 | 表征骨关节炎滑膜的转录表型,特别关注与疼痛相关的信号通路 | 人类非骨关节炎和骨关节炎患者的滑膜组织 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 微阵列,RNA测序,单细胞RNA测序,多组学数据分析 | 加权Z检验,基因集富集分析,细胞类型富集分析,调控网络分析 | 基因表达数据 | 153名受试者(质量控制后139名) | NA | 微阵列,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
1225 | 2025-10-05 |
Machine learning integration of bulk and single-cell RNA-seq data reveals glycolytic heterogeneity in colorectal cancer
2025-Aug-30, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03007-6
PMID:40884604
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学数据分析揭示结直肠癌中糖酵解代谢异质性 | 首次系统整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,结合五种特征选择算法识别糖酵解核心调控基因,发现具有高糖酵解状态的肿瘤亚群 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步实验验证调控基因的功能机制 | 探索结直肠癌中糖酵解代谢的调控机制和细胞异质性 | 结直肠癌组织和细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习特征选择算法 | 基因表达数据 | 多中心队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1226 | 2025-10-05 |
Identification of prognostic biomarkers in colorectal cancer through multi-omics profiling of programmed cell death pathways
2025-Aug-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-2024-861
PMID:40950352
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研究论文 | 通过多组学分析程序性细胞死亡通路,识别结直肠癌预后生物标志物 | 整合多组学数据和动态网络生物标志物模型,揭示PCD通路在结直肠癌中的阶段特异性关键转变 | NA | 分析程序性细胞死亡通路在结直肠癌中的作用及其预后价值 | 结直肠癌组织和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞测序,空间转录组学,GSVA,ssGSEA,Cox回归,LASSO回归 | 动态网络生物标志物模型 | 基因组数据,转录组数据 | TCGA数据库结直肠癌样本 | NA | 单细胞测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | NA |
1227 | 2025-10-05 |
Liposomal Doxorubicin, but Not Platinum-Taxane, Supports MHC-II Expression and Immune Maturation in the Ovarian Tumor Microenvironment
2025-Aug-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172827
PMID:40940927
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序评估不同化疗方案对卵巢癌肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | 首次发现脂质体阿霉素能选择性上调肿瘤细胞MHC-II表达并促进免疫成熟 | 研究基于小鼠模型,临床相关性需进一步验证 | 评估化疗药物与免疫系统的相互作用机制 | 卵巢癌小鼠模型和患者肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1228 | 2025-10-05 |
TGFB2/IGFBP5 activated by transcription factors STAT2 and SMAD3 initiate granulosa cell degeneration and cause follicular atresia in chickens
2025-Aug-28, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105747
PMID:40902342
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研究论文 | 本研究通过鉴定TGFB2和IGFBP5基因的启动子区域,揭示了STAT2和SMAD3转录因子在鸡卵泡闭锁过程中调控颗粒细胞退化的分子机制 | 首次发现STAT2是TGFB2和IGFBP5的共同转录因子,并揭示了JAK/STAT与TGF-β/SMAD信号通路在卵泡闭锁中的协同调控作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内功能验证实验 | 阐明鸡卵泡闭锁过程中颗粒细胞退化的分子调控机制 | 鸡卵泡颗粒细胞 | 分子生物学 | 生殖系统疾病 | DNA pull-down, 质谱分析, 单细胞RNA测序, SCENIC分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1229 | 2025-10-05 |
Immune profiling in oncology: bridging the gap between technology and treatment
2025-Aug-26, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03002-x
PMID:40856894
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综述 | 本文探讨免疫分析技术在肿瘤学中的发展及其在临床实践中的应用与挑战 | 整合质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、空间转录组学和液体活检等前沿技术,结合人工智能模型进行多组学数据分析 | 存在成本高昂、通量限制、标准化不足、样本变异性和数据整合等挑战 | 研究免疫分析技术在肿瘤精准医疗中的应用与发展 | 肿瘤免疫相互作用及治疗反应预测 | 生物信息学 | 肿瘤 | 质谱流式细胞术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学, 液体活检, 多组学整合 | 人工智能(AI)驱动模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 液体活检 | NA | NA |
