单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 12341 - 12360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12341 | 2024-08-05 |
Precision analysis of mutant U2AF1 activity reveals deployment of stress granules in myeloid malignancies
2022-03-17, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.02.025
PMID:35303483
|
研究论文 | 该文章研究了U2AF1突变在骨髓恶性肿瘤中的作用及其对应激颗粒的影响。 | 文章揭示了U2AF1突变带来的新3'剪接位点接触，以及这些突变如何通过影响应激颗粒成分促进癌症发展。 | 研究主要集中在特定突变，可能无法全面反映所有U2AF1突变的影响。 | 研究U2AF1突变对剪接和癌症的影响，特别是在骨髓恶性肿瘤中的作用。 | 研究对象包括U2AF1突变的细胞系和患者来源的骨髓增生异常综合症/急性髓性白血病细胞。 | 数字病理学 | 骨髓恶性肿瘤 | 交联免疫沉淀 | NA | RNA-seq | 涉及U2AF1突变细胞系和患者来源的细胞 |
| 12342 | 2024-08-05 |
Pooled CRISPR screening with single-cell transcriptome readout
2017-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4177
PMID:28099430
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研究论文 | 本文结合了池化CRISPR筛选和单细胞RNA测序的方法 | 提出了一种CRISPR水滴测序（CROP-seq）方法，能够在单细胞转录组分辨率下进行池化CRISPR筛选 | 当前方法的提出可能仍受到现有CRISPR技术的限制 | 旨在促进对复杂调控机制和异质细胞群体的高通量功能解析 | 针对单个细胞的转录组响应与引导RNA表达进行关联 | 数字病理学 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成千上个体细胞 |
| 12343 | 2024-08-04 |
Peripheral nervous system lymphatic vessels: A simple delivery route to promote nerve regeneration
2024-Jul, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114783
PMID:38688418
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研究论文 | 本文阐明了周围神经系统淋巴血管的存在及其在神经再生中的作用 | 首次证明了外围神经中的淋巴血管在促进神经再生中的独特运输能力 | 研究主要集中在动物模型上，缺乏临床人类样本的验证 | 探讨周围神经系统淋巴血管在神经再生中的作用及其输送能力 | 使用大鼠、PROX1-EGFP转基因小鼠和人类的周围神经样本 | 数字病理学 | 周围神经损伤 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 使用了大鼠和转基因小鼠的样本 |
| 12344 | 2024-08-05 |
Characteristics of peripheral blood mononuclear cells and potential related molecular mechanisms in patients with autoimmune hepatitis: a single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jun, Medical molecular morphology
IF:1.2Q3
DOI:10.1007/s00795-024-00380-5
PMID:38340154
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性肝炎患者外周血单核细胞的特征及潜在相关分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统性分析自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞特征 | 对免疫细胞群体特征的理解仍然有限，可能没有考虑其他类型的免疫细胞 | 分析自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞特点及其潜在的分子机制 | 来自4名健康对照和4名自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3690个来自健康对照和3511个来自自身免疫性肝炎患者的单细胞转录组 |
| 12345 | 2024-08-04 |
Improving replicability in single-cell RNA-Seq cell type discovery with Dune
2024-May-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05814-6
PMID:38789920
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研究论文 | 本文提出了一种新方法Dune，用于优化单细胞RNA-Seq中细胞类型发现的簇分辨率和可重复性之间的权衡 | Dune通过迭代合并簇来最大化不同分区之间的一致性，改善了集群分析的稳健性 | 本文未提及具体限制因素 | 旨在提高单细胞转录组测序中细胞分类的可靠性和再现性 | 涉及单细胞RNA-Seq数据集中的细胞类型分类 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用来自不同平台的多个数据集进行验证 |
| 12346 | 2024-08-05 |
Identifying potential drug targets for keloid: A Mendelian randomization study
2024-May-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.04.023
PMID:38797322
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研究论文 | 本文识别了瘢痕疙瘩的潜在药物靶点 | 通过孟德尔随机化研究发现七种潜在的药物靶点，特别强调了NTM的临床相关性 | 本研究可能受限于样本量和数据库的可用性 | 识别瘢痕疙瘩的药物靶点以改进治疗效果 | 靶向瘢痕疙瘩的七种蛋白质 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化分析 | NA | 蛋白质数据, scRNA-seq数据 | NA |
| 12347 | 2024-08-04 |
The Identification of RPL4 as a Hub Gene Associated with Goat Litter Size via Weighted Gene Co-Expression Network Analysis
