单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 12321 - 12340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12321 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis of Blood-Brain Barrier Response to Pericyte Loss
2021-02-19, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317473
PMID:33375813
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研究论文 | 本研究揭示了缺失周细胞对脑内皮细胞转录变化的影响 | 首次从单细胞层面揭示了缺失周细胞对血脑屏障的复杂影响及其分子机制 | 研究中使用的是基因诱导的周细胞缺失小鼠模型，可能不完全反映人类病理状态 | 映射缺失周细胞接触对脑内皮细胞转录变化的影响，并与血脑屏障功能和血管表型的区域异质性进行关联 | 缺失周细胞接触的脑内皮细胞 | 数字病理学 | 脑部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了成年Pdgfbret/ret小鼠进行研究 |
| 12322 | 2024-08-05 |
A Single-Cell Transcriptional Roadmap of the Mouse and Human Lymph Node Lymphatic Vasculature
2020, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2020.00052
PMID:32426372
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究小鼠和人类淋巴结淋巴血管的细胞异质性和组织结构 | 识别出淋巴小结中的五个明确的细胞亚群，并揭示了新的淋巴血管组织特征 | NA | 深入理解淋巴血管的发育与构建 | 小鼠淋巴结淋巴内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12323 | 2024-08-05 |
Integration analysis of cell division cycle-associated family genes revealed potential mechanisms of gliomagenesis and constructed an artificial intelligence-driven prognostic signature
2024-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111168
PMID:38599441
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研究论文 | 本研究揭示了CDCA基因家族在胶质瘤中的潜在机制并构建了人工智能驱动的预后标志。 | 本研究首次系统分析了CDCA基因家族在胶质瘤中的作用，并基于机器学习构建了新的预后评分系统。 | 本研究未深入探讨CDCA基因家族的所有成员在不同类型胶质瘤中的具体机制。 | 阐明CDCA基因家族在胶质瘤中的功能及其在预后中的作用。 | 包括八个胶质瘤队列的病人样本。 | 数字病理 | 胶质瘤 | 多组学数据分析，单细胞RNA测序，空间转录组测序 | 机器学习 | 生物信息数据，组织样本 | 八个胶质瘤队列的样本 |
| 12324 | 2024-08-05 |
Integrated enhancer regulatory network by enhancer-promoter looping in gastric cancer
2024-Jun, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcae020
PMID:38720882
|
研究论文 | 本研究分析了胃癌细胞中增强子-启动子环状相互作用的调控网络 | 发现胃癌特异性增强子通过增强子-启动子环与近邻启动子相互作用激活多个基因，尤其是在胃癌细胞中表达的肿瘤相关基因 | 未提及具体的局限性 | 研究胃癌细胞中增强子如何调控癌基因转录 | 胃癌细胞系与正常胃上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，CRISPR干扰 | NA | 基因表达数据 | 使用了两种胃癌细胞系和临床胃癌样本 |
| 12325 | 2024-08-05 |
Rethinking eco-evo studies of gene expression for non-model organisms in the genomic era
2024-May-09, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17378
PMID:38721834
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评论 | 本文回顾了基因表达研究中最新的基因组技术对非模式生物的影响 | 提出了长读序列技术和单细胞RNA测序方法在生态基因组学中的应用潜力 | 传统的RNA测序方法无法捕捉稀有细胞群体的表达变化 | 探讨基因组技术如何提高对基因表达变化的理解 | 非模式生物的基因表达和细胞异质性 | 生态基因组学 | NA | 长读测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12326 | 2024-08-04 |
Genomic insights into the cellular specialization of predation in raptorial protists
2024-May-07, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01904-2
PMID:38715037
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研究论文 | 本研究探讨了捕食原生动物的细胞特化的基因组机制 | 首次揭示了Haptoria纤毛虫在毒素生成和释放中的基因重复与表达特征 | 对毒素形成和释放的遗传过程的理解仍然有限 | 研究Haptoria纤毛虫的捕食策略及其细胞结构 | 七个Haptoria纤毛虫物种 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | 七个Haptoria纤毛虫物种 |
| 12327 | 2024-08-05 |
Single-cell senescence identification reveals senescence heterogeneity, trajectory, and modulators
2024-May-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.009
PMID:38604170
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研究论文 | 本文介绍了一种机器学习程序SenCID，用于准确识别衰老细胞 | SenCID能够识别不同的衰老身份，并重建衰老轨迹，揭示了衰老调节因子的层级结构 | 未提及具体的限制 | 研究细胞衰老及其异质性 | 602个样本来自52个衰老转录组数据集 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | 转录组测序 | 机器学习模型 | 文本数据 | 602个样本，涉及30种细胞类型 |
| 12328 | 2024-08-04 |