1230 | 2025-10-05 |
Identification of immune signatures associated with both SARS-CoV-2 infection and lung transplantation
2025-Aug-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102262
PMID:40749682
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COVID-19相关肺损伤肺移植患者的免疫特征 | 首次揭示肺移植患者中RBD特异性抗体显著降低,并鉴定出三种在CALI肺移植患者中扩增的免疫细胞亚群 | 样本量有限,未明确这些免疫特征变化的长期临床意义 | 探究SARS-CoV-2感染和肺移植共同作用下的免疫特征变化 | COVID-19相关肺损伤肺移植患者、非移植COVID-19患者和血清阴性对照 | 单细胞组学 | COVID-19相关肺损伤 | 单细胞RNA测序,多重细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据,细胞因子数据 | 未明确具体样本数量,包括CALI肺移植患者、非移植COVID-19组和血清阴性对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1231 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals metastatic and immunosuppressive characteristics in meningioma brain-tumor interface
2025-Aug-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06935-z
PMID:40826459
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示脑膜瘤脑肿瘤界面的转移和免疫抑制特征 | 首次在脑膜瘤脑肿瘤界面识别出具有促上皮间质转化特征的肿瘤细胞群及其生物标志物ANXA2和COL5A1,并揭示了由SPP1+巨噬细胞、ACKR1high内皮细胞和THY1high周细胞组成的免疫抑制微环境 | NA | 识别脑膜瘤早期转移的生物标志物并发现潜在治疗靶点 | 脑膜瘤脑肿瘤界面的细胞群体 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1232 | 2025-10-05 |
Focused ultrasound-induced blood-brain barrier opening promotes glioprotective phenotypes in ACSA-II+ murine astrocytes
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113173
PMID:40948563
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术探究聚焦超声诱导血脑屏障开放对海马星形胶质细胞表型的影响 | 首次揭示FUS-BBBO通过诱导星形胶质细胞呈现神经保护表型,促进突触修饰、神经发生和神经元发育相关基因表达 | 研究仅观察了2、4、7天三个时间点,未涵盖更长期的细胞反应;机制研究尚不完善 | 探究FUS-BBBO对星形胶质细胞表型影响的细胞机制 | 老年野生型和阿尔茨海默病模型小鼠的海马ACSA-II+星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 老年WT和AD模型小鼠,在FUS-BBBO后2、4、7天三个时间点采集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1233 | 2025-10-05 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2025-Jul-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100447
PMID:40329537
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据,增强阿尔茨海默病相关表型的差异基因表达分析能力 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序数据整合,实现了皮层层次和细胞类型特异性的差异基因表达分析 | 空间转录组学数据样本量较小,分析仅限于背外侧前额叶皮层组织 | 增强阿尔茨海默病相关表型的空间信息差异基因表达分析能力 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织中的约150万个细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 线性混合模型 | 基因表达数据 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
1234 | 2025-10-05 |
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae189
PMID:39212489
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研究论文 | 本文详细介绍通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的实验方案 | 提供了从肺组织和气道分离单细胞并进行全面染色的详细步骤方案 | NA | 探索中性粒细胞在肺部生理和病理条件下的复杂功能 | 小鼠肺部中性粒细胞 | NA | 肺部炎症 | 流式细胞术 | NA | 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
1235 | 2025-10-05 |
YBX1/CD36 positive feedback loop-mediated lipid accumulation drives metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.105798
PMID:40083711
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研究论文 | 本研究揭示了YBX1/CD36正反馈环路通过促进肝脏脂质积累驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝病的新机制 | 首次发现YBX1与CD36之间形成正反馈环路,该环路通过增强CD36表达和膜定位促进肝脏脂质积累 | 研究主要基于小鼠模型和原代肝细胞,需要进一步在人类临床试验中验证 | 探究MASLD的发病机制及YBX1在该疾病中的作用 | 小鼠模型、原代肝细胞、人类肝脏样本 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞测序、透射电子显微镜、生物学和组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像、电子显微镜图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1236 | 2025-10-05 |
Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596916
PMID:40936897
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研究论文 | 通过分析头颈癌单细胞RNA测序数据,发现PRDM6通过调节免疫基因表达促进肿瘤进展 | 首次发现PRDM6在促进肿瘤细胞增殖中的新作用,并揭示HPV病毒癌蛋白通过上调PRDM6表达与HPV阳性头颈癌相关 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌中转录因子-免疫应答基因网络对肿瘤进展的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | IRIS3 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1237 | 2025-10-05 |
MAIT Cells with High PFN1 Expression Mediate Immune Activation and Metabolic Reprogramming in Psoriasis
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S535795
PMID:40948612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传分析揭示了MAIT细胞及其高表达基因PFN1在银屑病免疫激活和代谢重编程中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,发现PFN1高表达的MAIT细胞在银屑病中介导免疫激活和代谢重编程 | 样本量较小(3例银屑病患者和2例对照),且PFN1表达与银屑病风险缺乏显著的遗传共定位证据 | 探索银屑病的细胞和分子机制,特别关注MAIT细胞的作用 | 银屑病患者和健康对照的皮肤组织样本 | 单细胞基因组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 基因表达谱分析, 孟德尔随机化分析, 富集分析 | 细胞分化轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 遗传数据 | 5例样本(3例银屑病,2例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1238 | 2025-10-05 |
Enhancing natural killer cell anti-tumour activity through macrophage manipulation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1656925
PMID:40948757
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综述 | 本文探讨通过调控肿瘤相关巨噬细胞来增强自然杀伤细胞抗肿瘤活性的策略 | 系统阐述巨噬细胞与NK细胞相互作用的双重调控机制及其在肿瘤免疫治疗中的转化潜力 | NA | 探索通过巨噬细胞干预增强NK细胞抗肿瘤功能的治疗策略 | 肿瘤微环境中的巨噬细胞和自然杀伤细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
1239 | 2025-10-05 |
Multi-omics approach to personalised treatment: insights into thrombus-derived exosome regulation in cardiomyocyte ferritinophagy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1607355
PMID:40948766
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研究论文 | 本研究首次揭示血栓来源外泌体通过FENDRR-m6A-NCOA4调控轴介导心肌细胞铁蛋白自噬在1型心肌梗死中的关键作用 | 首次发现血栓来源外泌体通过lncRNA FENDRR与P53协同调控m6A修饰,揭示铁蛋白自噬与免疫炎症反应的关联机制 | 铁蛋白自噬在T1MI中的具体作用机制仍需进一步阐明 | 系统分析铁蛋白自噬在1型心肌梗死中的作用机制及其与免疫炎症反应的潜在联系 | 1型心肌梗死患者冠状动脉血栓来源外泌体及心肌细胞 | 多组学分析 | 心血管疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,RIP,FISH,ChIP,m6A甲基化实验,生物信息学分析 | 心肌细胞模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 1型心肌梗死患者冠状动脉血栓样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
1240 | 2025-10-05 |
Dissecting the immune evasion and therapeutic resistance mechanisms in EGFR/TP53 co-mutated non-small cell lung cancer: implications for targeted and immunotherapy strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652213
PMID:40948762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌的免疫逃逸和治疗抵抗机制 | 首次在单细胞层面发现EGFR/TP53共突变NSCLC中两种恶性上皮细胞亚群的协同作用机制,并揭示STAT1/ETS1转录调控网络的核心作用 | 样本量较小(仅4例进行单细胞测序),需要在更大患者队列和功能研究中进一步验证 | 探究EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌的分子机制及治疗策略 | 40例住院NSCLC患者的福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 下一代测序 | NA | 基因表达数据, 突变数据 | 40例NSCLC患者,其中4例EGFR/TP53共突变样本进行单细胞测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | 10x Genomics单细胞转录组测序平台 |