2024-May-15, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14101470
PMID:38791687
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析识别出与山羊窝重相关的枢纽基因RPL4 | 揭示了RPL4基因在山羊生育能力中的重要作用，为评估山羊窝重提供了生物标志物 | 未提及样本的地理分布和环境影响因素 | 探索与山羊生殖性能相关的标志基因 | 山羊卵母细胞中的基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 卵母细胞数据集GSE136005来自GEO数据库 |
| 12348 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatotoxic analgesic generating AM404 in the midbrain PAG region
2024-05-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61791-z
PMID:38750093
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研究论文 | 本文开发了一种无肝毒性的非阿片类小分子SRP-001，能够有效管理疼痛且安全性高 | SRP-001不会产生肝毒性代谢物，且在高剂量下保护肝脏紧密连接的完整性 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床应用仍需进一步验证 | 研究一种新的非肝毒性镇痛药SRP-001及其机制 | CD-1小鼠及其对SRP-001和ApAP的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 生物医学数据 | CD-1小鼠，具体样本量未提及 |
| 12349 | 2024-08-05 |
Identifying Key Regulatory Genes in Drug Resistance Acquisition: Modeling Pseudotime Trajectories of Breast Cancer Single-Cell Transcriptome
2024-May-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16101884
PMID:38791962
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研究论文 | 本文提出了一种结合数学建模和伪时间分析的方法，以研究乳腺癌单细胞转录组中的药物耐药性关键调控基因 | 创新点在于使用时间序列scRNA-seq数据和单基因数学模型，识别了约560-680个表现多稳定表达状态的基因 | 对分子系统层面动态细胞转变的理解仍然有限 | 研究药物耐药性获得的关键调控基因 | MCF-7乳腺癌细胞系在他莫昔芬处理下的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 单基因数学模型 | 基因表达数据 | 6000个基因的多个亚群体 |
| 12350 | 2024-08-05 |
A Gold Standard-Derived Modular Barcoding Approach to Cancer Transcriptomics
2024-May-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16101886
PMID:38791964
|
研究论文 | 本文提出了一种灵活条形码的癌症转录组学方法，将癌症特异性基因表达模块组合成便于管理的信息。 | 创新点在于采用高质量金标准导出的模块捕捉与特定癌症类型相关的功能性基因，提供了快速有效的假设生成和测试方式 | 本研究的局限性在于未提供与不同癌症类型之间更广泛的数据对比 | 研究目的在于简化癌症转录组信息，以便于更广泛的研究和临床应用 | 研究对象为癌症类型特异性的基因表达模块 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12351 | 2024-08-05 |
Deciphering the Genetic Links between Psychological Stress, Autophagy, and Dermatological Health: Insights from Bioinformatics, Single-Cell Analysis, and Machine Learning in Psoriasis and Anxiety Disorders
2024-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105387
PMID:38791423
|
研究论文 | 本研究探讨了心理压力、自噬相关基因与皮肤健康之间的关系，特别关注银屑病与焦虑障碍的共病机制 | 揭示了银屑病与焦虑障碍之间可能存在的共享生物机制及其潜在生物标志物 | 样本数据来源于GEO数据库，未具体提及样本的多样性和数据的全面性 | 探索银屑病与焦虑障碍之间的共病机制 | 银屑病与焦虑障碍相关的数据和基因 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞RNA测序分析 | 机器学习算法 | 基因数据 | 未具体提及样本数量 |
| 12352 | 2024-08-04 |
Special Issue "Cancer Immunotherapy: Tumor Microenvironment, Biomarker Discovery and Immune Resistance"
2024-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105113
PMID:38791152
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研究论文 | 该特刊汇集了癌症免疫治疗领域的最新研究成果和进展 | 介绍了新型药物开发和机制理解的最新进展 | 未提及具体的研究限制 | 推动对癌症免疫治疗领域新的理解和技术应用 | 癌症免疫治疗相关的肿瘤微环境、生物标志物和免疫耐受性 | 数字病理学 | 癌症 | 人工智能，机器学习，单细胞测序，空间分析 | NA | NA | NA |
| 12353 | 2024-08-05 |
Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis
2024-Apr-30, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-024-05659-6
PMID:38684576
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研究论文 | 本研究识别了导致综合性牙缺失的新型SOX4基因突变 | 首次报告了导致综合性牙缺失的SOX4错义突变 | 研究中可能未充分探索其他潜在的调控机制 | 识别Coffin-Siris综合症中导致牙缺失的致病突变并探索调控机制 | 研究对象为表现出牙缺失的Coffin-Siris综合症患者 | 数字病理学 | 综合性疾病 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 1名中国Coffin-Siris综合症患者 |