Catalytic Nanodots-Driven Pyroptosis Suppression in Nucleus Pulposus for Antioxidant Intervention of Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202313248
PMID:38299823
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研究论文 | 本研究开发了碳化锰纳米点（MCDs）作为抗氧化剂，以抑制髓核细胞的焦亡，从而有效缓解椎间盘退变。 | 该研究首次使用碳化锰纳米点作为ROS清除催化生物材料，展示了其在抑制焦亡和缓解椎间盘退变中的优越效果。 | 该研究的局限性可能包括小鼠模型的适用性和长期效果需进一步验证。 | 研究的目的是开发一种新的抗氧化干预措施，以抑制椎间盘退变中的焦亡。 | 研究对象为椎间盘退变相关的髓核细胞。 | 数字病理 | 椎间盘退变 | 催化干预 | 小鼠模型 | 生物材料和生物化学数据 | 使用了多种小鼠样本进行体内评估 |
| 12329 | 2024-08-05 |
Identification of a novel ADCC-related gene signature for predicting the prognosis and therapy response in lung adenocarcinoma
2024-May, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01871-y
PMID:38507067
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研究论文 | 该研究识别了一种新的ADCC相关基因特征，预测肺腺癌的预后和治疗反应 | 首次系统编制ADCC相关基因创建预后标志，并展示了其在多组患者中的有效性 | 可能未对所有潜在的ADCC相关基因进行全面考察，且外部验证需要进一步研究 | 旨在通过ADCC相关基因特征提高肺腺癌患者的预后预测和治疗反应评估 | 包括1564例肺腺癌患者以及其他多种癌症类型的总共5000多名患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 机器学习 | 集成机器学习方法 | 基因组数据、单细胞数据 | 1564名肺腺癌患者，2057名非小细胞肺癌患者，以及5000多名其他癌症患者 |
| 12330 | 2024-08-05 |
The Mas-related G protein-coupled receptor d (Mrgprd) mediates pain hypersensitivity in painful diabetic neuropathy
2024-May-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003120
PMID:38147415
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研究论文 | 该研究探讨了Mrgprd在糖尿病性神经病痛中的作用。 | 首次揭示了Mrgprd在高脂饮食小鼠模型中的表达增加及其与神经痛相关的机制。 | 研究主要集中在动物模型上，尚未在人类糖尿病性神经病痛患者中验证。 | 阐明糖尿病性神经病痛中DRG神经元的超兴奋性分子机制。 | 高脂饮食小鼠模型中的DRG神经元。 | 数字病理 | 糖尿病性神经病痛 | 单细胞RNA测序和体内钙成像。 | NA | RNA数据和钙成像数据。 | 研究涉及高脂饮食小鼠模型的多个神经元亚群体。 |
| 12331 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a signature based on myofibroblastic cancer-associated fibroblast marker genes for predicting prognosis, immune infiltration, and therapeutic response in bladder cancer
2024-May, Investigative and clinical urology
IF:2.5Q2
DOI:10.4111/icu.20230300
PMID:38714517
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研究论文 | 本研究探讨了用于预测膀胱癌预后、免疫浸润和治疗反应的肌成纤维癌相关成纤维细胞标记基因的特征。 | 本研究构建了一个基于两个基因(COL6A1和MAP1B)的风险特征，为膀胱癌患者提供了新的治疗靶点。 | 本研究在样本选择和数据分析上可能存在一定的局限性，未详细讨论如何克服这些局限。 | 研究目的在于探索膀胱癌患者临床诊断和治疗中的myCAF标记基因生物标志物。 | 研究对象为膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据和临床数据。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因组学 | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据 | NA |
| 12332 | 2024-08-05 |
Shared and Compartment-Specific Processes in Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus During Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309032
PMID:38403470
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研究论文 | 本研究揭示了在椎间盘退化过程中，细胞群体的共享与特定过程。 | 该论文首次识别了退化中椎间盘各特定细胞群体的机制与分子，提供了更精确的IDD预防和治疗靶点。 | 具体样本来源及数量在研究中没有详细阐述。 | 研究椎间盘退化中细胞群体如何促使发病与进展。 | 对人类健康与病变椎间盘的环状纤维与髓核进行单细胞RNA测序分析。 | 数字病理学 | 椎间盘退化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 共计70,000多个细胞样本，其中AF为26,983和19,978个细胞，NP为24,489和20,884个细胞 |
| 12333 | 2024-08-05 |
Early megakaryocyte lineage-committed progenitors in adult mouse bone marrow
2024-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000187
PMID:38721470
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研究论文 | 本研究首次识别了成年小鼠骨髓中早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 本研究提出了一个新的分化模型，表明巨核细胞谱系承诺发生在分化的晚期，而非直接由造血干细胞生成。 | 研究中未能展示MgPs在体内的再生能力，且MgPs在基因表达上表现出转录异质性。 | 研究巨核细胞谱系承诺的前体细胞在小鼠骨髓中的特点及其起源。 | 成年小鼠骨髓中的早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞克隆培养、反转录聚合酶链反应（RT-PCR） | NA | 细胞、基因表达数据 | CD201CD48细胞和CD48细胞 |
