单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28786 篇文献，本页显示第 12361 - 12380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12361 | 2024-08-05 |
DIMINISHED EXPRESSION OF GLS IN CD4 + T CELLS SERVES AS A PROGNOSTIC INDICATOR ASSOCIATED WITH CUPROPTOSIS IN SEPTIC PATIENTS
2024-Jul-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002370
PMID:38662604
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研究论文 | 本研究探讨了与铜死亡相关的分子标志物在脓毒症患者中的表达及其对预后的影响 | 识别了与铜死亡相关的新型分子标志物，并提出其作为脓毒症患者的预后指标的潜力 | 关于GLS水平变化与铜之间关系的进一步研究仍需进行 | 探索脓毒症患者中与铜死亡相关的分子标志物，以改善患者的分层和预后 | 脓毒症患者的外周血样本和免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA-seq, 免疫印迹, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 生物样本 | 脓毒症患者的外周血样本 |
| 12362 | 2024-08-05 |
ScHGSC-IGDC: Identifying genes with differential correlations of high-grade serous ovarian cancer based on single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32909
PMID:38975079
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析确定了高等级浆液性卵巢癌中的差异关联基因 | 提出了ScHGSC-IGDC框架，以识别HGSC发展中的核心基因，并通过分析找到34个模块的基因互作网络 | 未在更广泛的人群中验证结果的普适性 | 旨在通过HGSC的scRNA-seq数据分析识别正常与肿瘤状态之间的差异关联核心基因 | 高等级浆液性卵巢癌患者的肿瘤及其相邻正常组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及的人类卵巢癌细胞系和组织样本未具体说明数量 |
| 12363 | 2024-08-04 |
TrkA + sensory neurons regulate osteosarcoma proliferation and vascularization to promote disease progression
2024-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.20.599869
PMID:38979210
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研究论文 | 该研究探讨了TrkA+感觉神经元在骨肉瘤增殖和血管化中的作用 | 首次揭示了肿瘤相关感觉神经元在骨肉瘤进展中的神经调节功能 | 该研究主要依赖于小鼠模型，可能不完全适用于人类骨肉瘤的情况 | 研究TrkA+感觉神经元如何影响骨肉瘤的发展和血液供应 | 研究的对象为骨肉瘤模型小鼠及其肿瘤微环境中的细胞 | 数字病理学 | 骨癌 | 化学基因学方法 | 转基因小鼠 | 单细胞转录组数据 | 包括小鼠模型和人类骨肉瘤样本的多模态分析 |
| 12364 | 2024-08-04 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals a dystrophic trajectory following a developmental bifurcation of myoblast cell fates in facioscapulohumeral muscular dystrophy
2024-06-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278717.123
PMID:38777608
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研究论文 | 这篇文章使用单细胞空间转录组学揭示了面肩肱肌营养不良症中肌母细胞命运发育分叉后的退化轨迹 | 本文使用多重错误稳健荧光原位杂交技术实现了对多核肌管转录组的高分辨率分析 | 单细胞或细胞核RNA测序无法充分捕捉多核大肌管的转录组 | 研究面肩肱肌营养不良症（FSHD）中肌母细胞分化过程中的转录组变化 | 研究对象为健康对照、同源D4Z4收缩突变体和FSHD患者样本中的体外分化肌管及未融合单核细胞 | 数字病理学 | 面肩肱肌营养不良症 | 多重错误稳健荧光原位杂交（MERFISH） | NA | RNA转录本 | 包括控制组、同源突变体和FSHD患者样本的多个肌管和单核细胞 |
| 12365 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional profile of CD34+ hematopoietic progenitor cells from del(5q) myelodysplastic syndromes and impact of lenalidomide
2024-Jun-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49529-x
PMID:38902243
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研究论文 | 本研究揭示了del(5q)骨髓增生异常综合症患者CD34+造血祖细胞的转录组变化及其对来那度胺治疗的影响 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了del(5q) MDS中存在的转录改变及其潜在的治疗影响 | 本研究未探讨其他可能的致病机制和较大样本的验证 | 阐明del(5q) MDS的转录变化及其影响来那度胺治疗的机制 | del(5q) MDS患者的CD34+造血祖细胞 | 数字病理学 | 骨髓增生异常综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自del(5q) MDS患者的CD34+细胞 |
| 12366 | 2024-08-05 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
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研究论文 | 本文提出一种优化的流式细胞术方法，用于分析小鼠脑中微胶质细胞的各种表型 | 本研究展示了一种不需要细胞分选的流式细胞分析协议，并且允许灵活结合额外标记以增强标记面板 | 所提方法仍可能受到诸如标记抗体选择与定量方法的限制 | 研究小鼠脑中微胶质细胞的不同表型以获得生物学见解 | 小鼠脑组织中不同表型的微胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术 | NA | 细胞表型 | NA |
| 12367 | 2024-08-05 |
CSTF3 contributes to platinum resistance in ovarian cancer through alternative polyadenylation of lncRNA NEAT1 and generating the short isoform NEAT1_1
