单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12341 - 12360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12341 | 2024-08-04 |
IFNɣ but not IFNα increases recognition of insulin defective ribosomal product-derived antigen to amplify islet autoimmunity
2023-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05991-8
PMID:37581620
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研究论文 | 本文研究了IFNγ在胰岛自免疫中对胰岛素缺陷核糖体产物衍生抗原识别的影响 | 揭示了IFNγ通过诱导PSMB10转录本的表达在胰岛β细胞中发挥关键作用 | 未提及具体的临床样本数据或长期效果 | 探索早期先天细胞因子和晚期免疫适应事件在2型糖尿病免疫过程中扮演的角色 | 人类胰腺胰岛的单细胞转录组数据及其在自身免疫中的作用 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类胰腺胰岛样本 |
| 12342 | 2024-08-05 |
Excess pancreatic elastase alters acinar-β cell communication by impairing the mechano-signaling and the PAR2 pathways
2023-07-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.05.007
PMID:37339634
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研究论文 | 该研究探讨了胰腺弹性蛋白酶对腺泡-β细胞相互作用的影响 | 发现胰腺弹性蛋白酶（PE）在2型糖尿病患者中的上调并对β细胞活力产生负面影响，同时鉴定了telaprevir作为有效的PE抑制剂 | 该研究主要集中在实验室环境中的细胞模型上，实际临床适用性可能需要进一步验证 | 识别影响胰腺β细胞活力的因素，以便开发针对糖尿病的治疗策略 | 研究对象为人类和啮齿动物的β细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 高通量筛选 assays, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞, 活体 | 人类和啮齿动物的β细胞 |
| 12343 | 2024-08-05 |
Speed and navigation control of thymocyte development by the fetal T-cell gene regulatory network
2023-05, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13190
PMID:36722494
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review | 本文回顾了胎儿和成人小鼠胸腺中 T 细胞分化相关的转录因子网络 | 探讨了胎儿 T 细胞发育与成人的不同之处，并强调了转录因子网络的独特性 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类的机制理解 | 研究胎儿 T 细胞发育过程中的转录因子网络 | 胎儿和成人小鼠的 T 细胞和胸腺发育 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12344 | 2024-08-04 |
Deep Crypt Secretory Cell Differentiation in the Colonic Epithelium Is Regulated by Sprouty2 and Interleukin 13
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.11.004
PMID:36414210
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研究论文 | 深隐窝分泌（DCS）细胞的分化受到Sprouty2和白细胞介素13的调控 | 本研究揭示了Sprouty2如何通过抑制IL13信号通路来限制结肠DCS细胞分化的机制 | 尚未探讨DCS细胞数量和功能调控的所有可能机制 | 研究Sprouty2与IL13在结肠DCS细胞分化中的作用 | 小鼠肠上皮特异性Sprouty2缺失模型与对照组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色、bulk RNA测序、定量聚合酶链反应 | NA | RNA | 小鼠结肠组织 |
| 12345 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1247131
PMID:38239341
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和芯片数据，揭示了败血症中PANoptosis相关基因 | 开发了一种基于Boruta算法的机器学习模型，用于识别PANoptosis相关亚组并预测败血症的生存和临床特征 | 尚未全面阐明PANoptosis在败血症中的角色 | 研究PANoptosis相关基因在败血症中的作用及其预后潜力 | 败血症样本和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 败血症 | 单细胞RNA-seq | Boruta算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的败血症样本和单细胞RNA-seq数据 |
| 12346 | 2024-08-04 |
A contrastive learning approach to integrate spatial transcriptomics and histological images
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.039
PMID:38707535
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的模型ConGcR，用于整合基因表达、空间位置和组织形态数据，以进行数据表征和空间组织结构识别 | 本研究创新性地提出了ConGcR模型，结合图卷积和ResNet编码器，增强了空间嵌入表示的建模能力 | 未提及具体限制 | 本研究旨在提高组织架构识别的准确性，并为空间转录组分析任务提供有效的数据表征 | 研究对象包括16个人脑、4只鸡心、8个乳腺肿瘤和30个来自人类肺部的空间转录组样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组技术 | 对比学习模型 | 基因表达、空间位置、组织图像 | 共58个样本，包括16个人脑、4只鸡心、8个乳腺肿瘤和30个人肺样本 |
| 12347 | 2024-08-04 |
Hybrid sequence-based analysis reveals the distribution of bacterial species and genes in the oral microbiome at a high resolution