| 12334 | 2024-08-04 |
Tumoral and stromal hMENA isoforms impact tertiary lymphoid structure localization in lung cancer and predict immune checkpoint blockade response in patients with cancer
2024-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105003
PMID:38340557
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤细胞和癌相关成纤维细胞中的hMENA亚型与三次淋巴结构（TLS）的关系及其对肺癌患者结果的影响 | 发现hMENA的选择性剪接是TLS相关肿瘤免疫微环境的重要未探索因素，且hMENA亚型可作为临床结果和ICB响应的潜在生物标志物 | 研究主要基于回顾性观察，可能存在样本选择偏倚 | 本研究旨在了解hMENA亚型如何影响肺癌的三次淋巴结构及其与免疫检查点抑制剂反应的关系 | 研究对象为非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤细胞和癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序，免疫组化，空间转录组学 | NA | 组织样本，转录组数据 | N0 NSCLC患者的手术切除组织 |
| 12335 | 2024-08-04 |
Sfrp1 inhibits lung fibroblast invasion during transition to injury-induced myofibroblasts
2024-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01326-2023
PMID:38212077
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研究论文 | 本文研究了Sfrp1在肺纤维母细胞转变为损伤诱导的肌成纤维细胞过程中的抑制作用 | 首次揭示了Sfrp1在调节人类肺纤维母细胞对TGFβ1响应中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和特定患者组织样本，可能限制结果的普遍适用性 | 探讨肺纤维母细胞在损伤和修复过程中的命运变化 | 小鼠肺再生过程中的纤维母细胞及其转变 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | 组织样本 | 小鼠模型和特定的特发性肺纤维化患者组织样本 |
| 12336 | 2024-08-04 |
Identifying specific TLS-associated genes as potential biomarkers for predicting prognosis and evaluating the efficacy of immunotherapy in soft tissue sarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372692
PMID:38720884
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研究论文 | 本研究探讨了TLS相关基因作为软组织肉瘤预后和免疫治疗疗效的潜在生物标志物 | 本研究系统性地探索了TLS及其相关基因，并建立了与预后和免疫治疗反应相关的风险评分和标志基因 | 研究仍需进一步验证TLS分数和生物标志物在临床中的有效性 | 探讨TLS结构在软组织肉瘤中的作用以及相关生物标志物 | 从TCGA-SARC和GSE212527队列收集的RNAseq和单细胞测序样本 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | RNA测序、单细胞测序 | 无 | RNA测序数据 | 256个RNAseq样本和7个单细胞测序样本 |
| 12337 | 2024-08-05 |
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.020
PMID:37995702
|
研究论文 | 本文开发了一种新的人脑类器官技术，能够在早期时间点生成自组织的单星状皮层类器官 | 提出了一种基于人诱导多能干细胞的单层培养方法，能够有效生成单星状皮层类器官 | 未提及具体的样本限制和对比分析的局限性 | 研究人脑发育及相关疾病模型 | 人诱导多能干细胞转化为皮层类器官 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 化学诱导 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 |
| 12338 | 2024-08-05 |
Distinct secretomes in p16- and p21- positive senescent cells across tissues
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.569858
PMID:38106149
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研究论文 | 本文综合研究了不同组织中p16和p21阳性衰老细胞的独特分泌组 | 揭示了p21和p16转录本在不同细胞类型和组织中的重大异质性，强调了细胞衰老及其分泌表型的多样性 | 部分SASP因子持续贡献于共享的“核心”SASP，仍需在更广泛的生物学背景下进行更细致的研究 | 探讨p21和p16在衰老细胞及其分泌表型中的作用 | 多个小鼠和人类组织的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个小鼠和人类组织的数据集 |
| 12339 | 2024-08-07 |
Correction to: Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis, by Mirhaidari et al. Tissue Engineering Part C: Methods 2023;29(2):72-84; doi: 10.1089/ten.tec.2022.0189
2023-Oct, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.tec.2022.0189.correx
PMID:37672627
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12340 | 2024-08-05 |
Systemic Alterations in Type-2 Conventional Dendritic Cells Lead to Impaired Tumor Immunity in Pancreatic Cancer
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0946
PMID:37229629
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研究论文 | 本研究分析了胰腺癌患者的外周血和骨髓中常规树突状细胞（cDC2）的变化 | 揭示了胰腺癌对系统性cDC2发育和功能的影响 | 未充分研究PDAC对系统性cDC1的影响 | 探讨胰腺癌对树突状细胞功能的影响及其对肿瘤免疫的影响 | 胰腺癌患者的外周血和骨髓样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和骨髓样本 | 106个样本 |