2024-Jun-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06816-1
PMID:38898019
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研究论文 | 本研究揭示了CSTF3通过调节长链非编码RNA NEAT1的多聚腺苷酸化而导致卵巢癌的铂耐药性的机制 | 首次揭示了CSTF3在铂耐药卵巢癌中的作用及其通过调节NEAT1的短异构体表达的机制 | 本研究的样本量和数据可能限制了结果的普遍适用性 | 研究铂耐药卵巢癌的分子机制与潜在的治疗靶点 | 铂耐药和铂敏感卵巢癌患者的组织和细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 从公共数据库中分析的一组单细胞RNA测序数据 |
| 12368 | 2024-08-04 |
Mgp High-Expressing MSCs Orchestrate the Osteoimmune Microenvironment of Collagen/Nanohydroxyapatite-Mediated Bone Regeneration
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308986
PMID:38588510
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研究论文 | 本文描述了Mgp高表达的间充质干细胞（MSCs）如何调控胶原蛋白/纳米羟基磷灰石介导的骨再生中的骨免疫微环境 | 该研究首次揭示了生物材料对间充质干细胞时空表达模式的调控，并识别出一组功能性MSC亚群体 | 尚未详尽探讨生物材料与MSC之间长时间的相互作用 | 研究生物材料对骨再生过程中的干细胞调节作用 | 高表达Mgp的间充质干细胞及其在骨再生中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序与空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12369 | 2024-08-05 |
Pan-Cancer Single-Cell and Spatial-Resolved Profiling Reveals the Immunosuppressive Role of APOE+ Macrophages in Immune Checkpoint Inhibitor Therapy
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401061
PMID:38569519
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研究论文 | 本研究探讨了APOE+巨噬细胞在免疫检查点抑制剂（ICI）治疗中的免疫抑制作用 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法，构建了M.Sig模型用于预测ICI反应，揭示了APOE巨噬细胞在ICI治疗中的重要作用 | 本研究可能缺乏对其他类型巨噬细胞的全面比较，未涵盖所有癌症类型 | 研究APOE+巨噬细胞在癌症免疫治疗中的作用与机制 | APOE+巨噬细胞以及与之互动的CD8+耗竭T细胞 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和机器学习 | M.Sig模型 | RNA数据 | 使用了4T1肿瘤-bearing小鼠模型和真实世界免疫治疗数据 |
| 12370 | 2024-08-04 |
Transcriptional programs mediating neuronal toxicity and altered glial-neuronal signaling in a Drosophila knock-in tauopathy model
2024-05-15, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278576.123
PMID:38599684
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研究论文 | 本文描述了利用CRISPR-Cas基因编辑技术构建的前额颞叶痴呆果蝇模型。 | 创造了与人类前额颞叶痴呆相关的正交突变，并且展示了非细胞自主变更在胶质细胞中的潜在作用。 | 研究可能受到模型局限性的影响，虽然模型重现了人类疾病的某些特征，但依然无法完全模拟人类遗传背景。 | 揭示TAU P301L突变引起的神经元功能障碍和死亡的分子事件。 | 研究对象为携带Tau P251L突变的果蝇及其对照品。 | 数字病理学 | 前额颞叶痴呆 | CRISPR-Cas基因编辑 | 果蝇模型 | 单细胞RNA测序数据 | 约130,000个细胞 |
| 12371 | 2024-08-05 |
FlyBase: updates to the Drosophila genes and genomes database
2024-05-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad211
PMID:38301657
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研究论文 | 本文描述了FlyBase关于果蝇基因和基因组数据库的最新进展和更新 | 引入了单细胞RNA测序数据，改善了功能信息的内容和显示，更新了同源性流程，增加了新的化学报告，并增强了宣传资源 | NA | 介绍FlyBase的最新开发和更新 | 果蝇基因组和基因信息 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12372 | 2024-08-04 |
Spatially resolved transcriptome of the aging mouse brain
2024-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14109
PMID:38372175
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研究论文 | 本文生成了小鼠大脑老化的空间转录组图谱。 | 建立了老化小鼠大脑的空间分子图谱，揭示了特定大脑区域的基因表达变化。 | 研究中对人脑老化的理解可能不适用于所有哺乳动物，数据主要来源于小鼠。 | 探讨老化小鼠大脑的基因表达及细胞类型在空间组织中的变化。 | 年轻和老年小鼠的大脑空间转录组图谱及其基因表达特征。 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的大脑样本 |
| 12373 | 2024-08-05 |
Systematic mapping of TF-mediated cell fate changes by a pooled induction coupled with scRNA-seq and multi-omics approaches
2024-04-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277926.123
PMID:38580401
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法iTF-seq，用于识别可以诱导细胞命运改变的转录因子 | 创新点在于引入了iTF-seq方法，能够在单细胞水平上监测转录组变化并识别影响细胞命运的转录因子 | 对多个转录因子在可诱导方式下的命运转换潜力的理解仍然有限 | 探索转录因子介导的细胞命运变化机制 | 小鼠胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | 多组学方法 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 12374 | 2024-08-07 |