2024-Jul, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2024.101717
PMID:38708423
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研究论文 | 本研究利用无培养分析技术识别口腔微生物组中的细菌种类和基因分布 | 采用细菌单细胞基因组测序等先进技术，实现了对口腔微生物的高分辨率分析 | 样本中约80%为非细菌源DNA，可能影响细菌种类的识别 | 旨在识别口腔微生物组中的细菌种类并研究其基因分布 | 研究对象为来自同一个体的唾液样本 | 数字病理学 | NA | 细菌单细胞基因组测序, 16S rRNA测序, 大规模全基因组测序 | NA | 基因组序列 | 48个井的样本中，非活性样本为43个，活性样本为45个 |
| 12348 | 2024-08-04 |
Identification of sepsis-associated mitochondrial genes through RNA and single-cell sequencing approaches
2024-May-03, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01891-x
PMID:38702721
|
研究论文 | 本研究通过RNA和单细胞测序方法鉴定与脓毒症相关的线粒体基因 | 发现了两个与脓毒症预后密切相关的线粒体基因COX7B和NDUFA4 | 样本量较小，仅包含20名脓毒症患者和10名健康志愿者作为对照 | 识别与脓毒症相关的线粒体生物标志物，以提高脓毒症诊断和预后的准确性 | 20名脓毒症患者的外周血样本及10名健康志愿者的血样作为对照 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA-seq和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 20名脓毒症患者和10名健康志愿者 |
| 12349 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to elucidate the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and cancer cells in hepatocellular carcinoma with spleen-deficiency syndrome
2024-May, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2023.11.008
PMID:38707923
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）合并脾虚综合征（SDS）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）与癌细胞之间的相互作用 | 揭示了CAFs与癌细胞之间的交互在SDS中促进肿瘤发展，并确认了PDGF信号通路在此过程中的重要作用 | 本研究主要基于小鼠模型，临床应用和人类数据的验证需进一步研究 | 研究脾虚综合征下肝细胞癌中细胞间的相互作用 | 主要研究对象为肝细胞癌细胞及其相关的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞转录组学与空间转录组学 | NA | 基因组数据 | 建立了以HCC-SDS小鼠为模型共29个细胞簇 |
| 12350 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals 2D cytokine assay can model atopic dermatitis more accurately than immune-competent 3D setup
2024-May, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15077
PMID:38711200
|
研究论文 | 本研究探讨了不同体外模型对特应性皮炎（AD）模拟的准确性。 | 首次使用单细胞RNA测序数据比较了2D和3D细胞培养在模拟AD方面的效果。 | 未能研究Th2细胞对模型AD的影响，且仅基于特定细胞类型的研究，结果可能有限。 | 理解特应性皮炎的病理生理，并识别新的治疗方法。 | 使用原代成纤维细胞和角质形成细胞进行的体外模型实验。 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 2D/3D细胞培养 | 基因表达数据 | 使用来自临床研究的皮肤活检的单细胞RNA测序数据和健康与AD供体的已发布数据 |
| 12351 | 2024-08-05 |
Lipoxin A 4 /FPR2 signaling mitigates ferroptosis of alveolar epithelial cells via NRF2-dependent pathway during lung ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590127
PMID:38712069
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研究论文 | 本研究探讨了Lipoxin A4对肺缺血再灌注损伤中肺泡上皮细胞铁死亡的保护作用 | 揭示了LxA4/FPR2信号通路通过NRF2依赖性机制减轻肺泡上皮细胞的铁死亡 | 本研究的局限性在于尚未探讨不同类型肺移植患者的普遍适用性 | 研究Lipoxin A4对肺缺血再灌注损伤中铁死亡的保护作用 | 主要研究对象为肺泡II型上皮细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 包括来自肺移植患者的样本，以及WT、Fpr2 -/-和Nrf2 -/-小鼠的样本 |
| 12352 | 2024-08-04 |
ALDH2 as an immunological and prognostic biomarker: Insights from pan-cancer analysis
2024-Apr-19, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037820
PMID:38640328
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研究论文 | 本研究全面评估了ALDH2在全癌症中的重要性 | 首次揭示了ALDH2与多种癌症类型及其免疫微环境的关联 | 尚未深入探讨ALDH2在各癌症类型中的具体机制 | 研究ALDH2在全癌症中的免疫学和预后生物标志物作用 | 分析ALDH2在不同癌症类型中的表达与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 跨16种不同癌症类型的肿瘤及正常组织样本 |