| 12354 | 2024-08-04 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.03.556122
PMID:37732188
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研究论文 | 本文提出Polaris，一个用于图像基础空间转录组分析的分析管道 | 结合深度学习模型进行细胞分割和点检测，以及概率基因解码器以准确量化单细胞基因表达 | NA | 开发一个无缝的解决方案用于分析空间转录组数据 | 图像基础空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 图像 | NA |
| 12355 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatoxic analgesic generating AM404 in the mid-brain PAG region
2023-May-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2883310/v1
PMID:37205420
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研究论文 | 这篇文章探讨了一种新型非肝毒性的镇痛药SRP-001的转录组特征、生物活性和安全性 | SRP-001作为一种小分子药物，具有非肝毒性并能够在中脑PAG区域生成AM404，展现出与传统镇痛药相比的创新效果 | 研究主要集中在转录组学的分析上，未提供大规模的临床验证数据 | 本研究旨在开发一种安全有效的非opioid镇痛药以替代现有的药物 | 主要研究对象是SRP-001及其在中脑PAG区域的生物作用及安全性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 12356 | 2024-08-05 |
Dedifferentiation maintains melanocyte stem cells in a dynamic niche
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05960-6
PMID:37076619
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研究论文 | 该文章研究了黑色素干细胞在动态微环境中的去分化现象 | 文章提出黑色素干细胞在发育和成熟过程中在不同状态间转变的机制，挑战了现有理论 | 研究未详细探讨外部因素如何影响黑色素干细胞的迁移和去分化 | 探索黑色素干细胞如何在动态微环境中维持 | 黑色素干细胞及其在毛囊中的行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | NA | NA |
| 12357 | 2024-08-05 |
Delineating the transcriptional landscape and clonal diversity of virus-specific CD4+ T cells during chronic viral infection
2022-10-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80079
PMID:36255051
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研究论文 | 本文研究了慢性病毒感染过程中病毒特异性CD4 T细胞的转录景观和克隆多样性 | 识别了在感染高峰期形成的Th1、Tfh和记忆样T细胞亚群中多个转录明显不同的状态，包括一个新的具有细胞杀伤特征的Slamf7亚群 | 尚未充分研究细胞内因子如TCR使用对CD4 T细胞命运承诺的影响 | 探究慢性病毒感染中CD4 T细胞的转录特征及其克隆多样性 | 病毒特异性CD4 T细胞，孤立于慢性淋巴细胞脉络膜脑膜炎病毒感染的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | NA | NA |
| 12358 | 2024-08-05 |
Metabolic transitions define spermatogonial stem cell maturation
2022-08-25, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac157
PMID:35856882
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研究论文 | 本研究表明人类青春前的生精细胞经历了从氧化磷酸化到厌氧代谢的显著代谢转变。 | 首次揭示了青春期前人类生精干细胞的代谢特征及其向成人代谢转变的机制。 | 人类青春前组织样本稀缺，每个年龄组样本数量有限，功能状态仅通过基因富集分析给出指示。 | 探讨生精细胞在青春前发展期间是否经历代谢改变。 | 研究对象包括人类青春前的生精细胞、鼠类和猪的生精细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 总共分析了来自3只幼鼠和2只成年鼠的生精细胞，以及不同年龄的人类生精细胞 |
| 12359 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals karyotype heterogeneity in murine and human malignancies
2016-05-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-0971-7
PMID:27246460
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研究论文 | 本文探讨了小鼠和人类恶性肿瘤中的核型异质性 | 采用新开发的单细胞全基因组测序平台揭示了肿瘤细胞间的拷贝数异质性 | 文章未提及具体的样本量和是否涉及其他类型的肿瘤 | 研究染色体不稳定性在恶性肿瘤中的影响 | 以小鼠T细胞淋巴瘤和人类B细胞白血病为对象 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞全基因组测序 (scWGS) | NA | 基因组数据 | 小鼠T细胞淋巴瘤样本和人类B细胞白血病样本 |
| 12360 | 2024-08-04 |
Spotless, a reproducible pipeline for benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics
2024-May-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88431
PMID:38787371
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研究论文 | 本文介绍了一个可重复的管道，用于基准测试空间转录组学中的细胞类型去卷积方法 | 开发了一个模拟引擎生成银标准，并比较了11种去卷积方法的性能 | 在细胞类型极为丰富或稀少的数据集中，所有方法的性能显著下降 | 研究空间转录组学中细胞类型的去卷积技术的有效性 | 基于63个银标准、3个金标准和2个案例研究进行评估 | 数字病理学 | 肝脏疾病与黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 简单回归模型 | 转录组数据 | 63个银标准和2个案例研究 |