Corrigendum: A statistical learning method for simultaneous copy number estimation and subclone clustering with single-cell sequencing data
2024-Apr-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279293.124
PMID:38664005
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12375 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome characteristics of testicular terminal epithelium lineages during aging in the Drosophila
2024-03, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14057
PMID:38044573
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研究论文 | 本研究对果蝇睾丸终末上皮细胞在衰老过程中的转录组特征进行了单细胞RNA测序分析 | 首次定义了以金属硫蛋白A为标志物的终末上皮群体，并细分为六个新的亚细胞群体 | 关于终末上皮的功能多样性和调控机制仍然了解不足 | 探讨衰老过程中果蝇睾丸终末上皮细胞的转录组特征及其功能 | 果蝇睾丸终末上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2天、10天和40天的果蝇样本 |
| 12376 | 2024-08-04 |
A statistical learning method for simultaneous copy number estimation and subclone clustering with single-cell sequencing data
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278098.123
PMID:38290978
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研究论文 | 本研究开发了一种基于融合套索模型的亚克隆聚类方法FLCNA，旨在同时检测单细胞DNA测序数据中的拷贝数异常(CNA) | FLCNA方法通过融合套索模型实现了同时检测CNA和亚克隆聚类，克服了现有方法可能产生的错误结果 | 未提及具体的限制 | 研究旨在改善在复杂细胞群体中亚克隆识别的准确性 | 研究对象为乳腺癌的单细胞DNA测序数据集 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序（scDNA-seq） | 融合套索模型 | 基因组数据 | 未提及具体样本量 |
| 12377 | 2024-08-04 |
A Bayesian framework to study tumor subclone-specific expression by combining bulk DNA and single-cell RNA sequencing data
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278234.123
PMID:38195207
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研究论文 | 本研究开发了一种Bayesian框架scBayes，以结合肿瘤亚克隆特定的基因表达和基因组数据。 | 提出了一种新方法，通过结合bulk DNA测序和单细胞RNA测序数据，填补了肿瘤亚克隆结构与转录组异质性之间的缺口。 | 使用了模拟数据及生物学数据集进行验证，但缺乏更广泛的临床数据。 | 研究肿瘤亚克隆特定的基因表达，为癌症的演化和耐药机制提供新的见解。 | 针对来自同一肿瘤的bulk DNA和单细胞RNA测序数据进行分析。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，bulk DNA测序 | Bayesian模型 | 基因组数据和RNA测序数据 | 使用生物数据集和模拟数据集进行验证，具体样本规模未明确说明 |
| 12378 | 2024-08-05 |
Data integration and inference of gene regulation using single-cell temporal multimodal data with scTIE
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277960.123
PMID:38190633
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研究论文 | 本研究提出scTIE，一种整合时间多模态数据并推测基因调控关系的方法 | scTIE通过使用自编码器和迭代最优传输，联合分析不同时间点的细胞数据，提供了对细胞转态变化的预测 | 该研究主要集中在单细胞数据集的整合上，可能对其他类型的数据整合不适用 | 旨在通过整合和推断基因调控关系，理解细胞状态变化的机制 | 研究对象为不同时间点的单细胞样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq 和 scATAC-seq | 自编码器 | 时间序列的多模态数据 | 使用多种合成和真实的时间多模态数据集进行验证 |
| 12379 | 2024-08-05 |
Transcriptional programs mediating neuronal toxicity and altered glial-neuronal signaling in a Drosophila knock-in tauopathy model
2024-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.02.578624
PMID:38352559
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas基因编辑技术构建了前额叶痴呆的果蝇模型，并探讨了神经元功能障碍和死亡的分子机制 | 该研究使用自有基因编辑方法忠实地重现了人类疾病的遗传背景与表型特征 | 该研究使用的模型可能无法完全代表人类疾病的所有复杂性 | 研究前额叶痴呆中tau蛋白突变导致的神经元毒性及胶质细胞-神经元信号改变的分子机制 | 进行单细胞RNA测序分析的果蝇，具体包括tau P251L突变体和对照果蝇 | 数字病理 | 前额叶痴呆 | CRISPR-Cas基因编辑 | 突变体模型 | 单细胞RNA测序数据 | 约130,000个细胞 |
| 12380 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomic analysis to unveil heterogeneity in high-grade serous ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1420847
PMID:38975339
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示高等级浆液性卵巢癌的异质性 | 该研究首次揭示了HGSOC的特定细胞特征与不良结果的相关性，并提出了代谢通路的治疗靶点 | 本研究主要集中在HGSOC的特定特征上，可能限制了其他类型卵巢癌的适用性 | 研究HGSOC的复杂机制并识别其异质性 | HGSOC的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括转移样本在内的多种HGSOC样本 |