| 12353 | 2024-08-04 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究探讨了在乙酰氨基酚诱导的肝损伤中，髓系Mas信号通路对细胞间病理性交互的调节作用 | 首次揭示了髓系Mas在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用，提供了细胞间相互作用的新视角 | 未明确Mas在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制和细分功能 | 研究髓系Mas信号通路在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用 | MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和动态观测成像 | NA | 生物样本 | 来自急性肝衰竭患者的样本 |
| 12354 | 2024-08-05 |
Identification of a distinct cluster of GDF15high macrophages induced by in vitro differentiation exhibiting anti-inflammatory activities
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1309739
PMID:38655264
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研究论文 | 本文研究了在体外分化中诱导的GDF15high巨噬细胞的特征及其抗炎活性 | 本研究首次识别出一种GDF15high巨噬细胞亚群，并揭示其独特的分子特征和抗炎功能 | 无法排除体外诱导协议对GDF15high巨噬细胞抗炎表型的影响 | 探讨GDF15high巨噬细胞的身份及其在炎症反应中的角色 | 来源于人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞的GDF15high巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA | 约1%的人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞中带有GDF15high表型的细胞 |
| 12355 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1418495
PMID:38711509
|
更正 | 这篇文章是对先前发表文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12356 | 2024-08-05 |
Alteration of Thyroid Hormones in Mouse Models of Alzheimer's Disease and Aging
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000536089
PMID:38228117
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病和衰老小鼠模型中甲状腺激素的变化 | 本研究首次揭示了免疫细胞浸润与甲状腺激素变化之间的潜在机制 | 研究仅限于小鼠模型，临床应用需要进一步验证 | 探讨甲状腺激素与阿尔茨海默病及衰老之间的关系 | FAD4T小鼠模型和自然衰老小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | FAD4T小鼠和自然衰老小鼠的甲状腺样本 |
| 12357 | 2024-08-05 |
Impaired Reorganization of Centrosome Structure Underlies Human Infantile Dilated Cardiomyopathy
2023-04-25, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了中心粒缺陷导致的人类婴儿扩张型心肌病的机制 | 首次将中心粒缺陷与非综合征型扩张型心肌病相关联，并发现RTTN在心脏发育中的新角色 | 该研究仅基于一名患者，可能无法广泛适用 | 探讨中心粒结构重组的障碍如何影响心肌细胞生物学及其与人类心脏疾病的关系 | 一名罕见的婴儿扩张型心肌病(I-DCM)患者 | 心血管疾病 | 扩张型心肌病 | CRISPR/Cas9基因敲除和校正、单细胞RNA测序 | 斑马鱼和果蝇 | 基因组数据、细胞数据 | 单个患者样本及其父母的全外显子组 |
| 12358 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181697
PMID:37180171
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研究论文 | 本文旨在识别与脓毒症免疫功能障碍相关的差异表达脂质代谢基因。 | 通过机器学习算法筛选出关键的脂质代谢相关中心基因，揭示了脓毒症中的免疫抑制微环境。 | 未提及具体的样本来源和大小，可能限制结果的普遍适用性。 | 探讨脓毒症中脂质代谢失衡与免疫反应的关系。 | 脓毒症患者与健康对照者的脂质代谢相关基因及相关免疫功能。 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE) | 基因数据 | 508个差异表达脂质代谢相关基因 |
| 12359 | 2024-08-05 |
Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions
2023, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20153.1
PMID:38707493
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研究论文 | 该研究调查了在神经性疼痛和非神经性疼痛情况下，脑脊液中的免疫细胞是否相似 | 结果表明，无论疼痛的病因如何，免疫细胞的数量和表型并没有明显差异，挑战了脑脊液作为微胶质细胞活化的生物标志物的有效性 | 该研究未能确定脑脊液中蛋白质的确切来源，是否直接来自于循环脑脊液单核细胞或源于脊髓微胶质细胞 | 本研究旨在探讨脑脊液是否可以用作人类微胶质细胞活化的代理测量 | 分析来自遭受神经性特征疼痛的个体的脑脊液免疫细胞群体 | 数字病理学 | 神经性疼痛 | RNA测序，CITE测序 | NA | 生物样本（脑脊液免疫细胞） | 分析了忍受神经性疼痛的个体的免疫细胞群体，样本大小未具体说明 |
| 12360 | 2024-08-05 |
Single-cell deletion analyses show control of pro-T cell developmental speed and pathways by Tcf7, Spi1, Gata3, Bcl11a, Erg, and Bcl11b
2022-05-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abm1920
PMID:35594339
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研究论文 | 该文章研究了个别转录因子在早期T细胞发育中的控制作用。 | 揭示了在T细胞承诺前期，不同转录因子之间的动态平衡和意外指导性作用。 | 该研究主要集中在单细胞分析，可能无法全面反映在整体细胞群体中的复杂交互。 | 探讨转录因子如何在早期T细胞发育过程中控制发育速度和选择路径。 | 研究对象为早期T细胞前体及其转录因子的功能。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR基因破坏 | NA | 基因表达数据 | 使用多个单细胞样本进行分析 |